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Anopheles gambiae
cluster # 5704 cluster # 5704       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5704#0 length = 1227 sequences # 4  

consensusID : consensus_5704#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1227
fasta sequence
                              [CCGAAAGAATTTAGAAACGGAGACTACGTGAAACACCAAAAATATTACACGCCATTATTAGATATAGATGAAGTAGACATCGTAACACAAACAACGATAGCCGATGACCTTCACTTGTTCGCACTAGGAATAGAAAAAAAATTACTTAAAGGTTTTACAACTGGTGCTTTACACCCTTTTCCGAAGTGGTCAAAACAGGAGCAGTTAGAAATTTCAAATATTTTAGTCAGGATCGAATACCCGTCAGAGATACATCGTAAGCCTAGGGCATTAAAATATTTAGGATTTTGGAAGGGGTCCGAATTGTCAGCATTTTTATATCACGTTAGCATACCTTTGTTAAAAAACAGAATATCAGATCTAGCCTATGAGCACCATAAACTTTTTTTCATTGCGGTAAATTTATTCTCATCAAGATTATTTGAACAATATTGGAAATATGCTGGTCAGTTGCTCGAACAATTTGTATTAGAATATAGCACAGTTTATAGTCGAACACATTTAACAATTAACGTTCATAATTTACTACATGTAGCAGCAGATGTTGAAAATTTCGGGCCTCTTCCATTTTTATCAACTTATCGTATTGAGGACAAGTTAGGCTTTATGAAAAACTTAGCTAGAACAGGACATAGAACTTTAAACCAGATAGTGTGTAGATTAATAGAACTAACACAATTAGAGGCAGCAGATGCAAGGAAAAAGGATGATACAGTGTATCCATCACTAAAGGTAAAAAAAAGATGAGGTAATTTTGTTGGTCAAACCAAAATTTATGTTAAGAAAGGGCAATAGAAATGGATGGTTTTTAACACAGGAGGATCAGATAGTAAGGTATTGTACTGCAGAAAAGTCATCAGGATCATATTTTATAGAAGGACGATTCTTAAAAGAGAAACAACTAACTTTTAGCCAACCATGTAGCTCGGCGATAATTTATAACTTTACAGCTAGGGTAGAAGATTTATCACAGGAAATAGTCAGGGTAGAATTAAAAGAAATTAAATGCAAGCTAGTGGCAGTTAGTTTAGATCAGGGTAATACATTTTATTTCAGTCCTCTTTTACATACACTTGAAAGTTAGATCATAATTAAAATATGTAAGCTGTTAGGTTTAGAATAGGTAGTTAAGGTTTAAGTTTAGGTAAATATTTTTATTAGTTTATTTTTTTATTAGTTTTGTATTAAAATGAGTAGAATAAAGTTGCCGAGTATGCCCGGGATAAG]

[+] EMBL BM655945             [CCGAAAGAATTTAGAAACGGAGACTACGTGAAACACCAAAAATATTACACGCCATTATTAGATATAGATGAAGTAGACATCGTAACACAAACAACGATAGCCGATGACCTTCACTTGTTCGCACTAGGAATAGAAAAAAAATTACTTAAAGGTTTTACAACTGGTGCTTTACACCCTTTTCCGAAGTGGTCAAAACAGGAGCAGTTAGAAATTTCAAATATTTTAGTCAGGATCGAATACCCGTCAGAGATACATCGTAAGCCTAGGGCATTAAAATATTTAGGATTTTGGAAGGGGTCCGAATTGTCAGCATTTTTATATCACGTTAGCATACCTTTGTTAAAAAACAGAATATCAGATCTAGCCTATGAGCACCATAAACTTTTTTTCATTGCGGTAAATTTATTCTCATCAAGATTATTTGAACAATATTGGAAATATGCTGGTCAGTTGCTCGAACAATTTGTATTAGAATATAGCACAGTTTATAGTCGAACACATTTAACAATTAACGTTCATAATTTACTACATGTAGCAGCAGATGTTGAAAATTTCGGGCCTCTTCCATTTTTATCAACTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BM596590             [                                                                       ccgAGACATCGTAACACAAACAACGATAGCCGATGACCTTCACTTGTTCGCACTAGGAATAGAAAAAAAATTACTTAAAGGTTTTACAACTGGTGCTTTACACCCTTTTCCGAAGTGGTCAAAACAGGAGCAGTTAGAAATTTCAAAAATTTTAGTCAGGATCTAATACCCGTCAGAGATACATCGTAAGCCTAGGGCATTAAAATATTTAGGATTTTGGAAGGGGTCCGAATTGTCAGCATTTTTATATCACGTTAGCATACCTTTGTTAAAAAACAGAATATCAGATCTAGCCTATGAGCACCATAAACTTTTTTTCATTGCGGTAAATTTATTCTCATCAAGATTATTTGAACAATATTGGAAATATGCTGGTCAGTTGCTCGAACAATTTGTATTAGAATATAGCACAGTTTATAGTCGAACACATTTAACAATTAACGTTCATAATTTACTACATGTAGCAGCAGATGTTGAAAATTTCGGGCCTCTTCCATTTTTATCGACTTATCGTATTGAGGACAAGTTAGGCTTTATGAAAAACTTAGCTAGAACAGGACATAGAACTTTAAACCAGATAGTGTGTAGATTAATAGAACTAACACAATTAGAGGCAGCAGATGCAAGGAAAAAGGATGATACAGTGTATCCATCACTAAAGGTAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BX608611             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CGGTAAATTTATTCTCATCAAGATTATTTGAACAATATTGGAAATATGCT  TCAGTTGCTCGAACAATTTGTATTAGAATATAGCACAGTTTATAGTCGAACACATTTAACAATTAACGTTCATAATTTACTACATGTAGCAGCAGATGTTGAAAATTTCGGGCCTCTTCCATTTTTATCAACTTATCGTATTGAGGACAAGTTAGGCTTTATGAAAAACTTAGCTAGAACAGGACATAGAACTTTAAACCAGATAGTGTGTAGATTAATAGAACTAACACAATTAGAGGCAGCAGATGCAAGGAAAAAGGATGATACAGTGTATCCATCACTAAAGGTAAAAAAAAGATGAGGTAATTTTGTTGGTCAAACCAAAATTTATGTTAAGAAAGGGCAATAGAAATGGATGGTTTTTAACACAGGAGGATCAGATAGTAAGGTATTGTACTGCAGAAAAGTCATCAGGATCATATTTTATAGAAGGACGATTCTTAAAAGAGAAACAACTAACTTTTAGCCAACCATGTAGCTCGGCGATAATTTATAACTTTACAGCTAGGGTAGAAGATTTATCACAGGAAATAGTCAGGGTAGAATTAAAAGAAATTAAATGCAAGCTAGTGGCAGTTAGTTTAGATCAGGGTAATACATTTTATTTCAGTCCTCTTTTACATACACTTGAAAGTTAGATCATAATTAAAATATGTAAGCTGTTAGGTTTAGAATAGGTAGTTAAGGTTTAAGTTTAGGTAAATATTTTTATTAGTTTATTTTTTTATTAGTTTTGTATTAAAATGAGTAGAATAAAGTTGCCGAGTATGCCCGGGATAAG]
[+] EMBL BX616601             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATAGTAAGGTATTGTACTGCAGAAAAGTCATCAGGATCATATTTTATAGAAGGACGATTCTTAAAAGAGAAACAACTAACTTTTAGCCAACCATGTAGCTCGGCGATAATTTATAACTTTACAGCTAGGGTAGAAGATTTATCATAGGAAATA                                                                                                                                                                                                                                                        ]


>consensus_5704#0 CCGAAAGAATTTAGAAACGGAGACTACGTGAAACACCAAAAATATTACACGCCATTATTA GATATAGATGAAGTAGACATCGTAACACAAACAACGATAGCCGATGACCTTCACTTGTTC GCACTAGGAATAGAAAAAAAATTACTTAAAGGTTTTACAACTGGTGCTTTACACCCTTTT CCGAAGTGGTCAAAACAGGAGCAGTTAGAAATTTCAAATATTTTAGTCAGGATCGAATAC CCGTCAGAGATACATCGTAAGCCTAGGGCATTAAAATATTTAGGATTTTGGAAGGGGTCC GAATTGTCAGCATTTTTATATCACGTTAGCATACCTTTGTTAAAAAACAGAATATCAGAT CTAGCCTATGAGCACCATAAACTTTTTTTCATTGCGGTAAATTTATTCTCATCAAGATTA TTTGAACAATATTGGAAATATGCTGGTCAGTTGCTCGAACAATTTGTATTAGAATATAGC ACAGTTTATAGTCGAACACATTTAACAATTAACGTTCATAATTTACTACATGTAGCAGCA GATGTTGAAAATTTCGGGCCTCTTCCATTTTTATCAACTTATCGTATTGAGGACAAGTTA GGCTTTATGAAAAACTTAGCTAGAACAGGACATAGAACTTTAAACCAGATAGTGTGTAGA TTAATAGAACTAACACAATTAGAGGCAGCAGATGCAAGGAAAAAGGATGATACAGTGTAT CCATCACTAAAGGTAAAAAAAAGATGAGGTAATTTTGTTGGTCAAACCAAAATTTATGTT AAGAAAGGGCAATAGAAATGGATGGTTTTTAACACAGGAGGATCAGATAGTAAGGTATTG TACTGCAGAAAAGTCATCAGGATCATATTTTATAGAAGGACGATTCTTAAAAGAGAAACA ACTAACTTTTAGCCAACCATGTAGCTCGGCGATAATTTATAACTTTACAGCTAGGGTAGA AGATTTATCACAGGAAATAGTCAGGGTAGAATTAAAAGAAATTAAATGCAAGCTAGTGGC AGTTAGTTTAGATCAGGGTAATACATTTTATTTCAGTCCTCTTTTACATACACTTGAAAG TTAGATCATAATTAAAATATGTAAGCTGTTAGGTTTAGAATAGGTAGTTAAGGTTTAAGT TTAGGTAAATATTTTTATTAGTTTATTTTTTTATTAGTTTTGTATTAAAATGAGTAGAAT AAAGTTGCCGAGTATGCCCGGGATAAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)