Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Anopheles gambiae
cluster # 4545 cluster # 4545       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4545#0 length = 942 sequences # 3  
consensusID : consensus_4545#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 942
fasta sequence 
                              [CCGCTAATTACCAGTTACGTTGCTGTTAGCTTTAACTATTCGGTTCTATAGGTTGTCCATCCGGTTGGCACCTAAACTTAAACAGACACACATACACACAGGGTTTAAACGATGACGCTTTCGCGCTTGCTTGCTCCTTTACGTTCGCGAGTTCATTCGTATTGCACTTTTCTTTTTGGGGGTGACAGGGGAGCGTGACAGTTGTTGAGTTAAATGCAAGTTCCTCTTAAGCAGTTTAGTTGGTAGTGGTAGTGTAGCGCAGTAGGCTTTGCAGTAGGGGTTGATTCGCGGAGTGCGTACGAAGTTAGTTAGGACGAACCTACGAAGGGTTCGGGGAAGCAAAATGGCGAACGTTTGCCTTTGAAGTTACTGGAAATAGCTCCGGTACCGGAAGTACCGGTACGCAAAGGTACGTAATTTAGTGTTGGTTTGTGCTTTTCAATGCAAAAGCAGTTTGGTAAGCGGCGTTTGGAACGTTCCAATTTCCATTTCCATTTGTACGGAATGTCACGAGTGAGCGAATTGGCATTTAAAAAGGTGGAAATCCGCGCAAAGCATCGATTGAAAACATATCCTGATTAGTTTGTCCACAACACTGTCGAGCAGAGAGTGAGAGACTTGTTGAGGGGAGGTGATAATACGCGATTCGTAGTATGTTCGGGGAACCAAATTGGGGTAGGATACTGCTGCTGTGGCACAGATACGTTTGCCTCGTCGCTGTAATAGAACGTAATAGGCTTGTAATTAATTAAGGCTTCTTTGTAGCTGTGCTTTAGCAGTCAGCCAGCACCAACCAACATGCCTGTCCTGGGTCGATCCGGCGGGGGGGATATTAGTTGCAGGACTGGGAGGAGCAGCTTAACAAAAAGGATATGTAGAAGGGATAGGACATTTACGTCAGCGAAAACAAAAAAAAACCCACACACTGAACAGGAAACGAAT]

[+] EMBL BM579522             [CCGCTAATTACCAGTTACGTTGCTGTTAGCTTTAACTATTCGGTTCTATAGGTTGTCCATCCGGTTGGCACCTAAACTTAAACAGACACACATACACACAGGGTTTAAACGATGACGCTTTCGCGCTTGCTTGCTCCTTTACGTTCGCGAGTTCATTCGTATTGCACTTTTCTTTTTGGGGGTGACAGGGGAGCGTGACAGTTGTTGAGTTAAATGCAAGTTCCTCTTAAGCAGTTTAGTTGGTAGTGGTAGTGTAGCGCAGTAGGCTTTGCAGTAGGGGTTGATTCGCGGAGTGCGTACGAAGTTAGTTAGGACGAACCTACGAAGGGTTCGGGGAAGCAAAATGGCGAACGTTTGCCTTTGAAGTTACTGGAAATAGCTCCGGTACCGGAAGTACCGGTACGCAAAGGTACGTAATTTAGTGTTGGTTTGTGCTTTTCAATGCAAAAGCAGTTTGGTAAGCGGCGTTTGGAACGTTCCAATTTCCATTTCCATTTGTACGGAATGTCACGAGTGAGCGAATTGGCATTTAAAAGGGTGGAAATCCGCGCAAAGCATCGATTAAAAACATATCCTGATTAGTTTGTCCACAACACTGTCGAGCAGAGAGTGAGAGACTTGTTGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BM634557             [                                                                                                                                                                                                                                                            ccgAGCGCAGTAGGCTTGGCAGTAGGGTTTGATTCGCAGGGTGCATACGAAGTTAGTAAGGACGAACCTACGAAGGGTTCGGGGAAGCAAAATGGCGAACGTTTGCCTTTGAAGTTACTGGAAATAGCTCCGGTACCGGAAGTAGTAGTACGCAAAGGTACGTAATTTAGTGTTGGTTTGTGCTTTTCAATGCAAAAGCAGTTTGGTAAGCGGCGTTTGGAACGTTCCAATTTCCATTTCCATTTGTACGGAATGTCACGAGTGAGCGAATTGGCATTTAAAAAGGTGGAAATCCGCGCAAAGCATCGATTGAAAACATATCCTGATTAGTTTGTCCACAACACTGTCGAGCAGAGAGTGAGAGACTTGTTGAGGGGAGGTGATAATACGCGATTCGTAGTATGTTCGGGGAACCAAATTGGGGTAGGATACTGCTGCTGTGGCACAGATACGTTTGCCTCGTCGCTGTAATAGAACGTAATAGGCTTGTAATTAATTAAGGCTTCTTTGTAGCTGTGCTTTAGCAGTCAGCCAGCACCAACCAACATGCCTGTCCTGGGTCGATCCGGCGGGGGGGATATTAGTTGCAGGACTGGGAGGAGCAGCTTAACAAAAAGGATATGTAGAAGGGATAGGACATTTACGTCAGCGAAAACAAAAAAAAACCCACACACTGAACAGGAAACGAAT]
[+] EMBL BM605061             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cCGGAATGTCACGAGTGAGCGAATTGGCATTTAAAAAGGTGGAAATCCGCGCAAAGCATCGATTGAAAACATATCCTGATTAGTTTGTCCACAACACTGTCGAGCAGAGAGTGAGAGACTTGTTGAGGGGAGGTGATAATACGCGATTCGTAGTATGTTCGGGGAACCAAATTGGGGTAGGATACTGCTGCTGTGGCACAGATACGTTTGCCTCGTCGCTGTAATAGAACGTAATAGGCTTGTAATTAATTAAGGCTTCTTTGTAGCTGTGCTTTAGCAGTCAGCCAGCACCAACCAACATGCCTGTCCTGGGTCGATCCGGCGGGGGGGATATTAGTTGCAGGACTGGGAGGAGCAGCTTAACAAAAAGGATATGTAGAAGGGATAGGACATTTACGTCAGCGAAAACAAAAAAAAACCCAC                    ]




>consensus_4545#0
CCGCTAATTACCAGTTACGTTGCTGTTAGCTTTAACTATTCGGTTCTATAGGTTGTCCAT
CCGGTTGGCACCTAAACTTAAACAGACACACATACACACAGGGTTTAAACGATGACGCTT
TCGCGCTTGCTTGCTCCTTTACGTTCGCGAGTTCATTCGTATTGCACTTTTCTTTTTGGG
GGTGACAGGGGAGCGTGACAGTTGTTGAGTTAAATGCAAGTTCCTCTTAAGCAGTTTAGT
TGGTAGTGGTAGTGTAGCGCAGTAGGCTTTGCAGTAGGGGTTGATTCGCGGAGTGCGTAC
GAAGTTAGTTAGGACGAACCTACGAAGGGTTCGGGGAAGCAAAATGGCGAACGTTTGCCT
TTGAAGTTACTGGAAATAGCTCCGGTACCGGAAGTACCGGTACGCAAAGGTACGTAATTT
AGTGTTGGTTTGTGCTTTTCAATGCAAAAGCAGTTTGGTAAGCGGCGTTTGGAACGTTCC
AATTTCCATTTCCATTTGTACGGAATGTCACGAGTGAGCGAATTGGCATTTAAAAAGGTG
GAAATCCGCGCAAAGCATCGATTGAAAACATATCCTGATTAGTTTGTCCACAACACTGTC
GAGCAGAGAGTGAGAGACTTGTTGAGGGGAGGTGATAATACGCGATTCGTAGTATGTTCG
GGGAACCAAATTGGGGTAGGATACTGCTGCTGTGGCACAGATACGTTTGCCTCGTCGCTG
TAATAGAACGTAATAGGCTTGTAATTAATTAAGGCTTCTTTGTAGCTGTGCTTTAGCAGT
CAGCCAGCACCAACCAACATGCCTGTCCTGGGTCGATCCGGCGGGGGGGATATTAGTTGC
AGGACTGGGAGGAGCAGCTTAACAAAAAGGATATGTAGAAGGGATAGGACATTTACGTCA
GCGAAAACAAAAAAAAACCCACACACTGAACAGGAAACGAAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)