Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Anopheles gambiae
cluster # 5784 cluster # 5784       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5784#0 length = 1039 sequences # 4  

consensusID : consensus_5784#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1039
fasta sequence
                              [TGCGATTCTCTGTGTTGTGTTAGAAGTGCGATTTTCTTTTTGTTGTCGTTTTAATTGTTGCCTGGTTTACCTATGCTAAACAAGGCCGAAACTTTGCTTTGTTTCAACTGATATTTGATTTCCATTGGGACTAGATTTTACCTTGTAGTGAAAGGTGCATGACGAGCCTCTCGTTCGCGTCGTA-AAAAAACATCTGCTTACAATTGATGGTTCTCGGAAAAAGCAACTTTGTGCATACGTTAAGCGAAAAAATAGCAAAACATATTTGGAGGAGCCTTAGCACAGAGCTTAATAACATATGTTTAGTCCAGTTTTAGATACATAAGGAATATAGTTTTTGTTGCCGTAATCTAAATACCTGTACCTGCGTACTAACGCGATGCAAAGCGGACAGGGTTTTGTTTCTATTTTGTGTATCATGAACGTAAAATAATGCGTTAAACTATCGGTTATATATGGCCACTGCAGGTCAAGTAAAGCCGGTTAGTAAATTC-AAAAAAACATTACTACGCAAGTAATTTTAATTGATAAAAGAAAAACAAATAGTTGTAAATTGCAACCAACGTAGTATATATTTTTTATGTTAGTCCAGTCATTATCCAGCATTCATATTGGTTGAATATCTATTCTGTGCGATAAAAATGGGTTTATGTTAAAATCCTTTGTTCAAGCATGTAGTTTTTTTACGTATTTCATATGAAAAAACACGTTACACTATGTTTCGCCTTTGTAATTGTCCCTATGCCCAGCATAATAAGGTTAGAAGGTTAGTTTCGTTTATATTTGTTCGAGTTTTCAATTTTTGTGCGAATTAGGTATTATATAAATGAATTGTTCTGCTTGTTAGATAGAATGCGTACTTTTCCATACCGTATCATGTAACA-TTTTGAAAGCTGCAAAGATAGTGATTCTTTTAACATCTGATGGGAACAATTTTATAAAGCAAAACCTTGAAGCAAGAGGATTTTACTAACAGGTTATTAGGGCCACACAAAAAGCAAGAAAGGCTGGATCTTAGCGAATCTCGCTAGCAACTGTT]

[+] EMBL BX619799             [TGCGATTCTCTGTGTTGTGTTAGAAGTGCGATTTTCTTTTTGTTGTCGTTTTAATTGTTGCCTGGTTTACCTATGCTAAACAAGGCCGAAACTTTGCTTTGTTTCAACTGATATTTGATTTCCATTGGGACTAGATTTTACCTTGTAGTGAAAGGTGCATGACGAGCCTCTCGTTCGCGTCGTA AAAAAACATCTGCTTACAATTGATGGTTCTCGGAAAAAGCAACTTTGTGCATACGTTAAGCGAAAAAATAGCAAAACATATTTGGAGGAGCCTTAGCACAGAGCTTAATAACATATGTTTAGTCCAGTTTTAGATACATAAAGAATATAGTTTTTGTTGCCGTAATCTAAATACCTGTACCTGCGTACTAACGCGATGCAAAGCGGACAGGGTTTTGTTTCTATTTTGTGTATCATGAACGTAAAATAATGCGTTAAACTATCGGTTATATATGGCCACTGCAGGTCAAGTAAAGCCGGTTAGTAAATTCAAAAAAAACATTACTACGCAAGTAATTTTAATTGATAAAAGAAAAACAGATAGTTGTAAATTGCAACCAACGTAGTATATATNTTTTATGTTAGTCCAGTCATNATCCAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BX626163             [                                                                                                                                                                        TCTCGTTCGCGTCGTANAANAAACATCTGCTTACAATTGATGGTTCTCGGAAAAAGCAACTTTGTGCATACGTTAAGCGAAAAAATAGCAAAACATATTTGGAGGAGCCTTAGCACAGAGCTTAATAACATATGTTTAGTCCAGTTTTAGATACATAAGGAATATAGTTTTTGTTGCCGTAATCTAAATACCTGTACCTGCGTACTAACGCGATGCAAAGCGGACAGGGTTTTGTTTCTATTTTGTGTATCATGAACGTAAAATAATGCGTTAAACTATCGGTTATATATGGCCACTGCAGGTCAAGTAAAGCCGGTTAGTAAATTC AAAAAAACATTACTACGCAAGTAATTTTAATTGATAAAAGAAAAACAAATAGTTGTAAATTGCAACCAACGTAGTATATATTTTTTATGTTAGTGCAGTCATTATCCAGCATTCATATTGGTTGAATATCTATTCTGTGCGATAAAAATGGGTTTATGTTAAAATCCTTTGTTCAAGCATGTAGTTTTTTTACGTATTTCATATGAAAAAACACGTTACACAATGTTTCGCCTTTGTAATTGTCCCTATGCCCAGCATAATAAGGTTAGAAGGTTAGTTTCGTTTATATTTGTTCGAGTTTTCAATTTTTGTGCGAATTAGGTATTATATAAATGAAATGTTCTGCTTGTTAGATAGAATGCGTACTTTTCCATACCGTATCATGTAATA TTTTGAAAGCTGC AAGATAGTGATTCTTTT ACATCTGATGGGAACAATTT                                                                                                       ]
[+] EMBL BX627979             [                                                                                                                                                                                                                   TTCTCGGAAAAAGCATCTTTGTGCATACGTTAAGCGAAAAAATAGCAAAAAATATATGGAGCAGCCTTAGCACAGAGCTTAATAACATATGTTTAGTCCAGTTTTAGATACATAAGGAATATAGTTTTTGTTGCCGTAATCTAAATACCTGTACCTGCGTACTAACGCGATGCAAAGCGGACAGGGTTTTGTTTCTATTTTGTGTATCATGAACGTAAAATAATGCGTTAAACTATCGGTTATATATGGCCACTGCAGGCCAAGTAAAGCCGGTTAGTAAATTC AAAAAAACATTACTACGCAAGTAATTTTAATTGATAAAAGAAAAACAAATAGTTGTAAATTGCAACCAACGTAGTATATATTTTTTATGTTAGTCCAGTCATTATCCAGCATTCATATTGGTTGAATATCTATTCTGTGCGATAAAAATGGGTTTATGTTAAAATCCTTTGTTCAAGCATGTAGTTTTTTTACGTATTTCATATGAAAAAACACGTTACACTATGTTTCGCCTTTGTAATTGTCCCTATGCCCAGCATAATAAGGTTAGAAGGTTAGTTTCGTTTATATTTGTTCGAGTTTTCAATTTTTGTGCGAATTAGGTATTATATAAATGAATTGTTCTGCTTGTTANATAGAATGCGTACTTTTCCATACCGTATCATGTAACATTTTTGAAAGCTGCAAAGATAGTGATTCTTTTAACATCTGAT                                                                                                                  ]
[+] EMBL BX622694             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AATGCGTTAAACTATCGGTTATATATGGCCACTGCAGGCCAAGTAAAGCCGGTTAGTAAATTC AAAAAAACATTACTACGCAAGTAATTTTAATTGATAAAAGAAAAACAAATAGTTGTAAATTGCAACCAACGTAGTATATATTTTTTATGTTAGTCCAGTCATTATCCAGCATTCATATTGGTTGAATATCTATTCTGTGCGATAAAAATGGGTTTATGTTAAAATCCTTTGTTCAAGCATGTAGTTTTTTTACGTATTTCATATGAAAAAACACGTTACACTATGTTTCGCCTTTGTAATTGTCCCTATGCCCAGCATAATAAGGTTAGAAGGTTAGTTTCGTTTATATTTGTTCGAGTTTTCAATTTTTGTGCGAATTAGGTATTATATAAATGAATTGTTCTGCTTGTTAGATAGAATGCGTACTTTTCCATACCGTATCATGTAACA TTTTGAAAGCTGCAAAGATAGTGATTCTTTTAACATCTGATGGGAACAATTTTATAAAGCAAAACCTTGAAGCAAGAGGATTTTACTAACAGGTTATTAGGGCCACACAAAAAGCAAGAAAGGCTGGATCTTAGCGAATCTCGCTAGCAACTGTT]


>consensus_5784#0 TGCGATTCTCTGTGTTGTGTTAGAAGTGCGATTTTCTTTTTGTTGTCGTTTTAATTGTTG CCTGGTTTACCTATGCTAAACAAGGCCGAAACTTTGCTTTGTTTCAACTGATATTTGATT TCCATTGGGACTAGATTTTACCTTGTAGTGAAAGGTGCATGACGAGCCTCTCGTTCGCGT CGTAAAAAAACATCTGCTTACAATTGATGGTTCTCGGAAAAAGCAACTTTGTGCATACGT TAAGCGAAAAAATAGCAAAACATATTTGGAGGAGCCTTAGCACAGAGCTTAATAACATAT GTTTAGTCCAGTTTTAGATACATAAGGAATATAGTTTTTGTTGCCGTAATCTAAATACCT GTACCTGCGTACTAACGCGATGCAAAGCGGACAGGGTTTTGTTTCTATTTTGTGTATCAT GAACGTAAAATAATGCGTTAAACTATCGGTTATATATGGCCACTGCAGGTCAAGTAAAGC CGGTTAGTAAATTCAAAAAAACATTACTACGCAAGTAATTTTAATTGATAAAAGAAAAAC AAATAGTTGTAAATTGCAACCAACGTAGTATATATTTTTTATGTTAGTCCAGTCATTATC CAGCATTCATATTGGTTGAATATCTATTCTGTGCGATAAAAATGGGTTTATGTTAAAATC CTTTGTTCAAGCATGTAGTTTTTTTACGTATTTCATATGAAAAAACACGTTACACTATGT TTCGCCTTTGTAATTGTCCCTATGCCCAGCATAATAAGGTTAGAAGGTTAGTTTCGTTTA TATTTGTTCGAGTTTTCAATTTTTGTGCGAATTAGGTATTATATAAATGAATTGTTCTGC TTGTTAGATAGAATGCGTACTTTTCCATACCGTATCATGTAACATTTTGAAAGCTGCAAA GATAGTGATTCTTTTAACATCTGATGGGAACAATTTTATAAAGCAAAACCTTGAAGCAAG AGGATTTTACTAACAGGTTATTAGGGCCACACAAAAAGCAAGAAAGGCTGGATCTTAGCG AATCTCGCTAGCAACTGTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)