<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=iso-8859-1">
<META content="MSHTML 6.00.2800.1141" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV><FONT face=Arial>Actually, I looked into it a bit further and they do have 
code in the new c++ Cn3D to do multiple structure alignments and RSMD 
comparisons</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial><A 
href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/IEB/ToolBox/CPP_DOC/lxr/ident?i=RealignStructure">http://www.ncbi.nlm.nih.gov/IEB/ToolBox/CPP_DOC/lxr/ident?i=RealignStructure</A></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial>Cheers</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial>-=Michel=-</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial>Michel Dumontier<BR>Ph.D. candidate<BR>1060-600 University 
Avenue<BR>SLRI, Mt. Sinai Hospital<BR>Dept of Biochemistry, University of 
Toronto<BR>Toronto, ON<BR>M5G1X5 Canada<BR>tel: 1.416.586.4800 x2416<BR>fax 
1.416.586.8869<BR>cell: 1.416.666.4165<BR>email: <A 
href="mailto:micheld@mshri.on.ca">micheld@mshri.on.ca</A><BR><A 
href="http://bioinfo.mshri.on.ca">http://bioinfo.mshri.on.ca</A><BR></FONT></DIV></BODY></HTML>