<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=iso-8859-1">
<META content="MSHTML 6.00.2800.1141" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV><FONT face=Arial>Daniel,</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial>&nbsp; One of the up and coming, actively developed and 
well documented&nbsp;bioinformatics c++ toolkits comes from the NCBI effort: <A 
href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/IEB/ToolBox/CPP_DOC/">http://www.ncbi.nlm.nih.gov/IEB/ToolBox/CPP_DOC/</A>&nbsp;.&nbsp; 
It provides a great framework to create cgi/fast cgi, web services, data 
serialization between asn.1/xml/ (it has automatic code generators from XML dtd 
and we are contributing XML schema conversion), GUI development, and of course, 
access to all of NCBI's&nbsp;ASN.1 data object definitions&nbsp;(which have been 
in use in the c toolkit&nbsp;for over 13 years).&nbsp; There is support for 
structure manipulation via the MMDB API, which was originally written in C by 
Dr. Christopher Hogue, but is now wrapped by c++.&nbsp; However, I don't think 
there is code to do the RMSD comparison, although you may be able to convince 
the developers to write you something... I can also suggest a variety of ways to 
do the RMSD comparison using Biostrucs.</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial>-=Michel=-</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial>Michel Dumontier<BR>Ph.D. candidate<BR>1060-600 University 
Avenue<BR>SLRI, Mt. Sinai Hospital<BR>Dept of Biochemistry, University of 
Toronto<BR>Toronto, ON<BR>M5G1X5 Canada<BR>tel: 1.416.586.4800 x2416<BR>fax 
1.416.586.8869<BR>cell: 1.416.666.4165<BR>email: <A 
href="mailto:micheld@mshri.on.ca">micheld@mshri.on.ca</A><BR><A 
href="http://bioinfo.mshri.on.ca">http://bioinfo.mshri.on.ca</A><BR></FONT></DIV></BODY></HTML>