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Anopheles gambiae
cluster # 3339 cluster # 3339       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3339#0 length = 1770 sequences # 3  

consensusID : consensus_3339#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1770
fasta sequence
                              [CCGGTAGGGGCTTACAAAATAAGTTGGTGCAATAGATACAGCCGGAAAGAAGCCGGAATGCTGCATTGAGGTTACTAGGGATATATGTTGAGTTGCTTATATGTAAAAAAAAATATCTAATGCTGATTCAAAACCAGTGAAAGATTGTTTCCTCTTTCACGCGTCCAAGCGTTTGCATGCTGCTCATGTTAGTAATAAACGTCGCCAGCGCGTTTTAACCATGTTTTTGTCAACTCTTTGTTGATGGTTGATTTCATTACATCTCTCTCTCTCTTTATATCTAAAGGTTTTGGTGATATATTTTGCTAGTTAATTGTTAGATGCATACGCGCTTGTGCGCTAAGCTCTCCATGTTGTATGCGTGCACCATTTGCTGTAGCTTGTTATGTACATTTTCATTGTCATTTAGCTCGTATTTGTGTTAAAAAAAAGTGCTATAAGCGATAAAGAACATCCATCAAACATAGTTTTACCCATACAAGAGCTAGTGCAGTAAGGCAAAGATAGTAAAGTCACGGTGAATCTCTTGTGAAAAAAATACGAGAAAACGGAACGATATGGCAAGAGTTTTAAATGGTTTTAGTTAGAATTTAACATTGCACGTTACAAAAATACTCTCGTAGTTATTTAATTTGTTTCGTTTGTACTTTGTTAATGCCTTAATTATTCAACCGAATGTTCTGCAGGAGGGGGGAGTGGAGGTGTAGGATAATCGTTTTTATTGAGTGGCATCAACAGCTCTTCGTTGTGTGCGTTTGGGTAGGCAAATGACAAATTCGCCACCGTGTGTTACCATTGCGTGAGAATGACGGAGTAAAGTAATGTTAGATTTTTTGTTTGTCTATTCTACGGTTTAATTTAGAACACGTTTATCGCTCCAATCTTTTGAGCGCATTAGAAAACGGCCCGAAACGAATGCGAAAGAATGCAAAATGGTACATTGCGCTGTACTACTGCTGCGGAGATGGTACGGTGGAAACACATCCAAATAGTTCCGATGCTGCCACTCAAACGAACTGAAATGTAGTAAAAC-AAAAACCACGTAGTCATATTTAGATGAACATAGTAGAAAGGTAGCGATTGGAGCACCACACCATGGAAATGAAGGCGCACGAAGAAGGTGCACGAAAAGAACGAGTGATGAAGGGTACGGAGTGAATGAACGAAACGATTTTTGTGTTAGTTTTGGTTTTAGCATAACCAGTGTGTATGTGTGTGTGTGGACACGGTGCTTAGTAGTGTAGGGGAGCAAATTTTTAATGTACGAACGAGCGACGACGAAGCAAACGAATGTGATGTGTTGTTTAGGAGGTGGTGCACCATGGGAAATGGTATGTATGAGATTAAATCGAGCTCTAGTTGGGTAGTCGTTAGGGGCTAAGAGGATGGGATGGTATGGTATAGACGTTTCTGTTCTTCTGTTTCTTCCTTGCAAGTGTATCACACAATCTGATGTGATTTAAGTATTAGGACGGTGTAACCAATAGTCAAACAAGAACGAAACATGGACGAATCATAACGATGGACTTTCTTCGCATGGAGCGCTATTTGTGTGCTGGATGTGAAATGAAGCGAAACAGCTACTCAAAATAATCAAATATACGTGCAATCACATTAATTCAAAAAAGGTACATATAAACAATGTTTAAAATTTATGCCACATACCATTAGAAGAGCAGCTGTGTGTTAAGTTGAATCGGTTGCAACCTTTTTTAAAAAAAAGCAGAAGTGTTATCAGTGGCATGGAACAAACAATAGACAAACAACTGG]

[+] EMBL BM622852             [CCGGTAGGGGCTTACAAAATAAGTTGGTGCAATAGATACAGCCGGAAAGAAGCCGGAATGCTGCATTGAGGTTACTAGGGATATATGTTGAGTTGCTTATATGTAAAAAAAAATATCTAATGCTGATTCAAAACCAGTGAAAGATTGTTTCCTCTTTCACGCGTCCAAGCGTTTGCATGCTGCTCATGTTAGTAATAAACGTCGCCAGCGCGTTTTAACCATGTTTTTGTCAACTCTTTGTTGATGGTTGATTTCATTACATCTCTCTCTCTCTTTATATCTAAAGGTTTTGGTGATATATTTTGCTAGTTAATTGTTAGATGCATACGCGCTTGTGCGCTAAGCTCTCCATGTTGTATGCGTGCACCATTTGCTGTAGCTTGTTATGTACATTTTCATTGTCATTTAGCTCGTATTTGTGTTAAAAAAAAGTGCTATAAGCGATAAAGAACATCCATCAAACATAGTTTTACCCATACAAGAGCTAGTGCAGTAAGGCAAAGATAGTAAAGTCACGGTGAATCTCTTGTGAAAAAAATACGAGAAAACGGAACGATATGGCAAGAGTTTTAAATGGTTTTAGTTAGAATTTAACATTGCACGTTACAAAAATACTCTCGTAGTTATTTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BM634680             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ACCAGAAAACGGAACGACATGGCAAGAGTTTTAAATGGTTTTAGTTAGAATTTAACATTGCACGTGACGAAAATACTCTCGTAGTTATTTAATTTGTTTCGTTTGTACTTTGTTAATGCCTTAATTATTCAACCGAATGTTCTGCAGGAGGGGGGAGTGGAGGTGTAGGATAATCGTTTTTATTGAGTGGCATCAACAGCTCTTCGTTGTGTGCGTTTGGGTAGGCAAATGACAAATTCGCCACCGTGTGTTACCATTGCGTGAGAATGACGGAGTAAAGTAATGTTAGATTTTTTGTTTGTCTATTCTACGGTTTAATTTAGAACACGTTTATCGCTCCAATCTTTTGAGCGCATTAGAAAACGGCCCGAAACGAATGCGAAAGAATGCAAAATGGTACATTGCGCTGTACTACTGCTGCGGAGATGGTACGGTGGAAACACATCCAAATAGTTCCGATGCTGCCACTCAAACGAACTGAAATGTAGTAAAAC AAAAACCACGTAGTCATATTTAGATGAACATAGTAGAAAGGTAGCGATTGGAGCACCACACCATGGAAATGAAGGCGCACGAAGAAGGTGCACGAAAAGAACGAGTGATGAAGGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BX608713             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CAAACGAACTGAAATGTAATAAAACAAAAAAAAACGTAGTCATATTTAGATGAACATAGTAGAAAGGTAGCGATAGGAGCACCACACCATGGAAATGAAGGCGCAC   GAAGGTGCACGAAAAGAACGAGTGTTGAAGCGCACGGAGTGAATGAACGAAACGATTTTTGTGTTAGTTTTGGTTTTAGCATAACCAGTGTGTATGTGTGTGTGTGGACACGGTGCTTAGTAGTGTAGGGGAGCAAATTTTTAATGTACGAACGAGCGACGACGAAGCAAACGAATGTGATGTGTTGTTTAGGAGGTGGTGCACCATGGGAAATGGTATGTATGAGATTAAATCGAGCTCTAGTTGGGTAGTCGTTAGGGGCTAAGAGGATGGGATGGTATGGTATAGACGTTTCTGTTCTTCTGTTTCTTCCTTGCAAGTGTATCACACAATCTGATGTGATTTAAGTATTAGGACGGTGTAACCAATAGTCAAACAAGAACGAAACATGGACGAATCATAACGATGGACTTTCTTCGCATGGAGCGCTATTTGTGTGCTGGATGTGAAATGAAGCGAAACAGCTACTCAAAATAATCAAATATACGTGCAATCACATTAATTCAAAAAAGGTACATATAAACAATGTTTAAAATTTATGCCACATACCATTAGAAGAGCAGCTGTGTGTTAAGTTGAATCGGTTGCAACCTTTTTTAAAAAAAAGCAGAAGTGTTATCAGTGGCATGGAACAAACAATAGACAAACAACTGG]


>consensus_3339#0 CCGGTAGGGGCTTACAAAATAAGTTGGTGCAATAGATACAGCCGGAAAGAAGCCGGAATG CTGCATTGAGGTTACTAGGGATATATGTTGAGTTGCTTATATGTAAAAAAAAATATCTAA TGCTGATTCAAAACCAGTGAAAGATTGTTTCCTCTTTCACGCGTCCAAGCGTTTGCATGC TGCTCATGTTAGTAATAAACGTCGCCAGCGCGTTTTAACCATGTTTTTGTCAACTCTTTG TTGATGGTTGATTTCATTACATCTCTCTCTCTCTTTATATCTAAAGGTTTTGGTGATATA TTTTGCTAGTTAATTGTTAGATGCATACGCGCTTGTGCGCTAAGCTCTCCATGTTGTATG CGTGCACCATTTGCTGTAGCTTGTTATGTACATTTTCATTGTCATTTAGCTCGTATTTGT GTTAAAAAAAAGTGCTATAAGCGATAAAGAACATCCATCAAACATAGTTTTACCCATACA AGAGCTAGTGCAGTAAGGCAAAGATAGTAAAGTCACGGTGAATCTCTTGTGAAAAAAATA CGAGAAAACGGAACGATATGGCAAGAGTTTTAAATGGTTTTAGTTAGAATTTAACATTGC ACGTTACAAAAATACTCTCGTAGTTATTTAATTTGTTTCGTTTGTACTTTGTTAATGCCT TAATTATTCAACCGAATGTTCTGCAGGAGGGGGGAGTGGAGGTGTAGGATAATCGTTTTT ATTGAGTGGCATCAACAGCTCTTCGTTGTGTGCGTTTGGGTAGGCAAATGACAAATTCGC CACCGTGTGTTACCATTGCGTGAGAATGACGGAGTAAAGTAATGTTAGATTTTTTGTTTG TCTATTCTACGGTTTAATTTAGAACACGTTTATCGCTCCAATCTTTTGAGCGCATTAGAA AACGGCCCGAAACGAATGCGAAAGAATGCAAAATGGTACATTGCGCTGTACTACTGCTGC GGAGATGGTACGGTGGAAACACATCCAAATAGTTCCGATGCTGCCACTCAAACGAACTGA AATGTAGTAAAACAAAAACCACGTAGTCATATTTAGATGAACATAGTAGAAAGGTAGCGA TTGGAGCACCACACCATGGAAATGAAGGCGCACGAAGAAGGTGCACGAAAAGAACGAGTG ATGAAGGGTACGGAGTGAATGAACGAAACGATTTTTGTGTTAGTTTTGGTTTTAGCATAA CCAGTGTGTATGTGTGTGTGTGGACACGGTGCTTAGTAGTGTAGGGGAGCAAATTTTTAA TGTACGAACGAGCGACGACGAAGCAAACGAATGTGATGTGTTGTTTAGGAGGTGGTGCAC CATGGGAAATGGTATGTATGAGATTAAATCGAGCTCTAGTTGGGTAGTCGTTAGGGGCTA AGAGGATGGGATGGTATGGTATAGACGTTTCTGTTCTTCTGTTTCTTCCTTGCAAGTGTA TCACACAATCTGATGTGATTTAAGTATTAGGACGGTGTAACCAATAGTCAAACAAGAACG AAACATGGACGAATCATAACGATGGACTTTCTTCGCATGGAGCGCTATTTGTGTGCTGGA TGTGAAATGAAGCGAAACAGCTACTCAAAATAATCAAATATACGTGCAATCACATTAATT CAAAAAAGGTACATATAAACAATGTTTAAAATTTATGCCACATACCATTAGAAGAGCAGC TGTGTGTTAAGTTGAATCGGTTGCAACCTTTTTTAAAAAAAAGCAGAAGTGTTATCAGTG GCATGGAACAAACAATAGACAAACAACTGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)