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Anopheles gambiae
cluster # 3635 cluster # 3635       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3635#0 length = 833 sequences # 3  

consensusID : consensus_3635#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 833
fasta sequence
                              [TCGTAGTACTTTTATTAACGTAAATTCCACATCCTTTACATTTCCATCAATACTTTCCTTTATTTTGCTTTTGCTATTGAAGTTGGAAAAATAAACAAATCTAGTTGTTCGGGTAAGTGTAACTAATGCTTCGTTTGCTGTTATTACACAAACGCGTTAGTCATCTTAAT--CTAGAAGAAGCGCTCGTAATTTAAATTATTTTAGTTTGATTGGTTATTTATAAAGCATAAAAAAC-AAAAACATCGTACAGAGTAGGTTTAGGTACTATGTATTAAAAAGCTCCTTTTCTGAACAAACAATTAAATTAAGTTATAGCTTGAAAATTATTATATTAAGGAAACTATCACAATCTATGCCTGCAGAAAGGAAATATTGTTTACAGCGTTAATATATCGTTTATATTCTGTTTGCTGTTTTTGACATTAGCATACAGTACTTTGCTGTGTTCCAATTACCTGTCGCCCGTACTAGCTGTACTGTTTTTTTTTTCGTCCTCTCCTTATTGTTTCTATTTACAATAGGTTTCGCACACTTTTATAACAACGTAAACGAATAATGCTCACTACAATGCAACCAGCAAGTAAATATATCGATTTGTTTTCTTTCTTACGTTTTGTGTATCGGATATTTTCCATTCTCTATACCATCTTTCCCTCCCCCTTTCTCGTCATTTCTCTCTGTTCAACGGTAACGTACGTGTATTTGTCAATGTTTCTGTTTAGGTGTTCAAAGTAGTGTTACTATTTTCTCCCTTTATTCTTTTTTTTTTTTTTGTTTCATTTAACAGTACCATTCTTCTCTAAATTTTCTCTTATAGCTTTCAGCTTTCGTGA]

[+] EMBL BM581874             [TCGTAGTACTTTTATTAACGTAAATTCCACATCCTTTACATTTCCATCAATACTTTCCTTTATTTTGCTTTTGCTATTGAAGTTGGAAAAATAAACAAATCTAGTTGTTCGGGTAAGTGTAACTAATGCTTCGTTTGCTGTTATTACACAAACGCGTTAGTCATCTTAAT  CTAGAAGAAGCGCTCGTAATTTAAATTATTTTAGTTTGATTGGTTATTTATAAAGCATAAAAAACAAAAAACATCGTACAGAGTAGGTTTAGGTACTATGTATTAAAAAGCTCCTTTTCTGAACAAACAATTAAATTAAGTTATAGCTTGAAAATTATTATATTAAGGAAACTATCACAATCTATGCCTGCAGAAAGGAAATATTGTTTACAGCGTTAATATATCGTTTATATTCTGTTTGCTGTTTTTGCCATTAGCATACAGTACTTTGCTGTGTTCCAATTACCTGTCGCCCGTACTAGCTGTACTGTTTTTGTTTTCGTCTTCTCCTTATTGTTTCTATTTACAATAGGTTTCGCACACTTTTATAACAACGTAAACGAATAATGCTCACTACAATGCAACCAGCAAGTAAATATATCGATTTGTTTTCTTTCTTACGTTTTGTGTATCGGATATTTTCCATTCTCTATACCATCTTTCCCTCCCCCTTTCTC                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL BX625451             [           TTATTAACGTAAATTCCACATCCTTTACATTTCCATCAATACTTTCCTTTA TTTGCTTTTGCTATNGAAGTTGGAAAATTAAACGAATCTAGTTGTTCGGGTAAGTGTAACTAATGCTTCATTTGCTGTTATTACACAAACGCGTTAGTCATCTTAATCGCTAGAAGAAGCGCTTGTAATTTAAATTATTTTAGTTTGTTTGGTTATTTGTAAAGCATAAAAAAC AAAAACATCGTACAGAGTAGGTTTAGGTACTATGTATTAAAAAGCTCCTTTTCTGAACAAACAATTAAATTAAGTTATAGCTTGAAAATTATTATATTAAGGAAACTATCACAATCTATGCCTGCAGAAAGGAAATATTGTTTACAGCGTTAATATATCGTTTATATTCTGTTTGCTGTTTTTGACATTAGCATACAGTACTTTGCTGTGTTCCAATTACCTGTCGCCCGTACTAGCTGTACTGTTTTTTTTTTCGTCCTCTCCTTATTGTTTCTATTTACAATAGGTTTCGCACACTTTTATAACAACGTAAACGAATAATGCTCACTACAATGCAACCAGCAAGTAAATATATCGATTTGTTTTCTTTCTTACGTTTTGTGTATCGGATATTTTCCATTCTCTATACCATCTTTCCC                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL BX622849             [                                                                                                                                                                                                                              TAAAGCATAAAAAAC AAAAACATCGTACAGAGTAGGTTTAGGTACTATGTATTAAAAAGCTCCTTTTCTGAACAAACAATTAAATTAAGTTATAGCTTGAAAATTATTATATTAAGGAAACTATCACAATCTATGCCTGCAGAAAGGAAATATTGTTTACAGCGTTAATATATCGTTTATATTCTGTTTGCTGTTTTTGACATTAGCATACAGTACTTTGCTGTGTTCCAATTACCTGTCGCCCGTACTAGCTGTACTGTTTTTTTTTTCGTCCTCTCCTTATTGTTTCTATTTACAATAGGTTTCGCACACTTTTATAACAACGTAAACGAATAATGCTCACTACAATGCAACCAGCAAGTAAATATATCGATTTGTTTTCTTTCTTACGTTTTGTGTATCGGATATTTTCCATTCTCTATACCATCTTTCCCT CCCCTTTCTCGTCATTTCTCTCTGTTCAACGGTAACGTACGTGTATTTGTCAATGTTTCTGTTTAGGTGTTCAAAGTAGTGTTACTATTTTCTCCCTTTATTCTTTTTTTTTTTTTTGTTTCATTTAACAGTACCATTCTTCTCTAAATTTTCTCTTATAGCTTTCAGCTTTCGTGA]


>consensus_3635#0 TCGTAGTACTTTTATTAACGTAAATTCCACATCCTTTACATTTCCATCAATACTTTCCTT TATTTTGCTTTTGCTATTGAAGTTGGAAAAATAAACAAATCTAGTTGTTCGGGTAAGTGT AACTAATGCTTCGTTTGCTGTTATTACACAAACGCGTTAGTCATCTTAATCTAGAAGAAG CGCTCGTAATTTAAATTATTTTAGTTTGATTGGTTATTTATAAAGCATAAAAAACAAAAA CATCGTACAGAGTAGGTTTAGGTACTATGTATTAAAAAGCTCCTTTTCTGAACAAACAAT TAAATTAAGTTATAGCTTGAAAATTATTATATTAAGGAAACTATCACAATCTATGCCTGC AGAAAGGAAATATTGTTTACAGCGTTAATATATCGTTTATATTCTGTTTGCTGTTTTTGA CATTAGCATACAGTACTTTGCTGTGTTCCAATTACCTGTCGCCCGTACTAGCTGTACTGT TTTTTTTTTCGTCCTCTCCTTATTGTTTCTATTTACAATAGGTTTCGCACACTTTTATAA CAACGTAAACGAATAATGCTCACTACAATGCAACCAGCAAGTAAATATATCGATTTGTTT TCTTTCTTACGTTTTGTGTATCGGATATTTTCCATTCTCTATACCATCTTTCCCTCCCCC TTTCTCGTCATTTCTCTCTGTTCAACGGTAACGTACGTGTATTTGTCAATGTTTCTGTTT AGGTGTTCAAAGTAGTGTTACTATTTTCTCCCTTTATTCTTTTTTTTTTTTTTGTTTCAT TTAACAGTACCATTCTTCTCTAAATTTTCTCTTATAGCTTTCAGCTTTCGTGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)