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Anopheles gambiae
cluster # 3447 cluster # 3447       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3447#0 length = 1153 sequences # 3  

consensusID : consensus_3447#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1153
fasta sequence
                              [CGCTATTATCTCCCTTTCTTTCCGCACGGTATTTCTATTTTTGAACCTTTTTTATGGGGGGGGAGAGAAAGTCCACCCTTTAACCACAAAATACTGCACAGTTTGTTGTTCGGGTTTGTGCGCTCTCGAACGAAGCATCTCCCCCTTCGTTGTTGCGTATTCCCCGACATTCCTGCAAACTAAAAATGTATCTCTTTCGTTTCCTCTTTTCACACATTAAAGTGGCTCCTTGTGAAATGTCCTAACAACCCCCGCTCAATCCATCCACCCTTCTTACCCTTTGCTGTACTGTCACTGTAATTTTATAAGTTGAACAGAGTGAACCATTACAATTAAAACATTGAAAGCAAGCAAAACTGATTAGCATTGTAATGATTGAGGTAAAGAGCACAGAGATAACGTGTTCCGCACGATATACCAGAAAGCGACTCGCGACGAGACAGCAACAAAAAAAACAACAACTAGAAGTCTTTTAGAAACGTTAAACCATGAAAATACATAACTACTAGCAATTGTGAATGCGCGCATTAATTAAAACAAAAAAAACGCTGCTAAAATAAATTATTAACAGGACACAGTTGCGCGCTTGGGAGATATTATTATAGCCGGAGGTGAACCCGGAAGTAATACACAAAGGTGTTATAAATTATAAAGACTAATTATTATTGTACCGCTAATAATTATTTGTT--ATTATTATTCTTTTTTTTTATTTTCACCCTAATTTCACTCACCCTATCTCTCCCTCGCCCGTATTGTTTTGCCTTGAGCGCGATATCGCCGATCGCAGAAGATGGGGGTGGGAGGGTGGAATCTGAAAGTCGTTATCAATCTACTGACGGTTAAAGTAATCTTCTCTAGTTCGAACGTCATAAACACACGTTCAAGTAATATTATGATTAATAATTATTATAATTACACTCCCGCAACGTTGTCGTTAGTTGCAGCTGACCATCCCTTCCAAAAAAACGGCAAACGAATCGATATAACACTCACACACACTACCCATATTAGTAACATTATTTTGTAATGTTTTTTTTGAACTGTAAAATATTTGCTTACGTATTAATGATTTGCGCCAGGCGTGTGGAGACAGAGCGGCAGCGCATGTGTGCGCGTGAGTTGAGTGCGTTGTGCGTCTCGAGCGCGCACGCGG]

[-] EMBL AGA281239            [CGCTATTATCTCCCTTTCTTTCCGCACGGTATTTCTATTTTTGAACCTTTTTTATGGGGGGGGAGAGAAAGTCCACCCTTTAACCACAAAATACTGCACAGTTTGTTGTTCGGGTTTGTGCGCTCTCGAACGAAGCATCTCCCCCTTCGTTGTTGCGTATTCCCCGACATTCCTGCAAACTAAAAATGTATCTCTTTCGTTTCCTCTTTTCACACATTAAAGTGGCTCCTTGTGAAATGTCCTAACAACCCCCGCTCAATCCATCCACCCTTCTTACCCTTTGCTGTACTGTCACTGTAATTTTATAAGTTGAACAGAGTGAACCATTACAATTAAAACATTGAAAGCAAGCAAAACTGATTAGCATTGTAATGATTGAGGTAAAGAGCACAGAGATAACGTGTTCCGCACGATATACCAGAAAGCGACTCGCGACGAGACAGCAACAAAAAAAACAACAACTAGAAGTCNNNNAGAAACGTTAAACCATGAAAATACATAACTACTAGCAATTGTGAATGCGCGCATTAAAAAAAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BX618315             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGTAATGATTGAGGTAAAGAGCACAGAGATAACGTGTTCCGCACGATATACCAGAAAGCGACTCGCGACGAGACAGCAACAAAAAAAACAACAACTAGAAGTCTTTTAGAAACGTTAAACCATGAAAATACATAACTACTAGCAATTGTGAATGCGCGCATTAATTAAAACAAAAAAAACGCTGCTAAAATAAATTATTAACAGGACACAGTTGCGCGCTTGGGAGATATTATTATAGCCGGAGGTGAACCCGGAAGTAATACACAAAGGTGTTATAAATTATAAAGACTAATTATTATTGTACCGCTAATAATTATTTGTT  ATTATTATTCTTTTTTTTTATTTTCACCCTAATTTCACTCACCCTATCTCTCCCTCGCCCGTATTGTTTTGCCTTGAGCGCGATATCGCCGATCGCAGAAGATGGGGGTGGGAGGGTGGAATCTGAAAGTCGTTATCAATCTACTGACGGTTAAAGTAATCTTCTCTAGTTCGAACGTCATAAACACACGTTCAAGTAATATTATGATTAATAATTATTATAATTACACTCCCGCAACGTTGTCGTTAGTTGCAGCTGACCATCCCTTCCAAAAAAACGGCAAACGAATCGATATAACACTCACACACACTACCCATATTAGTAACATTATTTTGTAATGTTTTTTTTGAACTGTAAAATATTTGCTTACGTATTAATGATTTGCGCCAGGCGTGTGGAGACAGAGCGGCAGCGCATGTGTGCGCGTGAGTTGAGTGCGTTGTGCGTCTCGAGCGCGCACGCGG]
[+] EMBL BX619048             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GATTGAGGTAAAGAGCACAGAGATAACGTGTTCCGCACGATATACCAGAAAGCGACTCGCGACGAGACAGCAACAAAAAAAACAACAACTAGAAGTCTTTTAGAAACGTTAAACCATGAAAATACATAACTACTAGCAATTGTGAATGCGCGCATTAATTAAAACAAAAAAAACGCTGCTAAAATAAATTATTAACAGGACACAGTTGCGCGCTTGGGAGATATTATTATAGCCGGAGGTGAACCCGGAAGTAATACACAAAGGTGTTATAAATTATAAAGACTAATTATTATTGTACCGCTAATAATTATTTGTTAAACTATTATTCTTTTTTTTTATTTTCACCCTAATTTCACTCACCCTATCTCTCCCTCGCCCGTATTGTTTTGCCTTGAGCGCGATATCGCCGATCGCAGAAGAGGGGGGTGGGAGGGTGGAATCTGAAAGTCGTTATCAATCTACTGACGGTTAAAGTAATCTTCTCTAGTTCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]


>consensus_3447#0 CGCTATTATCTCCCTTTCTTTCCGCACGGTATTTCTATTTTTGAACCTTTTTTATGGGGG GGGAGAGAAAGTCCACCCTTTAACCACAAAATACTGCACAGTTTGTTGTTCGGGTTTGTG CGCTCTCGAACGAAGCATCTCCCCCTTCGTTGTTGCGTATTCCCCGACATTCCTGCAAAC TAAAAATGTATCTCTTTCGTTTCCTCTTTTCACACATTAAAGTGGCTCCTTGTGAAATGT CCTAACAACCCCCGCTCAATCCATCCACCCTTCTTACCCTTTGCTGTACTGTCACTGTAA TTTTATAAGTTGAACAGAGTGAACCATTACAATTAAAACATTGAAAGCAAGCAAAACTGA TTAGCATTGTAATGATTGAGGTAAAGAGCACAGAGATAACGTGTTCCGCACGATATACCA GAAAGCGACTCGCGACGAGACAGCAACAAAAAAAACAACAACTAGAAGTCTTTTAGAAAC GTTAAACCATGAAAATACATAACTACTAGCAATTGTGAATGCGCGCATTAATTAAAACAA AAAAAACGCTGCTAAAATAAATTATTAACAGGACACAGTTGCGCGCTTGGGAGATATTAT TATAGCCGGAGGTGAACCCGGAAGTAATACACAAAGGTGTTATAAATTATAAAGACTAAT TATTATTGTACCGCTAATAATTATTTGTTATTATTATTCTTTTTTTTTATTTTCACCCTA ATTTCACTCACCCTATCTCTCCCTCGCCCGTATTGTTTTGCCTTGAGCGCGATATCGCCG ATCGCAGAAGATGGGGGTGGGAGGGTGGAATCTGAAAGTCGTTATCAATCTACTGACGGT TAAAGTAATCTTCTCTAGTTCGAACGTCATAAACACACGTTCAAGTAATATTATGATTAA TAATTATTATAATTACACTCCCGCAACGTTGTCGTTAGTTGCAGCTGACCATCCCTTCCA AAAAAACGGCAAACGAATCGATATAACACTCACACACACTACCCATATTAGTAACATTAT TTTGTAATGTTTTTTTTGAACTGTAAAATATTTGCTTACGTATTAATGATTTGCGCCAGG CGTGTGGAGACAGAGCGGCAGCGCATGTGTGCGCGTGAGTTGAGTGCGTTGTGCGTCTCG AGCGCGCACGCGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)