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Anopheles gambiae
cluster # 5137 cluster # 5137       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5137#0 length = 2541 sequences # 4  

consensusID : consensus_5137#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 2541
fasta sequence
                              [CTATCCTTCAGCTGTCCGCTGTTTCGCTCTCAATCAACTAAGGAAACTAACTCTCTGTATGATAAACGCTACTTTTAAAATGAGCAATTCAAAGTGAAAACGCCTGCTACTGGTGAAACAAAACACGTAATTGTTGAAATGAGATTATTTACAAAACAAATTGAAAACTTTTTTTACCATGTTTTTTTAAGATTTTCTTTTCATAGAACGTCTTAAGCATTTCTTAAAGGTTAATTTGCTCCTAAGCAACTGTCCTGCGGGTACACCTGGAAGCCTAAAATTAATTAAAACTGGTTCCATAAAACATTAGTCAGCTCTGTTTAGCTTACTTAGTATTTACTTATTTTTTGTCTCAAAAAACCTTTAATTTTCTTTTTTTTCTGATACACACGATTCAACATCGAC-TTCCAACAACCGGCTGAAGGATGTCGCTCAGTCAGTTGGTTAGAGCTTGGGTATGACATTTTTTTTAATTTGTGTAACACTCACTTTTGGGAAAATGAAAATTGACCATATTTTTTTTTTAATTTGACTTTAGCGAAAAGAAAATTGACCGAGTAGTGTTTCGGGGAGAATCGGGATCATCACTATAGGGGAAAACACTGATCATTGCTCTACTGTAGAAGAGTGTAGTGAGCTAACACACGCTACTAAAGGTGTCCGGACCTTGATCCACAGTCAAATTCCATTATGTCGTCTACGTCGTACGTTTAACAATCGGTTCAGTTGTTTTTGTTTTTCCCCGGTATAAGCGCGATCATCCGCTTTCCGTTCGATAGTGGGGTGTTGTGTGACATTGAAAATTTCAAAGGGAGTTGCGGGCTAACTGGTTGCTGAAACTTGCATTCACTTCACGGTAGATCACGCTGTTGTCTATGAGAAAAAATATCATGGCATTGGCATTCATATGTGTGTGTGTGTTTTTCGACGGACAGAAGAACGCAACGAATTTCATCCCTTCGTTATGCTTCGTTGTCGGTTTGGCCGATTATTGAACCAACTGGACTTTGGTTTGATAAGTTGTAGTTCTAATAATATCTAATAAGATTGAACATTGTCTGTGAATAATAAACATAAATGTAAGAAGCCAACCGGTCACAATGCGACCAACCGAATGCGACTACGAAGGATGCATTTCTTTCGATGAATTGCGTTAGCTCTTCTTGGGCCAAAAAAGGCAGATTCTTTTGGCATCGGTTTGTGAAGAAAATATGTGACTTATCCGAGGCGGTATCAATGCTATGCAGCTCATGGGAAGTGTTTCTGTTCTAATTTTATGTTCCACGTTTCAGTTCGATTTCGATTCGACTCACGCTGTAACCGTTTCTTATGCAAAAGATGCAACGAAAGCAAGCGCTCGCTCGCCACGCGGCTTGCCACAATTGCCCAAAGGAACTGACGCGTTTATTTTGTGGTCATTTTGCTGTCCCAAACGCTTGACCGGAAGCTGACCCACAGCAGAGAAGCACTCGCTCACCAATACTTTAATGCAATTAGTTTTGCTAACCTTGAATGGTTTTGCCCCTTTTTTTTGTTGCCTTTTCTTTTTCGCCGCTCATATTAGCATTTTGCTCACATTCTACATTCTACCCAAAGGGTTTTCCGCATTGTTACACGTCGGTTTTTTAAATTCTCGTACTAGCCTACATCACAGTCTCATAGCGGTTGCATTTTCATTCGCTTGTTGGAATTGTATTTAGAAAAAAAAGAAGCAAAACCATTCCCCGAGAACATCGGCAAAGACTCATTCGCTCACCATCATCTACTTCTTCTGCTAGAGATAGTAGGTAAGTTACGAGGGAAGAAACCATAAGGAAAGCAATTATGTGTCGAGAGAAACTTTCCGCTAACGTATAGCAAATAGGAAAACTCAAAGCACAGCACCGGCACACGTACGGACGGATTGTAATGGAGGTCGGAAATGGAAAGCTTCCGTGGGGGAAATTGATTTTCGTTTACCTTTTTCCCTTTGTTCGGTTTCCTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGGTTCTTTAACCTTGGCTGTCATTGATGTGCAAGAAAGTGGTGAAAACTGACTTAAAGTGGCCCACTAATGGGGGGAGAGAAAATGCATTTCAGCAAACCGTGTGCGTTACCGTGTCATCGGTAGAAATATGTGAATTATTTAAAGCTTGTTCAAGTGCTGCAGGTTTGCTGAAGCTAACAAAACAAAATATGTTTCCCTTGCGTTGCTTTCGAATCAAACAAAAGCCATTATAAAATCAAAGTAACGTCTTGCCCTCGCTACATGGAACTCTACAGAAGAGCAGAACGAAAAGCATGAATACAGGCTCTTTTCTGCTTACAAAGCATCATTGATAGCACACAATGCAGTCACAATTCAGACGCTCGAGAGGAGCACTTCACAATTGTTCACCTGTGCTTGGATGGTACTTACTGGTGGAAACGCTTCCTATAATCCTGCGAGTGTTAAGCGAAGGTTGCTTTCCGAAGCTACCGGAAAGCATGAAAGGTACGCTTACAACCCGTACTGCAGTGTGAAAACAGTGCTGTGGATGTACGTC]

[-] EMBL BM636039             [CTATCCTTCAGCTGTCCGCTGTTTCGCTCTCAATCAACTAAGGAAACTAACTCTCTGTATGATAAACGCTACTTTTAAAATGAGCAATTCAAAGTGAAAACGCCTGCTACTGGTGAAACAAAACACGTAATTGTTGAAATGAGATTATTTACAAAACAAATTGAAAACTTTTTTTACCATGTTTTTTTAAGATTTTCTTTTCATAGAACGTCTTAAGCATTTCTTAAAGGTTAATTTGCTCCTAAGCAACTGTCCTGCGGGTACACCTGGAAGCCTAAAATTAATTAAAACTGGTTCCATAAAACATTAGTCAGCTCTGTTTAGCTTACTTAGTATTTACTTATTTTTTGTCTCAAAAAACCTTTAATTTTCTTTTTTTTCTGATACACACGATTCAACATCGACTTTCCAACAACCGGCTGAAGGATGTCGCTCAGTCAGTTGGTTAGAGCTTGGGTATGACATTTTTTTTAATTTGTGTAACACTCACTTTTGGGAAAATGAAAATTGACCATATTTTTTTTTTAATTTGACTTTAGCGAAAAGAAAATTGACCGAGTAGTGTTTCGGGGAGAATCGGGATCATCACTATAGGGGAAAACACTGATCATTGCTCTACTGTAGAAGAGTGTAGTGAGCTAACACACGCTACTAAAGGTGTCCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL BX613210             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CGATTCAACATCGAC TTCCAACAACCGGCTGAAGGATGTCGCTCAGTCAGTTGGTTAGAGCTTGGGTATGACATTTTTTTTAATTTGTGTAACACTCACTTTTGGGAAAATGAAAATTGACCATATTTTTTTTTTAATTTGACTTTAGCGAAAAGAAAATTGACCGAGTAGTGTTTCGGGGAGAATCGGGATCATCACTATAGGGGAAAACACTGATCATTGCTCTACTGTAGAAGAGTGTAGTGAGCTAACACACGCTACTAAAGGTGTCTGTACCTTGATCCACAGTCAAATTCCATTATGTCGTCTACGTCGTACGTTTAACAATCGGTTCAGTTGTTTTTGTTTTTCCCCGGTATAAGCGCGATCATCCGCTTTCCGTTCGATAGTGGGGTGTTGTGTGACATTGAAAATTTCAAAGGGAGTTGCGGGCTAACTGGTTGCTGAAACTTGCATTCACTTCACGGTAGATCACGCTGTTGTCTATGAGAAAAAATATCATGGCATTGGCATTCATATGTGTGTGTGTGTTTTTCGACGGACAGAAGAACGCAACGAATTTCATCCCTTCGTTATGCTTCGTTGTCGGTTTGGCCGATTATTGAACCAACTGGACTTTGGTTTGATAAGTTGTAGTTCTAATAATATCTAATAAGATTGAACATTGTCTGTGAATAATAAACATAAATGTAAGAAGCCAACCGGTCACAATGCGACCAACCGAATGCGACTACGAAGGATGCATTTCTTTCGATGAATTGCGTTAGCTCTTCTTGGGCCAAAAAAGGCAGATTCTTTTGGCATCGGTTTGTGAAGAAAATATGTGACTTATCCGAGGCGGTATCAATGCTATGCAGCTCATGGGAAGTGTTTCTGTTCTAATTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL BX628107             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TATCNGAGGCGGTATCAATGCTATGCAGCTCATGGGAAGTGTTTCTGTTCTAATTTTATGTTCCACGTTTCAGTTCGATTTCGATTCGACTCACGCTGTAACCGTTTCTTATGCAAAAGATGCAACGAAAGCAAGCGCTCGCTCGCCACGCGGCTTGCCACAATTGCCCAAAGGAACTGACGCGTTTATTTTGTGGTCATTTTGCTGTCCCAAACGCTTGACCGGAAGCTGACCCACAGCAGAGAAGCACTCGCTCACCAATACTTTAATGCAATTAGTTTTGCTAACCTTGAATGGTTTTGCCCCTTTTTTTTGTTGCCTTTTCTTTTTCGCCGCTCATATTAGCATTTTGCTCACATTCTACATTCTACCCAAAGGGTTTTCCGCATTGTTACACGTCGGTTTTTTAAATTCTCGTACTAGCCTACATCACAGTCTCATAGCGGTTGCATTTTCATTCGCTTGTTGGAATTGTATTTAGAAAAAAAAGAAGCAAAACCATTCCCCGAGAACATCGGCAAAGACTCATTCGCTCACCATCATCTACTTCTTCTGCTAGAGATAGTAGGTAAGTTACGAGGGAAGAAACCATAAGGAAAGCAATTATGTGTCGAGAGAAACTTTCCGCTAACGTATAGCAAATAGGAAAACTCAAAGCACAGCACCGGCACACGTACGGACGGATTGTAATGGAGGTCGGAAATGGAAAGCTTCCGTGGGGGAAATTGATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CNS098F1             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTAGCATTTTGCTCACATTCTACATTCTACCCAAAGGGTTTTCCGCATTGTTACACGTCGGTTTTTTAAATTCTCGTACTAGCCTACATCACAGTCTCATAGCGGTTGCATTTTCATTCGCTTGTTGGAATTGTATTTAGAAAAAAAAGAAGCAAAACCATTCCCCGAGAACATCGGCAAAGACTCATTCGCTCACCATCATCTACTTCTTCTGCTAGAGATAGTAGGTAAGTTACGAGGGAAGAAACCATAAGGAAAGCAATTATGTGTCGAGAGAAACTTTCCGCTAACGTATAGCAAATAGGAAAACTCAAAGCACAGCACCGGCACACGTACGGACGGATTGTAATGGAGGTCGGAAATGGAAAGCTTCCGTGGGGGAAATTGATTTTCGTTTACCTTTTTCCCTTTGTTCGGTTTCCTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGGTTCTTTAACCTTGGCTGTCATTGATGTGCAAGAAAGTGGTGAAAACTGACTTAAAGTGGCCCACTAATGGGGGGAGAGAAAATGCATTTCAGCAAACCGTGTGCGTTACCGTGTCATCGGTAGAAATATGTGAATTATTTAAAGCTTGTTCAAGTGCTGCAGGTTTGCTGAAGCTAACAAAACAAAATATGTTTCCCTTGCGTTGCTTTCGAATCAAACAAAAGCCATTATAAAATCAAAGTAACGTCTTGCCCTCGCTACATGGAACTCTACAGAAGAGCAGAACGAAAAGCATGAATACAGGCTCTTTTCTGCTTACAAAGCATCATTGATAGCACACAATGCAGTCACAATTCAGACGCTCGAGAGGAGCACTTCACAATTGTTCACCTGTGCTTGGATGGTACTTACTGGTGGAAACGCTTCCTATAATCCTGCGAGTGTTAAGCGAAGGTTGCTTTCCGAAGCTACCGGAAAGCATGAAAGGTACGCTTACAACCCGTACTGCAGTGTGAAAACAGTGCTGTGGATGTACGTC]


>consensus_5137#0 CTATCCTTCAGCTGTCCGCTGTTTCGCTCTCAATCAACTAAGGAAACTAACTCTCTGTAT GATAAACGCTACTTTTAAAATGAGCAATTCAAAGTGAAAACGCCTGCTACTGGTGAAACA AAACACGTAATTGTTGAAATGAGATTATTTACAAAACAAATTGAAAACTTTTTTTACCAT GTTTTTTTAAGATTTTCTTTTCATAGAACGTCTTAAGCATTTCTTAAAGGTTAATTTGCT CCTAAGCAACTGTCCTGCGGGTACACCTGGAAGCCTAAAATTAATTAAAACTGGTTCCAT AAAACATTAGTCAGCTCTGTTTAGCTTACTTAGTATTTACTTATTTTTTGTCTCAAAAAA CCTTTAATTTTCTTTTTTTTCTGATACACACGATTCAACATCGACTTCCAACAACCGGCT GAAGGATGTCGCTCAGTCAGTTGGTTAGAGCTTGGGTATGACATTTTTTTTAATTTGTGT AACACTCACTTTTGGGAAAATGAAAATTGACCATATTTTTTTTTTAATTTGACTTTAGCG AAAAGAAAATTGACCGAGTAGTGTTTCGGGGAGAATCGGGATCATCACTATAGGGGAAAA CACTGATCATTGCTCTACTGTAGAAGAGTGTAGTGAGCTAACACACGCTACTAAAGGTGT CCGGACCTTGATCCACAGTCAAATTCCATTATGTCGTCTACGTCGTACGTTTAACAATCG GTTCAGTTGTTTTTGTTTTTCCCCGGTATAAGCGCGATCATCCGCTTTCCGTTCGATAGT GGGGTGTTGTGTGACATTGAAAATTTCAAAGGGAGTTGCGGGCTAACTGGTTGCTGAAAC TTGCATTCACTTCACGGTAGATCACGCTGTTGTCTATGAGAAAAAATATCATGGCATTGG CATTCATATGTGTGTGTGTGTTTTTCGACGGACAGAAGAACGCAACGAATTTCATCCCTT CGTTATGCTTCGTTGTCGGTTTGGCCGATTATTGAACCAACTGGACTTTGGTTTGATAAG TTGTAGTTCTAATAATATCTAATAAGATTGAACATTGTCTGTGAATAATAAACATAAATG TAAGAAGCCAACCGGTCACAATGCGACCAACCGAATGCGACTACGAAGGATGCATTTCTT TCGATGAATTGCGTTAGCTCTTCTTGGGCCAAAAAAGGCAGATTCTTTTGGCATCGGTTT GTGAAGAAAATATGTGACTTATCCGAGGCGGTATCAATGCTATGCAGCTCATGGGAAGTG TTTCTGTTCTAATTTTATGTTCCACGTTTCAGTTCGATTTCGATTCGACTCACGCTGTAA CCGTTTCTTATGCAAAAGATGCAACGAAAGCAAGCGCTCGCTCGCCACGCGGCTTGCCAC AATTGCCCAAAGGAACTGACGCGTTTATTTTGTGGTCATTTTGCTGTCCCAAACGCTTGA CCGGAAGCTGACCCACAGCAGAGAAGCACTCGCTCACCAATACTTTAATGCAATTAGTTT TGCTAACCTTGAATGGTTTTGCCCCTTTTTTTTGTTGCCTTTTCTTTTTCGCCGCTCATA TTAGCATTTTGCTCACATTCTACATTCTACCCAAAGGGTTTTCCGCATTGTTACACGTCG GTTTTTTAAATTCTCGTACTAGCCTACATCACAGTCTCATAGCGGTTGCATTTTCATTCG CTTGTTGGAATTGTATTTAGAAAAAAAAGAAGCAAAACCATTCCCCGAGAACATCGGCAA AGACTCATTCGCTCACCATCATCTACTTCTTCTGCTAGAGATAGTAGGTAAGTTACGAGG GAAGAAACCATAAGGAAAGCAATTATGTGTCGAGAGAAACTTTCCGCTAACGTATAGCAA ATAGGAAAACTCAAAGCACAGCACCGGCACACGTACGGACGGATTGTAATGGAGGTCGGA AATGGAAAGCTTCCGTGGGGGAAATTGATTTTCGTTTACCTTTTTCCCTTTGTTCGGTTT CCTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGGTTCTTTAACCTTGGCTGTCATTGATGTGCAAGAAAGT GGTGAAAACTGACTTAAAGTGGCCCACTAATGGGGGGAGAGAAAATGCATTTCAGCAAAC CGTGTGCGTTACCGTGTCATCGGTAGAAATATGTGAATTATTTAAAGCTTGTTCAAGTGC TGCAGGTTTGCTGAAGCTAACAAAACAAAATATGTTTCCCTTGCGTTGCTTTCGAATCAA ACAAAAGCCATTATAAAATCAAAGTAACGTCTTGCCCTCGCTACATGGAACTCTACAGAA GAGCAGAACGAAAAGCATGAATACAGGCTCTTTTCTGCTTACAAAGCATCATTGATAGCA CACAATGCAGTCACAATTCAGACGCTCGAGAGGAGCACTTCACAATTGTTCACCTGTGCT TGGATGGTACTTACTGGTGGAAACGCTTCCTATAATCCTGCGAGTGTTAAGCGAAGGTTG CTTTCCGAAGCTACCGGAAAGCATGAAAGGTACGCTTACAACCCGTACTGCAGTGTGAAA ACAGTGCTGTGGATGTACGTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)