<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
<head>
  <meta content="text/html;charset=ISO-8859-1" http-equiv="Content-Type">
</head>
<body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
<pre wrap="">Aaron Darling <a class="moz-txt-link-rfc2396E"
 href="mailto:darling@cs.wisc.edu">&lt;darling@cs.wisc.edu&gt;</a> wrote:</pre>
<blockquote
 cite="mid20060202094049.C44F71C0AE@primary.bioinformatics.org"
 type="cite">
  <pre wrap="">Anyways, my point is that it would be great if NCBI would set up a bittorent server themselves, but I wouldn't hold my breath waiting for their leadership on the issue.</pre>
</blockquote>
<br>
People interested in high-performance file transfer might check out
multicast data distribution tools from Micah Beck's
"Logistical Computing and Internetworking Lab"&nbsp; <a
 href="http://loci.cs.utk.edu/projects/index.php">http://loci.cs.utk.edu/</a>&nbsp;
Collectively they call it a "Logistical Distribution Network" (LoDN -
"lowdown").&nbsp; I've seen demos at Internet2 and Supercomputing meetings
(mainly, like BitTorrent, for sucking down huge digital video files)
and it's quite impressive.&nbsp; Data streams from multiple storage
sites ("depots") simultaneously, aggregated and presented to the client
as a
single "exNode" ... basically it treats high-speed internet connections
as a virtual backplane using a specialized protocol/middleware.&nbsp;&nbsp; There
is no single point-of-failure and no one site has to bear the entire
burden of providing data resources.&nbsp; It's sort of the same mentality as
the LOCKSS project in the digital
library/archival community -- "Lots Of Copies Keeps Stuff Safe" --
except oriented towards highly dynamic rather than archival data, so
for instance there are mechanisms to keep data current.&nbsp; And unlike
bittorrent and other p2p content sharing services, control is retained
over data stored on depots. Whether it would work well for our purposes
or NIH/NCBI would even go for something like this is uncertain, but the
NSF and US Dept. of Energy have been interested enough to fund it for
several years.<br>
<br>
<pre class="moz-signature" cols="78">-- 

Lee Watkins, Jr. 
Director of Bioinformatics 
Center for Inherited Disease Research (CIDR) 
Institute of Genetic Medicine 
Johns Hopkins Bayview Research Campus 
333 Cassell Drive, Triad Bldg. Suite 2000 
Baltimore, MD 21224

<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:lwatkins@jhu.edu">lwatkins@jhu.edu</a> | <a
 class="moz-txt-link-abbreviated" href="http://www.cidr.jhmi.edu">www.cidr.jhmi.edu</a> 
410-550-7042 ofc | 410-903-2989 cell </pre>
</body>
</html>