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Anopheles gambiae
cluster # 2112 cluster # 2112       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2112#0 length = 931 sequences # 2  

consensusID : consensus_2112#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 931
fasta sequence
                              [TCATGGTGATCATTACTAAAAAATAAAGGCACAGCAGTAAAATAAAAGCGCATCAAAACACTACCCAAATAGCATTACATCACATGTAAGACCCTCTCGGCGTTTAACGACTTACCTCGGTCGCTTCGTCTCCTGTTTTGTTGGTTGCTTTTGATAACAAACGTAATGCGCATAATTTCTTGCCCAACTAATTTCGCGTGTGTCAATTGCCAGTGAAAATCAACACTGCTGCTGTACCTTTTCTTTCACTTTATGATTTTGTTTTTTTAAATTGATGTTGCAAAAAATGCATATCGCTGCGGATAACGCTATTGTTGTATATCGGTACACTATTCCCGTAGCTTAACCTTGTGACGGATTGTCGGTGAATGATGTTAGAAAGAGCATCGGTGAGCCTGAGACTATAACGGTACGCGGTACCGGCCGCATTGATTACGCGGGAGTGTTACGCTTCGAATAACAAAACCGCTTACTGCTTGTGATGAAAACACTTCACGCGTGTGACGGACGGCAATAGCGCATTGAGAAACGAGCACAATATATTCAATTTTTTATGCTTGTGTTATCTCTTGTTTAGTCGATGATTTTACGTCACCCATGGTAACGTATCACCATGGTACGACGATATTAGGTTGTGTATAAAGTAAGTCAGTGAGCAGCTCGTTCGCACATACGTGTAACATACGATTGAATTCTCCGCGAGAATGGATGAGCGATTGCGGATGGCAAATGATCTATACACTTCAGTTTGCAGTTTTGTTTAGACGTTCGAAGAAGCCCCAGCCGTTTCGTTAGCTGCATGGCAAAACGTGCTAATTTTCATTATAAACTGTTTG-TGCACACTACTAGCACATTATGC-TCGTTCAAATAACGAACCCTTTAAATTGTGTTAATTTGTCTCCCAGTAGGCCAACAGTTCTCGAGGGATTCC]

[-] EMBL CNS09H18             [TCATGGTGATCATTACTAAAAAATAAAGGCACAGCAGTAAAATAAAAGCGCATCAAAACACTACCCAAATAGCATTACATCACATGTAAGACCCTCTCGGCGTTTAACGACTTACCTCGGTCGCTTCGTCTCCTGTTTTGTTGGTTGCTTTTGATAACAAACGTAATGCGCATAATTTCTTGCCCAACTAATTTCGCGTGTGTCAATTGCCAGTGAAAATCAACACTGCTGCTGTACCTTTTCTTTCACTTTATGATTTTGTTTTTTTAAATTGATGTTGCAAAAAATGCATATCGCTGCGGATAACGCTATTGTTGTATATCGGTACACTATTCCCGTAGCTTAACCTTGTGACGGATTGTCGGTGAATGATGTTAGAAAGAGCATCGGTGAGCCTGAGACTATAACGGTACGCGGTACCGGCCGCATTGATTACGCGGGAGTGTTACGCTTCGAATAACAAAACCGCTTACTGCTTGTGATGAAAACACTTCACGCGTGTGACGGACGGCAATAGCGCATTGAGAAACGAGCACAATATATTCAATTTTTTATGCTTGTGTTATCTCTTGTTTAGTCGATGATTTTACGTCACCCATGGTAACGTATCACCATGGTACGACGATATTAGGTTGTGTATAAAGTAAGTCAGTGAGCAGCTCGTTCGCACATACGTGTAACATACGATTGAATTCTCCGCGAGAATGGATGAGCGATTGCGGATGGCAAATGATCTATACACTTCAGTTTGCAGTTTTGTTTAGACGTTCGAAGAAGCCCCAGCCGTTTCGTTAGCTGCATGGCAAAACGTGCTAATTTTCATTATAAACTGTTTG TGCACACTACTAGCACATTATGC TCGTTCAAATAACGAACCCTTT                                                  ]
[+] EMBL CNS09H19             [                   AAAATAAAGGCACAGCAGTAAAATAAAAGCGCATCAAAACACTACCCAAATAGCATTACATCACATGTAAGACCCTCTCGGCGTTTAACGACTTACCTCGGTCGCTTCGTCTCCTGTTTTGTTGGTTGCTTTTGATAACAAACGTAATGCGCATAATTTCTTGCCCAACTAATTTCGCGTGTTTCAATTGCCAGTGAAAATCAACACTGCTGCTGTACCTTTTCTTTCACTTTATGATTTTGTTTTTTTAAATTGATGTTGCAAAAAATGCATATCGCTGCGGATAACGCTATTGTTGTATATCGGTACACTATTCCCGTAGCTTAACCTTGTGACGGATTGTCGGTGAATGATGTTAGAAAGAGCATCGGTGAGCCTGAGACTATAACGGTACGCGGTACCGGCCGCATTGATTACGCGGGAGTATTACGCTTCGAATAACAAAACCGCTTACTGCTTGTGATGAAAACACTTCACGCGTGTAACGGACGGCAATAGCGCATTGAGAAACGAGCACAATATATTCAATTTTTTATGCTTGTGTTATCTCTTGTTTAGTCGATGATTTTACGTCACCCATGGTAACGTATCACCATGGTACGACGATATTAGGTTGTGTATAAAGTAAGTCAGTCAGCAGCTCGTTCGCACATACGTGTAACATACGATTGAATTCTCCGCGAGAATGGATGAGCGATTGCGGATGGCAAATGATCTATACACTTCAGTTTGCAGTTTTGTTTAGACGTTCGAAGAAGCCCCAGCCGTTTCGTTAGCTGCATGGCAAAACGTGCTAATTTTCATTATAAACTGTTTGTTGCACACTACTAGCACATTATGCTTCGTTCAAATAACGAACCCTTTAAATTGTGTTAATTTGTCTCCCAGTAGGCCAACAGTTCTCGAGGGATTCC]


>consensus_2112#0 TCATGGTGATCATTACTAAAAAATAAAGGCACAGCAGTAAAATAAAAGCGCATCAAAACA CTACCCAAATAGCATTACATCACATGTAAGACCCTCTCGGCGTTTAACGACTTACCTCGG TCGCTTCGTCTCCTGTTTTGTTGGTTGCTTTTGATAACAAACGTAATGCGCATAATTTCT TGCCCAACTAATTTCGCGTGTGTCAATTGCCAGTGAAAATCAACACTGCTGCTGTACCTT TTCTTTCACTTTATGATTTTGTTTTTTTAAATTGATGTTGCAAAAAATGCATATCGCTGC GGATAACGCTATTGTTGTATATCGGTACACTATTCCCGTAGCTTAACCTTGTGACGGATT GTCGGTGAATGATGTTAGAAAGAGCATCGGTGAGCCTGAGACTATAACGGTACGCGGTAC CGGCCGCATTGATTACGCGGGAGTGTTACGCTTCGAATAACAAAACCGCTTACTGCTTGT GATGAAAACACTTCACGCGTGTGACGGACGGCAATAGCGCATTGAGAAACGAGCACAATA TATTCAATTTTTTATGCTTGTGTTATCTCTTGTTTAGTCGATGATTTTACGTCACCCATG GTAACGTATCACCATGGTACGACGATATTAGGTTGTGTATAAAGTAAGTCAGTGAGCAGC TCGTTCGCACATACGTGTAACATACGATTGAATTCTCCGCGAGAATGGATGAGCGATTGC GGATGGCAAATGATCTATACACTTCAGTTTGCAGTTTTGTTTAGACGTTCGAAGAAGCCC CAGCCGTTTCGTTAGCTGCATGGCAAAACGTGCTAATTTTCATTATAAACTGTTTGTGCA CACTACTAGCACATTATGCTCGTTCAAATAACGAACCCTTTAAATTGTGTTAATTTGTCT CCCAGTAGGCCAACAGTTCTCGAGGGATTCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)