These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6156#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1020 fasta sequence [TTTCGTTCACCTCCTGCTCGTACTGGAACTTGCGCTTCGACACGATCACATCCTCGATGCCCGACCGGTCGCCGTACTTTTTCTCGTGTATCGTGTACGCCTTGTACAGTTCCGTCGTGCGATCCTTCGGCAGGTGGTCCAGCGCGTACTTGTAGATGACGCGCACGCGGTCGTGCTCCTTCTGGCCCTCCTCGAAGCGAGCGAACGCGATGAACAGCCGCTCGTCGGCGTGATCGTCGCCGAAGAACTCGATCGCCCGCTCGTACACAGTGCGCGACCCATTGATGAA-CCCGTGCGCCTCCTCGAACC-GGGCGTACTTGATCCAGTTCTTCACCTCC-GGATGTACCATCACGAACCGCTCGTAGATCGTGCGGGCCCGGTCGATCTCTTTGTAGCGCAGCTCGAAGTTGATGTACGTTTGCCACGCCTGCTCCTCCGGTTGCCATTCCATCCAGCGCTCAAACACCTGCCGGGCGCCGGCAACATTCTCCAGCATTTCTTCCATGTACGTGTACTTGTACCAGAACTGGTTGACACGCGGCAGTATCGTGACCGCCCGGTCCCACAGATTGCGCGCATGGTTCACCTGCCGGTGCTTCATCTCCATCTCCGCGTACTTCAGCCATATCGTAATGTTCCGATGGTCGTTATCGATCGCACGCTCCCAGATCGACCGGGCGCGCTGAATTTCCTTCTGCGACTCTTCCCACTGGGCGTACTTGATCCAGTTGCTGACGACCATGCGGTTTTTGCGCAGATTGTCCTCGAACGTTTTGCGCTTCCGCTGCTGGTAGTCGGCCAGCTCGGCCGCATCGGAAATCTTTTGCTTCGGCGGCGGTGGCAGAATTTCCAGATCACGCTCCTTCGCCTCACGCAGCAGCTGTTCAGCGGTGATTTGCACCTCCGCTGGTGCTTTGTTTTTCACCTTTGCCACTTTGGGCATTTTCTGTGGTTTCTCCATGGTAGTGGATGGTTTTTGTTGAAATTTTTAACGCGATTCACCTGGTTGCGTTGCGTCGG] [+] EMBL BX627283 [TTTCGTTCACCTCCTGCTCGTACTGGAACTTGCGCTTCGACACGATCACATCCTCGATGCCCGACCGGTCGCCGTACTTTTTCTCGTGTATCGTGTACGCCTTGTACAGTTCCGTCGTGCGATCCTTCGGCAGGTGGTCCAGCGCGTACTTGTAGATGACGCGCACGCGGTCGTGCTCCTTCTGGCCCTCCTCGAAGCGAGCGAACGCGATGAACAGCCGCTCGTCGGCGTGATCGTCGCCGAAGAACTCGATCGCCCGCTCGTACACAGTGCGCGACCCATTGATGAA CCCGTGCGCCTCCTCGAACC GGGCGTACTTGATCCAGTTCTTCACCTCC GGATGTACCATCACGAACCGCTCGTAGATCGTGCGGGCCCGGTCGATCTCTTTGTAGCGCAGCTCGAAGTTGATGTACGTTTGCCACGCCTGCTCCTCCGGTTGCCATTCCATCCAGCGCTCAAACACCTGCCGGGCGCCGGCAACATTCTCCAGCATTTCTTCCATGTACGTGTACTTGTACCAGAACTGGTTGACACGCGGCAGTATCGTGACCGCCCGGTCCCACAGATTGCGCGCATGGTTCACCTGCCGGTGCTTCATCTCCATCTCCGCGTACTTCAGCCATATCGTAATGGTCCGATGGTCGNTATCGATCGCACGCTCCCAGATCGACCGGGCGCGCTGAATTTNCTTCTGCGACTCTTCCCACTGGGCGTACTTGATCCAGTTGCTGA ] [-] EMBL BM639628 [TTTCGTTCACCTCCTGCTCGTACTGGAACTTGCGCTTCGACACGATCACATCCTCGATGCCCGACCGGTCGCCGTACTTTTTCTCGTGTATCGTGTACGCCTTGTACAGTTCCGTCGTGCGATCCTTCGGCAGGTGGTCCAGCGCGTACTTGTAGATGACGCGCACGCGGTCGTGCTCCTTCTGGCCCTCCTCGAAACGAGCGAACGCGATGAACAGCCGCTCGTCGGCGTGATCGTCGCCGAAGAACTCGATCGCCCGCTCGTACACAGTGCGCGACCCATTGATGAA CCCGTGCGCCTCCTCGAACC GGGCGTACTTGATCCAGTTCTTCACCTCC GGATGTACCATCACGAACCGCTCGTAGATCGTGCGGGCCCGGTCGATCTCTTTGTAGCGCAGCTCGAAGTTGATGTACGTTTGCCACGCCTGCTCCTCCGGTTGCCATTCCATCCAGCGCTCAAACACCTGCCGGGCGCCGGCCACATTCTCCAGCATTTCCTCCATGTACGTGTACTTGTACCAGAACTGGTTGACACGCGGCAGTATCGTGACCGCCCGGTCCCACAGATTGCGCGCGTGGTTCACCTGCCGGTGCTTCATCTCCcgg ] [+] EMBL BX627436 [ TTCACCTCCTGCTCGTACTGGAACTTGCGCTTCGACACGATCACATCCTCGATGCCCGACCGGTCGCCGTACTTTTTCTCGTGTATCGTGTACGCCTTGTACAGTTCCGTCGTGCGATCCTTCGGCAGGTGGTCCAGCGCGTACTTGTAGATGACGCGCACGCGGTCGTACTCCTTCTGGCCCTCCTCGAAGCGAGCGAACGCGATGAACAGCCGCTCGTCGGCGTGATCGTCGCCGAAGAACTCGATCGCCCGCTCGTACACAGTGCGCGACCCATTGATGAA CCCGTGCGCCTCCTCGAACC GGGCGTACTTGATCCAGTTCTTCACCTCC GGATGTACCATCACGAACCGCTCGTAGATCGTGCGGGCCCGGTCGATCTCTTTGTAGCGCAGCTCGAAGTTGATGTACGTTTGCCACGCCTGCTCCTCCGGTTGNCATTCCATCCAGCGCTCAAACACCTGCCGGGCGCCGGCAACATTCTCCAGCATTTCTTCCATGTACGTGTACTTGTACCAGAACTGGTTGACACGCGGCAGTATCGTGACCGCCCGGTCCCACAGATTGCGCGCATGGTTCACCTGCCGGTGCTTCATCTCCATCTCCGCGTACTTCAGCCATATCGTAATGTTCCGATGGTCGTTATCGATCGCACGCTCCTCGATCGACCGGGCGCGCTGAATTTCCTTCTGCGACTCTTTCCACTGGGCGTACTTGATCCAGTTGCTGACGACCATGCGGGTTTTGCGCAGATTGTCCTCGAACGTTTT ] [-] EMBL BM607368 [ TACTTGTAGATGACGCGCACGCGGTCGTGCTCCTTCTGGCCCTCCTCGAAGCGAGCGAACGCGATGAACAGCCGCTCGTCGGCGTGATCGTCGCCGAAGAACTCGATCGCCCGCTCGTACACAGTGCGCGACCCATTGATGAA CCCGTGCGCCTCCTCGAACC GGGCGTACTTGATCCAGTTCTTCACCTCC GGATGTACCATCACGAACCGCTCGTAGATCGTGCGGGCCCGGTCGATCTCTTTGTAGCGCAGCTCGAAGTTGATGTACGTTTGCCACGCCTGCTCCTCCGGTTGCCATTCCATCCAGCGCTCAAACACCTGCCGGGCGCCGGCAACATTCTCCAGCATTTCTTCCATGTACGTGTACTTGTACCAGAACTGGTTGACACGCGGCAGTATCGTGACCGCCCGGTCCCACAGATTGCGCGCATGGTTCACCTGCCGGTGCTTCATCTCCATCTCCGCGTACTTCAGCCATATCGTAATGTTCCGATGGTCGTTATCGATCGCACGCTCCCAGATCGACCGGGCGCGCTGAATTTCCTTCTGCGACTCTTCCCACTGGGCGTACTTGATCCAGTTGCTGACGACCATGCGGTTTTTGCGCAGATTGTCCTCGAACGTTTTGCGCTTCCGCTGCTGGTAGTCGGCCAGCTCGGCCGCATCGGAAATCTTTTGCTTCGG ] [-] EMBL BM617799 [ gttgGTACCCAGTGCGCGACCCATTGATGAACCCCGTGCGCTTCCTCGAACCGGGGCGTACTTGATCCAGTTCTTCACCTCCTGGATGTACCATCACGAACCGCTCGTAGATCGTGCGGGCCCGGTCGATCTCTTTGTAGCGCAGCTCGAAGTTGATGTACGTTTGCCACGCCTGCTCCTCCGGTTGCCATTCCATCCAGCGCTCAAACACCTGCCGGGCGCCGGCAACATTCTCCAGCATTTCTTCCATGTACGTGTACTTGTACCAGAACTGGTTGACACGCGGCAGTATCGTGACCGCCCGGTCCCACAGATTGCGCGCATGGTTCACCTGCCGGTGCTTCATCTCCATCTCCGCGTACTTTAGCCATATCGTAATGTTCCGATGGTCGTTATCGATCGCACGCTCCCAGATCGACCGGGCGCGCTGAATTTCCTTCTGCGACTCTTCCCACTGGGCGTACTTGATCCAGTTGCTGACGACCATGCGGTTTTTGCGCAGATTGTCCTCGAACGTTTTGCGCTTCCGCTGCTGGTAGTCGGCCAGCTCGGCCGCATCGGAAATCTTTTGCTTCGGCGGCGGTGGCAGAATTTCCAGATCACGCTCCTTCGCCTCACGCAGCAGCTGTTCAGCGGTGATTTGCACCTCCGCTGGTGCTTTGTTTTTCACCTTTGCCACTTTGGGCATTTTCTGTGGTTTCTCCATGGTAGTGGATGGTTTTTGTTGAAATTTTTAACGCGATTCACCTGGTTGCGTTGCGTCGG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||