cluster # 4340

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Anopheles gambiae
cluster # 4340 cluster # 4340 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4340#0 length = 1327 sequences # 3
consensusID : consensus_4340#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1327
fasta sequence
                              [AAATAGTCTAACGCACCCAGGAGCGTCACGCTTGAGCAGTAGCACCATGGGAAAATTTAGCAACGGTGCTTTGGAATTTAGCAAATTTTGGAGAATGGTTGCTCTATAAACGGCATCTCCAAAGTCAACATCAGTTGCATACGCAAATTTGAGAGTTCAAATTCTCTCAAGTGAATGTTTAGGTGATAGTTCACAAAAAAATTGGTCAAAGGCAACCATGCTTTTTCTTTTGCGTCTCGACTTCATAGCAATACCTTCATTAGTTATCCTCAACGTGAATATCTCTCTAAGATGACGGTCCCTTGAAGATTCACCTTAGAGAAATCTCTGTAATCACATTCAATTACTTTAATTTAACTGGCCTTGAAATGTAACAATTGATTCAATACCTTAATTTCAGTCAGTCGGCTAATGTTGAGTCCCGTGGTAAACCTAAACAACAATACGGACATAGGCCATAGATATGGATTGGATCACGCACTCCAAGTGACTGACTATGGGCACACCAGATAGCTAAGGATATTAGAGGCTAAGACAGGCCCAAATCTACAACATTGTGGGCGTTGCTGTCCCAAATACCAAGAAGAAGAATTTCGGTCATAACTGGCCATCAACTGAACACGTCTGATAAGGATGGATAAGGTGGAGGCTATATATAAAGCCCAGAATCCTTAAGCTTGATATGGCATTGCTAGAGTTAAACTTGGTAAACAAAAAACTGATCTAATTATTGATGCAAGAATCGGGTTGTGAACAACTGCCAGGATCTTTGAACGGGTTGCTTCAAAGTTAAAAGTATTAGGAAGAATGATCCTATGGCGGAAAATCAGATATGCAGGCCAGCAGGATCTTTTGTAATCAGCTGGTTCCCATCCGGAATATCACCAAGAAGCAAAGACAGACTATCCAGTGCTTTGAACCTAATTAGTATAGAAAGAGTCTGTACAATGGAAGCCTGTAGCATAAGAAAAAAAAACAGGTAGAATCAGGATTGTCAACATGTTGTTCGCGAAATTGACGCAAAGATTAAACTATAAGTAATACAAACAACTGATCAAAAACAATTCGACTATTGTTACAAGATTTGAAAATGTTGTAATATAGGATATCTAATGCATTAACATGAAAACAGCAGCTAAAACGAGTCTGAGATTTTGGAAGTGGAAAAACTTGAGATATAATTTGAATCTTATCTTGGCCCAGTCTCTCTGCTCAATCCTTGCTATGGGTTAACGGTTGAAATAANGCTTGAGTTTGTATTTTTAAAGTCGTACGAGGTTNCGACTGTAATCACGGGACCACCCACATGTAATCCTTCTTCTTCTTT]

[-] EMBL BX615935             [AAATAGTCTAACGCACCCAGGAGCGTCACGCTTGAGCAGTAGCACCATGGGAAAATTTAGCAACGGTGCTTTGGAATTTAGCAAATTTTGGAGAATGGTTGCTCTATAAACGGCATCTCCAAAGTCAACATCAGTTGCATACGCAAATTTGAGAGTTCAAATTCTCTCAAGTGAATGTTTAGGTGATAGTTCACAAAAAAATTGGTCAAAGGCAACCATGCTTTTTCTTTTGCGTCTCGACTTCATAGCAATACCTTCATTAGTTATCCTCAACGTGAATATCTCTCTAAGATGACGGTCCCTTGAAGATTCACCTTAGAGAAATCTCTGTAATCACATTCAATTACTTTAATTTAACTGGCCTTGAAATGTAACAATTGATTCAATACCTTAATTTCAGTCAGTCGGCTAATGTTGAGTCCCGTGGTAAACCTAAACAACAATACGGACATAGGCCATAGATATGGATTGGATCACGCACTCCAAGTGACTGACTATGGGCACACCAGATAGCTAAGGATATTAGAGGCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BX610007             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ACCTTAATTTCAGTCAGTCGGCTAATGTTTAGTCCCGTGGTAAACCTAAACAACAATACGGACATAGGCCATAGATATGGATTGGATCACTCACTCCAAGTGACTGACTATGGGCACACCAGATAGCTAAGGATATTAGAGGCTAAGACAGGCCCAAATCTACAACATTGTGGGCGTTGCTGTCCCAAATACCAAGAAGAAGAATTTCGGTCATAACTGGCCATCAACTGAACACGTCTGATAAGGATGGATAAGGTGGAGGCTATATATAAAGCCCAGAATCCTTAAGCTTGATATGGCATTGCTAGAGTTAAACTTGGTAAACAAAAAACTGATCTAATTATTGATGCAAGAATCGGGTTGTGAACAACTGCCAGGATCTTTGAACGGGTTGCTTCAAAGTTAAAAGTATTAGGAAGAATGATCCTATGGCGGAAAATCAGATATGCAGGCCAGCAGGATCTTTTGTAATCAGCTGGTTCCCATCCGGAATATCACCAAGAAGCAAAGACAGACTATCCAGTGCTTTGAACCTAATTAGTATAGAAAGAGTCTGTACAATGGAAGCCTGTAGCATAAGAAAAAAAAACAGGTAGAATCAGGATTGTCAACATGTTGTTCGCGAAATTGACGCAAAGATTAAACTATAAGTAATACAAACAACTGATCAAAAACAATTCGACTATTGTTACAAGATTTGAAAATGTTGTAATATAGGATATCTAATGCATTAACA                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BX620840             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AAGAATGATCCTATGGCGGAAAATCAGATATGCAGGCCAGCAGGATCTTTTGTAATCAGCTGGTTCCCATCCGGAATATCACCAAGAAGCAAAGACAGACTATCCAGTGCTTTGAACCTAATTAGTATAGAAAGAGTCTGTACAATGGAAGCCTGTAGCATAAGAAAAAAAAACAGGTAGAATCAGGATTGTCAACATGTTGTTCGCGAAATTGACGCAAAGATTAAACTATAAGTAATACAAACAACTGATCAAAAACAATTCGACTATTGTTACAAGATTTGAAAATGTTGTAATATAGGATATCTAATGCATTAACATGAAAACAGCAGCTAAAACGAGTCTGAGATTTTGGAAGTGGAAAAACTTGAGATATAATTTGAATCTTATCTTGGCCCAGTCTCTCTGCTCAATCCTTGCTATGGGTTAACGGTTGAAATAANGCTTGAGTTTGTATTTTTAAAGTCGTACGAGGTTNCGACTGTAATCACGGGACCACCCACATGTAATCCTTCTTCTTCTTT]




>consensus_4340#0
AAATAGTCTAACGCACCCAGGAGCGTCACGCTTGAGCAGTAGCACCATGGGAAAATTTAG
CAACGGTGCTTTGGAATTTAGCAAATTTTGGAGAATGGTTGCTCTATAAACGGCATCTCC
AAAGTCAACATCAGTTGCATACGCAAATTTGAGAGTTCAAATTCTCTCAAGTGAATGTTT
AGGTGATAGTTCACAAAAAAATTGGTCAAAGGCAACCATGCTTTTTCTTTTGCGTCTCGA
CTTCATAGCAATACCTTCATTAGTTATCCTCAACGTGAATATCTCTCTAAGATGACGGTC
CCTTGAAGATTCACCTTAGAGAAATCTCTGTAATCACATTCAATTACTTTAATTTAACTG
GCCTTGAAATGTAACAATTGATTCAATACCTTAATTTCAGTCAGTCGGCTAATGTTGAGT
CCCGTGGTAAACCTAAACAACAATACGGACATAGGCCATAGATATGGATTGGATCACGCA
CTCCAAGTGACTGACTATGGGCACACCAGATAGCTAAGGATATTAGAGGCTAAGACAGGC
CCAAATCTACAACATTGTGGGCGTTGCTGTCCCAAATACCAAGAAGAAGAATTTCGGTCA
TAACTGGCCATCAACTGAACACGTCTGATAAGGATGGATAAGGTGGAGGCTATATATAAA
GCCCAGAATCCTTAAGCTTGATATGGCATTGCTAGAGTTAAACTTGGTAAACAAAAAACT
GATCTAATTATTGATGCAAGAATCGGGTTGTGAACAACTGCCAGGATCTTTGAACGGGTT
GCTTCAAAGTTAAAAGTATTAGGAAGAATGATCCTATGGCGGAAAATCAGATATGCAGGC
CAGCAGGATCTTTTGTAATCAGCTGGTTCCCATCCGGAATATCACCAAGAAGCAAAGACA
GACTATCCAGTGCTTTGAACCTAATTAGTATAGAAAGAGTCTGTACAATGGAAGCCTGTA
GCATAAGAAAAAAAAACAGGTAGAATCAGGATTGTCAACATGTTGTTCGCGAAATTGACG
CAAAGATTAAACTATAAGTAATACAAACAACTGATCAAAAACAATTCGACTATTGTTACA
AGATTTGAAAATGTTGTAATATAGGATATCTAATGCATTAACATGAAAACAGCAGCTAAA
ACGAGTCTGAGATTTTGGAAGTGGAAAAACTTGAGATATAATTTGAATCTTATCTTGGCC
CAGTCTCTCTGCTCAATCCTTGCTATGGGTTAACGGTTGAAATAANGCTTGAGTTTGTAT
TTTTAAAGTCGTACGAGGTTNCGACTGTAATCACGGGACCACCCACATGTAATCCTTCTT
CTTCTTT
clustalw multiple alignements is not computed in this case