<DIV>Thanks Aaron.</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>The program is called lamwipe but it doesn't help at all. I still&nbsp;run into&nbsp;these errors very very frequently. On the rare occasions when mpiblast works ,it takes an awful lot of time !!</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>btw, Is mpich an alternative to lam-mpi ?</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>-Cel.</DIV>
<DIV><BR><B><I>Aaron Darling &lt;darling@cs.wisc.edu&gt;</I></B> wrote:</DIV>
<BLOCKQUOTE class=replbq style="PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #1010ff 2px solid">Hi, based on the call stack it looks like LAM is crashing during <BR>initialization (MPI_Init()). I can't imagine why mpiblast would cause <BR>such behavior. Do other parallel applications exhibit similar behavior?<BR>Perhaps you need to clean your LAM environment after a previous crash? <BR>I think there's a program called lamclean or something. Maybe somebody <BR>else could comment--I'm mostly an mpich user.<BR><BR>-Aaron<BR><BR>Celeste vikram wrote:<BR><BR>&gt; Hi,<BR>&gt; <BR>&gt; Sometimes I get some errors while running mpiblast1.3...Any help would <BR>&gt; be appreciated.<BR>&gt; ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------<BR>&gt; MPI_Recv: process in local group is dead (rank 1, MPI_COMM_WORLD)<BR>&gt; Rank (1, MPI_COMM_WORLD): Call stack within LAM:<BR>&gt; Rank (1, MPI_COMM_WORLD): - MPI_Recv()<BR>&
 gt; Rank
 (1, MPI_COMM_WORLD): - MPI_Allreduce()<BR>&gt; Rank (1, MPI_COMM_WORLD): - MPI_Comm_split()<BR>&gt; Rank (1, MPI_COMM_WORLD): - MPI_Init()<BR>&gt; Rank (1, MPI_COMM_WORLD): - main()<BR>&gt; MPI_Recv: process in local group is dead (rank 2, MPI_COMM_WORLD)<BR>&gt; Rank (2, MPI_COMM_WORLD): Call stack within LAM:<BR>&gt; Rank (2, MPI_COMM_WORLD): - MPI_Recv()<BR>&gt; Rank (2, MPI_COMM_WORLD): - MPI_Allreduce()<BR>&gt; Rank (2, MPI_COMM_WORLD): - MPI_Comm_split()<BR>&gt; Rank (2, MPI_COMM_WORLD): - MPI_Init()<BR>&gt; Rank (2, MPI_COMM_WORLD): - main()<BR>&gt; MPI_Recv: process in local group is dead (rank 3, MPI_COMM_WORLD)<BR>&gt; Rank (3, MPI_COMM_WORLD): Call stack within LAM:<BR>&gt; Rank (3, MPI_COMM_WORLD): - MPI_Recv()<BR>&gt; Rank (3, MPI_COMM_WORLD): - MPI_Allreduce()<BR>&gt; Rank (3, MPI_COMM_WORLD):&amp;n bsp; - MPI_Comm_split()<BR>&gt; Rank (3, MPI_COMM_WORLD): - MPI_Init()<BR>&gt; Rank (3, MPI_COMM_WORLD): - main()<BR>&gt;
 -----------------------------------------------------------------------------<BR>&gt; One of the processes started by mpirun has exited with a nonzero exit<BR>&gt; code. This typically indicates that the process finished in error.<BR>&gt; If your process did not finish in error, be sure to include a "return<BR>&gt; 0" or "exit(0)" in your C code before exiting the application.<BR>&gt; <BR>&gt; PID 17770 failed on node n0 (40.191.22.1) due to signal 15.<BR>&gt; ------------------------------------------------------------------------------------------------------<BR>&gt; <BR>&gt; Thx,<BR>&gt; Cel<BR>&gt;<BR>&gt; ------------------------------------------------------------------------<BR>&gt; Do you Yahoo!?<BR>&gt; Yahoo! Search presents - Jib Jab's 'Second Term' <BR>&gt; <HTTP: evt="30648/*http://movies.yahoo.com/movies/feature/jibjabinaugural.html"
 us.rd.yahoo.com><BR>&gt;<BR>&gt;<BR>&gt;------------------------------------------------------------------------<BR>&gt;<BR>&gt;_______________________________________________<BR>&gt;Bioclusters maillist - Bioclusters@bioinformatics.org<BR>&gt;https://bioinformatics.org/mailman/listinfo/bioclusters<BR>&gt; <BR>&gt;<BR></BLOCKQUOTE><p>__________________________________________________<br>Do You Yahoo!?<br>Tired of spam?  Yahoo! Mail has the best spam protection around <br>http://mail.yahoo.com