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Anopheles gambiae
cluster # 6087 cluster # 6087       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6087#0 length = 1200 sequences # 5  

consensusID : consensus_6087#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1200
fasta sequence
                              [ACCTTCAAAAAAAAAAGGTAAAAAAATAGCAAACTTAATCAAGTTTAGCAAGGTTTCATAGAAGAAGAAGAAAAAAAAACAAAGTTAAGAAAAAAGCTTATCAAATGAAATGAGAAAAAATAGATACCAATACAAGGTGCAACAACTGCTAACAGATCGGTTAGATATTCTTCAACAAAAACTATAACAATTTTGTGTGTGTGTCTTTTTTTTGTTTGTACGTAAAAGTGTTACATTGAACAAATTAGTTCACTTAAAGACACTTTCACATATTTTATATCAACATTTCGTTCCCTTTCCGATTATCATGCAACTTTGCACGTCTTTAAACACACACACGAACAAGTAAATACCAGAA--ACAGTACAATACAAATCGAGCACTTGTAAACTTGAAACAAAGCCACAACTAGCAAGTAAGAAGACTACGTAACAGATAAACTGTGCAGTTTTATAATATCGTCTAAACTAATCGACAAAACAAACAATGGCAAATGACAAATGACATGCAGTTAAAACTTTCAGCCGACAGACCGACACACTGTTAGCGTAGCGAAAACAGAAATGTGGAAAAAAGGACAGTGAACAAAGAGTACAACTTTATATCGGTGTAGTAATCAGTAACTAATCAGCACCACATGTGTGTGTGTGTATGTAGCGTGTGTGTGTGTGTAGT-GTTCCGAAGTAAAGAGCATAAGTCTCCAATCAATCCAATACAGTATCAAATTTAACCCCAAAAAAGGGGAATTCAA-AATTTTACCAATT-TAACTATTTTCCAGACAGTAATTTGGCACCGTTTTTGTCTTTTTTTGGGTTTGGTATACTTACGTTTCGACTTTCCACTAATATTTTATGCACAAAACTGT-ATGTAACAATTATT-ATGCACTACACACACCACTGCAAGCTGCAGCTCGTGTGGTTAAGCTAATTATGTGTAGATGTGTATGTAGATTCAT-AAGATGGTGGTAGAAAATTATATTTNANCAGTTTATAGATGTTTCACGTTGTATGTTTTCCCTTCTTCTAATTTCTACGCGGCGATTTCTGCACGAAATGTTTGATTTGATGAAATATTTCTTTACCCAAGCCGCTTTGTGGCGAATTAAANAACGATTGAAATTACCTCTTCACACTGCAACGACCGCGTTTAAATGAAACTATTTTTTGGTAGNCCTTCTATGTGTAAACATTACTATTTANGAA]

[+] EMBL BX616907             [ACCTTCAAAAAAAAAAGGTAAAAAAATAGCAAACTTAATCAAGTTTAGCAAGGTTTCATAGAAGAAGAAGAAAAAAAAACAAAGTTAAGAAAAAAGCTTATCAAATGAAATGAGAAAAAATAGATACCAATACAAGGTGCAACAACTGCTAACAGATCGGTTAGATATTCTTCAACAAAAACTATAACAATTTTGTGTGTGTGTCTTTTTTTTGTTTGTACGTAAAAGTGTTACATTGAACAAATTAGTTCACTTAAAGACACTTTCACATATTTTATATCAACATTTCGTTCCCTTTCCGATTATCATGCAACTTTGCACGTCTTTAAACACACACACGAACAAGTAAATACCAGAA  ACAGTACAATACAAATCGAGCACTTGTAAACTTGAAACAAAGCCACAACTAGCAAGTAAGAAGACTACGTAACAGATAAACTGTGCAGTTTTATAATATCGTCTAAACTAATCGACAAAACAAACAATGGCAAATGACAAATGACATGCAGTTAAAACTTTCAGCCGACAGACCGACACACTGTTAGCGTAGCGAAAACAGAAATGTGGAAAAAAGGACAGTGAACAAAGAGTACAACTTTATATCGGTGTAGTAATCAGTAACTAATCAGCACCACATGTGTGTGTGTGTATGTAGCGTGTGTGTGTGTGTAGT GTTCCGAAGTAAAGAGCATAAGTCTCCAATCAATCCAATACAGTATCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BX622678             [                                                                                                                                                                                                                                                                                           CATTTCGTTCCCTTTCCGATTATCATGCAACTTTGCACGTCTTTAAACACACACACGAACAAGTAAATACCAGAA  ACAGTACAATACAAATCGAGCACTTGTAAACTTGAAACAAAGCCACAACTAGCAAGTAAGAAGACTACGTAACAGATAAACTGTGCAGTTTTATAATATCGTCTAAACTAATCGACAAAACAAACAATGGCAAATGACAAATGACATGCAGTTAAAACTTTCAGCCGACAGACCGACACACTGTTAGCGTAGCGAAAACAGAAATGTGGAAAAAAGGACAGTGAACAAAGAGTACAACTTTATATCGGTGTAGTAATCAGTAACTAATCAGCACCACATGTGTGTGTGTGTATGTAGCGTGTGTGTGTGTGTAGT GTTCCGAAGTAAAGAGCATAAGTCTCCAATCAATCCAATACAGTATCAAATTTAACCCCAAAAAAGGGGAATTCAA AATTTTACCAATT TAACTATTTTCCAGACAGTAATTTGGCACCGTTTTTGTCTTTTTTTGGGTTTGGTATACTTACGTTTCGACTTTCCACTAATATTTTATGCACAAAACTGT ATGTAACAATTATT ATGCACTACACACACCACTGCAAGCTGCAGCTCGTGTGGTTAAGCTAATTATGTGTAGATGTGTATGTAGATTCAT AAGATG                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AL697515             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atcgcCCAGGATTACAGTACAATACAAATCGAGC CTTGTAAACTTGAAACAAAGCCACAACTAGCAAGTAAGAAGACTTCGTAACAGATAAACTGTGCAGTTTTATAATATCGTCTAAACTAATCGACAAAACAAACAATGGCAAATGACAAATGACATGCAGCTAAAACTTTCACCCGACAGACCGACACACTGTTAGCGTAGCGAAAACAGAAATGTGG AAAANGGACAGTGAACAAAGAGTACAACTTTATATCGGTGTAGTAATCAGTAACTAATCAGCTCCACAAGTGTGTGTGTGTATGTAGC  GTGTGTGTGTGTAGTGGTTCGCAAGTAAAGAGCATAAGTCTCCAATCAATCCAATACACTATCAAATTTAA CCCAACAAAGAAGAATTCAACAATTTTACCAATTCTAACTATTTTCTAGACAGTAATTTGGCACCGNTTACGTCTTTNANAGGGTNAGGTATACTTACGTTTCGACTTTCCACTAATATTTTATGCACAAAACTGTCATGTAACAATTATTCATGCACTACACACACCACTGCAAGCTGCAGCTCGTGTGGTTAAGCTAATTATGTGTAGATGTGTATGTAGATTCATNAAGATGGTGGTAGAAAATTATATTTNANCAGTTTATAGATGTTTCACGT                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BX614924             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TAGCGTAGCGAAAACAGAAATGTGGAAAAAAGGACAGTGAACAAAGAGTACAACTTTATATCGGGGTAGTAATCAGTAACTAATCAGCACCACATGTGTGTGTGTGTATGTAGCGTGTGTGTGTGTGTAGT GTTCCGAAGTAAAGAGCATAAGTCTCCAATCAATCCAATACAGTATCAAATTTAACCCCAAAAAAGGGGAATTCAA AATTTTACCAATT TAACTATTTTCCAGAAAGTAATTTGGCACCGTTTTTGTCTTTTTTTGGGTTTGGTATACTTACGTTTCGACTTTCCACTAATATTTTATGCACAAAACTGT ATGTAACAATTATT ATGCACTACACACACCACTGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BX625136             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTAGATGTGTATGTANATTCAT AAGATGGTGGTAGAAAATTATATTT TTCAGNTTATAGATGTTTCACGTTGTATGTTTTCCCTTCTTCTAATTTCTACGCGGCGATTTCTGCACGAAATGTTTGATTTGATGAAATATTTCTTTACCCAAGCCGCTTTGTGGCGAATTAAANAACGATTGAAATTACCTCTTCACACTGCAACGACCGCGTTTAAATGAAACTATTTTTTGGTAGNCCTTCTATGTGTAAACATTACTATTTANGAA]


>consensus_6087#0 ACCTTCAAAAAAAAAAGGTAAAAAAATAGCAAACTTAATCAAGTTTAGCAAGGTTTCATA GAAGAAGAAGAAAAAAAAACAAAGTTAAGAAAAAAGCTTATCAAATGAAATGAGAAAAAA TAGATACCAATACAAGGTGCAACAACTGCTAACAGATCGGTTAGATATTCTTCAACAAAA ACTATAACAATTTTGTGTGTGTGTCTTTTTTTTGTTTGTACGTAAAAGTGTTACATTGAA CAAATTAGTTCACTTAAAGACACTTTCACATATTTTATATCAACATTTCGTTCCCTTTCC GATTATCATGCAACTTTGCACGTCTTTAAACACACACACGAACAAGTAAATACCAGAAAC AGTACAATACAAATCGAGCACTTGTAAACTTGAAACAAAGCCACAACTAGCAAGTAAGAA GACTACGTAACAGATAAACTGTGCAGTTTTATAATATCGTCTAAACTAATCGACAAAACA AACAATGGCAAATGACAAATGACATGCAGTTAAAACTTTCAGCCGACAGACCGACACACT GTTAGCGTAGCGAAAACAGAAATGTGGAAAAAAGGACAGTGAACAAAGAGTACAACTTTA TATCGGTGTAGTAATCAGTAACTAATCAGCACCACATGTGTGTGTGTGTATGTAGCGTGT GTGTGTGTGTAGTGTTCCGAAGTAAAGAGCATAAGTCTCCAATCAATCCAATACAGTATC AAATTTAACCCCAAAAAAGGGGAATTCAAAATTTTACCAATTTAACTATTTTCCAGACAG TAATTTGGCACCGTTTTTGTCTTTTTTTGGGTTTGGTATACTTACGTTTCGACTTTCCAC TAATATTTTATGCACAAAACTGTATGTAACAATTATTATGCACTACACACACCACTGCAA GCTGCAGCTCGTGTGGTTAAGCTAATTATGTGTAGATGTGTATGTAGATTCATAAGATGG TGGTAGAAAATTATATTTNANCAGTTTATAGATGTTTCACGTTGTATGTTTTCCCTTCTT CTAATTTCTACGCGGCGATTTCTGCACGAAATGTTTGATTTGATGAAATATTTCTTTACC CAAGCCGCTTTGTGGCGAATTAAANAACGATTGAAATTACCTCTTCACACTGCAACGACC GCGTTTAAATGAAACTATTTTTTGGTAGNCCTTCTATGTGTAAACATTACTATTTANGAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)