These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5179#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1680 fasta sequence [TTTCGAATAGCGCTTTTTTATTGATGGTTCATCTTTTGTTTCCTTATTTACCCACTGTTTCGGTGCACGTTTAATCCATCCTAGCCGCGTGTGGCTGCATGCAGCGCAGACAATACTCGACAAACTTTAGGTCCTTTACGTACTCGGTGAGTCGCTTGAAGTGCCGCTCCGTGTACGGAAGCGACGCTTCGAGGTGTTTGTTCAGCTCGCTTACCTGAAACCGGCCCGCCAGCGTCTCCTGCAGCAGTACGTTCAGCGCCACGAGCCGGTCGGCAATTTTTGCTGTTTGTGTTCCACTCGATCGCGTGCCGGAGCAGTCGCTCTTTGTGATCGTTCGACAACTTTGTTCACAGTGTCCTCCAGGCCTTGCTCCTTCGTTCGGATCACCTCGTTAACGATCTTCAGCGTGCTGAGCGGCCGGTCGAGGTTGAGCGACAGGCGCA-CGCTTTCAGCAGCTTCCGCTCGCTCAACAGATTGCTCAGCTCCTGCTCCTGTAGCAGCGTGTCCTTGCGCTGGTCCAGCTCCTGCTGACGTTTGCTTTCCGTAACATCCTGCCACTGGATGAGCTGCGAGTCGGACCCACCGCTGTAGAACATACTCTCGTCCCGCGTCACACACAGCGCCCAGACGCGGTTATCGTGCTTGTCCAGCGTCTGCACACAGTCGGAGGTTTTGATCGACCACAGCTTTACCAGCCCGTCCGCACCCGCCGACAGCAGCTGCATACCGTTGGTGAGAAACTCGACGCGCAGCACC-GAGCTGTCGTGCCCTTCGAGCGTTTTCAGGCAGGTCATATCCTCCAGCGACCACAGTTTGATGGTGCAGTCGGCCGCATTGGTGAGCAGTATCTGATCGACCGGGGAAAACCGTACCGCCCAGATGCCACGCGTATGGCCGCGGAACACGCCCACCACGCTCAGATCGCTCGCGTCCCACAGTTTGGCCGTTTTGTCCTGCGAAGCCGTCGCTATCAGCGGA-CGCGTGGGCGGAATGGTCACACAGTTAATGTCCTTCTCGTGGGCCAACGCGGTCAGGCTGCACTGTAGCCGCGGCAGCTCGCCGTCCTCTTCGGTGGTGAACTTTTTCGGTATTTTCCACGTCTTCAGGCAACGGTCCTGACTGAC-GCTGGCACAGAAATTACCGCCCTGCCTGCTCAGCGTCAC-ACACCCGACCGTGTTCGTGTGCTTCAGCCCGATCGCAACGCAGCTGATCGTGANCGGTTCCTCGGTAAAGCTCCACAGGCGGATCGAGTTATCCTTGG-AGGAGGAAAGC-AAATACCGATCGTTTGCACACAGCG-ACAGCAC-AATGTCCGGTCGTGCGCCCTTCACCAGCCGNCAGTTACATCGTGCTCACGTCGTACACCTTAAAAGTCGCTATCTGTTNGTTGCCATGGCCGATGCTGCTGCTCGCGCATTTGGACCGAACAAGAATCAAGGCTCCCAANTATNTCGCACGTTGTAGCNCCGACGATCTAGCTAGTTGTCACAGCTAGTAGAAGCTGTGTCGCAATACCGATGCACCCAGAATGTTCTGGTCGCCTCAACATCAGACACACCAGTGCTGACNGTCGNGGCTACACTGTAGAACAGGTGCGTAATAGCCAGCCCACCCTCTTCACGCCGCTTTCGCCACGAGACTGTTCGACTGTTTGAAGATATCTTGCAAAACCTCGGGGGATTC] [+] EMBL CNS08SSL [TTTCGAATAGCGCTTTTTTATTGATGGTTCATCTTTTGTTTCCTTATTTACCCACTGTTTCGGTGCACGTTTAATCCATCCTAGCCGCGTGTGGCTGCATGCAGCGCAGACAATACTCGACAAACTTTAGGTCCTTTACGTACTCGGTGAGTCGCTTGAAGTGCCGCTCCGTGTACGGAAGCGACGCTTCGAGGTGTTTGTTCAGCTCGCTTACCTGAAACCGGCCCGCCAGCGTCTCCTGCAGCAGTACGTTCAGCGCCACGAGCCGGTCGGCAATTTTTGCTGTTTGTGTTCCACTCGATCGCGTGCCGGAGCAGTCGCTCTTTGTGATCGTTCGACAACTTTGTTCACAGTGTCCTCCAGGCCTTGCTCCTTCGTTCGGATCACCTCGTTAACGATCTTCAGCGTGCTGAGCGGCCGGTCGAGGTTGAGCGACAGGCGCA CGCTTTCAGCAGCTTCCGCTCGCTCAACAGATTGCTCAGCTCCTGCTCCTGTAGCAGCGTGTCCTTGCGCTGGTCCAGCTCCTGCTGACGTTTGCTTTCCGTAACATCCTGCCACTGGATGAGCTGCGAGTCGGACCCACCGCTGTAGAACATACTCTCGTCCCGCGTCACACACAGCGCCCAGACGCGGTTATCGTGCTTGTCTAGCGTTTGCACACAGTCGGAGGTTTTGATTGACCACAGCTTTACCAGCCCGTCTGCACCCGCCGACAGCAGCTGCATACCGTTGGTGAGAAACTCGACGCGCA CACCGGAGCTATCGTGCCCTTCGAGCGTTTTCAGGCAGGTCATGTCCTCCAGCGACCACAGCTTGATGGTGCAGTCGGCCGC ] [-] EMBL BM649615 [ CAGGCGCAGCGCTTTCAGCAGCTTCCGCTCGCTCAACAGATTGCTCAGCTCCTGCTCCTGTAGCAGCGTGTCCTTGCGCTGGTCCAGCTCCTGCTGACGTTTGCTTTCCGTAACATCCTGCCACTGGATGAGCTGCGAGTCGGAGCCACCGCTGTAGAACATACTCTCATCCCGCGTCACACACAGCGCCCAGACGCGGTTATCGTGCTTGTCCAGCGTCTGCACACAGTCGGAGGTTTTGATCGACCACAGCTTTACCAGCCCGTCCGCACCCGCCGACAGCAGCTGCATACCGTTGGTGAGAAACTCGACGCGCAGCACC GAGCTGTCGTGCCCTTCGAGCGTTTTCAGGCAGGTCATATCCTCCAGCGACCACAGTTTGATGGTGCAGTCGGCCGCATTGGTGAGCAGTATCTGATCGACCGGGGAAAACCGTACCGCCCAGATGCCACGCGTATGGCCGCGGAACACGCCCACCACGCTCAGATCGCTCGCGTCCCACAGTTTGGCCGTTTTGTCCTGCGAAGCCGTCGCTATCAGCGGA CGCGTGGGCGG ] [-] EMBL BX620250 [ CCAGCGTCTGCACACAGTCGGAGGTTTTGATCGACCACAGCTTTACCAGCCCGTCCGCACCCGCCGACAGCAGCTGCATACCGTTGGTGAGAAACTCGACGCGCAGCACC GAGCTGTCGTGCCCTTCGAGCGTTTTCAGGCAGGTCATATCCTCCAGCGACCACAGTTTGATGGTGCAGTCGGCCGCATTGGTGAGCAGTATCTGATCGACCGGGGAAAACCGTACCGCCCAGATGCCACGCGTATGGCCGCGGAACACGCCCACCACGCTCAGATCGCTCGCGTCCCACAGTTTGGCCGTTTTGTCCTGCGAAGCCGTCGCTATCAGCCGATCG TTCGGCGAAATGGTCACACAGTTAATGTCCTTCTCGTGGGCCAACGCGGTCAGGCTGCACTGTAGCCGCGGCAGCTCGCCGTCCTCTTCGGTGGTGAACTTTTTCGGTATTTTCCACGTCTTCAGGCAACGGTCCTGACTGAC GCTGGCACAGAAATTACCGCCCTGCCTGCTCAGCGTCAC ACACCCGACCGTGTTCGTGTGCTTCAGCCCGATCGCAACGCAGCTGATCGTGANCGGTTCCTCGGTAAAGCTCCACAGGCGGATCGAGTTATCCTTGG AGGAGGAAAGC AAATACCGATCGTTTGCACACAGCG ACAGCAC AATGTCCG ] [-] EMBL AL694866 [ TTTTCGGTATTTNCCACGTCTTCAGGCAACGGTCCTGACTGACAGCTGGCACAGAAATNACCGCCCTGCCTGCTCAGCGTCACAACACCCGACCGTGTTCGTGTGCTTCAGCCCGATCGCAACGCAGCTGATCGTGAACGGTTCCTCGGTAAAGCTCCACAGCCGGATCGAGTTATCCTTGGAAGGAGGAAAGCAAAATACCGATCGTTTGCACACAGCGNACAGCACAAATGTCACGTCGTGCGCCCTTCACCAGCCGNCAGTTACATCGTGCTCACGTCGTACACCTTAAAAGTCGCTATCTGTTNGTTGCCATGGCCGATGCTGCTGCTCGCGCATTTGGACCGAACAAGAATCAAGGCTCCCAANTATNTCGCACGTTGTAGCNCCGACGATCTAGCTAGTTGTCACAGCTAGTAGAAGCTGTGTCGCAATACCGATGCACCCAGAATGTTCTGGTCGCCTCAACATCAGACACACCAGTGCTGACNGTCGNGGCTACACTGTAGAACAGGTGCGTAATAGCCAGCCCACCCTCTTCACGCCGCTTTCGCCACGAGACTGTTCGACTGTTTGAAGATATCTTGCAAAACCTCGGGGGATTC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||