These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5197#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1230 fasta sequence [GGCAGAATCGCCACGAGGGTCCCTGTAGGTTGTACATTTTAAGCTAGAATCTGAAGAGAGGGACACAAAACACAGAGACAACCGTGTCAACCGAGTACTCTACCAGACAGTCGTTATATACAAAATAAAAGAGCTGTATTTAATTCCTAAAGATGCGGGTGCATCAACTGCAACAGCAACCTGCAACCAATTGCTCAGTACCGACGCTCAATGCTAGGGAGAATGAATTAGAGGAAAACAGAAGGCTGATTGGGTGTGTGAGACGTGAATAGTAGAAATTTGAAAAGGGGAATCGCGATATATTATATTGCACATGGTGCAATAATGAGAACAGCTTTGCTGGAAAGGAATGCCAACCATATTGCGTGAGATGTGTAAAGGAAATGCCGTGTTCGGCCAACGGCTGAACGGATCAGATATTTTGTAATTTATTTGTTAATGTT-TTTTTCTCCTTTCGTCATGTGTGTTT-TGTGAGTTTGTGTTATTTTTGAAATTT------TTTTTTTTATCGAGAGTATATATGTTTATTTTTAGTT-TGT-T-GTCTAGGTTGTTCCATATTACCATTT-GTTAGAAAATGTTGCCTTTTCCCACGTCCCCATTACCACCATTCCGCTTGAACGTTGTTATATTCGTCATGTTTATTGTTCTTCCTATTCTCATTTGTCACATGCGTAACCGTATTTAATCTGCCTAGAGCTACCCATTGGGATATTATCACACACATAAAGAAAGCTAAGACGAAACGTTGTATGCGAGATAGTACCGACAGCTCTTGTTAGCGTGTTAAAAGAAGATATTGAGTTTTTGTTGTAGCGTACTTTACTTTTACGAACNAACCACAAAGTTTTCATGTGTTGCAAGTTGGATAATGNTGTGTGGTGAAGGCAAAGTANAGCCTTGNTTTTATCATACCATGTTGACCAATTTCCAGGAGCCTTCTTTTTCGTGTTATTGGCTCCAGAGTTGTTAGTTAGCGTAGAAACAACAACCCCTTTAGTTTATTCATTAGAATATTCAGTGCAATCAGCGATCGACCGACCAGCGATCGAGCTCGTGTTACTTACCAAGCACCAAGTTGCGTATGAGTTAATGATATTTTCCACCTCCACACAACGAGTGTGGTGTGCTGTAATGTATAAATGTAGTTAATATTTTTCAATTTTTATCATCATTTTGTAAAAAAAATCAACAAAAAACCAACTCACGTTTACAAGCGTTATCTTCCAATCGTTC] [+] EMBL BX467355 [GGCAGAATCGCCACGAGGGTCCCTGTAGGTTGTACATTTTAAGCTAGAATCTGAAGAGAGGGACACAAAACACAGAGACAACCGTGTCAACCGAGTACTCTACCAGACAGTCGTTATATACAAAATAAAAGAGCTGTATTTAATTCCTAAAGATGCGGGTGCATCAACTGCAACAGCAACCTGCAACCAATTGCTCAGTACCGACGCTCAATGCTAGGGAGAATGAATTAGAGGAAAACAGAAGGCTGATTGGGTGTGTGAGACGTGAATAGTAGAAATTTGAAAAGGGGAATCGCGATATATTATATTGCACATGGTGCAATAATGAGAACAGCTTTGCTGGAAAGGAATGCCAACCATATTGCGTGAGATGTGTAAAGGAAATGCCGTGTTCGGCCAAGGGCTGAACGGATCAGATATTTTGTAATTTATTTGTTAATGTTGTTTTTCTCCTTTCGTCATGTGTGTTTATGTGAGTTTGTGTTATTTTTGAAATTTGGCTNATTGTGTGTATCGAGAGTATATATGTTTATTTTTAGTTNTGTATAGTCTAGGTTGTTCCATATTACCATTTAGTTAGAAAATGTTGCCTTTTCCCACGTCCCC ] [+] EMBL BX629253 [ GTCAACCGAGTACTCTACCAGACAGTCGTTATATACAAAATAAAAGAGCTGTATTTAATTCCTAAAGATGCGGGTGCATCAACTGCAACAGCAACCTGCAACCAATTGCTCAGTACCGACGCTCAATGCTAGGGAGAATGAATTAGAGGAAAACAGAAGGCTGATTGGGTGTGTGAGACGTGAATAGTAGAAATTTGAAAAGGGGAATCGCGATATATTATATTGCACATGGTGCAATAATGAGAACAGCTTTGCTGGAAAGGAATGCCAACCATATTGCGTGAGATGTGTAAAGGAAATGCCGTGTTCGGCCAACGGCTGAACGGATCAGATATTTTGTAATTTATTTGTTAATGTT TTTTTCTCCTTTCGTCATGTGTGTTT TGTGAGTTTGTGTTATTTTTGAAATTT TTTTTTTTATCGAGAGTATATATGTTTATTTTTAGTT TGT T GTCTAGGTTGTTCCATATTACCATTT GTTAGAAAATGTTGCCTTTTCCCACGTCCCCATTACCACCATTCCGCTTGAACGTTGTTATATTCGTCATGTTTATTGTTCTTCCTATTCTCATTTGTCACATGCGTAACCGTATTTAATCTGCCTAGAGCTACCCATTGGGATATTATCACACACATAAAGAAAGCTAAGACGAAACGTTGTATGCGAGATAGTACCGACAGCTCTTGTTAGCGTGTTAAAAGAAGATATTGAGTTTTTGTTGTAGCGTACTTTACTTTTACGAACNAACCACAAAGTTTTCATGTGTTGCAAGTTGGATAATGNTGTGTGGTGAAGGCAAAGTANAGCCTTGNTTTTATCAT ] [+] EMBL BX629144 [ CGAGTACTCTACCAGACAGTCGTTATATACAAAATAAAAGAGCTGTATTTAATTCCTAAAGATGCGGGTGCATCAACTGCAACAGCAACCTGCAACCAATTGCTCAGTACCGACGCTCAATGCTAGGGAGAATGAATTAGAGGAAAACAGAAGGCTGATTGGGTGTGTGAGACGTGAATAGTAGAAATTTGAAAAGGGGAATCGCGATATATTATATTGCACATGGTGCAATAATGAGAACAGCTTTGCTGGAAAGGAATGCCAACCATATTGCGTGAGATGTGTAAAGGAAATGCCGTGTTCGGCCAACGGCTGAACGGATCAGATATTTTGTAATTTATTTGTTAATGTT TTTTTCTCCTTTCGTCATGTGTGTTT TGTGAGTTTGTGTTATTTTTGAAATTT TTTTTTTTATCGAGAGTATATATGTTTATTTTTAGTT TGT T GTCTAGGTTGTTCCATATTACCATTT GTTAGAAAATGTTGCCTTTTCCCACGTCCCCATTACCACCATTCCGCTTGAACGTTGTTATATTCGTCATGTTTATTGTTCTTCCTATTCTCATTTGTCACATGCGTAACCGTATTTAATCTGCCTAGAGCTACCCATTGGGATATTATCACACACATAAAGAAAGCTAAGACGAAACGTTGTATGCGAGATAGTACCGACAGCTCTTGTTAGCGTGTTAAAAGAAGATATTGAGTTTTTGTTGTAGCGTACTTTACTTTTA ] [+] EMBL BX618795 [ CCGACAGCTCTTGTTAGCGTGTTAAAAGAA AAATTGAGTTTTTGTTGTAGCGTACTTCACTTTTACGAACAAACCACAAAGTTTTCATGTGTTGCAAGTTGGATAATGTTGTGTGGTGAAGGCAAAGTAGAGCCTTGTTTTTATCATACCATGTTGACCAATTTCCAGGAGCCTTCTTTTTCGTGTTATTGGCTCCAGAGTTGTTAGTTAGCGTAGAAACAACAACCCCTTTAGTTTATTCATTAGAATATTCAGTGCAATCAGCGATCGACCGACCAGCGATCGAGCTCGTGTTACTTACCAAGCACCAAGTTGCGTATGAGTTAATGATATTTTCCACCTCCACACAACGAGTGTGGTGTGCTGTAATGTATAAATGTAGTTAATATTTTTCAATTTTTATCATCATTTTGTAAAAAAAATCAACAAAAAACCAACTCACGTTTACAAGCGTTATCTTCCAATCGTTC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||