Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Anopheles gambiae
cluster # 4651 cluster # 4651       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4651#0 length = 1605 sequences # 3  

consensusID : consensus_4651#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1605
fasta sequence
                              [CCGGATTTGCTACAAAATTTTAACACTTTTAACAAAAAGTCTATTACAGCTCCTGACTATTGCTTTTTATCGGTATTGTTCTGTTTCAATGCGGTTGTTTTTTCTTCATCATACTTTAACGGTTTTTTGAGTAGTAGATCGCGTATCGTAACATTCTTACGTCTGTTTTCTTGCTTAACAAACAAACAACAAACAACTAGCCTAGTTAAGTTGCATTTTTTCAACACAATTTGTTGTTCGTTTAATCGACCGGATTACACGCACCACGGTAGAAGATGATTGTGTGCCATCACGGGTGGCCTCATAGGTTTATGTCTATATTTAGTGTGTAACCCATGTAAGCAAACGTTCAGCAGTCGGTTCGTGTAGCTGTTTGCATGGTTGTGGTTTTTATAGTATCAAAATAATTTTATACTTATCGAAATGCTTGATCAACGAATAACCTGTGTGTACACACCCCTCAAGTCGGTGAAATAGCAAAGAACAGTAATGATTGTTAAAACATACGTAGGACCAATGCCATAATAGTCACGATACGATATAAGCAAATAGTAT---G--AC-AACAAGAGCAAGTTAGAATCTTTTATCTTGTTTTTGTTAGTTTTATCACTAACAAATCTCGTAATGATCAATTTCAACCAGAGTTACCTTACACATATTGGTTTTGCCTCGATAGCATTTTACATTATAGCATTCGCTTAAGCTCTTTCTTCTACTATCGCCACCAACGTTATCTTTTGTGTAGGGCCAACCCACGAACCTATAGTTTTGTCATACTTTTGTAATTTGTAAGGTCAGATTTTCATGCACTTTTCATCAGCGCTGTTCTGCTCTGCTGCTTATAATGCTTGTTTAACAATCGTTGCACGTGTATGGTCGAGACTAGGCAGAGAACTGGATATTCAAAATCATTCCATTAGGCAAACCATTAAGGCTTGTAAGTCACGCGGATTTGCGACAAACTTCTCATCAGAGGAGTATATTTTAAAAGTGGTGTTTTGTGTTGTTTCTCTTCATACCTTTTTTACTGATAATGCATTTTAAAGTTGCTGTGGAAATTCCTATCTTATTTTTTTGTTTCAATCTATTCTATAAGCACACCATTAGCCCATTTTTATCTCAGGACAAGTATCGTTTTTTTCTTTATTTTACAAAAGCACCAATGCTAGATTTGCAAGTACAGTTTTAGTTGGTATGATCGTGTGCACAGATTTGATTCGAATAACGGATGCAACAATCAGCAATCAACAAAACAGAAAAAAAGCTTTGAATCTTCCGTTCAGTTCCTGGGAGCTTCGATTTATGTTTCACTGGAGCGCTTTATGATCTCGAATGAATTGCATGCGCGCGCGTGCGTGTTTGTGTGTTATTAAACCGTTCGCAAGCAAATCTGTACTATCTATCACGTAGGTTATTTTAATTTTAATAAACATGCACGCACACGCAGACAAACCGTGGCCCATCCCGACGAGGGCTGTGGTCGGTTAAGCAATCATCCCTTTTATTGCCTTTCCATTAATCCATAAATGCCATTCAGCTTTATTAATATAGCAATGTTATAGTTGCTACGCGTTTAGTGATTATTACTTGTTTCATTAAGTCATATCC]

[+] EMBL BM579718             [CCGGATTTGCTACAAAATTTTAACACTTTTAACAAAAAGTCTATTACAGCTCCTGACTATTGCTTTTTATCGGTATTGTTCTGTTTCAATGCGGTTGTTTTTTCTTCATCATACTTTAACGGTTTTTTGAGTAGTAGATCGCGTATCGTAACATTCTTACGTCTGTTTTCTTGCTTAACAAACAAACAACAAACAACTAGCCTAGTTAAGTTGCATTTTTTCAACACAATTTGTTGTTCGTTTAATCGACCGGATTACACGCACCACGGTAGAAGATGATTGTGTGCCATCACGGGTGGCCTCATAGGTTTATGTCTATATTTAGTGTGTAACCCATGTAAGCAAACGTTCAGCAGTCGGTTCGTGTAGCTGTTTGCATGGTTGTGGTTTTTATAGTATCAAAATAATTTTATACTTATCGAAATGCTTGATCAACGAATAACCTGTGTGTACACACCCCTCAAGTCGGTGAAATAGCAAAGAACAGTAATGATTGTTAAAACATACGTAGGACCAATGCCATAATAGTCACGATACGATATAAGCAAATAGTATCAAGTTACAAACAAGAGCAAGTTAGAATCTTTTATCTTGTTTTTGTTAGTTTTATCACTAACAAATCTCGTAATGATCAATTTCAACCAGAGTTACCTTACACATATTGGTTTTGCCTCGATAGCATTTTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BM651849             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ccgGCAAATAGTAT   G  AC CACAAGAGCAAGTTAGAATCTTTTATCTTGTTTTTGTTTGTTTTATCACTAACAAATCTCGTAATGATCAATTTCAACCAGAGTTACCTTACACATATTGGTTTTGCCTCGATAGCATTTTACATTATAGCATTCGCTTAAGCTCTTTCTTCTACTATCGCCACCAACGTTATCTTTTGTGTAGGGCCAACCCACGAACCTATAGTTTTGTCATACTTTTGTAATTTGTAAGGTCAGATTTTCATGCACTTTTCATCAGCGCTGTTCTGCTCTGCTGCTTATAATGCTTGTTTAACAATCGTTGCACGTGTATGGTCGAGACTAGGCAGAGAACTGGATATTCAAAATCATTCCATTAGGCAAACCATTAAGGCTTGTAAGTCACGCGGATTTGCGACAAACTTCTCATCAGAGGAGTATATTTTAAAAGTGGTGTTTTGTGTTGTTTCTCTTCATACCTTTTTTACTGATAATGCATTTTAAAGTTGCTGTGGAAATTCCTATCTTATTTTTTTGTTTCAATCTATTCTATAAGCACACCATTAGCCCATTTTTATCTCAGGACAAGTATCGTTTTTTTCTTTATTTTACAAAAGCACCAATGCTAGATTTGCAAGTACAGTTTTAGTTGGTATGATCGTGTGCACAGATTTGATTCGAATAACGGATGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BM657799             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ccgTTCAAAATCATTCCATTAGGCAAACCATTAAGGCTTGTAAGTCACGCGGATTTGCGACAAACTTCTCATCAGAGGAGTATATTTTAAAAGTGGTGTTTTGTGTTGTTTCTCTTCATACCTTTTTTACTGATAATGCATTTTAAAGTTGCTGTGGAAATTCCTATCTTATTTTTTTGTTTCAATCTATTCTATAAGCACACCATTAGCCCATTTTTATCTCAGGACAAGTATCGTTTTTTTCTTTATTTTACAAAAGCACCAATGCTAGATTTGCAAGTACAGTTTTAGTTGGTATGATCGTGTGCACAGATTTGATTCGAATAACGGATGCAACAATCAGCAATCAACAAAACAGAAAAAAAGCTTTGAATCTTCCGTTCAGTTCCTGGGAGCTTCGATTTATGTTTCACTGGAGCGCTTTATGATCTCGAATGAATTGCATGCGCGCGCGTGCGTGTTTGTGTGTTATTAAACCGTTCGCAAGCAAATCTGTACTATCTATCACGTAGGTTATTTTAATTTTAATAAACATGCACGCACACGCAGACAAACCGTGGCCCATCCCGACGAGGGCTGTGGTCGGTTAAGCAATCATCCCTTTTATTGCCTTTCCATTAATCCATAAATGCCATTCAGCTTTATTAATATAGCAATGTTATAGTTGCTACGCGTTTAGTGATTATTACTTGTTTCATTAAGTCATATCC]


>consensus_4651#0 CCGGATTTGCTACAAAATTTTAACACTTTTAACAAAAAGTCTATTACAGCTCCTGACTAT TGCTTTTTATCGGTATTGTTCTGTTTCAATGCGGTTGTTTTTTCTTCATCATACTTTAAC GGTTTTTTGAGTAGTAGATCGCGTATCGTAACATTCTTACGTCTGTTTTCTTGCTTAACA AACAAACAACAAACAACTAGCCTAGTTAAGTTGCATTTTTTCAACACAATTTGTTGTTCG TTTAATCGACCGGATTACACGCACCACGGTAGAAGATGATTGTGTGCCATCACGGGTGGC CTCATAGGTTTATGTCTATATTTAGTGTGTAACCCATGTAAGCAAACGTTCAGCAGTCGG TTCGTGTAGCTGTTTGCATGGTTGTGGTTTTTATAGTATCAAAATAATTTTATACTTATC GAAATGCTTGATCAACGAATAACCTGTGTGTACACACCCCTCAAGTCGGTGAAATAGCAA AGAACAGTAATGATTGTTAAAACATACGTAGGACCAATGCCATAATAGTCACGATACGAT ATAAGCAAATAGTATGACAACAAGAGCAAGTTAGAATCTTTTATCTTGTTTTTGTTAGTT TTATCACTAACAAATCTCGTAATGATCAATTTCAACCAGAGTTACCTTACACATATTGGT TTTGCCTCGATAGCATTTTACATTATAGCATTCGCTTAAGCTCTTTCTTCTACTATCGCC ACCAACGTTATCTTTTGTGTAGGGCCAACCCACGAACCTATAGTTTTGTCATACTTTTGT AATTTGTAAGGTCAGATTTTCATGCACTTTTCATCAGCGCTGTTCTGCTCTGCTGCTTAT AATGCTTGTTTAACAATCGTTGCACGTGTATGGTCGAGACTAGGCAGAGAACTGGATATT CAAAATCATTCCATTAGGCAAACCATTAAGGCTTGTAAGTCACGCGGATTTGCGACAAAC TTCTCATCAGAGGAGTATATTTTAAAAGTGGTGTTTTGTGTTGTTTCTCTTCATACCTTT TTTACTGATAATGCATTTTAAAGTTGCTGTGGAAATTCCTATCTTATTTTTTTGTTTCAA TCTATTCTATAAGCACACCATTAGCCCATTTTTATCTCAGGACAAGTATCGTTTTTTTCT TTATTTTACAAAAGCACCAATGCTAGATTTGCAAGTACAGTTTTAGTTGGTATGATCGTG TGCACAGATTTGATTCGAATAACGGATGCAACAATCAGCAATCAACAAAACAGAAAAAAA GCTTTGAATCTTCCGTTCAGTTCCTGGGAGCTTCGATTTATGTTTCACTGGAGCGCTTTA TGATCTCGAATGAATTGCATGCGCGCGCGTGCGTGTTTGTGTGTTATTAAACCGTTCGCA AGCAAATCTGTACTATCTATCACGTAGGTTATTTTAATTTTAATAAACATGCACGCACAC GCAGACAAACCGTGGCCCATCCCGACGAGGGCTGTGGTCGGTTAAGCAATCATCCCTTTT ATTGCCTTTCCATTAATCCATAAATGCCATTCAGCTTTATTAATATAGCAATGTTATAGT TGCTACGCGTTTAGTGATTATTACTTGTTTCATTAAGTCATATCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)