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Anopheles gambiae
cluster # 4876 cluster # 4876       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4876#0 length = 1404 sequences # 4  

consensusID : consensus_4876#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1404
fasta sequence
                              [TTTTTGTTAAAGCTGTAATCGTGCACAAAGCATTCGTATAATGCTTTGAGGTCAATTGTTTATTACAAAAAATAAATGGAAGCACACCTTGCACCTTCCGTGCCTCGAGTAGGGAAGGTAATTACGAATTTCCCTGTGACTGTGTGGCACCGTTGCGACGCTTTCGGGGTTTCTTCTGTGCGGTGCTGGACACCTTCGTCGAAGCTGCTGGTGACTGCTTAGAGGTTGATGTTACCGTCGAGGTCGTCGTTGGCGTTGTCTTAACCGTTGCTGTTGCTGTTACGGATGGTGTTGTGGTTAGAGCATCGGCCCCACTTGGCAGCAGTACCGGCTGCTGACGACGCCCTACCGTCTCGAAGATGTTGTACGGTCCCTGGTTAAGGTTGTAGCTGTGCTTGAAGCTTTTCGCCTGCGTACGCTGGGCGGCGGTCACTTCTGCGTCGTCCAGGTAGCGCAACTGCGGTAGAATACTGATCACGAACAGCCGGTAGTCGTTGTGTTCGAGCGTGGAGTTGCCGTTGAAGGAGGAGGTCGCACCCGGGTTACCCATCAGCGATAGGTACTTGAGCGAGGGGCAGCATTCGCGGATGCGATAGATCCAGTTCTGCAGGTTGATGATATCACAGTGGTTGAGCCAGAGCAGCTCCAGGTTGGGAAGGGTCGGTAGCGTTCGCTCGTCCGGCTGTACGTTCTTGTCCAGGATGAGTGTGTTCAGCTGCCGGAAGTGTGTCAGGAAGGAGAGGTCTTTGATTTCATTGTAGCTCAAATCGAGGATCGTCGTCGTGCGGGAGAACTTCTCGGCGATTTTGCGCGGGATCTGTGACAATCGTTCGTACGCCAACGAGAGCCGCTCGCCGTTCTGGTCAATGTCATCCGATTTGCTTGAGTCACTGGGAGAGACAGAGATGCGAACAAACAATTTTATAAGACCTTCCGGCACTTTTAATCGACATCGCGTCCGATGACCAGTCGTAGCTCAGATACAGCTCGTCGTCCTCGTCCATGGTGGAGTAATTGTCGACGAAAAATCGCTCATTGTAGCCGATGGCTTGCATAATTGATACTGATAAGGACGATGTTCTGGGACAATTTGTCAGAATGCTGTACAATTGTGA-TCGTTTCACTTAAAGATGCCTCTGCTTTTTGTTAACCGTTTCTATTCACGATCTACAGAAAACGCACGCTATCGTTAGATTAGTTTAGAAATACATTCAAAC-GATTGTTTCCCAAGATCGTGCTGGGTACAGCAGCATAACGAAACACAACACTAAACACAGCACAGCGAATGCTTAAAAC-CTGCAACGAATCGAATCCGCTGTGGGCGATTGTGTGCCCTTTCTAGTCCGAGT-AGTTTTAGCCGCGATAAGCGCGCGCTTCCTGTCGCGTGCTACCACACACTTGCTT]

[+] EMBL CNS08DHQ             [TTTTTGTTAAAGCTGTAATCGTGCACAAAGCATTCGTATAATGCTTTGAGGTCAATTGTTTATTACAAAAAATAAATGGAAGCACACCTTGCACCTTCCGTGCCTCGAGTAGGGAAGGTAATTACGAATTTCCCTGTGACTGTGTGGCACCGTTGCGACGCTTTCGGGGTTTCTTCTGTGCGGTGCTGGACACCTTCGTCGAAGCTGCTGGTGACTGCTTAGAGGTTGATGTTACCGTCGAGGTCGTCGTTGGCGTTGTCTTAACCGTTGCTGTTGCTGTTACGGATGGTGTTGTGGTTAGAGCATCGGCCCCACTTGGCAGCAGTACCGGCTGCTGACGACGCCCTACCGTCTCGAAGATGTTGTACGGTCCCTGGTTAAGGTTGTAGCTGTGCTTGAAGCTTTTCGCCTGCGTACGCTGGGCGGCGGTCACTTCTGCGTCGTCCAGGTAGCGCAACTGCGGTAGAATACTGATCACGAACAGCCGGTAGTCGTTGTGTTCGAGCGTGGAGTTGCCGTTGAAGGAGGAGGTCGCACCCGGGTTACCCATCAGCGATAGGTACTTGAGCGAGGGGCAGCATTCGCGGATGCGATAAATCCAGTTCTGCAGGTTGATGATATCACAGTGGTTGAGCCAGAACAGCTCCAGGTTGGGAAGGGTCGGTAGCGTTCGCTCGTCCGGCTGTACGTTCTTGTCCAGGATGAGTGTTTTCAGCTGCCGGAAGTGTGTCAGGAAGGAGAGGTCTTTGATTTCATTGTAGCTCAAATCGAGGATCGTCGTCGTGCGGGAGAACTTCTCGGCGATTTTGCGCGGGATCTGTGACAATCGTTCGTACGCCAACGAGAGCCGCTCGCCGTTCTGGTCAATGTCATCCGATTTGCTTGAGTCACTGGGAGAGACAGAAATGCGAACAAACAATTTTATAAGACCTTCCGGCACTTTTAATCGACATCGCGTCCGATGACCAGTCGTAGCTCAGATACAGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CNS08DHP             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GGCGGTCACTTCTGCGTCGTCCAGGTAGCGCAACTGCGGTAGAATACTGATCACGAACAGCCGGTAGTCGTTGTGTTCGAGCGTGGAGTTGCCGTTGAAGGAGGAGGTCGCACCCGGGTTACCCATCAGCGATAGGTACTTGAGCGAGGGGCAGCATTCGCGGATGCGATAGATCCAGTTCTGCAGGTTGATGATATCACAGTGGTTGAGCCAGAGCAGCTCCAGGTTGGGAAGGGTCGGTAGCGTTCGCTCGTCCGGCTGTACGTTCTTGTCCAGGATGAGTGTGTTCAGCTGCCGGAAGTGTGTCAGGAAGGAGAGGTCTTTGATTTCATTGTAGCTCAAATCGAGGATCGTCGTCGTGCGGGAGAACTTCTCGGCGATTTTGCGCGGGATCTGTGACAATCGTTCGTACGCCAACGAGAGCCGCTCGCCGTTCTGGTCAATGTCATCCGATTTGCTTGAGTCACTGGGAGAGACAGAGATGCGAACAAACAATTTTATAAGACCTTCCGGCACTTTTAATCGACATCGCGTCCGATGACCAGTCGTAGCTCAGATACAGCTCGTCGTCCTCGTCCATGGTGGAGTAATTGTCGACGAAAAATCGCTCATTGTAGCCGATGGCTTGCATAATTGATACTGATAAGGACGATGTTCTGGGACAATTTGTCAGAATGCTGTACAATTGTGACTCGTTTCACTTAAAGATGCCTCTGCTTTTTGTTAACCGTTTCTATTCACGATCTACAGAAAACGCACGCTATCGTTAGATTAGTTTAGAAATACATTCAAAC GATTGTTTCCCAAGATCGTGCTGGGTACAGCAGCATAACGAAACACAACACTAAACACAGCACAGCGAATGCTTAAAAC CTGCAACGAATCGAATCCGCTGTGGGCGATTGTGTGCCCTTTCTAGTCCGAGT AGTTTTAGCCGCGATAAGCGCGCGCTTCCTGTCGCGTGCTACCACACACTTGCTT]
[-] EMBL CNS08PAF             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GATCACGAACAGCCGGTAGTCGTTGTGTTCGAGCGTGGAGTTGCCGTTGAAGGAGGAGTTCGCACCCGGGTTACCCATCAGCGATAGGTACTTGAGCGAGGGGCAGAATTCGCGGATGCGATAGATCCAGTTCTGCAGGTTGATGATATCACAGTGGTTGAGCCAGAGCAGCTCCAGGTTGGGAAGGGTCGGTAGCGTTCGCTCGTCCGGCTGTACGTTCTTGTCCAGGATGAGTGTGTTCAGCTGCCGGAAGTGTGTCAGGAAGGAGAGGTCTTTGATTTCATTGTAGCTCAAATCGAGGATCGTCGTCGTGCGGGAGAACTTCTCGGCGATTTTGCGCGGGATCTGTGACAATCGTTCGTACGCCAACGAGAGCCGCTCGCCGTTCTGGTCAATGTCATCCGATTTGCTTGAGTCACTGGGAGAGACAGAGATGCGAACAAACAATTTTATAAGACCTTCCGGCACTTTTAATCGACATCGCGTCCGATGACCAGTCGTAGCTCAGATACAGCTCGTCGTCCTCGTCCATGGTGGAGTAATTGTCGACGAAAAATCGCTCATTGTAGCCGATGGCTTGCATAATTGATACTGATAAGGACGATGTTCTGGGACAATTTGTCAGAATGCTGTACAATTGTGA TCGTTTCACTTAAAGATGCCTCTGCTTTTTGTTAACCGTTTCTATTCACGATCTACAGAAAACGCACGCTATCGTTAGATTAGTTTAGAAATACATTCAAACAGATTGTTTCCCAAGATCGTGCTGGGTACAGCAGCATAACGAAACACAACACTAAACACAGCACAGCGAATGCTTAAAACACTGCAACGAATCGAATCCGCTGTGGGCGATTGTGTGCCCTTTCTAGTCCGAGTGAGTTTTAGCCGCGATA                                       ]
[-] EMBL BX602946             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GAGATGCGAAC AACAATTTTATAAGACCTTCCGGCACTTTTAATCGAAATCGCGTCCGATGACCAGTCGTAGCTCAGATACAGCTCGTCGTCCTCGTCCATGGTGGAGTAATTGTCGACGAAAAATCGCTCATTGTAGCCGATGGCTTGCATAATTGATACTGATAAGGACGATGTTCTGGGACAATTTGTCAGAATGCTGTACAATTGTGA TCGTTTCACTTAAAGATGCCTCTGCTTTTTGTTCACCGTTTCTATTCACGATCTACAGAAAACGCACGCTATCGTTAGATTAGTTTAGAAATACATTCAAAC GATTGTTTCCCAAGATCGTGCTGGGTACAGCAGCATAACGAAACACAACACTAAACACAGCACAGCGAATGCTTAAAAC CTGCAACGAATCGAATCCGCTGTGGGCGATTGTGTGCCCTTTCTAGTCCGAGT AGTTTTAGCCGCGATAAGCGCGCGCTTCCTGTCGCGTGCTACCACACA       ]


>consensus_4876#0 TTTTTGTTAAAGCTGTAATCGTGCACAAAGCATTCGTATAATGCTTTGAGGTCAATTGTT TATTACAAAAAATAAATGGAAGCACACCTTGCACCTTCCGTGCCTCGAGTAGGGAAGGTA ATTACGAATTTCCCTGTGACTGTGTGGCACCGTTGCGACGCTTTCGGGGTTTCTTCTGTG CGGTGCTGGACACCTTCGTCGAAGCTGCTGGTGACTGCTTAGAGGTTGATGTTACCGTCG AGGTCGTCGTTGGCGTTGTCTTAACCGTTGCTGTTGCTGTTACGGATGGTGTTGTGGTTA GAGCATCGGCCCCACTTGGCAGCAGTACCGGCTGCTGACGACGCCCTACCGTCTCGAAGA TGTTGTACGGTCCCTGGTTAAGGTTGTAGCTGTGCTTGAAGCTTTTCGCCTGCGTACGCT GGGCGGCGGTCACTTCTGCGTCGTCCAGGTAGCGCAACTGCGGTAGAATACTGATCACGA ACAGCCGGTAGTCGTTGTGTTCGAGCGTGGAGTTGCCGTTGAAGGAGGAGGTCGCACCCG GGTTACCCATCAGCGATAGGTACTTGAGCGAGGGGCAGCATTCGCGGATGCGATAGATCC AGTTCTGCAGGTTGATGATATCACAGTGGTTGAGCCAGAGCAGCTCCAGGTTGGGAAGGG TCGGTAGCGTTCGCTCGTCCGGCTGTACGTTCTTGTCCAGGATGAGTGTGTTCAGCTGCC GGAAGTGTGTCAGGAAGGAGAGGTCTTTGATTTCATTGTAGCTCAAATCGAGGATCGTCG TCGTGCGGGAGAACTTCTCGGCGATTTTGCGCGGGATCTGTGACAATCGTTCGTACGCCA ACGAGAGCCGCTCGCCGTTCTGGTCAATGTCATCCGATTTGCTTGAGTCACTGGGAGAGA CAGAGATGCGAACAAACAATTTTATAAGACCTTCCGGCACTTTTAATCGACATCGCGTCC GATGACCAGTCGTAGCTCAGATACAGCTCGTCGTCCTCGTCCATGGTGGAGTAATTGTCG ACGAAAAATCGCTCATTGTAGCCGATGGCTTGCATAATTGATACTGATAAGGACGATGTT CTGGGACAATTTGTCAGAATGCTGTACAATTGTGATCGTTTCACTTAAAGATGCCTCTGC TTTTTGTTAACCGTTTCTATTCACGATCTACAGAAAACGCACGCTATCGTTAGATTAGTT TAGAAATACATTCAAACGATTGTTTCCCAAGATCGTGCTGGGTACAGCAGCATAACGAAA CACAACACTAAACACAGCACAGCGAATGCTTAAAACCTGCAACGAATCGAATCCGCTGTG GGCGATTGTGTGCCCTTTCTAGTCCGAGTAGTTTTAGCCGCGATAAGCGCGCGCTTCCTG TCGCGTGCTACCACACACTTGCTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)