Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Anopheles gambiae
cluster # 6193 cluster # 6193       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6193#0 length = 1259 sequences # 5  

consensusID : consensus_6193#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1259
fasta sequence
                              [ATGAGTGTGCGCCTATGGGCCAAGCTCCTCTTGCGCAGCGGAATCAGTGGCGCTGCTCGCGCTGGTTTGAGGCATGGTTTGTTTCCTTTTTTTTCTGTCGCTGTCGAATGTGGGCCGGTCGGGTGCTCTGTCTGTGTGGTGGTGTTGTTTGAAGCTTCGGAGCGGAAGGATATTGCAGAGGCAGCCAAAGCCATTGAAGGTTGTTCAATTCAAGGTGCATTTTGCAACGCAAAA-TTTTTAAG-CCAGCAATCACGATCAAACACGCTTGATCGCGAACAAAAATCCTGTCAATTTTGGTATTTTGGTTCCCAGTTTTAATGGTGTGATGCTCTTTTCTTTACTGCTACGAATATGGTACTGTTTATACATACTTTGGTTTGGTTTTATTGCTTCCTGGTCCTTGTGCACACCAACTAGAATCGAATCTACTTCCAGCAGGCACCGCGGACAAAGGGAAAGAGAAACAAAC-AAACACACTCCTCCAACTACATGTGTAAATTCTGTTGTGATATAGTTGCAAAATGCTGCTCTAGATGCGTTAGAATGGGATTTTTCCCCCTTCGTCAAGTTTTATTATGTGGATACGTGTTTTTTTTATATGTATGATAGTTTTCGTGTAAGTCGTCGTCTTCGTTTACGTATGAGCTAGTTCGTTTTAATGCAGTTTTAATATTACCGAAATAGGCAAGTAAGCTTTTTTTAAACACTGTTTTTAACGCGTAGTAGTACATCGAAAGAGGAATCCTGTTC--TTTTTTTAGCTCTTTTATATTGTTATACTGTTGTGTTCGATTTTAATGTTTCCTTCTTGTGCTAGAATCTGTATTCCACTATTTTATAGCTATTTTATACTTGAAACTATAGTTGATACAATTTTAACAAATATAAATATGAATTTCCAGAGAGTGCCTTATAGAGCAGAGTAATTCAAAAATAGTTCAAAAATTACCTTAAATTATTTGATCCNTTTAAAATATCATCACTTGCATTGAATCACTTTCGGACTGACCAACTAAAAGACAATGTCACCATGCAAAAAAGCTTCCTCTATTTGCACTCTATTTGTTAAAACAAAATGATTCCGTTAAAATATCGTTCAAATGTGATGTCGCGTGTGTCTCCTCCAGTAGCTTGTAACCCGTACTCTAGTTCGTACGTTTCTCTCTCTCTCTGAGGCAAGCGTTTTGCCGTGTGGCGTGTGATGCATGATTGTGACGTTTTTTGCATGAGCTGTTTTTGCGTATGCGTGTGATGATAATTA]

[+] EMBL BX621625             [ATGAGTGTGCGCCTATGGGCCAAGCTCCTCTTGCGCAGCGGAATCAGTGGCGCTGCTCGCGCTGGTTTGAGGCATGGTTTGTTTCCTTTTTTTTCTGTCGCTGTCGAATGTGGGCCGGTCGGGTGCTCTGTCTGTGTGGTGGTGTTGTTTGAAGCTTCGGAGCGGAAGGATATTGCAGAGGCAGCCAAAGCCATTGAAGGTTGTTCAATTCAAGGTGCATTTTGCAACGCAAAA TTTTTAAG CCAGCAATCACGATCAAACACGCTTGATCGCGAACAAAAATCCTGTCAATTTTGGTATTTTGGTTCCCAGTTTTAATGGTGTGATGCTCTTTTCTTTACTGCTACGAATATGGTACTGTTTATACATACTTTGGTTTGGTTTTATTGCTTCCTGGTCCTTGTGCACACCAACTAGAATCGAATCTACTTCCAGCAGGCACCGCGGACAAAGGGAAAGAGAAACAAAC AAACACACTCCTCCAACTACATGTGTAAATTCTGTTGTGATATAGTTGCAAAATGCTGCTCTAGATGCGTTAGAATGGGATTTTTCCCCCTTCGTCAAGTTTTATTATGTGGATACGTGTTTTTTTTATATGTATGATAGTTTTCGTGTAAGTCGTCGTCTTCGTTTACGTATGAGCTAGTTCGTTTTAATGCAGTTTTAATATTACCGAAATAGGCAAGTAAGCTTTTTTTAAACACTGTTTTTAACGCGTAGTAGTACATCGAAAGANGAATCCTGTTC  TTTTTTTAGCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BM591228             [                                                                                                                                                                        ccgATTGCAGAGGCAGCCAAAGCCATTGAAGGTTGTTCAATTCAAGGTGCATTTTGCAACGCAAAATTTTTTAAG CCAGCAATCAAGATCAAACACGCTTGATCGCGAACAAAAATCCTGTCAATTTTGGTATTTCGGTTCCCAGTTTTAATGGTGTGATGCTCTTTTCTTCACTGCTACGAATATGGTACTGTTTATACATACTTTGGTTTGGTTTTATTGCTTCCTGGTCCTTGTGCACACCAACTAGAATCGAATCTACTTCCAGCAGGCACCGCAGACAAAGGGAAAGAGAAACAAACAAAACCCGCTCCTCCAACTACATGTGTAAATTTTGTTGTGATATAGTTGCAAAATGCTGCTCTAGACGCGTTAGAATGGGATTTTTCCCCCTTCGTCAAGTTTTATTATGTGGATACGTG  TTTTTTATATGTATGATAGTTTTCGTGTAAGTCGTCGTCTTCGTTTACGTATGAGCTAGTTCGTTTTAATGCAGTTTTAATATTACCGAAATAGGCAAGTAAGC TTTTTTAAACACTTTTTTTAACGCGTAGTAGTACATCGAAAGAGGAATCCTGTTCTTTTTTTTTAGCTCTTTTATATTGTTATACTGTTGTGTTCGATTTTAATGTTTCCTTCTTGTGCTAGAATCTGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BM626080             [                                                                                                                                                                                                                                     ccgAA TTTTTTAGACCAGCAATCACGATCAAACACGCTTGATCGCGAACAAAAATCCTGTCAATTTTGGTATTTTGGTTCCCAGTTTTAATGGTATGATGCTCTTTTCTTTACTGCTACGAATATGGTACTGTTTATACATACTTTGGTTTGGTTTTATTGCTTCCTGGTCCTTGTGCACACCAACTAGAATCGAATCTACTTCCAGCAGGCACCGCGGACAAAGGGAAAGAGAAACAAAC AAACACGCTCCTCCAACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BX626960             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTGGTTTTATTGCTTCCTGGTCCTTGTGCACACCAACTAGAATCGAATCTACTTCCAGCAGGCACCGCGGACAAAGGGAAAGAGAAACAAAC AAACACACTCCTCCAACTACATGTGTAAATTCTGTTGTGATATAGTTGCAAAATGCTGCTCTAGATGCGTTAGAATGGGATTTTTCCCCCTTCGTCAAGTTTTATTATGTGGATACGTGTTTTTTTTATATGTATGATAGTTTTCGTGTAAGTCGTCGTCTTCGTTTACGTATGAGCTAGTTCGTTTTAATGCAGTTTTAATATTACCGAAATAGGCAAGTAAGCTTTTTTTAAACACTGTTTTTAACGCGTAGTAGTACATCGAAAGAGGAATCCTGTTC  TTTTTTTAGCTCTTTTATATGGTTATACTGTTGTGTTCGATTTAAATGNTTCCTTGTTGTGCTAGAATCTGTATTCCACTATTTTATAGCTATTTTATACTTGAAACTATAGTTGATACAATTTTAACAAATATAAATATGAATTTCCAGAGAGTGCCTTATAGAGCAGAGTAATTCAAAAATAGTTCAAAAATTACCTTAAATTATTTGATCCNTTTAAAATATCATCA                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BM643863             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ccGAGCTAGTTCGTTTTAATGCAGTTTTAATATTACCGAAATAGGCAAGTAAGCTTTTTTTAAACACTGTTTTTAACGCGTAGTAGTACATCGAAAGAGGCATCCTGTTCT TTTTTTTAGCTCTTTTATATTATTATACTGTTGTGTTCGATTTTAATGTTTCCTTCTTGTGCTAGAATCTGTATTCCACTATTTTATAGCTATTTTATACTTGAAACTATAGTTGATACAATTTTAACAAATATAAATATGAATTTCCAGAGAGTGCCTTATAGAGCAGAGTAATTCAAAAATAGTT AAAAATTACCTTAAATTA TTGATCC TTTAAAATATTATCACTTGCATTGAATCACTTTCGGACTGACCAACTAAAAGACAATGTCACCATGCAAAAAAGCTTCCTCTATTTGCACTCTATTTGTTAAAACAAAATGATTCCGTTAAAATATCGTTCAAATGTGATGTCGCGTGTGTCTCCTCCAGTAGCTTGTAACCCGTACTCTAGTTCGTACGTTTCTCTCTCTCTCTGAGGCAAGCGTTTTGCCGTGTGGCGTGTGATGCATGATTGTGACGTTTTTTGCATGAGCTGTTTTTGCGTATGCGTGTGATGATAATTA]


>consensus_6193#0 ATGAGTGTGCGCCTATGGGCCAAGCTCCTCTTGCGCAGCGGAATCAGTGGCGCTGCTCGC GCTGGTTTGAGGCATGGTTTGTTTCCTTTTTTTTCTGTCGCTGTCGAATGTGGGCCGGTC GGGTGCTCTGTCTGTGTGGTGGTGTTGTTTGAAGCTTCGGAGCGGAAGGATATTGCAGAG GCAGCCAAAGCCATTGAAGGTTGTTCAATTCAAGGTGCATTTTGCAACGCAAAATTTTTA AGCCAGCAATCACGATCAAACACGCTTGATCGCGAACAAAAATCCTGTCAATTTTGGTAT TTTGGTTCCCAGTTTTAATGGTGTGATGCTCTTTTCTTTACTGCTACGAATATGGTACTG TTTATACATACTTTGGTTTGGTTTTATTGCTTCCTGGTCCTTGTGCACACCAACTAGAAT CGAATCTACTTCCAGCAGGCACCGCGGACAAAGGGAAAGAGAAACAAACAAACACACTCC TCCAACTACATGTGTAAATTCTGTTGTGATATAGTTGCAAAATGCTGCTCTAGATGCGTT AGAATGGGATTTTTCCCCCTTCGTCAAGTTTTATTATGTGGATACGTGTTTTTTTTATAT GTATGATAGTTTTCGTGTAAGTCGTCGTCTTCGTTTACGTATGAGCTAGTTCGTTTTAAT GCAGTTTTAATATTACCGAAATAGGCAAGTAAGCTTTTTTTAAACACTGTTTTTAACGCG TAGTAGTACATCGAAAGAGGAATCCTGTTCTTTTTTTAGCTCTTTTATATTGTTATACTG TTGTGTTCGATTTTAATGTTTCCTTCTTGTGCTAGAATCTGTATTCCACTATTTTATAGC TATTTTATACTTGAAACTATAGTTGATACAATTTTAACAAATATAAATATGAATTTCCAG AGAGTGCCTTATAGAGCAGAGTAATTCAAAAATAGTTCAAAAATTACCTTAAATTATTTG ATCCNTTTAAAATATCATCACTTGCATTGAATCACTTTCGGACTGACCAACTAAAAGACA ATGTCACCATGCAAAAAAGCTTCCTCTATTTGCACTCTATTTGTTAAAACAAAATGATTC CGTTAAAATATCGTTCAAATGTGATGTCGCGTGTGTCTCCTCCAGTAGCTTGTAACCCGT ACTCTAGTTCGTACGTTTCTCTCTCTCTCTGAGGCAAGCGTTTTGCCGTGTGGCGTGTGA TGCATGATTGTGACGTTTTTTGCATGAGCTGTTTTTGCGTATGCGTGTGATGATAATTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)