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Anopheles gambiae
cluster # 5867 cluster # 5867       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5867#0 length = 1578 sequences # 4  

consensusID : consensus_5867#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1578
fasta sequence
                              [CCGGTAATGGCAGTAGTGCGTAAATGATAACCCACAGAACAGACACACATATACAACAAACAAACAAAAAACCGTACGCAAGGTGCATAAAAGTTCGATTATAGTAGCGAGGAATGGGTTTGCGGTACAAACAGGTTGATGAAGCTAAATGAATTTAATGTTTTTTCTTCCCTTGTATAATGTTCGCATTACCTTTCGAGGTAATTGATCCTCTGACTCACATTGATTCACATCGGTAACAGTTTACATTCGTGTGCGGAACAAAAAACAGTGAAAAGAAAAACAAAACAAAATCAGCTTCTAGTCATTTTCTTCCAGCATTGGTCAAAATTAGCCGTTAACAAAATGACATTTAATAATGTTCGTATTATTTCCGGAGCGTTTATGAAGCAATGCTTAATTAAGAGCTATTTCAGCCACTGTGCCATACTAATTTTGAGTAGTGTTTTCGTATTGCGCATCACCATAACCAGCAATCGAACAGCGAGACTCAGTTGCTCTACTAGTACCGGATCTCCTCAACCACAACCAAACTGCAAAAAATAATTGAAAATTGTTACTTGTGTTACGCATATAACGGACAAAAAAGGAAATTTAATCAAAATTAATGCAACAATTGTTGTACAAAAAAACCAAATAATAGAGCATGGT-ATGATGATTGATGGTTGAAAGGATGGATGGATAATGAGGATGATAAGTGAGGGCATGCTTTTCGTACCATATAATAATATTTAGAGGACGTAAGAATAGGCAAAAGAAGAAAAAACACACACACACATACAGAGAAAATGACATTTATTTACACTGTTTGGGCAACTGCAAATGACAAATTAGGCCACAATTCTGATTTATCGTAAAAATGAAACAGAAAGCTATAGTTTAATTAAAGTAAATCATTTTCAGTGTCGCTTTTATTCCCTTTCTAAAGTGTCACATTTGGATCAGCTTTTTCCCTACATAAATAGTACCGATAATAATCTTTAGACGGCCCCAGGTATCTCTAATGTCGTAATGTGTCACTCAAACTCAAACAAAAAAAAAGAATTCTTGGACTAAAATTTAAAACAGCTCTGTAGTATAATCCTTATACGATAAGCTCGCAAAAAAAAACATCACGTAATCAATGTAATCACTTATTGGAAAAGGTGTGTGAAACTAACGTTTAAGAAATGTTCTGAAAAGCTCTGGTTCAATGGTTGGCGGCGTTCGGTTTTGCGAAAGAAAACATCACCCCAAACAGGCAAACAAAACGAAAGAATGGAACGGTGAACCACGACACGAACAAAAACTAAATGAAACAAATATACGAACAATCACCGTTCATTAAGGAAACAACAAC-AAAAAAACACATAATTTCAGTAACATTACCCATTAAATGTAGTGGATTGCTAATAATTGCTTGCTTGATATTCGTCAAACACAGGAAATAGGCGTGTATGTGTAGGGCACGTGGAAAGAAGTAGTAATAGAAAACGCAAATGGAAAACGAATGAAAAATTGTGAAAGGATGAAAAGAAGGGAATGCGAAAAATCAATTCCCCTTTGC-AAAGAGCCAGAAAAAGCCGAACCNGAGAGCAA]

[+] EMBL BM621566             [CCGGTAATGGCAGTAGTGCGTAAATGATAACCCACAGAACAGACACACATATACAACAAACAAACAAAAAACCGTACGCAAGGTGCATAAAAGTTCGATTATAGTAGCGAGGAATGGGTTTGCGGTACAAACAGGTTGATGAAGCTAAATGAATTTAATGTTTTTTCTTCCCTTGTATAATGTTCGCATTACCTTTCGAGGTAATTGATCCTCTGACTCACATTGATTCACATCGGTAACAGTTTACATTCGTGTGCGGAACAAAAAACAGTGAAAAGAAAAACAAAACAAAATCAGCTTCTAGTCATTTTCTTCCAGCATTGGTCAAAATTAGCCGTTAACAAAATGACATTTAATAATGTTCGTATTATTTCCGGAGCGTTTATGAAGCAATGCTTAATTAAGAGCTATTTCAGCCACTGTGCCATACTAATTTTGAGTAGTGTTTTCGTATTGCGCATCACCATAACCAGCAATCGAACAGCGAGACTCAGTTGCTCTACTAGTACCGGATCTCCTCAACCACAACCAAACTGCAAAAAATAATTGAAAATTGTTACTTGTGTTACGCATATAACGGACAAAAAAGGAAATTTAATCAAAATTAATGCAACAATTGTTGTACAAAAAAACCAAATAATAGAGCATGGTGATGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BM644881             [                                                                                                                                                                   ccgCTTCCCTTGTATAATGTTCACATTACCTTTCGAGGTAATTGATCCTCTGACTCACATTGATTCACATCGGTAACAGTTTACATTCGTGTGCGGAACAAAAAACAGTGAAAAGAAAAACAAAACAAAATCAGCTTCTAGTCATTTTCTTCCAGCATTGGTCAAAATTAGCCGTTAACAAAATGACATTTAATAATGTTCGTATTATTTCCGGAGCGTTTATGAAGCAATGCTTAATTAAGAGCTATTTCAGCCACTGTGCCATACTAATTTTGAGTAGTGTTTTCGTATTGCGCATAACCATAACCAGCAATCGATCAGCGAGACTCAGTTGCTCTATTAGTACCGGATCTCCTCAACCACAACCAAACTGCAAAAAATAATTGAAAATTGTTACTTGTGTTACGCATATAACGGACAAAAAAGGAAATTTAATCAAAATTAATGCAACAATTGTTGTACAAAAAAACCAAATAATAGAGCATGAT ATGATGATTGATGGTTGAAAGGATGGATGGATAATGAGGATGATAAGTGAGGGCATGCTTTTCGTACCATATAATAATATTTAGAGGACGTAAGAATAGGCAAAAGAAGAAAAAACACACACACACATACAGAGAAAATGACATTTATTTACACTGTTTGGGCAACTGCAAATGACAAATTAGGCCACAATTCTGATTTATCGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BX622353             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GACATTTATTTACACTGTTTGGGCAACTG AAATGACAAATTAGGCCACAATTCTGATTTATCGTAAAAATGAAACAGAAAGCTATAGTTTAATTAAAGTAAATCATTTTCAGTGTCGCTTTTATTCCCTTTCTAAAGTGTCACATTTGGATCAGCTTTTTCCCTACATAAATAGTACCGATAATAATCTTTAGACGGCCCCAGGTATCTCTAATGTCGTAATGTGTCACTCAAACTCAAACAAAAAAAAAGAATTCTTGGACTAAAATTTAAAACAGCTCTGTAGTATAATCCTTATACGATAAGCTCGCAAAAAAAAACATCACGTAATCAATGTAATCACTTATTGGAAAAGGTGTGTGAAACTAACGTTTAAGAAATGTTCTGAAAAGCTCTGGTTCAATGGTTGGCGGCGTTCGGTTTTGCGAAAGAAAACATCACCCCAAACAGGCAAACAAAACGAAAGAATGGAACGGTGAACCACGACACGAACAAAAACTAAATGAAACAAATATACGAACAATCACCGTTCATTAAGGAAACAACAAC AAAAAAACACATAATTTCAGTAACATTACCCATTAAATGTAGTGGATTGCTAATAATTGCTTGCTTGATATTCGTCAAACACAGGAAATAGGCGTGTATGTGTAGGGCACGTGGAAAGAAGTAGTAATAGAAAACGCAAATGGAAAACGAATGAAAAATTGTGAAAGGATGAAAAGAAGGGAATGCGAAAAATCAATTCCCCTTTGC AAAGAGCCAGAAAAAGCCGAACCNGAGAGCAA]
[+] EMBL BM629953             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ccgTAAAATTTAAAACAGCTCTGTAGTATAATCCTTATACGATAAGCTCGC AAAAAAAACATCACGTAATCAATGTAATCACTTATTGGAAAAGGTGTGTGAAACTAACGTTTAAGAAATGTTCTGAAAAGCTCTGGTTCAATGGTTGGCGGCGTTCGGTTTTGCGAAAGAAAACATCACCCCAAACAAGCAAACAAAACGAAAGAATGGAACGGTGAAC  CGACACGAACACAAACTAAATGAAACAAATATACGAACAATCACCGTTCATTAAGGAAACAACAACAAAAAAAACACATAATTTCAGTAACATTACCCATTAAATGTAGTGTATTGCTAATAATTGCTTGCTTGATATTCGTCAAACACAGGAAATAGGCGTGTATGTGTAGGGCACGTGGAAAGAAGTAGTAATAGAAAACGCAAACAGAAAACGAACGAAAAATTGTGAAAGGATGAAAAGCAGGGAATGCGAAAAATCAATTCCCCTTTGCAAAAGAGCCAGAA                    ]


>consensus_5867#0 CCGGTAATGGCAGTAGTGCGTAAATGATAACCCACAGAACAGACACACATATACAACAAA CAAACAAAAAACCGTACGCAAGGTGCATAAAAGTTCGATTATAGTAGCGAGGAATGGGTT TGCGGTACAAACAGGTTGATGAAGCTAAATGAATTTAATGTTTTTTCTTCCCTTGTATAA TGTTCGCATTACCTTTCGAGGTAATTGATCCTCTGACTCACATTGATTCACATCGGTAAC AGTTTACATTCGTGTGCGGAACAAAAAACAGTGAAAAGAAAAACAAAACAAAATCAGCTT CTAGTCATTTTCTTCCAGCATTGGTCAAAATTAGCCGTTAACAAAATGACATTTAATAAT GTTCGTATTATTTCCGGAGCGTTTATGAAGCAATGCTTAATTAAGAGCTATTTCAGCCAC TGTGCCATACTAATTTTGAGTAGTGTTTTCGTATTGCGCATCACCATAACCAGCAATCGA ACAGCGAGACTCAGTTGCTCTACTAGTACCGGATCTCCTCAACCACAACCAAACTGCAAA AAATAATTGAAAATTGTTACTTGTGTTACGCATATAACGGACAAAAAAGGAAATTTAATC AAAATTAATGCAACAATTGTTGTACAAAAAAACCAAATAATAGAGCATGGTATGATGATT GATGGTTGAAAGGATGGATGGATAATGAGGATGATAAGTGAGGGCATGCTTTTCGTACCA TATAATAATATTTAGAGGACGTAAGAATAGGCAAAAGAAGAAAAAACACACACACACATA CAGAGAAAATGACATTTATTTACACTGTTTGGGCAACTGCAAATGACAAATTAGGCCACA ATTCTGATTTATCGTAAAAATGAAACAGAAAGCTATAGTTTAATTAAAGTAAATCATTTT CAGTGTCGCTTTTATTCCCTTTCTAAAGTGTCACATTTGGATCAGCTTTTTCCCTACATA AATAGTACCGATAATAATCTTTAGACGGCCCCAGGTATCTCTAATGTCGTAATGTGTCAC TCAAACTCAAACAAAAAAAAAGAATTCTTGGACTAAAATTTAAAACAGCTCTGTAGTATA ATCCTTATACGATAAGCTCGCAAAAAAAAACATCACGTAATCAATGTAATCACTTATTGG AAAAGGTGTGTGAAACTAACGTTTAAGAAATGTTCTGAAAAGCTCTGGTTCAATGGTTGG CGGCGTTCGGTTTTGCGAAAGAAAACATCACCCCAAACAGGCAAACAAAACGAAAGAATG GAACGGTGAACCACGACACGAACAAAAACTAAATGAAACAAATATACGAACAATCACCGT TCATTAAGGAAACAACAACAAAAAAACACATAATTTCAGTAACATTACCCATTAAATGTA GTGGATTGCTAATAATTGCTTGCTTGATATTCGTCAAACACAGGAAATAGGCGTGTATGT GTAGGGCACGTGGAAAGAAGTAGTAATAGAAAACGCAAATGGAAAACGAATGAAAAATTG TGAAAGGATGAAAAGAAGGGAATGCGAAAAATCAATTCCCCTTTGCAAAGAGCCAGAAAA AGCCGAACCNGAGAGCAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)