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Anopheles gambiae
cluster # 2212 cluster # 2212       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2212#0 length = 857 sequences # 2  

consensusID : consensus_2212#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 857
fasta sequence
                              [TCTTTTGTCGATCATTTTCGGCGTCAAGCTGTCGACGCTGTACCAAAAGTCGGATCCCTACCCGGGCCCGATGGTGGAATCGTAAGTGCCAAATGATAGTTCTTCTCTCCCTTTCCACACCCCTCTAGCTTACAGTAGTGATTCCAGCAGCCACCCCTGAACAACTGCATGGCTTAAGTAGATCTCCAAAAAGTATAGTTAAACATTGCGCTTGCATGCGTGTATGTATGTACTAAAACGTGTCGACGTTTTACTGTAGTTTAGTGATCATTGCACGAGATTAGTTTGTGCGGAGTATTAGACTGTGCTGCTGCATGCCGATCGCTTTATAACGAGCTTCCCACTGTAACAGTATTAAAATGTGACCGGCAGGGTATTCGGATTCCACTTAAGCTTTAAGATTTGCTTTTTAGTTTTTAAAAATTCCTTCCGGGCAGCACG-GAGCGTAATTCATGGTTTAAGTTTATTTTATGCAAAATATTAACATTAAGCTTTTAGCGAATTTTGTGAAATTGGCAAGTTTGAATGGGTATATGCTGTTTTTTCTTTGGTGGAATGTATACATTAGCTGGTAATGGCAGCTGTTACTATTTAAAGAGATTTTCCTATGTTACATACGGTTATGTTTTTGCAATTATTTAATAAATCCACTGTACATCGAATGCACTACTTAAGTTATTTGGTTATGCTAGCAAGTTGTAAATATGCAAACTCCTTTCTGTTGACCCTAATAATACTGTAAAACTCAATTTAACCTTAATTTAGCCTAGGTTAGTGTAGAGACTGCAATCAGTTTAATAAAAAAAAAAACGTTTCCAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACATGTGCTCGGGCTTGGGGT]

[+] EMBL CNS09L26             [TCTTTTGTCGATCATTTTCGGCGTCAAGCTGTCGACGCTGTACCAAAAGTCGGATCCCTACCCGGGCCCGATGGTGGAATCGTAAGTGCCAAATGATAGTTCTTCTCTCCCTTTCCACACCCCTCTAGCTTACAGTAGTGATTCCAGCAGCCACCCCTGAACAACTGCATGGCTTAAGTAGATCTCCAAAAAGTATAGTTAAACATTGCGCTTGCATGCGTGTATGTATGTACTAAAACGTGTCGACGTTTTACTGTAGTTTAGTGATCATTGCACGAGATTAGTTTGTGCGGAGTATTAGACTGTGCTGCTGCATGCCGATCGCTTTATAACGAGCTTCCCACTGTAACAGTATTAAAATGTGACCGGCAGGGTATTCGGATTCCACTTAAGCTTTAAGATTTGCTTTTTAGTTTTTAAAAATTCCTTCCGGGCAGCACG GAGCGTAATTCATGGTTTAAGTTTATTTTATGCAAAATATTAACATTAAGCTTTTAGCGAATTTTGTGAAATTGGCAAGTTTGAATGGGTATATGCTGTTTTTTCTTTGGTGGAATGTATACATTAGCTGGTAATGGCAGCTGTTACTATTTAAAGAGATTTTCCTATGTTACATACGGTTATGTTTTTGCAATTATTTAATAAATCCACTGTACATCGAATGCACTACTTAAGTTATTTGGTTATGCTAGCAAGTTGTAAATATGCAAACTCCTTTCTGTTGACCCTAATAATACTGTAAAACTCAATTTAACCTTAATTTAGCCTAGGTTAGTGTAGAGACTGCAATCAGTTTAATAAAAAAAAAAACGTTTCCAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACATGTGCTCGGGCTTGGGGT]
[-] EMBL CNS09L27             [                                                                                                                                             TTCCAGCAGCCACCCCTGAACAACTGCATGGCTTAAGTAGATCTCCAAAAAGTATAGTTAAACATTGCGCTTGCATGCGTGTATGTATGTACTAAAACGTGTCGACGTTTTACTGTAGTTTAGTGATCATTGCACGAGATTAGTTTGTGCGGAGTATTAGACTGTGCTGCTGCATGCCGATCGCTTTATAACGAGCTTCCCACTGTAACAGTATTAAAATGTGACCGGCAGGGTATTCGGATTCCACTTAAGCTTTAAGATTTGCTTTTTAGTTTTTAAAAATTCCTTCCGGGCAGCACGCGAGCGTAATTCATGGTTTAAGTTTATTTTATGCAAAATATTAACATTAAGCTTTTAGCGAATTTTGTGAAATTGGCAAGTTTGAATGGGTATATGCTGTTTTTTCTTTGGTGGAATGTATACATTAGCTGGTAATGGCAGCTGTTACTATTTAAAGAGATTTTCCTATGTTACATACGGTTATGTTTTTGCAATTATTTAATAAATCCACTGTACATCGAATGCACTACTTAAGTTA TTGGTTATGCTAGCAAGTTGTAAATATGCAAACTCCTTTCTGTTGACCCTAATAATACTGTAAAACTCAATTTAACCTTAATTTAGCCTAGGTTAGTGTAGAGACTGCAATCAGTTTAATAAAAAAAAAAAC                                              ]


>consensus_2212#0 TCTTTTGTCGATCATTTTCGGCGTCAAGCTGTCGACGCTGTACCAAAAGTCGGATCCCTA CCCGGGCCCGATGGTGGAATCGTAAGTGCCAAATGATAGTTCTTCTCTCCCTTTCCACAC CCCTCTAGCTTACAGTAGTGATTCCAGCAGCCACCCCTGAACAACTGCATGGCTTAAGTA GATCTCCAAAAAGTATAGTTAAACATTGCGCTTGCATGCGTGTATGTATGTACTAAAACG TGTCGACGTTTTACTGTAGTTTAGTGATCATTGCACGAGATTAGTTTGTGCGGAGTATTA GACTGTGCTGCTGCATGCCGATCGCTTTATAACGAGCTTCCCACTGTAACAGTATTAAAA TGTGACCGGCAGGGTATTCGGATTCCACTTAAGCTTTAAGATTTGCTTTTTAGTTTTTAA AAATTCCTTCCGGGCAGCACGGAGCGTAATTCATGGTTTAAGTTTATTTTATGCAAAATA TTAACATTAAGCTTTTAGCGAATTTTGTGAAATTGGCAAGTTTGAATGGGTATATGCTGT TTTTTCTTTGGTGGAATGTATACATTAGCTGGTAATGGCAGCTGTTACTATTTAAAGAGA TTTTCCTATGTTACATACGGTTATGTTTTTGCAATTATTTAATAAATCCACTGTACATCG AATGCACTACTTAAGTTATTTGGTTATGCTAGCAAGTTGTAAATATGCAAACTCCTTTCT GTTGACCCTAATAATACTGTAAAACTCAATTTAACCTTAATTTAGCCTAGGTTAGTGTAG AGACTGCAATCAGTTTAATAAAAAAAAAAACGTTTCCAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACAT GTGCTCGGGCTTGGGGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)