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Anopheles gambiae
cluster # 6485 cluster # 6485       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6485#0 length = 1488 sequences # 5  

consensusID : consensus_6485#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1488
fasta sequence
                              [AGCAACAAATAAGTATTCACAATTACTACCATTTGGTATTGTAAACGTTCCCTTTTCTCTCTTTCTCTCTGTCACCGCGCGCCGTCCGCGTTGGCCACCACGTCTCGTGTTTTCTCCACACAAACACACTAACACACACACACAAGTTGTTGCGCTTCAAGCTTAGAAAACGGATCTTCTTAAAAATTAAACGCCTTTTTTCTCCGATTTGTCTTGCGCTTGCCCTCCTCCTGCACCGTTTGCCTTCGAAAAGAATGAGAAAAAGGAATCGCACTCACGGCGGCCGTCTACTACAAGGTATATATGTTGTAGCTGCGGGTTCATCCGTTGCGCCATCCCCACGACCATCGCGAGTTGAACCCCCCCTTCAAATCTTCCTCCTATCCGCCAGTTGGCAGCTGGCAGTGCGCGAGTTGCATTAACGGTTCAAAAAGCAAATCGGTGTTAACATCGCGCGGTGTTTGCTTCTGCTGGTGCCGGTGGTGGTCGTGGTGGTGGTCGTGATGGTGTTCCGACAATCCATTCTTTATCACACTACTCCTCCAGATCGGCGACGAACAGTACCTCGCGGTTCTTCAGTCCCGACAGCAGCAGCGTCTGTCCCGGCTCGTCGCCCGAACACTCGATCACGCGCTTCGGAAAGTTGGTGGTGATTTCGAACGAGTCGGGCGCATCCGGGTGGCAGAAAATAAAGTGGTAAATATCCCTCATTGTGTCGGTGCTTCTAAACCTTCTCTCTAATCGCAGCCCGCTCGGCAGCTTGAACACTATGCTGATCGTGTCGGGCGCACCGGCTGCCGGTTCCGAAGGCACTAGCTGGGCCAGATCGAGCTTTAACCGTTCGATGTCCTCCTTGCGCTGCTGCTCGGCCGCCTGTTCCGCCTCGATCGCGGCCTGGATGCGCATCGCCTCCTCCCGCTCCTGCTGCTTCCGGCGCTGCTTCTCCTGGTCGGCCTGCAGCGAGCGCTGGTACGCTTCGTCCTGCTG-TGGCGCAACGTTTGCGTCAGATCGCGCTCGAGCCGATCCTGGCGGGCCTGATTGAGCCACACCTCGTTATCGTTCACCACCGTGTCCATCCGGCGGATCAGCTCCTCCGCCGAACAGTCACCCTCCAGCCGGCCCATAATGATCATCTTGTTCGCCCGCATGCCGATGATGAGCAGGGTCGGGTGCGTACGGACACTGACCGTGGTCGCCACCCGCTTGCCCTCGTGCGAGGCCATATCGCAGCCCCAGAACAGCATCCGCCGATTGACGTACTCGATCACCAGCGGGTCGGACAGGGCGCCGCGACAGAACGCGACCGCCTCGGACGTCGCCTCGGAATGCAGATAGACTAGCAGGAAGCGCAGCTCGTTCTTCGCGGCGTTCAGTGCCTGCGAGTACGTGCCCCTGGTAAAACACCGGATGCTCCGGGTACTTTTCATTGTACGTTTGAATGAACTTCAGCACGTCGCCGAGCGATCGCCGAATAACCTCGGGGATTCT]

[+] EMBL CNS08HSF             [AGCAACAAATAAGTATTCACAATTACTACCATTTGGTATTGTAAACGTTCCCTTTTCTCTCTTTCTCTCTGTCACCGCGCGCCGTCCGCGTTGGCCACCACGTCTCGTGTTTTCTCCACACAAACACACTAACACACACACACAAGTTGTTGCGCTTCAAGCTTAGAAAACGGATCTTCTTAAAAATTAAACGCCTTTTTTCTCCGATTTGTCTTGCGCTTGCCCTCCTCCTGCACCGTTTGCCTTCGAAAAGAATGAGAAAAAGGAATCGCACTCACGGCGGCCGTCTACTACAAGGTATATATGTTGTAGCTGCGGGTTCATCCGTTGCGCCATCCCCACGACCATCGCGAGTTGAACCCCCCCTTCAAATCTTCCTCCTATCCGCCAGTTGGCAGCTGGCAGTGCGCGAGTTGCATTAACGGTTCAAAAAGCAAATCGGTGTTAACATCGCGCGGTGTTTGCTTCTGCTGGTGCCGGTGGTGGTCGTGGTGGTGGTCGTGATGGTGTTCCGACAATCCATTCTTTATCACACTACTCCTCCAGATCGGCGACGAACAGTACCTCGCGGTTCTTCAGTCCCGACAGCAGCAGCGTCTGTTCCGGCTCGTCGCCCGAACACTCGATCACGCGCTTCGGAAAGTTGGTGGTGATTTCGAACGAGTTGGGCGCATCCGGGTGGCAGAAAATAAAGTGGTAAATATCCCTCATTGTGTCGGTGCTTCTAAACCTTCTCTCTAATCGCAGCCCGCTCGGCAGCTTGAACACTATGCTGATCGTGTCGGGCGCACCGGCTGCCGGTTCCGAA GCACTAGCTGGGCCAGAACGAGCTTTAACCGTTCGATGTTCTCCTTGCGCTGCTGCTCGGCCGCCTGTTCCGCCTCGATCGCGGCCTGGATGCGCATCGCCTCCTCCCGCTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CNS08HSE             [                                                                                                                                                                                               CGCCTTTTTTCTCCGATTTGTCTTGCGCTTGCCCTCCTCCTGCACCGTTTGCCTTCGAAAAGAATGAGAAAAAGGAATCGAACTCACGGCGGCCGTCTACTACAAGGTATATATGTTGTAGCTGCGGGTTCATCCGTTGCGCCATCCCCACGACCATCGCGAGTTGAACCCCCCCTTCAAATCTTCCTCCTATCCGCCAGTTGGCAGCTGGCAGTGCGCGAGTAGCATTAACGGTTCAAAAAGCAAATCGGTGTTAACATCGCGCGGTGTTTGCTTCTGCTGGTGCCGGTGGTGGTCGTGGTGGTGGTCGTGATGGTGTTCCGACAATCCATTCTTTATCACACTACTCCTCCAGATCGGCGACGAACAGTACCTCGCGGTTCTTCAGTCCCGACAGCAGCAGCGTCTGTCCCGGCTCGTCGCCCGAACACTCGATCACGCGCTTCGGAAAGTTGGTGGTGATTTCGAACGAGTCGGGCGCATCCGGGTGGCAGAAAATAAAGTGGTAAATATCCCTCATTGTGTCGGTGCTTCTAAACCTTCTCTCTAATCGCAGCCCGCTCGGCAGCTTGAACACTATGCTGATCGTGTCGGGCGCACCGGCTGCCGGTTCCGAAGGCACTAGCTGGGCCAGATCGAGCTTTAACCGTTCGATGTCCTCCTTGCGCTGCTGCTCGGCCGCCTGTTCCGCCTCGATCGCGGCCTGGATGCGCATCGCCTCCTCCCGCTCCTGCTGCTTCCGGCGCTGCTTCTCCTGGTCGGCCTGCAGCGAGCGCTGGTACGCTTCGTCCTGCTG TGGCGCAACGTTTGCGTCAGATCGCGCTCGAGCCGATCCTGGCGGGCCTGATTGAGCCACACCTCGTTATCGTTCACCACCGTGTCCATCCGGCGGATCAGCTCCTCCGCCGAACAGTCACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL BX602740             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gGTGGTGCTGGTGGTGATGGTGTTCCGACAATCCATTCTTTATCACACTACGCCTCCAGATCGGCGACGAACAGTACCTCGCGGTTCTTCAGCCCCGACAGCAGCAGCGTCTGTCCCGGCTCGTCGCCCGAACACTCGATCACGCGCTTCGGGAAGTTGGTGGTGATTTCGAACGAGTCGGGCGCATCCGGGTGGCAGAAAATAAAGTGGTAAATATCCCTCATTGTGTCGGTGCTTCTAAACCTTCTCTCTAATCGCAGCCCGCTCGGCAGCTTGAACACTATGCTGATCGTGTCGGGCGCACCGGCTGCCGGTTCCGAAGGCACTAGCTGGGCCAGATCGAGCTTTAACCGTTCGATGTCCTCCTTGCGCTGCTGCTCGGCCGCCTGTTCCGCCTCGATCGCGGCCTGGATGCGCATCGCCTCCTCCCGCTCCTGCTGCTTCCGGCGCTGCTTCTCCTGGTCGGCCTGCAGCGAGCGCTGGTACGCTTCGTCCTGCTGCTGGCGCAACGTTTGCGTCAGATCGCGCTCGAGCCGATCCTGGCGGGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL BM592012             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCGCAGCCCGCTCGGCAGCTTGAACACTATGCTGATCGTGTCGGGCGCACCGGCTTCCGGTTCCGAAGGCACTAGCTGGGCCAGATCGAGCTTTAACCGTTCAATGTCCTCCTTGCGCTGCTGCTCGGCCGCCTGTTCCGCCTCGATCGCGGCCTGGATGCGCATCGCCTCCTCCCGCTCCTGCTGCTTCCGGCGCTGCTTCTCCTGGTCGGCCTGCAGCGAGCGCTGGTACGCTTCGTCCTGCTGCTGGCGCAACGTTTGCGTCAGATCGCGCTCGAGCCGATCCTGGCGGGCCTGATTGAGCCACACCTCGTTATCGTTCACCACCGTGTCCATTCGGCGGATCAGCTCCTCCGCCGAACAGTCACCCTCCAGCCGGCCCATAATGATCATCTTGTTCGCCCGCATGCCGATGATGAGCAGGGTCGGGTGCGTACGGACACTGACCGTGGTCGCCACCCGCTTGCCCTCGTGCGAGGCCATATCGCAGCCCCAGAACAGCATCCGCCGATTGACGTACTCGATCACCAGCGGGTCGGACAGGGCGCCGCGACAGAACGCGACCGCCTCGGACGTCGCCTCGGAATGCAGATAGACTAGCAGGAAGCGCAGCTCGTTCTTCGCGG                                                                                                                          ]
[-] EMBL AL929689             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CCTCCAGCCGGCCCATAATGATCATCTTGTTCGCCCGCATGCCGATGATGAGCAGGGTCGGGTGCGTACGGACACTGACCGTGGTCGCCACCCGTTTGCCCTCGTGCGAGGCCATATCGCAGCCCCAGAACAGCATCCGCCGATTGACGTACTCGATCACCAGCGGGTCGGACAGGGCGCCGCGACAGAACGCGACCGCCTCGGACGTCGCCTCGGAATGCAGATAGACTAGCAGGAAGCGCAGCTCGTTCTTCGCATCGTTCAGTGCCTGCGAGTACGTGCCCCTGGTAAAACACCGGATGCTCCGGGTACTTTTCATTGTACGTTTGAATGAACTTCAGCACGTCGCCGAGCGATCGCCGAATAACCTCGGGGATTCT]


>consensus_6485#0 AGCAACAAATAAGTATTCACAATTACTACCATTTGGTATTGTAAACGTTCCCTTTTCTCT CTTTCTCTCTGTCACCGCGCGCCGTCCGCGTTGGCCACCACGTCTCGTGTTTTCTCCACA CAAACACACTAACACACACACACAAGTTGTTGCGCTTCAAGCTTAGAAAACGGATCTTCT TAAAAATTAAACGCCTTTTTTCTCCGATTTGTCTTGCGCTTGCCCTCCTCCTGCACCGTT TGCCTTCGAAAAGAATGAGAAAAAGGAATCGCACTCACGGCGGCCGTCTACTACAAGGTA TATATGTTGTAGCTGCGGGTTCATCCGTTGCGCCATCCCCACGACCATCGCGAGTTGAAC CCCCCCTTCAAATCTTCCTCCTATCCGCCAGTTGGCAGCTGGCAGTGCGCGAGTTGCATT AACGGTTCAAAAAGCAAATCGGTGTTAACATCGCGCGGTGTTTGCTTCTGCTGGTGCCGG TGGTGGTCGTGGTGGTGGTCGTGATGGTGTTCCGACAATCCATTCTTTATCACACTACTC CTCCAGATCGGCGACGAACAGTACCTCGCGGTTCTTCAGTCCCGACAGCAGCAGCGTCTG TCCCGGCTCGTCGCCCGAACACTCGATCACGCGCTTCGGAAAGTTGGTGGTGATTTCGAA CGAGTCGGGCGCATCCGGGTGGCAGAAAATAAAGTGGTAAATATCCCTCATTGTGTCGGT GCTTCTAAACCTTCTCTCTAATCGCAGCCCGCTCGGCAGCTTGAACACTATGCTGATCGT GTCGGGCGCACCGGCTGCCGGTTCCGAAGGCACTAGCTGGGCCAGATCGAGCTTTAACCG TTCGATGTCCTCCTTGCGCTGCTGCTCGGCCGCCTGTTCCGCCTCGATCGCGGCCTGGAT GCGCATCGCCTCCTCCCGCTCCTGCTGCTTCCGGCGCTGCTTCTCCTGGTCGGCCTGCAG CGAGCGCTGGTACGCTTCGTCCTGCTGTGGCGCAACGTTTGCGTCAGATCGCGCTCGAGC CGATCCTGGCGGGCCTGATTGAGCCACACCTCGTTATCGTTCACCACCGTGTCCATCCGG CGGATCAGCTCCTCCGCCGAACAGTCACCCTCCAGCCGGCCCATAATGATCATCTTGTTC GCCCGCATGCCGATGATGAGCAGGGTCGGGTGCGTACGGACACTGACCGTGGTCGCCACC CGCTTGCCCTCGTGCGAGGCCATATCGCAGCCCCAGAACAGCATCCGCCGATTGACGTAC TCGATCACCAGCGGGTCGGACAGGGCGCCGCGACAGAACGCGACCGCCTCGGACGTCGCC TCGGAATGCAGATAGACTAGCAGGAAGCGCAGCTCGTTCTTCGCGGCGTTCAGTGCCTGC GAGTACGTGCCCCTGGTAAAACACCGGATGCTCCGGGTACTTTTCATTGTACGTTTGAAT GAACTTCAGCACGTCGCCGAGCGATCGCCGAATAACCTCGGGGATTCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)