These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_4876#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1404 fasta sequence [TTTTTGTTAAAGCTGTAATCGTGCACAAAGCATTCGTATAATGCTTTGAGGTCAATTGTTTATTACAAAAAATAAATGGAAGCACACCTTGCACCTTCCGTGCCTCGAGTAGGGAAGGTAATTACGAATTTCCCTGTGACTGTGTGGCACCGTTGCGACGCTTTCGGGGTTTCTTCTGTGCGGTGCTGGACACCTTCGTCGAAGCTGCTGGTGACTGCTTAGAGGTTGATGTTACCGTCGAGGTCGTCGTTGGCGTTGTCTTAACCGTTGCTGTTGCTGTTACGGATGGTGTTGTGGTTAGAGCATCGGCCCCACTTGGCAGCAGTACCGGCTGCTGACGACGCCCTACCGTCTCGAAGATGTTGTACGGTCCCTGGTTAAGGTTGTAGCTGTGCTTGAAGCTTTTCGCCTGCGTACGCTGGGCGGCGGTCACTTCTGCGTCGTCCAGGTAGCGCAACTGCGGTAGAATACTGATCACGAACAGCCGGTAGTCGTTGTGTTCGAGCGTGGAGTTGCCGTTGAAGGAGGAGGTCGCACCCGGGTTACCCATCAGCGATAGGTACTTGAGCGAGGGGCAGCATTCGCGGATGCGATAGATCCAGTTCTGCAGGTTGATGATATCACAGTGGTTGAGCCAGAGCAGCTCCAGGTTGGGAAGGGTCGGTAGCGTTCGCTCGTCCGGCTGTACGTTCTTGTCCAGGATGAGTGTGTTCAGCTGCCGGAAGTGTGTCAGGAAGGAGAGGTCTTTGATTTCATTGTAGCTCAAATCGAGGATCGTCGTCGTGCGGGAGAACTTCTCGGCGATTTTGCGCGGGATCTGTGACAATCGTTCGTACGCCAACGAGAGCCGCTCGCCGTTCTGGTCAATGTCATCCGATTTGCTTGAGTCACTGGGAGAGACAGAGATGCGAACAAACAATTTTATAAGACCTTCCGGCACTTTTAATCGACATCGCGTCCGATGACCAGTCGTAGCTCAGATACAGCTCGTCGTCCTCGTCCATGGTGGAGTAATTGTCGACGAAAAATCGCTCATTGTAGCCGATGGCTTGCATAATTGATACTGATAAGGACGATGTTCTGGGACAATTTGTCAGAATGCTGTACAATTGTGA-TCGTTTCACTTAAAGATGCCTCTGCTTTTTGTTAACCGTTTCTATTCACGATCTACAGAAAACGCACGCTATCGTTAGATTAGTTTAGAAATACATTCAAAC-GATTGTTTCCCAAGATCGTGCTGGGTACAGCAGCATAACGAAACACAACACTAAACACAGCACAGCGAATGCTTAAAAC-CTGCAACGAATCGAATCCGCTGTGGGCGATTGTGTGCCCTTTCTAGTCCGAGT-AGTTTTAGCCGCGATAAGCGCGCGCTTCCTGTCGCGTGCTACCACACACTTGCTT] [+] EMBL CNS08DHQ [TTTTTGTTAAAGCTGTAATCGTGCACAAAGCATTCGTATAATGCTTTGAGGTCAATTGTTTATTACAAAAAATAAATGGAAGCACACCTTGCACCTTCCGTGCCTCGAGTAGGGAAGGTAATTACGAATTTCCCTGTGACTGTGTGGCACCGTTGCGACGCTTTCGGGGTTTCTTCTGTGCGGTGCTGGACACCTTCGTCGAAGCTGCTGGTGACTGCTTAGAGGTTGATGTTACCGTCGAGGTCGTCGTTGGCGTTGTCTTAACCGTTGCTGTTGCTGTTACGGATGGTGTTGTGGTTAGAGCATCGGCCCCACTTGGCAGCAGTACCGGCTGCTGACGACGCCCTACCGTCTCGAAGATGTTGTACGGTCCCTGGTTAAGGTTGTAGCTGTGCTTGAAGCTTTTCGCCTGCGTACGCTGGGCGGCGGTCACTTCTGCGTCGTCCAGGTAGCGCAACTGCGGTAGAATACTGATCACGAACAGCCGGTAGTCGTTGTGTTCGAGCGTGGAGTTGCCGTTGAAGGAGGAGGTCGCACCCGGGTTACCCATCAGCGATAGGTACTTGAGCGAGGGGCAGCATTCGCGGATGCGATAAATCCAGTTCTGCAGGTTGATGATATCACAGTGGTTGAGCCAGAACAGCTCCAGGTTGGGAAGGGTCGGTAGCGTTCGCTCGTCCGGCTGTACGTTCTTGTCCAGGATGAGTGTTTTCAGCTGCCGGAAGTGTGTCAGGAAGGAGAGGTCTTTGATTTCATTGTAGCTCAAATCGAGGATCGTCGTCGTGCGGGAGAACTTCTCGGCGATTTTGCGCGGGATCTGTGACAATCGTTCGTACGCCAACGAGAGCCGCTCGCCGTTCTGGTCAATGTCATCCGATTTGCTTGAGTCACTGGGAGAGACAGAAATGCGAACAAACAATTTTATAAGACCTTCCGGCACTTTTAATCGACATCGCGTCCGATGACCAGTCGTAGCTCAGATACAGCT ] [-] EMBL CNS08DHP [ GGCGGTCACTTCTGCGTCGTCCAGGTAGCGCAACTGCGGTAGAATACTGATCACGAACAGCCGGTAGTCGTTGTGTTCGAGCGTGGAGTTGCCGTTGAAGGAGGAGGTCGCACCCGGGTTACCCATCAGCGATAGGTACTTGAGCGAGGGGCAGCATTCGCGGATGCGATAGATCCAGTTCTGCAGGTTGATGATATCACAGTGGTTGAGCCAGAGCAGCTCCAGGTTGGGAAGGGTCGGTAGCGTTCGCTCGTCCGGCTGTACGTTCTTGTCCAGGATGAGTGTGTTCAGCTGCCGGAAGTGTGTCAGGAAGGAGAGGTCTTTGATTTCATTGTAGCTCAAATCGAGGATCGTCGTCGTGCGGGAGAACTTCTCGGCGATTTTGCGCGGGATCTGTGACAATCGTTCGTACGCCAACGAGAGCCGCTCGCCGTTCTGGTCAATGTCATCCGATTTGCTTGAGTCACTGGGAGAGACAGAGATGCGAACAAACAATTTTATAAGACCTTCCGGCACTTTTAATCGACATCGCGTCCGATGACCAGTCGTAGCTCAGATACAGCTCGTCGTCCTCGTCCATGGTGGAGTAATTGTCGACGAAAAATCGCTCATTGTAGCCGATGGCTTGCATAATTGATACTGATAAGGACGATGTTCTGGGACAATTTGTCAGAATGCTGTACAATTGTGACTCGTTTCACTTAAAGATGCCTCTGCTTTTTGTTAACCGTTTCTATTCACGATCTACAGAAAACGCACGCTATCGTTAGATTAGTTTAGAAATACATTCAAAC GATTGTTTCCCAAGATCGTGCTGGGTACAGCAGCATAACGAAACACAACACTAAACACAGCACAGCGAATGCTTAAAAC CTGCAACGAATCGAATCCGCTGTGGGCGATTGTGTGCCCTTTCTAGTCCGAGT AGTTTTAGCCGCGATAAGCGCGCGCTTCCTGTCGCGTGCTACCACACACTTGCTT] [-] EMBL CNS08PAF [ GATCACGAACAGCCGGTAGTCGTTGTGTTCGAGCGTGGAGTTGCCGTTGAAGGAGGAGTTCGCACCCGGGTTACCCATCAGCGATAGGTACTTGAGCGAGGGGCAGAATTCGCGGATGCGATAGATCCAGTTCTGCAGGTTGATGATATCACAGTGGTTGAGCCAGAGCAGCTCCAGGTTGGGAAGGGTCGGTAGCGTTCGCTCGTCCGGCTGTACGTTCTTGTCCAGGATGAGTGTGTTCAGCTGCCGGAAGTGTGTCAGGAAGGAGAGGTCTTTGATTTCATTGTAGCTCAAATCGAGGATCGTCGTCGTGCGGGAGAACTTCTCGGCGATTTTGCGCGGGATCTGTGACAATCGTTCGTACGCCAACGAGAGCCGCTCGCCGTTCTGGTCAATGTCATCCGATTTGCTTGAGTCACTGGGAGAGACAGAGATGCGAACAAACAATTTTATAAGACCTTCCGGCACTTTTAATCGACATCGCGTCCGATGACCAGTCGTAGCTCAGATACAGCTCGTCGTCCTCGTCCATGGTGGAGTAATTGTCGACGAAAAATCGCTCATTGTAGCCGATGGCTTGCATAATTGATACTGATAAGGACGATGTTCTGGGACAATTTGTCAGAATGCTGTACAATTGTGA TCGTTTCACTTAAAGATGCCTCTGCTTTTTGTTAACCGTTTCTATTCACGATCTACAGAAAACGCACGCTATCGTTAGATTAGTTTAGAAATACATTCAAACAGATTGTTTCCCAAGATCGTGCTGGGTACAGCAGCATAACGAAACACAACACTAAACACAGCACAGCGAATGCTTAAAACACTGCAACGAATCGAATCCGCTGTGGGCGATTGTGTGCCCTTTCTAGTCCGAGTGAGTTTTAGCCGCGATA ] [-] EMBL BX602946 [ GAGATGCGAAC AACAATTTTATAAGACCTTCCGGCACTTTTAATCGAAATCGCGTCCGATGACCAGTCGTAGCTCAGATACAGCTCGTCGTCCTCGTCCATGGTGGAGTAATTGTCGACGAAAAATCGCTCATTGTAGCCGATGGCTTGCATAATTGATACTGATAAGGACGATGTTCTGGGACAATTTGTCAGAATGCTGTACAATTGTGA TCGTTTCACTTAAAGATGCCTCTGCTTTTTGTTCACCGTTTCTATTCACGATCTACAGAAAACGCACGCTATCGTTAGATTAGTTTAGAAATACATTCAAAC GATTGTTTCCCAAGATCGTGCTGGGTACAGCAGCATAACGAAACACAACACTAAACACAGCACAGCGAATGCTTAAAAC CTGCAACGAATCGAATCCGCTGTGGGCGATTGTGTGCCCTTTCTAGTCCGAGT AGTTTTAGCCGCGATAAGCGCGCGCTTCCTGTCGCGTGCTACCACACA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||