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Anopheles gambiae
cluster # 10395 cluster # 10395       Sequences # 38       consensus # 3


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10395#0 length = 816 sequences # 22  
consensus_10395#1 length = 682 sequences # 3  
consensus_10395#2 length = 659 sequences # 13  

consensusID : consensus_10395#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 22
consensus length = 816
fasta sequence
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[+] EMBL BM591952             [                                                                                              ccgCGCGTGCGTGTTTGTGGTGTGACGACGAAAGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTA GCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCC GCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCA GCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGATCGTCAC CGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTGTCCCGAAGCTGGCCCACGG TTTGCTGCTGCTCGTGTCCGCCGCCACGC TCGGCGGGCTGTTCTACTTCAACTACAACGACA TCGGCATCGCGGGCTTCGTGCGCAAGATCTGGTCGACCAAGGCGAAGGAATGAAGCGGCCAGCGGT GGGAAGAA CAAATTAACGATTATTACC TTTAGTAACTAGTTG AA                                                  ]
[+] EMBL BM595119             [                                                                                                  cCGTGCGTGTTTGTGGTGTGACGACGAAAGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTA GCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCC GCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCA GCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGATCGTCAC CGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTGTCCCGAAGCTGGCCCACGG TTTGCTGCTGCTCGTGTCCGCCGCCACGC TCGGCGGGCTGTTCTACTTCAACTACAACGACT CCGGCATCGCGGGCTTCGTGCGCAAGATCTGGTCGACCAAGGCGAAGGAATGAAGCGGCCAGCGGT GGGAAGAA CAAATTAACGATTATTACC TTTAGTAACTAGTTG AA                                                  ]
[+] EMBL BM605301             [                                                                                                   ccgGCGTGTTTGTGGTGTGACGACGAAAGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTA GCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCC GCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCA GCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGATCGTCAC CGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTGTCCCGAAGCTGGCCCACGG TTTGCTGCTGCTCGTGTCCGCCGCCACGC TCGGCGGGCTGTTCTACTTCAACTACAACGACA TCGGCATCGCGGGCTTCGTGCGCAAGATCTGGTCGACCAAGGCGAAGGAATGAAGCGGCCAGCGGT GG                                                                                               ]
[+] EMBL BM648616             [                                                                                                          ccgTGTGGTGTGACGACGAAAGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTA GCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCC GCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCA GCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGATCGTCAC CGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTGTCCCGAAGCTGGCCCACGG TTTGCTGCTGCTCGTGTCCGCCGCCACGC TCGGCGGGCTGTTCTACTTCAACTACAACGACA TCGGCATCGCGGGCTTCGTGCGCAAGATCTGGTCGACCAAGGCGAAGGAATGAAGCGGCCAGCGGT GGGAAGAA CAAATTAACGATTATTACC TTTAGTAACTAGTTGAAACGCGAACGCCTGACG G AGGA AGCAAGAGATCAGT             ]
[+] EMBL BM616066             [                                                                                                                ccgGTGACGACGAAAGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTA GCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCC GCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCA GCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGATCGTCAC CGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTGTCCCGAAGCTGGCCCACGG TTTGCTGCTGCTCGTGTCCGCCGCCACGC TCGGCGGGCTGTTCTACTTCAACTACAACGACA TCGGCATCGCGGGCTTCGTGCGCAAGATCTGGTCGACCAAGGCGAAGGAATGAAGCGGCCAGCGGT GGGAAGAA CAAATTAACGATTATTACC TTTAGTAACTAGTTG AACGCGAACGCCTGACG G AGGA AGCAAGAGATCAGTAAATTAAATACA ]
[+] EMBL BM653151             [                                                                                                                ccgGTGACGACGAAAGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTA GCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCC GCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCA GCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGATCGTCAC CGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTGTCCCGAAGCTGGCCCACGG TTTGCTGCTGCTCGTGTCCGCCGCCACGC TCGGCGGGCTGTTCTACTTCAACTACAACGACA TCGGCATCGCGGGCTTCGTGCGCAAGATCTGGTCGACCAAGGCGAAGGAATGAAGCGGCCAGCGGT GGGAAGAA CAAATTAACGATTATTACC TTTAGTAACTAGTTG ACCGCGAACGCCTGACG G AGGA AGCAAGAGATCAGTAAATTAA      ]
[+] EMBL BX608508             [                                                                                                                                                                      TCCTAAAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTA GCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCC GCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCA GCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGATCGTCAC CGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTGTCCCGAAGCTGGCCCACGG TTTGCTGCTGCTCGTGTCCGCCGCCACGC TCGGCGGGCTGTTCTACTTCAACTACAACGACA TCGGCATCGCGGGCTTCGTGCGCAAGATCTGGTCGACCAAGGCGAAGGAATGAAGCGGCCAGCGGT GGGAAGAA CAAATTAACGATTATTACC TTTAGTAACTAGTTG AACGCGAACGCCTGACG G AGGA AGCAAGAGATCAGTAAATTAAATACAA]
[+] EMBL BM613827             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CCGCCCA CGCGTCCGGCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCA GCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTGGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGATCGTCAC CGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTGTCCCGAAGCTGGCCCACGG TTTGCTGCTGCTCGTGTCCGCCGCCACGC TCGGCGGGCTGTTCTACTTCAACTACAACGACA TCGGCATCGCGGGCTTCGTGCGCAAGATCTGGTCGACCAAGGCGAAGGAATGAAGCGGCCAGTGGT GGGAAGAA CAAATTAACGATTATTACC TTTAGTAACTAGTTG AACGCGAACGCCT                                       ]


>consensus_10395#0 CCGCCCACGCGTCCGCGCAGGCTTTGGGCTGGAGCAGCGAAACGAAAATATCAACCCCTT TTCGAGCGCCGATTTGTTTTGCTTCAACACTTCGTCGCGTGCGTGTTTGTGGTGTGACGA CGAAAGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGC GATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCAC GCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTAGCAATGTTCACCGGCAGCCTGGT GGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCCGCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGT CTCGCCCGTGCGGTGTTCCAGCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGC CCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGG CGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGATCGT CACCGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTGTCCCGAAGCTGGCCCACGGTTT GCTGCTGCTCGTGTCCGCCGCCACGCTCGGCGGGCTGTTCTACTTCAACTACAACGACAT CGGCATCGCGGGCTTCGTGCGCAAGATCTGGTCGACCAAGGCGAAGGAATGAAGCGGCCA GCGGTGGGAAGAACAAATTAACGATTATTACCTTTAGTAACTAGTTGAACGCGAACGCCT GACGGAGGAAGCAAGAGATCAGTAAATTAAATACAA



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NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
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                              [CCGCCCACGCGTCCGC--CCACGCGTCCG-GTTTGTGGTGTGACGACGAAAGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTAGCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCCGCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCAGCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGATCGTCACCGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTGTCCCGAAGCTGGCCCACGGTTTGCTGCTGCTCGTGTCCGCCGCCACGCTCGGCGGGCTGTTCTACTTCAACTACAACGACATCGGCATCGCGGGCTTCGTGCGCAAGATCTGGTCGACCAAGGCGAAGGAATGAAGCGGCCAGCGGT-GGGAAGAACAAATTAACGATTATTACCTTTTAGT]

[+] EMBL BM631058             [CCGCCCACGCGTCCGC  CCACGCGTCCG GTTTGTGGTGTGACGACGAAAGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTAGCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCCGCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCAGCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGATCGTCACCGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTGTCCCGAAGCTGGCCCACGGTTTGCTGCTGCTCGTGTCCGCCGCCACGCTCGGCGGGCTGTTCTACTTCAACTACAACGACATCGGCATCGCGGGCTTCGTGCGCAAGATCTGGTCGACCAAGGCGAAGGAATGAAGCGGCCAGCGGT GGGAAGAACAAATTAACGATTATTACCTTTTAGT]
[+] EMBL BM624049             [CCGCCCACGCGTCCGCTTCGTCGCGTGCGTGTTTGTGGTGTGACGACGAAAGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTAGCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCCGCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCAGCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGATCGTCACCGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTGTCCCGAAGCTGGCCCACGGTTTGCTGCTGCTCGTGTCCGCCGCCACGCTCGGCGGGCTGTTCTACTTCAACTACAACGACATCGGCATCGCGGGCTTCGTGCGCAAGATCTGGTCGACCAAGGCGAAGGAATGAAGCGGCCAGCGGTGGGGAAGAACAAATTAA                  ]
[+] EMBL BX620027             [                                       GTGACGACGAAAGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCCATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTAGCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCCGCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCAGCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGATCGTCACCGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTGTCCCGAAGCTGGCCCACGGTTTGCTGCTGCTCGTGTCCGCCGCCACGCTCGGCGGGCTGTTCTACTTCAACTACAACGACATCGGCATCGCGGGCTTCGTGCGCAAGATCTGGTCGACCAAAGCGAANGAA                                                   ]


>consensus_10395#1 CCGCCCACGCGTCCGCCCACGCGTCCGGTTTGTGGTGTGACGACGAAAGTTTCGGTCGTA AGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCC TGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGT CGGCGGCCCTGCCTAGGGTAGCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCGCTGCCCGCA AAGCGCAGCCGCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTT CCAGCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGC TCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGACACCCTGATCGCGG TCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGATCGTCACCGATTACGTGCGCC CGATCCTGTTCGGCACCACTGTCCCGAAGCTGGCCCACGGTTTGCTGCTGCTCGTGTCCG CCGCCACGCTCGGCGGGCTGTTCTACTTCAACTACAACGACATCGGCATCGCGGGCTTCG TGCGCAAGATCTGGTCGACCAAGGCGAAGGAATGAAGCGGCCAGCGGTGGGAAGAACAAA TTAACGATTATTACCTTTTAGT



consensusID : consensus_10395#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 13
consensus length = 659
fasta sequence
                              [CCCCGCAGTTGTGGAAGCTTTGGGCTGGAGCAGCGAAACGAAAATATCAACCCCTTTTCGAGCGCCGATTTGTTTTGCTTCAACACTTCGTCGCGTGCGTGTTTGTGGTGTGACGACGAAAGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTAGCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCCGCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCAGCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGATCGTCACCGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTG-TCCCGAAGCTGGCCCACGGTTTGCTGCTGCTCGTGTCCGCCGCCACGC-TCGGCGGGCTGTTCTACTTCAACTACAACGAATTCGG]

[+] EMBL BM609464             [  CCGCAGTTGTGGAAGCTTTGGGCTGGAGCAGCGAAACGAAAATATCAACCCCTTTTCGAGCGCCGATTTGTTTTGCTTCAACACTTCGTCGCGTGCGTGTTTGTGGTGTGACGACGAAAGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGTCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTAGCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCCGCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCAGCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGATCGTCACCGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTG TCCCGAAGCTGGCCCACGGTTTGCTGCTGCTCGTGTCCGCCGCCACGC TCGGCGGGCTGTTCTACTTCAACTACAA         ]
[+] EMBL BM594619             [ccggtCAGTTGTGGAAGCTTTGGGCTGGAGCAGCGAAACGAAAATATCAACCCCTTTTCGAGCGCCGATTTGTTTTGCTTCAACACTTCGTCGCGTGCGTGTTTGTGGTGTGACGACGAAAGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTAGCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCCGCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCAGCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGATCGTCACCGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTGATCCCGAAGCTGGCCCACGGTTTGCTGCTGCTCGTGTCCGCCGCCACGCTTCGGCGGGCTGTTCTACTTCAACTACAACGAATTCGG]
[+] EMBL BM653941             [          ccGGAAGCTTTGGGCTGGAGCAGCGAAACGAAAATATCAACCCCTTTTCGAGCGCCGATTTGTTTTGCTTCAACACTTCGTCGCGTGCGTGTTTGTGGTGTGACGACGAAAGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTAGCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCCGCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCAGCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGAAAGCGATCGTCACCGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTG TCCCGAAGCTGGCCCACGGTTTGCTGCTGCTCGTGTCCGCCGCCACGC TCGGCGGGCTGTTCTACTTCAACTACAACGA      ]
[+] EMBL BM617084             [                            ccgAGCGAAACGAAAATATCAACCCCTTTTCGAGCGCCGATTTGTTTTGCTTCAACACTTCGTCGCGTGCGTGTTTGTGGTGTGACGACGAAAGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTAGCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCCGCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCAGCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGATCGTCACCGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTG TCCCGAAGCTGGCCCACGGTTTGCTGCTGCTCGTGTCCGCCGCCACGC TCGGCGGGCTGTTCTACTTCAACTACAAC        ]
[+] EMBL BX623105             [                                GCGAAACGAAAATATCANCCCCTTTTCGAGCGCCGATTTGTTTTGCTTCAACACTTCGTCGCGTGCGTGTTTGTGGTGTGACGACGAAAGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTAGCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCCGCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCAGCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGATCGTCACCGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCAC                                                                                         ]
[+] EMBL BX609666             [                                                 ACCCCTTTTCGAGCGCCGATTTGTTTTGCTTCAACACTTCGTCGCGTGCGTGTTTGTGGTGTGACGACGAAAGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTAGCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCCGCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCAGCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATG                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BM621763             [                                                           GAGCGCCGATTTGTTTTGCTTCAACACTTCGTCGCGTGCGTGTTTGTGGTGTGACGACGAAAGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTAGCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCCGCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCAGCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGAC                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BX604490             [                                                                           TGCTTC ACACTTCGTCGCGTGCGTGTTTGTGGTGTGACGACGAAAGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTAGCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCCGCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCAGCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGATCGTCACCGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTG TCCCGAAGCTGGCCCACGGTTTGCTGCTGCTCGTGTCC                                                ]
[+] EMBL BX617609             [                                                                                                         TGGTGTGACGACGAAAGTTTCGGTTGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTATCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCTCTGCCCGCAAAGCGCAGCCGCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCAGCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGC                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BM651962             [                                                                                                       ccgGGTGTGACGACGAAAGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTAGCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCCGCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCAGCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGATCGTCACCGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTG TCCCGAAGCTGGCCCACGGTTTGCTGCTGCTCGTGTCCGCCGCCACGC                                      ]
[+] EMBL BX615399             [                                                                                                                                TCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTAGCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BX617825             [                                                                                                                                    AAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTAGCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCCGCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCAGCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGATCGTCACCGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTG TCCCGAAGCTGGCCCACGGTTTGCTGCTGCTCGTGTCCGCCGCCACGC TCGGCGGGCTGTTCTACTTCAACTACAACGA      ]
[+] EMBL BX612350             [                                                                                                                                                                     AAGAAAAAAGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTAGCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCGCCCGCTGCCCGC AAGCGCAGCCGCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCAGCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGACACCCTGATCG                                                                                                                                                                           ]


>consensus_10395#2 CCCCGCAGTTGTGGAAGCTTTGGGCTGGAGCAGCGAAACGAAAATATCAACCCCTTTTCG AGCGCCGATTTGTTTTGCTTCAACACTTCGTCGCGTGCGTGTTTGTGGTGTGACGACGAA AGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAAAGCGATG GCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCGCACGCTC GTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTAGCAATGTTCACCGGCAGCCTGGTGGCG CCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCCGCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGCCGTCTCG CCCGTGCGGTGTTCCAGCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCGTGCCCTG TCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGTCGGCGAC ACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGATCGTCACC GATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTGTCCCGAAGCTGGCCCACGGTTTGCTG CTGCTCGTGTCCGCCGCCACGCTCGGCGGGCTGTTCTACTTCAACTACAACGAATTCGG



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_10395#0      CCGCCCACGCGTCCGCGCAGGCTTTGGGCTGGAGCAGCGAAACGAAAATATCAACCCCTT 60
consensus_10395#2      ----CCCCGCAGTTGTGGAAGCTTTGGGCTGGAGCAGCGAAACGAAAATATCAACCCCTT 56
consensus_10395#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_10395#0      TTCGAGCGCCGATTTGTTTTGCTTCAACACTTCGTCGCGTGCGT---GTTTGTGGTGTGA 117
consensus_10395#2      TTCGAGCGCCGATTTGTTTTGCTTCAACACTTCGTCGCGTGCGT---GTTTGTGGTGTGA 113
consensus_10395#1      --------------------CCGCCCACGCGTCCGCCCACGCGTCCGGTTTGTGGTGTGA 40
                                            *  * ** * **  * *  ****   *************

consensus_10395#0      CGACGAAAGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAA 177
consensus_10395#2      CGACGAAAGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAA 173
consensus_10395#1      CGACGAAAGTTTCGGTCGTAAGTGAATCCCTGCCGAGCATCTGTGCCTCCTAAAGAAAAA 100
                       ************************************************************

consensus_10395#0      AGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCG 237
consensus_10395#2      AGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCG 233
consensus_10395#1      AGCGATGGCCAACTGTATCCTGCGCGGCACACTGTCGAAGCCAGCGATGGCGTTCGCCCG 160
                       ************************************************************

consensus_10395#0      CACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTAGCAATGTTCACCGGCAGCCT 297
consensus_10395#2      CACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTAGCAATGTTCACCGGCAGCCT 293
consensus_10395#1      CACGCTCGTCTCGGGCCAGTCGGCGGCCCTGCCTAGGGTAGCAATGTTCACCGGCAGCCT 220
                       ************************************************************

consensus_10395#0      GGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCCGCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGC 357
consensus_10395#2      GGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCCGCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGC 353
consensus_10395#1      GGTGGCGCCCGCTGCCCGCAAAGCGCAGCCGCTCGCCAGCACCACCGTGCGCCACTTTGC 280
                       ************************************************************

consensus_10395#0      CGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCAGCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCG 417
consensus_10395#2      CGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCAGCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCG 413
consensus_10395#1      CGTCTCGCCCGTGCGGTGTTCCAGCGGTGGCAGCCACGTTACGCTGTGGAATGCCGAGCG 340
                       ************************************************************

consensus_10395#0      TGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGT 477
consensus_10395#2      TGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGT 473
consensus_10395#1      TGCCCTGTCGGTCGCGCTGCTCGGCGTCATCCCGGTCGGGCTAATGTTCCCGTCCCAGGT 400
                       ************************************************************

consensus_10395#0      CGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGAT 537
consensus_10395#2      CGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGAT 533
consensus_10395#1      CGGCGACACCCTGATCGCGGTCAGCGTCGTGATGCACCAGCACTGGGGCCTGGAAGCGAT 460
                       ************************************************************

consensus_10395#0      CGTCACCGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTGTCCCGAAGCTGGCCCACGG 597
consensus_10395#2      CGTCACCGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTGTCCCGAAGCTGGCCCACGG 593
consensus_10395#1      CGTCACCGATTACGTGCGCCCGATCCTGTTCGGCACCACTGTCCCGAAGCTGGCCCACGG 520
                       ************************************************************

consensus_10395#0      TTTGCTGCTGCTCGTGTCCGCCGCCACGCTCGGCGGGCTGTTCTACTTCAACTACAACGA 657
consensus_10395#2      TTTGCTGCTGCTCGTGTCCGCCGCCACGCTCGGCGGGCTGTTCTACTTCAACTACAACGA 653
consensus_10395#1      TTTGCTGCTGCTCGTGTCCGCCGCCACGCTCGGCGGGCTGTTCTACTTCAACTACAACGA 580
                       ************************************************************

consensus_10395#0      CATCGGCATCGCGGGCTTCGTGCGCAAGATCTGGTCGACCAAGGCGAAGGAATGAAGCGG 717
consensus_10395#2      ATTCGG------------------------------------------------------ 659
consensus_10395#1      CATCGGCATCGCGGGCTTCGTGCGCAAGATCTGGTCGACCAAGGCGAAGGAATGAAGCGG 640
                         ****                                                      

consensus_10395#0      CCAGCGGTGGGAAGAACAAATTAACGATTATTACCTTTAGTAACTAGTTGAACGCGAACG 777
consensus_10395#2      ------------------------------------------------------------
consensus_10395#1      CCAGCGGTGGGAAGAACAAATTAACGATTATTACCTTTTAGT------------------ 682
                                                                                   

consensus_10395#0      CCTGACGGAGGAAGCAAGAGATCAGTAAATTAAATACAA 816
consensus_10395#2      ---------------------------------------
consensus_10395#1      ---------------------------------------
                                                              




Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)