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Anopheles gambiae
cluster # 5218 cluster # 5218       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5218#0 length = 1009 sequences # 4  

consensusID : consensus_5218#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1009
fasta sequence
                              [TTACGTTCCCGTTCGGTATTCACTATGCTTGGATGGTGATGGTGTTTACGACTAGCACAGTCTATAGCCTTGCTTGCCCGCTGATCATGCCTTTTGCTATGGTGTACATCACATTGAAACACTTTGTCGACAAGCATAATCTATTTTTCGCGTTCGCACCATCCAATATGATCAGTCAAGGTAGTGGGGGTAAAATTCACAGCACCGCCGTTACTATGACAAAATTTTCGGTGGTTCTGCTTTTGATCATCATGGCAGCATTGGCCGTGGTGCGCACTGGACAGGTTGAGCTTCGTGCTGTCGTACTGATCCTTGCTCTGTGCGCCACTCTCGTAATGTTCGCATGCATGTCACCGATTAAACGGTGTACCACAAAGCCACTACGCATCGTGGAACTGGATGGACCGGCCCCGATCTACGTGGCAGATGTTTTAATCAACAGAAGAATGGTATCAGATAGCCCGTCCCATCTCAGCTACGGTTCTGACACGACTATGAACATTGTGATGAATGATGCCGATGTCAGTGTGACTGCATAGAGCACATCCTCCTTTTCCTTCCATACCTTTCCCCTGTACACCCGTTTTATGCTCTCCTCTCCCGTGGTCGTAGGCATGATCGAAAGTGATATTAAATGTTAAGCCAACTAGATTGCTTACAATGCAGTATTCCGTGTCTCATGTATGTGCAGAACCGGAACCTAATCAGCTCAGATTTTCTGTTAGCTATCTTCACCGTGGTTGTAAATTGGTTTGTATGGGCACACCGCTTTACCACTAGACTTTTTGTGCAAGTCTAGAATGACACAAGCTCTAAACAATAGTTGTGATCGATCAAACCATTTGGAGTACAGATTTTCTTTGTTTAGTTTGTGGTGAAT-GTTTTGGTCAGC-TTTTATGTATGCTTTATGATTATCATTTTTGTATCTTTTGGATTGAAACCAATTGCACATTTAGTTTTATGTTAATAATGACTCAGTATACCAGTAAAATTATTAGCAAAATTGTGT]

[+] EMBL BX626608             [TTACGTTCCCGTTCGGTATTCACTATGCTTGGATGGTGATGGTGTTTACGACTAGCACAGTCTATAGCCTTGCTTGCCCGCTGATCATGCCTTTTGCTATGGTGTACATCACATTGAAACACTTTGTCGACAAGCATAATCTATTTTTCGCGTTCGCACCATCCAATATGATCAGTCAAGGTAGTGGGGGTAAAATTCACAGCACCGCCGTTACTATGACAAAATTTTCGGTGGTTCTGCTTTTGATCATCATGGCAGCATTGGCCGTGGTGCGCACTGGACAGGTTGAGCTTCGTGCTGTCGTACTGATCCTTGCTCTGTGCGCCACTCTCGTAATGTTCGCATGCATGTCACCGATTAAACGGTGTACCACAAAGCCACTACGCATCGTGGAACTGGATGGACCGGCCCCGATCTACGTGGCAGATGTTTTAATCAACAGAAGAATGGTATCAGATAGCCCGTCCCATCTCAGCTACGGTTCTGACACGACTATGAACATTGTGATGAATGATGCCGATGTCAGTGTGACTGCATAGAGCACATCCTCCTTTTCCTTNCATACCTTTCCCCTGTACACCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BX626289             [                                                                                                                                                                                                                                             TGCTTTTGATCATCATGGCAGCATTGGCCGTGGTGCGCACTGGACAGGTTGAGCTTCGTGCTGTCGTACTGATCCTTGCTCTGTGCGCCACTCTCGTAATGTTCGCATGCATGTCACCGATTAAACGGTGTACCACAAAGCCACTACGCATCGTGGAACTGGATGGACCGGCCCCGANCTACGTGGCAGATGTTTTAATCAACAGAAGAATGGTATCAGATAGCCCGTCCCATCTCAGCTACGGTTCTGACACGACTATGAACATTGTGATGAATGATGCCGATGTCAGTGTGACTGCATAGAGCACATCCTCCTTTTCCTTCCATACCTTTCCCCTGTACACCCGTTTTATGCTCTCCTCTCCCGTGGTCGTAGGCATGATCGAAAGTGATATTAAATGTTAAGCCAACTAGATTGCTTACAATGCAGTATTCCGTGTCTCATGTATGTGCAGAACCGGAACCTAATCAGCTCAGATTTTCTGTTAGCTATCTTCACCGTGGTTGTAAATTGGTTTGTATGGGCACACCGCTTTACCACTAGACTTTTTGTGCAAGTCTAGAATGACACAAGCTCTAAACAATAGTTGTGATCGATCAAACCATTTGGAGTACAGATTTTCTTTGTTTAGTTTGTGGTGAAT GTTTTGGTCAGC TTTTATGTATGCTTTATGATTATCATTTTTGTATCTTTTGGA                                                                           ]
[+] EMBL BX626045             [                                                                                                                                                                                                                                               CTTTTGATCATCATGGCAGCATTGGCCGTGGTGCGCACTGGACAGGTTGAGCTTCGTGCTGTCGTACTGATCCTTGCTCTGTGCGCCACTCTCGTAATGTTCGCATGCATGTCACCGATTAAACGGTGTACCACAAAGCCACTACGCATCGTGGAACTGGATGGACCGGCCCCGATCTACGTGGCAGATGTTTTAATCAACAGAAGAATGGTATCAGATAGCCCGTCCCATCTCAGCTACGGTTCTGACACGACTATGAACATTGTGATGAATGATGCCGATGTCAGTGTGACTGCATAGAGCACATCCTCCTTTTCCTTCCATACCTTTCCCCTGTACACCCGTTTTATGCTCTCCTCTCCCGTGGTCGTAGGCATGATCGAAAGTGATATTAAATGTTAAGCCAACTAGATTGCTTACAATGCAGTATTCCGTGTCTCATGTATGTGCAGAACCGGAACCTAATCAGCTCAGATTTTCTGTTAGCTATCTTCACCGTGGTTGTAAATTGGTTTGTATGGGCACACCGCTTTACCACTAGACTTTTTGTGCAAGTCTAGAATGACACAAGCTCTAAACAATAGTTGTGATCGATCAAACCATTTGGAGTACAGATTTTCTTTGNTTAGTTTGTGGTGAATGGTTTTGGTCAGC TTTTATGTATGCTTTATGATTATCATTTTTGGATCTTTTGGATTGAAACCAATTGCACATTTAGTTTTATGTTAATAATGACTCAGTATACCAGTAAAATTATTAGCAAAATTGTGT]
[+] EMBL BX623230             [                                                                                                                                                                                                                                                                                   ACTGGACAGGTTGAGCTTCGTGCTGTCGTACTGATCCTTGCTCTGTGCGCCACTCTCGTAATGTTCGCATGCATGTCACCGATTAAACGGTGTACCACAAAGCCACTACGCATCGTGGAACTGGATGGACCGGCCCCGATCTACGTGGCAGATGTTTTAATCAACAGAAGAATGGTATCAGATAGCCCGTCCCATCTCAGCTACGGTTCTGACACGACCATGAACATTGTGATGAATGATGCCGATGTCAGTGTGACTGCATAGAGCACATCCTCCTTTTCCTTCCATACCTTTCCCCTGTACACCCGTTTTATGCTCTCCTCTCCCGTGGTCGTAGGCATGATCGAAAGTGATATTAAATGTTAAGCCAACTAGATTGCTTACAATGCAGTATTCCGTGTCTCATGTATGTGCAGAACCGGAACCTAATCAGCTCAGATTTTCTGTTAGCTATCTTCACCGTGGTTGTAAATTGGTTTGTATGGGCACACCGCTTTACCACTAGACTTTTTGTGCAAGTCTAGAATGACACAAGCTCTAAACAATAGTTGTGATCGATCAAACCATTTGGAGTACAGATTTTCTTTGTTTAGTTTGTGGTGAAT GTTTTGGTCAGCTTTTTATGTATGCTTTtat                                                                                                   ]


>consensus_5218#0 TTACGTTCCCGTTCGGTATTCACTATGCTTGGATGGTGATGGTGTTTACGACTAGCACAG TCTATAGCCTTGCTTGCCCGCTGATCATGCCTTTTGCTATGGTGTACATCACATTGAAAC ACTTTGTCGACAAGCATAATCTATTTTTCGCGTTCGCACCATCCAATATGATCAGTCAAG GTAGTGGGGGTAAAATTCACAGCACCGCCGTTACTATGACAAAATTTTCGGTGGTTCTGC TTTTGATCATCATGGCAGCATTGGCCGTGGTGCGCACTGGACAGGTTGAGCTTCGTGCTG TCGTACTGATCCTTGCTCTGTGCGCCACTCTCGTAATGTTCGCATGCATGTCACCGATTA AACGGTGTACCACAAAGCCACTACGCATCGTGGAACTGGATGGACCGGCCCCGATCTACG TGGCAGATGTTTTAATCAACAGAAGAATGGTATCAGATAGCCCGTCCCATCTCAGCTACG GTTCTGACACGACTATGAACATTGTGATGAATGATGCCGATGTCAGTGTGACTGCATAGA GCACATCCTCCTTTTCCTTCCATACCTTTCCCCTGTACACCCGTTTTATGCTCTCCTCTC CCGTGGTCGTAGGCATGATCGAAAGTGATATTAAATGTTAAGCCAACTAGATTGCTTACA ATGCAGTATTCCGTGTCTCATGTATGTGCAGAACCGGAACCTAATCAGCTCAGATTTTCT GTTAGCTATCTTCACCGTGGTTGTAAATTGGTTTGTATGGGCACACCGCTTTACCACTAG ACTTTTTGTGCAAGTCTAGAATGACACAAGCTCTAAACAATAGTTGTGATCGATCAAACC ATTTGGAGTACAGATTTTCTTTGTTTAGTTTGTGGTGAATGTTTTGGTCAGCTTTTATGT ATGCTTTATGATTATCATTTTTGTATCTTTTGGATTGAAACCAATTGCACATTTAGTTTT ATGTTAATAATGACTCAGTATACCAGTAAAATTATTAGCAAAATTGTGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)