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Anopheles gambiae
cluster # 5609 cluster # 5609       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5609#0 length = 715 sequences # 4  

consensusID : consensus_5609#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 715
fasta sequence
                              [GTGTGCTCGAGAGAGCTTGCGTCATAGACGAAGGGTGACTTGAAGCGGATTGCAAGATCATAGACACTTTGTATACGTGTGTTAGTTTGTATGTATCGTTGAAAGGGAACCGGCAATGGGATCTGTTTTTGGAGCAGCAATGGTGGATGCTAGACGCTTCCCATGGCGAGGTGAGTCATGAATGTAACTGTGCCGGGCATGCAGGAGTATGTAGCAACAAGCAATGTACAACAGAAGACAGATTTATTTTTGACACTTTAATGCACAAAAAGAAGAGACATACAATTTCGGAAACAACAAGTTTAAACAAAACTCAAAAAAGTAATATCTACAGTAAGGATCTCTGGAAGAG-AAAAAAAACATGTAAGAAAGACTACAACTGTGTTGGAAATTGGCACAAACGAGTGCATAATTCGTTTTAAAATACATAAACTGTACAGAAAGACGATAACGTAGTTGTTGGTAAGGTTGGTCGATAAAATGTTTGAAAGATGGGACGTTTTGTAGCGCAAACCGAGCTAGTTACAGTGATTGTCCTATACACGAATTGGGCACGATTTCGTTCGTTAGTTTTGTTTTATTCTTTAGTTGAACTCATAATTCAGACAATTTTTAACGCTTACCTTATCGTTTAAAGGTTGGAAG-AGTTGGTG-AAGTTTGTTCAGAAGAAAAATCATAC-AATTCTTTAGCAACAGTCGCGCTCATCCTTGGGCAT]

[+] EMBL BX610250             [GTGTGCTCGAGAGAGCTTGCGTCATAGACGAAGGGTGACTTGAAGCGGATTGCAAGATCATAGACACTTTGTATACGTGTGTTAGTTTGTATGTATCGTTGAAAGGGAACCGGCAATGGGATCTGTTTTTGGAGCAGCAATGGTGGATGCTAGACGCTTCCCATGGCGAGGTGAGTCATGAATGTAACTGTGCCGGGCATGCAGGAGTATGTAGCAACAAGCAATGTACAACAGAAGACAGATTTATTTTTGACACTTTAATGCACAAAAAGAAGAGACATACAATTTCGGAAACAACAAGTTTAAACAAAACTCAAAAAAGTAATATCTACAGTAAGTATCTCTGGAAGAG AAAAAAAACATGTAAGAAAGACTACAACTGTGTTGAAAATTGGCACAAACGAGTGCATAATTCGTTTTAAAATACATAAACTGTACAGAAAGACGATAACTTAGTTGTTGGTAAGGTTGGTCGAAAAAATGTTTGAAAGATGGGACGTTTTGTAGCGCAAACCGAGCTAGTTACAGTGATTGTCCTATACACGAATTGGGCACGATTTCGTTCGTTAGTTTTGTTTTATTCTTTAGTTGAACTCATAATTCAGACAATTTTTAACGCTTACCTTATCGTTTAAAGGTTGGAAG TGTTGGTG AAGTTTGTTCAGAAGAAAAATCATACAAATTCTTTAGCAACAGTCGCGCTCATCCTTGG    ]
[+] EMBL BX604104             [                                  GTGACTTGAAGCGTATTGCAAGATCATAGACACTTTGTATACGTGTGTTAGTTTGTATGTATCGTTGAAAGGGAACCGGCAATGGGATCTGTTTTTGGAGCAGCAATGGTGGATGCGAGACGCTTCCCATGGCGAGGTGAGTCATGAATGTAACTGTGCCGGGCATGCAGGAGTATGTAGCAACAAGCAATGTACAACAGAAGACAGATTTATTTTTGACACTTTAATGCACAAAAAGAAGAGACATACAATTTCGGAAATAACAAGTTTAAACATAACTCAAAAAAGTAATACCTACAGTAAGGATCTCTGGAAGAG AAAAAAAACATGTAAGAAAGACTACAACTGTGTTGGAAATTGGCACAAACGAGTGCATAATTCGTTTTAAAATACATAAACTGTACAGAAAGACGATAACGTAGTTGTTGGTAAGGTTGGTCGATAAAATGTTTGAAAGATGGGACTTTTTGTAGCGCAAACCGAGCTAGTTACAGTGATTGTCCTATACACGAATTGGGCACGATTTCGTTCGTTAGT                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BM638144             [                                   ccgCTTGAAGCGGATTGCAAGATCATAGACACTTTGTATACGTGTGTTAGTTTGTATGTATCGTTGAAAGGGAACCGGCAATGGGATCTGTTTTTGGAGCAGCAATGGTGGATGCTAGACGCTTCCCATGGCGAGGTGAGTCATGAATGTAACTGTGCCGGGCATGCAGGAGTATGTAGCAACAAGCAATGTACAACAGAAGACAGATTTATTTTTGACACTTTAATGCACAAAAAGAAGAGACATACAATTTCGGAAACAACAAGTTTAAACAAAACTCAAAAAAGTAATATCTACAGTAAGGATCTCTGGAAGAG AAAAAAAACATGTAAGAAAGACTACAACTGTGTTGGAAATTGGCACAAACGAGTGCATAATTCGTTTTAAAATACATAAACTGTACAGAAAGACGATAACGTAGTTGTTGGTAAGGTTGGTCGATAAAATGTTTGAAAGATGGGACGTTTTGTAGCGCAAACCGAGCTAGTTACAGTGATTGTCCTATACACGAATTGGGCACGATTTCGTTCGTTAGTTTTGTTTTATTCTTTAGTTGAACTCATAATTCAGACAATTTTTAACGCTTACCTTATCGTTTAAAGGTTGGAAGAAGTTGGTGAAAGTTTGTTCAGAAGAAAAATCATAC AATTCTTTAGCAACAGTCGCGCTCATCCTTGGGCAT]
[+] EMBL BM586197             [                                                                                                                                             ccgGGATGCTAGACGCTTCCCATGGCGAGGTGAGTCATGAATGTAACTGTGCCGGGCATGCAGGAGTATGTAGCAACAAGCAATGTACAACAGAAGACAGATTTATTTTTGACACTTTAATGCACAAAAAGAAGAGACATACAATTTCGGAAACAACAAGTTTAAACAAAACTCAAAAAAGTAATATCTACAGTAAGGATCTCTGGAAGAGAAAAAAAAACATGTAAGAAAGACTACAACTGTGTTGGAAATTGGCAGAAACGAGTGCATAATTCGTTTTAAAATACATAAACTGTACAGAAAGACGATAACGTAGTTGTTGGTAAGGTTGGTCGATAAAATGTTTGAAAGATGGGACGTTTTGTAGCGCAAACCGAGCTAGTTACAGTGATTGTCCTATACACGAATTGGGCACGATTTCGTTCGTTAGTTTTGTTTTATTCTTTAGTTGGACTCATAATTCAGACAATTTTTAACGCTTACCTTATCGTTTAAAGGTTGGAAG AGTTGGTG AAGTTTGTTCAGAAGAAAAATCATAC AATTC                               ]


>consensus_5609#0 GTGTGCTCGAGAGAGCTTGCGTCATAGACGAAGGGTGACTTGAAGCGGATTGCAAGATCA TAGACACTTTGTATACGTGTGTTAGTTTGTATGTATCGTTGAAAGGGAACCGGCAATGGG ATCTGTTTTTGGAGCAGCAATGGTGGATGCTAGACGCTTCCCATGGCGAGGTGAGTCATG AATGTAACTGTGCCGGGCATGCAGGAGTATGTAGCAACAAGCAATGTACAACAGAAGACA GATTTATTTTTGACACTTTAATGCACAAAAAGAAGAGACATACAATTTCGGAAACAACAA GTTTAAACAAAACTCAAAAAAGTAATATCTACAGTAAGGATCTCTGGAAGAGAAAAAAAA CATGTAAGAAAGACTACAACTGTGTTGGAAATTGGCACAAACGAGTGCATAATTCGTTTT AAAATACATAAACTGTACAGAAAGACGATAACGTAGTTGTTGGTAAGGTTGGTCGATAAA ATGTTTGAAAGATGGGACGTTTTGTAGCGCAAACCGAGCTAGTTACAGTGATTGTCCTAT ACACGAATTGGGCACGATTTCGTTCGTTAGTTTTGTTTTATTCTTTAGTTGAACTCATAA TTCAGACAATTTTTAACGCTTACCTTATCGTTTAAAGGTTGGAAGAGTTGGTGAAGTTTG TTCAGAAGAAAAATCATACAATTCTTTAGCAACAGTCGCGCTCATCCTTGGGCAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)