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Anopheles gambiae
cluster # 5455 cluster # 5455       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5455#0 length = 1334 sequences # 4  

consensusID : consensus_5455#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1334
fasta sequence
                              [TTTCCTGTGCNCTTTATACCCAACGCGGTGATCGCTTTGGTAAAGCAGCAGTGTTATGAGTGCTTGCGGATTTTTATTNANACAATCTTTTATAGATTGTGTTTATATTACTAGTGAATGCAATATTACCAACGGACGGGACCTANTCGNTGGATAGTTTTGCTTANCATTTGCAATAATACTAATTTATAACCCAAATATTTATTTCNTATCAATTAATTCTGAATGTCGCATGCTGCTAAATCAATGCTGTCGGATTTTTGAATGAAAGTTGTGTAAAAAGTTCACNAACCACAAGGACGATCTTGCAAACTATTTAAAAAGTTTGTAAAAGGAAAGGAGACTTGCATACAAACAAGGTTNCAGTTTTTTTATGTTCANATGGTGCTTTTATTGAAGTATTGTATTGTAGAACGAAATTGTGAGAAGATAATGAAGTTATTTTATTAGTACGATTTATCCACTGCGACAAACCACTATACATAATATGGTCCATAGAAATTGGTGTCCTTTTTAACATAAACAGCGATAAAAAAGCACAACATTATTTTCGATGCGTCTAAGATTAACTTTTGTGCGTACGTTTTTGGTTCAGTTCCATACTCATTTAATGTACACTGTAGAAGCAAAAACAAACTACATACAAACTAATATTTACGTACCTGATCAATCTGAAGCGTAGAGCTGAGTGTAAATGCTCATCATTGAACTGGAAAAGGCAACATTGCACTGTAGACAGTTTTTATTTACTTTATTTTCTCTGAAAAACGCTGGAAAAGCTGTTGGATGTGTACAGTTTACGATAACACAATGCACATCGCCTATTAAATCATAATTACTATCCACTTGAAAGGAGAGACTAATGTGCTAT-CCGTCTAGACGTCAGTCAGTAAGGAGATTCATTTAAATGTTTCACACATTCCGTTTGCGTGTGTTTGTAAGATAATTATATTTTAGCAATTTAGGCAGACTGTGCCGTGTGTGGCTTTTCCCGGAATGCACGTCTTCCCATTTTTTGGTGCGTCATTTGTATTTTGGTGCGCTTTCGTGTGTGTCCTTGTGGCAGAGAGCTTAGGTTAGATTACATTCATTATGCTTAAAGCGCTGAAAAAATACATCAATCGTTGGGACATGAAATCGAACCAGAGTGAGAGGAATGTGTTTAGTGTAGTGATAAGCATATGGCGCAACAAAATGCAGCCTGGTGCGGTGCATGGAGTTTTTGAAACAGAGGATTGCACTGGACAGATGTAGAGATAGAGAGAGATACAGAAGAAGGATCGTAAAACGCTATTTTGTAAGCATTTTCAACTTTGTGCAACCCGTACCGCTGT]

[+] EMBL BX628821             [TTTCCTGTGCNCTTTATACCCAACGCGGTGATCGCTTTGGTAAAGCAGCAGTGTTATGAGTGCTTGCGGATTTTTATTNANACAATCTTTTATAGATTGTGTTTATATTACTAGTGAATGCAATATTACCAACGGACGGGACCTANTCGNTGGATAGTTTTGCTTANCATTTGCAATAATACTAATTTATAACCCAAATATTTATTTCNTATCAATTAATTCTGAATGTCGCATGCTGCTAAATCAATGCTGTCGGATTTTTGAATGAAAGTTGTGTAAAAAGTTCACNAACCACAAGGACGATCTTGCAAACTATTTAAAAAGTTTGTAAAAGGAAAGGAGACTTGCATACAAACAAGGTTNCAGTTTTTTTATGTTCANATGGTGCTTTTATTGAAGTATTGTATTGTAGAACGAAATTGTGAGAAGATAATGAAGTTATTTTATTAGTACGATTTATCCACTGCGACAAACCACTATACATAATATGGTCCATAGAAATTGGTGTCCTTTTTAACATAAACAGCGATAAAAAAGCACAACATTATTTTAGATGCGTCTAAGATTAACTTTTGTGCGTACGTTTTTGGTTCAGNTCCATACTCATTTAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BM575385             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ccgTAAAAAGTTTGTAAAAGGAAAGGAGACTTGCATACAAACAAGGTTTCAGTTTTTTTATGTTCAAATGGTGCTTTTATTGAAGTATTGTATCGTAGAACGAAATTGTGAGAAGATAATGAAGTTATTTTATTAGTACGATTTATCCACTGCGACAAACCACTATACATAATATGGTCCATAGAAATTGGTGTCCTTTTTAACATAAACAGCGATAAAAAAGCACAACATTATTTTCGATGCGTCTTAGATTAACTTTTGTGCGTACGTTTTTGGTTCAGTTCCATACTCATTTAATGTACACTGTAGAAGCAAAAACAAACTACATACAAACTAATATTTACGTACCTGATCAATCTGAAGCGTAGAGCTGAGTGTAAATGCTCATCATTGAACTGGAAAAGGCAACATTGCACTGTAGACAGTTTTTATTTACTTTATTTTCTCTGAAAAACGCTGGAAAAGCTGTTGGATGTGTACAGTTTACGATAACACAATGCACATCGCCTATTAAATCATAATTACTATCCACTTGAAAGGAGAGACTAATGTGCTATCCCGTCTAGACGTCAGTCAGTAAGGAGATTCATTTAAATGTTTCACACATTCCGTTTGCGTGTGTTTGTAAGATAATTATATTTTAGCAATTTACGCAGACTGTGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BX618827             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGATGCGTCTAAGATTAACTTTTGTGCGTACGTTTTTGGTTCAGTTCCATACTCATTTAATGTACACTGTAGAAGCAAAAACAAACTACATACAAACTAATATTTACGTACCTGATCAATCTGAAGCGTAGAGCTGAGTGTAAATGCTCATCATTGAACTGGAAAAGGCAACATTGCACTGTAGACAGTTTTTATTTACTTTATTTTCTCTGAAAAACGCTGGAAAAGCTGTTGGATGTGTACAGTTTACGATAACACAATGCACATCGCCTATTAAATCATAATTACTATCCACTTGAAAGGAGAGACTAATGTGCTAT CCGTCTAGACGTCAGTCAGTAAGGAGATTCATTTAAATGTTTCACACATTCCGTTTGCGTGTGTTTGTAAGATAATTA ATTTTAGTAATTTAGGCAGACTGTGCCGTGTGTGGCTTTTCCCGGAATGCACGTCTTCCCATTTTTTGGTGCGTCATTTGTATTTTGGTGCGCTTTCGTGTGTGTCCTTGTGGCAG                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BX610081             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AGAGCTGAGTGT AATGCTCATTATTGAACTGGAAAAGGCAACATTGAACTGTAGACAGTTTTTATTTACTTTATTTTCACTGAAAAATGCTGGAAAAGCTGTTGGATGTGTACAGTTTACGATAACACAATGCACATCGCCTAATAAATCATAATTACTATCCACTTGAAAGGAGAGACTAATGTGCTAT CCGTCTAGACGTCAGTCAGTAAGGAGATTCATTTAAATGTTTCACACATTCCGTTTGCGTGTGTTTGTAAGATAATTATATTTTAGCAATTTAGGCAGACTGTGCCGTGTGTGGCTTTTCCCGGAATGCACGTCTTCCCATTTTTTGGTGCGTCATTTGTATTTTGGTGCGCTTTCGTGTGTATCCTTGGGGCAGAGAGCTTAGGTTAGATTACATTCATTATGCTTAAAGCGCTGAAAAAATACATCAATCGTTGGGACATGAAATCGAACCAGAGTGAGAGGAATGTGTTTAGTGTAGTGATAAGCATATGGCGCAACAAAATGCAGCCTGGTGCGGTGCATGGAGTTTTTGAAACAGAGGATTGCACTGGACAGATGTAGAGATAGAGAGAGATACAGAAGAAGGATCGTAAAACGCTATTTTGTAAGCATTTTCAACTTTGTGCAACCCGTACCGCTGT]


>consensus_5455#0 TTTCCTGTGCNCTTTATACCCAACGCGGTGATCGCTTTGGTAAAGCAGCAGTGTTATGAG TGCTTGCGGATTTTTATTNANACAATCTTTTATAGATTGTGTTTATATTACTAGTGAATG CAATATTACCAACGGACGGGACCTANTCGNTGGATAGTTTTGCTTANCATTTGCAATAAT ACTAATTTATAACCCAAATATTTATTTCNTATCAATTAATTCTGAATGTCGCATGCTGCT AAATCAATGCTGTCGGATTTTTGAATGAAAGTTGTGTAAAAAGTTCACNAACCACAAGGA CGATCTTGCAAACTATTTAAAAAGTTTGTAAAAGGAAAGGAGACTTGCATACAAACAAGG TTNCAGTTTTTTTATGTTCANATGGTGCTTTTATTGAAGTATTGTATTGTAGAACGAAAT TGTGAGAAGATAATGAAGTTATTTTATTAGTACGATTTATCCACTGCGACAAACCACTAT ACATAATATGGTCCATAGAAATTGGTGTCCTTTTTAACATAAACAGCGATAAAAAAGCAC AACATTATTTTCGATGCGTCTAAGATTAACTTTTGTGCGTACGTTTTTGGTTCAGTTCCA TACTCATTTAATGTACACTGTAGAAGCAAAAACAAACTACATACAAACTAATATTTACGT ACCTGATCAATCTGAAGCGTAGAGCTGAGTGTAAATGCTCATCATTGAACTGGAAAAGGC AACATTGCACTGTAGACAGTTTTTATTTACTTTATTTTCTCTGAAAAACGCTGGAAAAGC TGTTGGATGTGTACAGTTTACGATAACACAATGCACATCGCCTATTAAATCATAATTACT ATCCACTTGAAAGGAGAGACTAATGTGCTATCCGTCTAGACGTCAGTCAGTAAGGAGATT CATTTAAATGTTTCACACATTCCGTTTGCGTGTGTTTGTAAGATAATTATATTTTAGCAA TTTAGGCAGACTGTGCCGTGTGTGGCTTTTCCCGGAATGCACGTCTTCCCATTTTTTGGT GCGTCATTTGTATTTTGGTGCGCTTTCGTGTGTGTCCTTGTGGCAGAGAGCTTAGGTTAG ATTACATTCATTATGCTTAAAGCGCTGAAAAAATACATCAATCGTTGGGACATGAAATCG AACCAGAGTGAGAGGAATGTGTTTAGTGTAGTGATAAGCATATGGCGCAACAAAATGCAG CCTGGTGCGGTGCATGGAGTTTTTGAAACAGAGGATTGCACTGGACAGATGTAGAGATAG AGAGAGATACAGAAGAAGGATCGTAAAACGCTATTTTGTAAGCATTTTCAACTTTGTGCA ACCCGTACCGCTGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)