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Anopheles gambiae
cluster # 5849 cluster # 5849       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5849#0 length = 1242 sequences # 4  

consensusID : consensus_5849#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1242
fasta sequence
                              [CCGCGGACGCGTGGGTTCTGAAACAATTCATAAACTCTGATATCAATTGGTGTGGAAGTGGTTAAAGGATTCCTATCCTCCATCTTGGTGTTAGGTATGATTTATTTCCTTCCTTTGAGTTGCCTTTTTGCATGTGGTACACGATGGAATTGAAAAAAAACAAACCAACTCTCTGTGAGGATTGTTGTTGCAGGCACTAATCACTAAGTAGTCTAAACGTTTACACCGACTTCCAATTACTTAGCAATTTTGATGTTGTACATCCTCCGGGTAACAAAAGGGGATCGTTTCTCCGCTTGCTTGGATGAATATCGTTCCATTGAAATGCTTTTTGGGTGTATTTATGCTCTGCTGCTTCTTTGCTTTGATCTTTTCTACACCTATTAATTGATCGTAGTTTATTTTAAAATGAAAATCAAAGCCATGTGAACTTTTATTGAATTTATTGTTCCTACTTTCATGATATTGATTAAAAAAAGTGTTGTTCGTTTGAATTGCAACACTGAGTATTAACACAACATGTGGCAACTCTCCAATGTGCTCCTCCAACTGCAACTATCTATGCAAATAAGCTTAATCGGTAAACGACAAACATGAACTACAAAAATAAATGCACACACTCAGCACGAGAGCTCTGCCACGTTGTGTGTGATTGATTAAAACGAGTAACAATCTAGAGCAAACAAAAAAATATAAACCTTTTGCAAAAATAAGCACACAATCGCGACACACTCTGTACAATAGCTGCACGCATTTACACATACATATACCGATGTATATTTGCATACTGGGGAAAACCCAAAGCGCCCCCTCCCATCGTTAACAACCACCCGCTCGGTTTTTCTTATCTCTTGACGCATGTAAAGCATTTTGGCTAAAGCGGGGAGCGGGATGTGAGACCATTATCAGCTTTCCTCTTTTTCCTCTTCCCCGCATTCTATCACTCGGTATAGGCATTTAAGACAACAACAAAAACGCACCCAACACTGCACCTCCTGTAATACAAAGATTGAAGGGGTGACAGCATTTTTTTGTATTGAAAAAAATGGGAGAAACAGATAGAGAGAAAAAAAGGAATTTGGACAGCTCGTCCTAAATACTGAGTGATGTTTGTACGTGTACGTGTGGGTGTGTGTGTGTACGAGTTTATATCGCACGACATCAACATTGAATGTAATGTTTGCAGGACAACATTACAGCACAAATACATATACACACAACATACACACGTTCTACGGTTAA]

[+] EMBL BM619291             [CCGCGGACGCGTGGGTTCTGAAACAATTCATAAACTCTGATATCAATTGGTGTGGAAGTGGTTAAAGGATTCCTATCCTCCATCTTGGTGTTAGGTATGATTTATTTCCTTCCTTTGAGTTGCCTTTTTGCATGTGGTACACGATGGAATTGAAAAAAAACAAACCAACTCTCTGTGAGGATTGTTGTTGCAGGCACTAATCACTAAGTAGTCTAAACGTTTACACCGACTTCCAATTACTTAGCAATTTTGATGTTGTACATCCTCCGGGTAACAAAAGGGGATCGTTTCTCCGCTTGCTTGGATGAATATCGTTCCATTGAAATGCTTTTTGGGTGTATTTATGCTCTGCTGCTTCTTTGCTTTGATCTTTTCTACACCTATTAATTGATCGTAGTTTATTTTAAAATGAAAATCAAAGCCATGTGAACTTTTATTGAATTTATTGTTCCTACTTTCATGATATTGATTAAAAAAAGTGTTGTTCGTTTGAATTGCAACACTGAGTATTAACACAACATGTGGCAACTCTCCAATGTGCTCCTCCAACTGCAACTATCTATGCAAATAAGCTTAATCGGTAAACGACAAACATGAACTACAAAAATAAATGCACACACTCAGCACGAGAGCTCTGCCACGTTGTGTGTGATTGATTAAAACGAGTAACAATCTAGAGCAAACAAAAAAATATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BX625285             [                                                                                                                                                                                                                                               CTTAGCAATTTTGATGTTGTACATCCTCCGGGTAACAAAAGGGGATCGTTTCTCCGCTTGCTTGGATGAATATCGTTCCATTGAAATGCTTTTTGGGTGTATTTATGCTCTGCTGCTTCTTTGCTTTGATCTTTTCTACACCTATTAATTGATCGTAGTTTATTTTAAAATGAAAATCAAAGCCATGTGAACTTTTATTGAATTTATTGTTCCTACTTTCATGATATTGATTAAAAAAAGTGTTGTTCGTTTGAATTGCAACACTGAGTATTAACACAACATGTGGCAACTCTCCAATGTGCTCCTCCAACTGCAACTATCTATGCAAATAAGCTTAATCGGTAAACGACAAACATGAACTACAAAAATAAATGCACACACTCAGCACGAGAGCTCTGCCACGTTGTGTGTGATTGATTAAAACGAGTAACAATCTAGAGCAAACAAAAAAATATAAACCTTTTGCAAAAATAAGCACACAATCGCGACACACTCTGTACAATAGCTGCACGCATTTACACATACATATACCGATGTATATTTGCATACTGGGGAAAACCCAAAGCGCCCCCTCCCATCGTTAACAACCACCCGCTCGGTTTTTCTTATCTCTTGACGCATGTAAAGCATTTTGGCTAAAGCGGGGAGCGGGATGTGAGACCATTATCAGCTTTCCTCTTTTTCCTCTTCCCCGCATTCTATCACTCGGTATAGGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BX615526             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GAACTTTTATTGAATTTATTGTTCCTACTTTCATGATATTGATTAAAAAAAGTGTTGTTCGTTTGAATTGCAACACTGAGTATTAACACAACATGTGGCAACTCTCCAATGTGCTCCTCCAACTGCAACTATCTATGCAAATAAGCTTAATCGGTAAACGACAAACATGAACTACAAAAATAAATGCACACACTCAGCACTAGAGCTCTGCCACGTTGTGTGTGATTGATTAAAACGAGTAACAATCTAGAGCAAACAAAAAAATATAAACCTTTTGCAAAAATAAGCACACAATCGCGACACACTCTGTACAATAGCTGCACGCATTTACACATACATATACCGATGTATATTTGCATACTGGGGAAAACCCAAAGCGCCCCCTCCCATCGTTAACAACCACCCGCTCGGTTTTTCTTATCTCTTGACGCATGTAAAGCATTTTGGCTAAAGCGGGGAGCGGGATGTGAGACCATTATCAGCTTTCCTCTTTTTCCTCTTCCCCGCATTCTATCACTCGGTATAGGCATTTAAGACAACAACAAAAACGCACCCAACACTGCACCTCCTGTAATACAAAGATTGAAGGGGTGACAGCATTTTTTTGTATTGAAAAAAATGGGAGAAACAGATAGAGAGAAAAAAAGGAATTTGGACAGCTCGTCCTAAATACTGAGTGATGTTTGTACGTGTACGTGTGGGTGTGTGTG                                                                                                         ]
[+] EMBL BX608590             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CGCATTCTATCACTCGGTATAGGCATTTAAGACAACAACAAAAACGCACCCAACACTGCACCTCCTGTCATACAAAGATTGAAGGGGTGACAGCATTTTTTTGTATTGAAAAAAATGGGAGAAACAGATAGAGAGAAAAAAAGGAATTTGGACAGCTCGTCCTAAATACTGAGTGATGTTTGTACGTGTACGTGTGGGTGTGTGTGTGTACGAGTTTATATCGCACGACATCAACATTGAATGTAATGTTTGCAGGACAACATTACAGCACAAATACATATACACACAACATACACACGTTCTACGGTTAA]


>consensus_5849#0 CCGCGGACGCGTGGGTTCTGAAACAATTCATAAACTCTGATATCAATTGGTGTGGAAGTG GTTAAAGGATTCCTATCCTCCATCTTGGTGTTAGGTATGATTTATTTCCTTCCTTTGAGT TGCCTTTTTGCATGTGGTACACGATGGAATTGAAAAAAAACAAACCAACTCTCTGTGAGG ATTGTTGTTGCAGGCACTAATCACTAAGTAGTCTAAACGTTTACACCGACTTCCAATTAC TTAGCAATTTTGATGTTGTACATCCTCCGGGTAACAAAAGGGGATCGTTTCTCCGCTTGC TTGGATGAATATCGTTCCATTGAAATGCTTTTTGGGTGTATTTATGCTCTGCTGCTTCTT TGCTTTGATCTTTTCTACACCTATTAATTGATCGTAGTTTATTTTAAAATGAAAATCAAA GCCATGTGAACTTTTATTGAATTTATTGTTCCTACTTTCATGATATTGATTAAAAAAAGT GTTGTTCGTTTGAATTGCAACACTGAGTATTAACACAACATGTGGCAACTCTCCAATGTG CTCCTCCAACTGCAACTATCTATGCAAATAAGCTTAATCGGTAAACGACAAACATGAACT ACAAAAATAAATGCACACACTCAGCACGAGAGCTCTGCCACGTTGTGTGTGATTGATTAA AACGAGTAACAATCTAGAGCAAACAAAAAAATATAAACCTTTTGCAAAAATAAGCACACA ATCGCGACACACTCTGTACAATAGCTGCACGCATTTACACATACATATACCGATGTATAT TTGCATACTGGGGAAAACCCAAAGCGCCCCCTCCCATCGTTAACAACCACCCGCTCGGTT TTTCTTATCTCTTGACGCATGTAAAGCATTTTGGCTAAAGCGGGGAGCGGGATGTGAGAC CATTATCAGCTTTCCTCTTTTTCCTCTTCCCCGCATTCTATCACTCGGTATAGGCATTTA AGACAACAACAAAAACGCACCCAACACTGCACCTCCTGTAATACAAAGATTGAAGGGGTG ACAGCATTTTTTTGTATTGAAAAAAATGGGAGAAACAGATAGAGAGAAAAAAAGGAATTT GGACAGCTCGTCCTAAATACTGAGTGATGTTTGTACGTGTACGTGTGGGTGTGTGTGTGT ACGAGTTTATATCGCACGACATCAACATTGAATGTAATGTTTGCAGGACAACATTACAGC ACAAATACATATACACACAACATACACACGTTCTACGGTTAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)