Hello,<br>
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First of all I would like to thank you (Tommi Hassinen) for your help with the example
programs to make libghemical perform batch energy calculations. <br>
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While validating the openbabel implementation of the ghemical
(tripos-5.2 like) I noticed that not all 1,4 non-bonded interactions
are scaled? For example the three interactions in a benzene ring
between opposite atoms is not scaled. But since there are other similar
cases (cyclo-hexane, special ring sytems with bridges, ...), I was not
able to find a consistent rule that could be applied.<br>
Could anyone tell me more about the 1,4-scaling in ghemical or point me in the right direction?<br>
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Thanks in advance,<br>
Tim Vandermeersch<br>
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