These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10565#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 45 consensus length = 1749 fasta sequence 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NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 667 fasta sequence [TGTCGATGCTACGCAGCTGCTCCGGCTGCTCCTCGAACAGGCGGCTCTGTACCGGTCCCGGGGCCAAGCCCACCACAAACCGGTCTATCAGCAGTGGCTCCAGCAGGCCCGCATCAAACTGGCACTCCATCGACAAGGCCTTGAGTCGGGCGTACCACTCCTTCACACCTTCACCACGCTGCTGCTCCGCCCGATAGAACAGGGCCCGATGGCGAAAGATCGCAATCTCCGGAATGTACTGGCGGGCCAGCACAGCGCACAGCTCCTCGTACGGCATGTCCTTCGGTGCGGTCGGGTGGCACAGACTTCGCAGCGTCCCGTACGTCGCCTTGCCAATCACACTGATCAGCACCGGTACGCGATCATCCCCGGTGATACCGTTCGCCCGGTAGAACTCGTCCAGAATCTCCCGGTACACGTTCCAGTCGTCCGTTTCGCCGTGAAATTCCGGCAGAATTGTTGGTGTCGTTGGTACCTTTGCCATCGTGCTTCGCCGCTGCTGGCAAACTTCTCGCTCGTTTTGACCCGTTGTTTCTCGAACTCTTCTCAGGCTCAGTTTAACAACGACAACCGTGTGTGAAGCAACAACTACTAGCGAGTCAACTTCAACCGAGAAGAGTTCGAGAAACTTCTCGCTCGTTTTGACCCGTTGCGGACGCGTGGGCGG] [-] EMBL BM649719 [TGTCGATGCTACGCAGCTGCTCCGGCTGCTCCTCGAACAGGCGGCTCTGTACCGGTCCCGGGGCCAAGCCCACCACAAACCGGTCTATCAGCAGTGGCTCCAGCAGGCCCGCATCAAACTGGCACTCCATCGACAAGGCCTTGAGTCGGGCGTACCACTCCTTCACACCTTCACCACGCTGCTGCTCCGCCCGATAGAACAGGGCCCGATGGCGAAAGATCGCAATCTCCGGAATGTACTGGCGGGCCAGCACAGCGCACAGCTCCTCGTACGGCATGTCCTTCGGTGCGGTCGGGTGGCACAGACTTCGCAGCGTCCCGTACGTCGCCTTGCCAATCACACTGATCAGCACCGGTACGCGATCATCCCCGGTGATACCGTTCGCCCGGTAGAACTCGTCCAGAATCTCCCGGTACACGTTCCAGTCGTCCGTTTCGCCGTGAAATTCCGGCAGAATTGTTGGTGTCGTTGGTACCTTTGCCATCGTGCTTCGCCGCTGCTGGCAAACTTCTCGCTCGTTTTGACCCGTTGTTTCTCGAACTCTTCTCAGGCTCAGTTTAACAACGACAACCGTGTGTGAAGCAACAACTACTAGCGAGTCAACTTCAACCGAGAAGAGTTCGAGAAACTTCTCGCTCGTTTTGACCCGTTGCGGACGCGTGGGCGG] [-] EMBL BM602334 [ CTGCTCCGCCCGATAGAACAGGGCCCGATGGCGAAAGATCGCAATCTCCGGAATGTACTGGCGGGCCAGCACAGCGCACAGCTCCTCGTACGGCATGTCCTTCGGTGCGGTCGGGTGGCACAGACTTCGCAGCGTCCCGTACGTCGCCTTGCCAATCACACTGATCAGCACCGGTACGCGATCATCCCCGGTGATACCGTTCGCCCGGTAGAACTCGTCCcgg ] consensusID : consensus_10565#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 570 fasta sequence [TTTTTTGTGGTGGGCTCTGTACCGGTCCCGGGGCCAAGCCCACCACAAA-CCGGTCTATCAGCAGGGGCTCCAGCAGGCCCGCATCAAACTGGCACTCCATCGACAAGGCCTTGAGTCGGGCGTACCACTCCTTCACACCTTCACCACGCTGCTGCTCTGCCCGATAGAACAGGGCCCGGTGGCGAAAGATTGCAATCTCCGGAATGTACTGGCGGGCCAACACAGCGCACAGCTCCTCGTACGGCATGTCCTTCGGTGCGGTCGGGTGGCACAGACTTCGCAACGTTCCGTAAGTGGCCTTGCCAATCACACTGATTAGCACCGGTACGCGATCAGTCCCGGTGATACCGTTCGCCCGGTAGAACTCGTCCAGAATCTCCCGGTACACGTTCCAGTCGTCCGTTTCGCCGTGAAACTCCGGCAGAATTGTTGGTGTCGTTGGTACCTTCGCCATCGTGCTTCGCCTTTGCTGGCAAACTGCTCGCTTCTTTCGCTCGTTTTGACCCGTTGTTTCTCGAACTCTTCTCGGTTGAAGTTGACTCGCTAGTAGTTGTTCGGACGCGTGGGCGG] [+] EMBL AGA281069 [TTTTTTGTGGTGGGCTCTGTACCGGTCCCGGGGCCAAGCCCACCACAAA CCGGTCTATCAGCAGGGGCTCCAGCAGGCCCGCATCAAACTGGCACTCCATCGACAAGGCCTTGAGTCGGGCGTACCACTCCTTCACACCTTCACCACGCTGCTGCTCTGCCCGATAGAACAGGGCCCGGTGGCGAAAGATTGCAATCTCCGGAATGTACTGGCGGGCCAACACAGCGCACAGCTCCTCGTACGGCATGTCCTTCGGTGCGGTCGGGTGGCACAGACTTCGCAACGTTCCGTAAGTGGCCTTGCCAATCACACTGATTAGCACCGGTACGCG ] [-] EMBL BM631206 [ TGTACCGGTCCCGGGGCCAAGCCCACCACAAACCCGGTCTATCAGCAGGGGCTCCAGCAGGCCCGCATCAAACTGGCACTCCATCGACAAGGCCTTGAGTCGGGCGTACCACTCCTTCACACCTTCACCACGCTGCTGCTCTGCCCGATAGAACAGGGCCCGGTGGCGAAAGATCGCAATCTCCGGAATGTACTGGCGGGCCAGCACAGCGCACAGCTCCTCGTACGGCATGTCCTTCGGTGCGGTCGGGTGGCACAGACTTCGCAGCGTTCCGTAAGTGGCCTTGCCAATCACACTGATCAGCACCGGTACGCGATCAGTCCCGGTGATACCGTTCGCCCGGTAGAACTCGTCCAGAATCTCCCGGTACACGTTCCAGTCGTCCGTTTCGCCGTGAAACTCCGGCAGAATTGTTGGTGTCGTTGGTACCTTCGCCATCGTGCTTCGCCTTTGCTGGCAAACTGCTCGCTTCTTTCGCTCGTTTTGACCCGTTGTTTCTCGAACTCTTCTCGGTTGAAGTTGACTCGCTAGTAGTTGTTCGGACGCGTGGGCGG] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_10565#0 CCATCCTTTTCTTTTATTTGTGTTTTTTTGTCGTTGGCTTATACATGTACCATTTTCATT 60 consensus_10565#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10565#1 ------------------------------------------------------------ consensus_10565#0 TTTATCTTTTTTTGGTGGATGGCTCGATTAGTAATAATAACCCATTAGTAATTACACCGG 120 consensus_10565#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10565#1 ------------------------------------------------------------ consensus_10565#0 TGTAATGTTGAGATTATTGTGATGTAAGCATAGAATAGAATTGGCTACACTGATCCTGTT 180 consensus_10565#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10565#1 ------------------------------------------------------------ consensus_10565#0 CCTCACTCGATCAGTTCGGGTTCCGTCGTAGGATCTGTGGGCGACACTTGTTCCGGATGC 240 consensus_10565#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10565#1 ------------------------------------------------------------ consensus_10565#0 TCGGGCGCTGTTGGTTCTTCCTCCGCCTGCTTGCGGTTCCGACGACAACGACCCTTCTTG 300 consensus_10565#2 ------------------------------------------------------------ consensus_10565#1 ------------------------------------------------------------ consensus_10565#0 CCACAGCGTTCCTCCTTGTTGCTCTCATCGTGATCGTGACGATGGTGGTGGTGATGATGA 360 consensus_10565#2 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Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||