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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5027#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1534 fasta sequence
[TGTAAACCAAGCGCGCAAAATAAAATTCATCGTAACGCGGGGAAGGACGAGAAAACAAAACGAAACAAGTGAAAAACAAACAAACTTACAAAAACAAAGCAAGATTGAAATCAACACCATCTGTGATACTAAAAAAGGGAGTTACGAGTAATGAAGAGAAGAAAACGCAAGCAAACAAACAAACAAACAAACGTAACGTTAACGTATAACATCAAAATGGTCAAAAAACAGAAAAAATCGAATGCTTAATGGTGACTTAAAGCCAAGCCAACGCCGCCCAACCGACAGTGGCAAGCAAAAAACCGTGGCAGCGGCCAGAT-AAAAAAAAAATGGTGGTTAACAACACAAACTAAGCGCTCAATATAAAACGTAACCGCACCATAAAAAAAATGAAAAAACGAAAGTACTGTAGAGAAGTGATAAAACGTACTGTTTAAATTAATATATCAATCGACCCACTCGCCCACCACCTTCTCGGTCGGTCGCGGATCGGAAGTAATTGGAAGCAAATTTAATTTAAATAATAAT--TTTGAAATTTGTTTTTGGTTTTGTCGTGTTTGTTTTATGTTGTAGATGTTGTGTTATAAAAGAATCAAGAGCAAGCACATTGTATACATTGTGAGCAAGTTAAGTCGGTAACAACAGCAAAAGCGACGAAAAATCGAAGCTTCGAAGAAGAGTAACTTAAACGAGCGATAAGCTACGAACAACCGCCAACTGTTCTATGAAGAAGAGAAACAGTTAGCAAAGAGAAAGAGAGAAGATAAATGTGCTAATTTGTGAAGTGAAGTGTGTGTGATATGGTGTGTATCACAACTCGATTCACGACGTACCGATCTTTTGAATCGTTTTACAGAGGGCAAACGTAGAATAATGGGAGGATTATTTTTTTAA-AACACACAGTCTTCACACATACTCTTCAAAACACTGTTGCGATCCTTGATGTGAACATTTAAAATAGCACGTCGCTTATACCGGAGAAAACAGCTATAAAGTGTGCTTCTTCCTTTTTAACGACACGCGTGCCCTCCTGGTACACTGAGTGAAGCAATATTTTCCTTGGGTTTTTGGATGTTTAAACCAAAACCCCTCGAAAAACGAAAATCCTACAATGGAATAGTGAAAAGGAATATTTTGAGTGTGTTTTATGTGTTGAACTTTTCTTTACTTTTTTTTCTAAAATGCTTTGCTAAGCTGACAGGACATTAACCTTGTCTACCAAAATGCAAACGCAAATTAGCAAATTTCCCCCACAATTAACCCCGCCGTGCACAGTAAAAGTGTGTGTGCATATGTGGTGCTTGTGTAAGTATGTATGTTTGCCCTTTCTTGTAATGACATAGTACGCGTACTACATGAATTCGCTGTGTGAACTCTATTATTCAGTCGTCAAACGCGGCAGTGCGCGTGATGCTATTAATCTCTTACGATTGAACAGCAAATGTAATGCAAAAAACCCCGGTCACTGNTGTGCAACTGTGTGTACACAGCTGTACGGTAATCTACATAAATCAACCCTTCTATTCTGTCTCTC]
[-] EMBL AGA284187 [TGTAAACCAAGCGCGCAAAATAAAATTCATCGTAACGCGGGGAAGGACGAGAAAACAAAACGAAACAAGTGAAAAACAAACAAACTTACAAAAACAAAGCAAGATTGAAATCAACACCATCTGTGATACTAAAAAAGGGAGTTACGAGTAATGAAGAGAAGAAAACGCAAGCAAACAAACAAACAAACAAACGTAACGTTAACGTATAACATCAAAATGGTCAAAAAACAGAAAAAATCGAATGCTTAATGGTGACTTAAAGCCAAGCCAACGCCGCCCAACCGACAGTGGCAAGCAAAAAACCGTGGCAGCGGCCAGAT AAAAAAAAAATGGTGGTTAACAACACAAACTAAGCGCTCAATATAAAACGTAACCGCACCATAAAAAA ]
[+] EMBL BX605540 [ GCGGCCAGATAAAAAAAAAAATGGTGGTTAACAACACAAACTAAGCGCTCAATATAAAACGTAACCGCACCATAAAAAAAATGAAAAAACGAAAGTACTGTAGAGAAGTGATAAAACGTACTGTTTAAATTAATATATCAATCGACCCACTCGCCCACCACCTTCTCGGTCGGTCGCGGATCGGAAGTAATTGGAAGCAAATTTAATTTAAATAATAAT TTTGAAATTTGTTTTTGGTTTTGTCGTGTTTGTTTTATGTTGTAGATGTTGTGTTATAAAAGAATCAAGAGCAAGCACATTGTATACATTGTGAGCAAGTTAAGTCGGTAACAACAGCAAAAGCGACGAAAAATCGAAGCTTCGAAGAAGAGTAACTTAAACGAGCGATAAGCTACGAACAACCGCCAACTGTTCTATGAAGAAGAGAAACAGTTAGCAAAGAGAAAGAGAGAAGATAAATGTGCTAATTTGTGAAGTGAAGTGTGTGTGATATGGTGTGTATCACAACTCGATTCACGACGTACCGAT ]
[+] EMBL BM618459 [ ccgCTTCTCGGTCGGTCGCGGATCGGAAGTAATTGGAAGCAAATTTAATTTAAATAATAATGGTTTGAAATTTGTTTTTGGTTTTGTCGTGTTTGTTTTATGTTGTAGATGTTATGTTATAAAAGAATGAAGAGCAAGCACATTGTATACATTGTGAGCAAGTAAAGTCGGTAACAACAGCAAAAGCGACGAAAAATCGAAGCTTCGAAGATGAGTAACTTAAACGAGCGAAAAGCTACGAACAACCGCCTACTGTTCTATGAAGAAGAGAAACAGTTAGCAAAGAGAAAGAGAGAAGATAAATGTGCTATTTTGTGAAGTGAAGTCCGTGTGATATGGTGTGTATCAGCACTCGATCCACGACGTACCGATCTTTTGAATCGTTTTACAGAGGGCAAACGTAGAATAATGGGAGGATTATTTTTTTAA AACACACAGTCTTCACACATACTCTTCAAAACACTGTTGCGATCCTTGATGTGAACATTTAAAATAGCACGTCGCTTATACCGGAGAAAACAGCTATAAAGTGTGCTTCTTCCTTTTTAACGACACGCGTGCCCTCCTGGTACACTGAGTGAAGCAATATTTTCCTTGGGTTTTTGGATGTTTAAACCAAAACCCCTCGAAAAACGAAA ]
[+] EMBL BX621691 [ GTGTATCACAACTCGATTCACGACGTACCGATCTTTTGAATCGTTTTACAAAGGGCAAACGCGGAATAATGGAAGGATT TTAATTTAACAACACACAGTCTTCACACATACTCTTCAAAACACTGTTGCGATCCTTGGTGTGGACATTTAAAATAGCACGTCGCTTATACCGGAGAAAACAGCTATAAAGTGTGCTTCTTCCTTTTTAATGACACGCGTGTCCTCCTGGTACACTGAGTGAAGCAATATTTTCCTTGCTTTTTTGGATGTTTAAACCAAAACCCCTTGAAAAACGAAAATCCTACAATGGAATAGTGAAAAGGAATATTTTGAGTGTGTTTTATGTGTTGAACTTTTCTTTACTTTTTTTTCTAAAATGCTTTGCTAAGCTGACAGGACATTAACCTTGTCTACCAAAATGCAAACGCAAATTAGCAAATTTCCCCCACAATTAACCCCGCCGTGCACAGTAAAAGTGTGTGTGCATATGTGGTGCTTGTGTAAGTATGTATGTTTGCCCTTTCTTGTAATGACATAGTACGCGTACTACATGAATTCGCTGTGTGAACTCTATTATTCAGTCGTCAAACGCGGCAGTGCGCGTGATGCTATTAATCTCTTACGATTGAACAGCAAATGTAATGCAAAAAACCCCGGTCACTGNTGTGCAACTGTGTGTACACAGCTGTACGGTAATCTACATAAATCAACCCTTCTATTCTGTCTCTC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||