These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_199#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 840 fasta sequence [CCGTCTAGATCGCGGGCCGCCCTTTTTTTTTATTTATAATTATTAATAAAAATAATTTTATTTTTTATAGTTTTAGTAATTTATAATGAAATAATAATTTTAATTATAGTGTATTAGTATTTTAAAAGAATATTGAAATAATTTGAAAAATTTTTAATTTTTAAGAAAATTTAATTTATTGTACCTTGTGTATCAGGGTTTATTAAATAATAAATTATTATAATAATTTTTCTCGAATTTTAAAGATTTAATTATATATAAAAGTTATTGTGGAATAACTATTTTAAATATGTAATTAGAAATGAAATGTTAATCGTTTTAAAATATATCTAGTTTTTTAAGAAATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTTAATTTTTTAATTTAATAATTAAATAAAGTAATATTTTAAGGGATGAGCTTTAAAAT-AAAATTTTATATTTTTTATAATTTTTAAATAAATATAAGCTTAAAAATAG-CTATTATTAATAAATTT-GTTATAATT-TA-TTTTTTATAAAAACTTATTTAA-TTTAAATTAAA-TTATTTATT-AAAATTTAAATTTTAA-TAAT-AAAAATTTACGCAACTTATGGACAAAATTAAGTATTATTAAATTTTTTTATAAAGCAACTTAATTTTGGAAAGGGTTTAATGGAAGAAATCCGCGCAAATTAAATATAATTCACCCTGGTTTTACCCCAAAACCAGGGCCCTTTTTTGGGATTTTTAATTTAAAGGGCCTAACCCTGGCCCCCCCGGGAGGTTTTTTAAAGGGACCCCGCGGGAATTTTTTGGCCCCGGGGCCAAAGGGGACCCCAAATCCCAAGGCCCCTTTTA] [+] EMBL BM655391 [CCGTCTAGATCGCGGGCCGCCCTTTTTTTTTATTTATAATTATTAATAAAAATAATTTTATTTTTTATAGTTTTAGTAATTTATAATGAAATAATAATTTTAATTATAGTGTATTAGTATTTTAAAAGAATATTGAAATAATTTGAAAAATTTTTAATTTTTAAGAAAATTTAATTTATTGTACCTTGTGTATCAGGGTTTATTAAATAATAAATTATTATAATAATTTTTCTCGAATTTTAAAGATTTAATTATATATAAAAGTTATTGTGGAATAACTATTTTAAATATGTAATTAGAAATGAAATGTTAATCGTTTTAAAATATATCTAGTTTTTTAAGAAATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTTAATTTTTTAATTTAATAATTAAATAAAGTAATATTTTAAGGGATGAGCTTTAAAAT AAAATTTTATATTTTTTATAATTTTTAAATAAATATAAGCTTAAAAATAG CTATTATTAATAAATTT GTTATAATT TA TTTTTTATAAAAACTTATTTAA TTTAAATTAAA TTATTTATT AAAATTTAAATTTTAA TAAT AAAAATTTA ] [+] EMBL BM657766 [ ccgTATTAATAAAAATAATTTTATTTTTTATAGTTTTAGTAATTTATAATGAAATAATAATTTTAATTATAGTGTATTAGTATTTTAAAAGAATATTGAAATAATTTGAAAAATTTTTAATTTTTAAGAAAATTTAATTTATTGTACCTTGTGTATCAGGGTTTATTAAATAATAAATTATTATAATAATTTTTCTCGAATTTTAAAGATTTAATTATATATAAAAGTTATTGTGGAATAACTATTTTAAATATGTAATTAGAAATGAAATGTTAATCGTTTTAAAATATATCTAGTTTTTTAAGAAATGAATTTAATTTAGCTTATTTATTTTATTAAGTTAATTTTTTAATTTAATAATTAGATAAAGTAATATTTTAAGGGATGAGCTTTAAAATAAAAATTTTATATTTTTTATAATTTTTAAATAAATATAAGCTTAAAAATAGCCTATTATTAATAAATTTGGTTATAATTCTATTTTTTTAAAAAAAATTATTTAATTTTAAATTAAATTTATTTATTAAAAATTTAAATTTTAACTAATAAAAAATTTACGCAACTTATGGACAAAATTAAGTATTATTAAATTTTTTTATAAAGCAACTTAATTTTGGAAAGGGTTTAATGGAAGAAATCCGCGCAAATTAAATATAATTCACCCTGGTTTTACCCCAAAACCAGGGCCCTTTTTTGGGATTTTTAATTTAAAGGGCCTAACCCTGGCCCCCCCGGGAGGTTTTTTAAAGGGACCCCGCGGGAATTTTTTGGCCCCGGGGCCAAAGGGGACCCCAAATCCCAAGGCCCCTTTTA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||