These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6193#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1259 fasta sequence [ATGAGTGTGCGCCTATGGGCCAAGCTCCTCTTGCGCAGCGGAATCAGTGGCGCTGCTCGCGCTGGTTTGAGGCATGGTTTGTTTCCTTTTTTTTCTGTCGCTGTCGAATGTGGGCCGGTCGGGTGCTCTGTCTGTGTGGTGGTGTTGTTTGAAGCTTCGGAGCGGAAGGATATTGCAGAGGCAGCCAAAGCCATTGAAGGTTGTTCAATTCAAGGTGCATTTTGCAACGCAAAA-TTTTTAAG-CCAGCAATCACGATCAAACACGCTTGATCGCGAACAAAAATCCTGTCAATTTTGGTATTTTGGTTCCCAGTTTTAATGGTGTGATGCTCTTTTCTTTACTGCTACGAATATGGTACTGTTTATACATACTTTGGTTTGGTTTTATTGCTTCCTGGTCCTTGTGCACACCAACTAGAATCGAATCTACTTCCAGCAGGCACCGCGGACAAAGGGAAAGAGAAACAAAC-AAACACACTCCTCCAACTACATGTGTAAATTCTGTTGTGATATAGTTGCAAAATGCTGCTCTAGATGCGTTAGAATGGGATTTTTCCCCCTTCGTCAAGTTTTATTATGTGGATACGTGTTTTTTTTATATGTATGATAGTTTTCGTGTAAGTCGTCGTCTTCGTTTACGTATGAGCTAGTTCGTTTTAATGCAGTTTTAATATTACCGAAATAGGCAAGTAAGCTTTTTTTAAACACTGTTTTTAACGCGTAGTAGTACATCGAAAGAGGAATCCTGTTC--TTTTTTTAGCTCTTTTATATTGTTATACTGTTGTGTTCGATTTTAATGTTTCCTTCTTGTGCTAGAATCTGTATTCCACTATTTTATAGCTATTTTATACTTGAAACTATAGTTGATACAATTTTAACAAATATAAATATGAATTTCCAGAGAGTGCCTTATAGAGCAGAGTAATTCAAAAATAGTTCAAAAATTACCTTAAATTATTTGATCCNTTTAAAATATCATCACTTGCATTGAATCACTTTCGGACTGACCAACTAAAAGACAATGTCACCATGCAAAAAAGCTTCCTCTATTTGCACTCTATTTGTTAAAACAAAATGATTCCGTTAAAATATCGTTCAAATGTGATGTCGCGTGTGTCTCCTCCAGTAGCTTGTAACCCGTACTCTAGTTCGTACGTTTCTCTCTCTCTCTGAGGCAAGCGTTTTGCCGTGTGGCGTGTGATGCATGATTGTGACGTTTTTTGCATGAGCTGTTTTTGCGTATGCGTGTGATGATAATTA] [+] EMBL BX621625 [ATGAGTGTGCGCCTATGGGCCAAGCTCCTCTTGCGCAGCGGAATCAGTGGCGCTGCTCGCGCTGGTTTGAGGCATGGTTTGTTTCCTTTTTTTTCTGTCGCTGTCGAATGTGGGCCGGTCGGGTGCTCTGTCTGTGTGGTGGTGTTGTTTGAAGCTTCGGAGCGGAAGGATATTGCAGAGGCAGCCAAAGCCATTGAAGGTTGTTCAATTCAAGGTGCATTTTGCAACGCAAAA TTTTTAAG CCAGCAATCACGATCAAACACGCTTGATCGCGAACAAAAATCCTGTCAATTTTGGTATTTTGGTTCCCAGTTTTAATGGTGTGATGCTCTTTTCTTTACTGCTACGAATATGGTACTGTTTATACATACTTTGGTTTGGTTTTATTGCTTCCTGGTCCTTGTGCACACCAACTAGAATCGAATCTACTTCCAGCAGGCACCGCGGACAAAGGGAAAGAGAAACAAAC AAACACACTCCTCCAACTACATGTGTAAATTCTGTTGTGATATAGTTGCAAAATGCTGCTCTAGATGCGTTAGAATGGGATTTTTCCCCCTTCGTCAAGTTTTATTATGTGGATACGTGTTTTTTTTATATGTATGATAGTTTTCGTGTAAGTCGTCGTCTTCGTTTACGTATGAGCTAGTTCGTTTTAATGCAGTTTTAATATTACCGAAATAGGCAAGTAAGCTTTTTTTAAACACTGTTTTTAACGCGTAGTAGTACATCGAAAGANGAATCCTGTTC TTTTTTTAGCTC ] [+] EMBL BM591228 [ ccgATTGCAGAGGCAGCCAAAGCCATTGAAGGTTGTTCAATTCAAGGTGCATTTTGCAACGCAAAATTTTTTAAG CCAGCAATCAAGATCAAACACGCTTGATCGCGAACAAAAATCCTGTCAATTTTGGTATTTCGGTTCCCAGTTTTAATGGTGTGATGCTCTTTTCTTCACTGCTACGAATATGGTACTGTTTATACATACTTTGGTTTGGTTTTATTGCTTCCTGGTCCTTGTGCACACCAACTAGAATCGAATCTACTTCCAGCAGGCACCGCAGACAAAGGGAAAGAGAAACAAACAAAACCCGCTCCTCCAACTACATGTGTAAATTTTGTTGTGATATAGTTGCAAAATGCTGCTCTAGACGCGTTAGAATGGGATTTTTCCCCCTTCGTCAAGTTTTATTATGTGGATACGTG TTTTTTATATGTATGATAGTTTTCGTGTAAGTCGTCGTCTTCGTTTACGTATGAGCTAGTTCGTTTTAATGCAGTTTTAATATTACCGAAATAGGCAAGTAAGC TTTTTTAAACACTTTTTTTAACGCGTAGTAGTACATCGAAAGAGGAATCCTGTTCTTTTTTTTTAGCTCTTTTATATTGTTATACTGTTGTGTTCGATTTTAATGTTTCCTTCTTGTGCTAGAATCTGTA ] [+] EMBL BM626080 [ ccgAA TTTTTTAGACCAGCAATCACGATCAAACACGCTTGATCGCGAACAAAAATCCTGTCAATTTTGGTATTTTGGTTCCCAGTTTTAATGGTATGATGCTCTTTTCTTTACTGCTACGAATATGGTACTGTTTATACATACTTTGGTTTGGTTTTATTGCTTCCTGGTCCTTGTGCACACCAACTAGAATCGAATCTACTTCCAGCAGGCACCGCGGACAAAGGGAAAGAGAAACAAAC AAACACGCTCCTCCAACT ] [+] EMBL BX626960 [ TTGGTTTTATTGCTTCCTGGTCCTTGTGCACACCAACTAGAATCGAATCTACTTCCAGCAGGCACCGCGGACAAAGGGAAAGAGAAACAAAC AAACACACTCCTCCAACTACATGTGTAAATTCTGTTGTGATATAGTTGCAAAATGCTGCTCTAGATGCGTTAGAATGGGATTTTTCCCCCTTCGTCAAGTTTTATTATGTGGATACGTGTTTTTTTTATATGTATGATAGTTTTCGTGTAAGTCGTCGTCTTCGTTTACGTATGAGCTAGTTCGTTTTAATGCAGTTTTAATATTACCGAAATAGGCAAGTAAGCTTTTTTTAAACACTGTTTTTAACGCGTAGTAGTACATCGAAAGAGGAATCCTGTTC TTTTTTTAGCTCTTTTATATGGTTATACTGTTGTGTTCGATTTAAATGNTTCCTTGTTGTGCTAGAATCTGTATTCCACTATTTTATAGCTATTTTATACTTGAAACTATAGTTGATACAATTTTAACAAATATAAATATGAATTTCCAGAGAGTGCCTTATAGAGCAGAGTAATTCAAAAATAGTTCAAAAATTACCTTAAATTATTTGATCCNTTTAAAATATCATCA ] [+] EMBL BM643863 [ ccGAGCTAGTTCGTTTTAATGCAGTTTTAATATTACCGAAATAGGCAAGTAAGCTTTTTTTAAACACTGTTTTTAACGCGTAGTAGTACATCGAAAGAGGCATCCTGTTCT TTTTTTTAGCTCTTTTATATTATTATACTGTTGTGTTCGATTTTAATGTTTCCTTCTTGTGCTAGAATCTGTATTCCACTATTTTATAGCTATTTTATACTTGAAACTATAGTTGATACAATTTTAACAAATATAAATATGAATTTCCAGAGAGTGCCTTATAGAGCAGAGTAATTCAAAAATAGTT AAAAATTACCTTAAATTA TTGATCC TTTAAAATATTATCACTTGCATTGAATCACTTTCGGACTGACCAACTAAAAGACAATGTCACCATGCAAAAAAGCTTCCTCTATTTGCACTCTATTTGTTAAAACAAAATGATTCCGTTAAAATATCGTTCAAATGTGATGTCGCGTGTGTCTCCTCCAGTAGCTTGTAACCCGTACTCTAGTTCGTACGTTTCTCTCTCTCTCTGAGGCAAGCGTTTTGCCGTGTGGCGTGTGATGCATGATTGTGACGTTTTTTGCATGAGCTGTTTTTGCGTATGCGTGTGATGATAATTA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||