Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Anopheles gambiae
cluster # 2620 cluster # 2620       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2620#0 length = 989 sequences # 2  

consensusID : consensus_2620#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 989
fasta sequence
                              [CCGGATTTTTGTGTGTGTGTTAAATTGCCCTATTTTTTGTTAAATCTGTACTTGAGCTACAATTGATGTGCAGGAAAGAGATAGTTATCAATAGAATTAGCTCTGCAAATTCGATTCAACCATGTTTAGACAGGCCTTGGACAGGGGAAAACAAGCGCATGGAAATTTCCACTATGTGGGTTTATCCGTCGTTATCTCCAGTGTTTTTGTTTTGTCTATTGCGGTGAGGTTCCGTCCATTTGTTTACCGTTATCTTTTTCTTCTTTGCACATCCTTTCCGGTTTTCTTACACGTCCGAAACTCCTTATCGTCATATTTATAGGTCCTATCCGGACCCCTTTTTCCCTGGACAAGAACGAAGAAGAAATCTGTATAAGGAGGGTTTGGCCACGTAGGTCGTTATGACAAGCAAGCGAAGATTTTTTTGTTGTAAATAACGGTTTAATTTTAATATTTAAATGTAAATTAGTTTTGATGTATTTGAGACTCTAACATACCGACATGTTTACTCATTGCTGCATTACTTCTGCCAAAGAAAGAGTGAATATTAACCCAATTGTATAATCTATCTCACTCGGAAACCTTACGGCTAACTGTTTTTACACTTGCTGCA-TTATTC-CTAACTCAGTCATTAAGAGTTAATAATGAGGGTATAACTGCA-AACT-AATC-TTCTTTTTTTTGTTGGTACTAATTATTGACAAACCTAGTTTGATTTCACCGTATAACCTCTTTCATTGTTGGCCTTTACATGCGATCACCACACAAAGAACCTGGAAGGTATTCGTTCATATATCGGAGCTATTCATCCTGGTGCCATCGTTACTGGGATAAAGGGTAACCTGGACATGTGTCTTGCGTCGCGCCTCTCGACACAGGCGAACCTGGGCAACATGTCCGGGCGGCGTGAGATCTTCCAAATGGTGCTCGGCAACATCGCGCTGGTGCAGGTGCAGGCAACGGTTGCGTCCTTCATCGCCTNGGCCGATTCT]

[+] EMBL BM630821             [CCGGATTTTTGTGTGTGTGTTAAATTGCCCTATTTTTTGTTAAATCTGTACTTGAGCTACAATTGATGTGCAGGAAAGAGATAGTTATCAATAGAATTAGCTCTGCAAATTCGATTCAACCATGTTTAGACAGGCCTTGGACAGGGGAAAACAAGCGCATGGAAATTTCCACTATGTGGGTTTATCCGTCGTTATCTCCAGTGTTTTTGTTTTGTCTATTGCGGTGAGGTTCCGTCCATTTGTTTACCGTTATCTTTTTCTTCTTTGCACATCCTTTCCGGTTTTCTTACACGTCCGAAACTCCTTATCGTCATATTTATAGGTCCTATCCGGACCCCTTTTTCCCTGGACAAGAACGAAGAAGAAATCTGTATAAGGAGGGTTTGGCCACGTAGGTCGTTATGACAAGCAAGCGAAGATTTTTTTGTTGTAAATAACGGTTTAATTTTAATATTTAAATGTAAATTAGTTTTGATGTATTTGAGACTCTAACATACCGACATGTTTACTCATTGCTGCATTACTTCTGCCAAAGAAAGAGTGAATATTAACCCAATTGTATAATCTATCTCACTCGGAAACCTTACGGCTAACTGTTTTTACACTTGCTGCA TTATTC CTAACTCAGTCATTAAGAGTTAATAATGAGGGTATAACTGCA AACT AATC TTCTTTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL AL934605             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   agTTTAAATGTAAATTAGTTTTGATGTATTTGAGACTCTAACATACCGACATGTTTACTCATTGCTGCATTACTTCTGCCAAAGAAAGAGTGAATATTAACCCAATTGTATAATCTATCTCACTCGGAAACCTTACGGCTAACTGTTTTTACACTTGCTGCAGTTATTCGCTAACTCAGTCATTAAGAGTTAATAATGAGGGTATAACTGCAGAACTGAATCGTTCGTTTTTTTGTTGGTACTAATTATTGACAAACCTAGTTTGATTTCACCGTATAACCTCTTTCATTGTTGGCCTTTACATGCGATCACCACACAAAGAACCTGGAAGGTATTCGTTCATATATCGGAGCTATTCATCCTGGTGCCATCGTTACTGGGATAAAGGGTAACCTGGACATGTGTCTTGCGTCGCGCCTCTCGACACAGGCGAACCTGGGCAACATGTCCGGGCGGCGTGAGATCTTCCAAATGGTGCTCGGCAACATCGCGCTGGTGCAGGTGCAGGCAACGGTTGCGTCCTTCATCGCCTNGGCCGATTCT]


>consensus_2620#0 CCGGATTTTTGTGTGTGTGTTAAATTGCCCTATTTTTTGTTAAATCTGTACTTGAGCTAC AATTGATGTGCAGGAAAGAGATAGTTATCAATAGAATTAGCTCTGCAAATTCGATTCAAC CATGTTTAGACAGGCCTTGGACAGGGGAAAACAAGCGCATGGAAATTTCCACTATGTGGG TTTATCCGTCGTTATCTCCAGTGTTTTTGTTTTGTCTATTGCGGTGAGGTTCCGTCCATT TGTTTACCGTTATCTTTTTCTTCTTTGCACATCCTTTCCGGTTTTCTTACACGTCCGAAA CTCCTTATCGTCATATTTATAGGTCCTATCCGGACCCCTTTTTCCCTGGACAAGAACGAA GAAGAAATCTGTATAAGGAGGGTTTGGCCACGTAGGTCGTTATGACAAGCAAGCGAAGAT TTTTTTGTTGTAAATAACGGTTTAATTTTAATATTTAAATGTAAATTAGTTTTGATGTAT TTGAGACTCTAACATACCGACATGTTTACTCATTGCTGCATTACTTCTGCCAAAGAAAGA GTGAATATTAACCCAATTGTATAATCTATCTCACTCGGAAACCTTACGGCTAACTGTTTT TACACTTGCTGCATTATTCCTAACTCAGTCATTAAGAGTTAATAATGAGGGTATAACTGC AAACTAATCTTCTTTTTTTTGTTGGTACTAATTATTGACAAACCTAGTTTGATTTCACCG TATAACCTCTTTCATTGTTGGCCTTTACATGCGATCACCACACAAAGAACCTGGAAGGTA TTCGTTCATATATCGGAGCTATTCATCCTGGTGCCATCGTTACTGGGATAAAGGGTAACC TGGACATGTGTCTTGCGTCGCGCCTCTCGACACAGGCGAACCTGGGCAACATGTCCGGGC GGCGTGAGATCTTCCAAATGGTGCTCGGCAACATCGCGCTGGTGCAGGTGCAGGCAACGG TTGCGTCCTTCATCGCCTNGGCCGATTCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)