<!doctype html public "-//W3C//DTD W3 HTML//EN">
<html><head><style type="text/css"><!--
blockquote, dl, ul, ol, li { padding-top: 0 ; padding-bottom: 0 }
 --></style><title>[Bioclusters] limiting job memory size  on
G5s</title></head><body>
<div>Hi Chris,</div>
<div>did you get anywhere with this request?</div>
<div>We have tried a test PBS cluster and cannot get it to limit the
execution size either, although we are still trying to get them to
make this happen.</div>
<div><br></div>
<div><br></div>
<div><font size="-4" color="#000000">Hi Barry,<br>
<br>
This is probably a Grid Engine issue; enforcing memory usage limits
for<br>
the purpose of sending suspend/terminate signals etc. has long been
part<br>
of the SGE feature set.<br>
<br>
You may want to post this message to the Grid Engine users mailing
list:<br>
&nbsp;</font><font size="-4" color="#551A8B"> users at
gridengine.sunsource.net</font><font size="-4" color="#000000"> to see
if anyone else is doing memory<br>
limit enforcement on Mac OS X with SGE 6<br>
<br>
I did a brief search through the open bug reports but did not see
any<br>
open issues that match your problem.<br>
<br>
That said though, I've only seen jobs trip SGE queues into error
state<br>
'E' when the job itself failed in a spectacular manner. It's odd that
it<br>
errors out several queues and the runs on a different box.<br>
<br>
If you are willing to share your test code I'd be interested in
trying<br>
to replicate on one of the G5 clusters I have access to.<br>
<br>
Regards,<br>
Chris</font></div>
<x-sigsep><pre>-- 
</pre></x-sigsep>
<div>------<br>
Barry Mc Innes<br>
Email: Barry.J.McInnes@noaa.gov<br>
Phone: 303-4976231 FAX: 303-4977013<br>
Smail: NOAA/CDC<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 325 Broadway R/CDC1<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Boulder CO 80305<br>
------</div>
</body>
</html>