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Anopheles gambiae
cluster # 6574 cluster # 6574       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6574#0 length = 889 sequences # 5  

consensusID : consensus_6574#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 889
fasta sequence
                              [CCGCAACGATGGTAGTACGGCTGAAGCGGCGGCGGCGGCAGCTAGCGACGAACCCGGCAGCACCAGTGGCCGGATCCGTGTCGCGATGGAAGCTGTACAGTAGGAGGAGTGAACAATCATGCAGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGGGGCGTGTTACGATATTTTTAATATGCTACCTTAGTAGAACCACACTAACCCATTTTCCTCCCATTTTCCCAAGCCCCCGCTGATCTGGAACATTGGCACGCATCGTATCCTCGCGCTCTAACCGTTAAATTAGATTGCAAATCCCGCCAATACGGCCAACATTCGAATAAGCTTTCGTTTTAACTTGCTGCAAAGCGTTAGAAAAGGTTAGAAAGCCCCTTCATTATCACTTGTGATTAATTTGTTTTTTCAAACTGACCAAATTTACCCGGTGCAATAGTAACAGCAAACACGTACCTTCACCCTTACAATGCAAATGCAAAATTTCATTAAAAGACACCCGTTTCACTCGCTGCTTTGTGCTGCGCTGCGGCCTTGGTGGGACACTTTTGTTGGTTG--AAAAAACACGCATCTATTCCCCACGTATTTATCCGATTTTGTGATAGTAAA-CCCCCCAAGCTCCTCCACCCTACGATGATAACCACCACACAGTGTGCTGCTAGCAATCGTTTAACTAGTTTGTTTTTTTCTTTCAATTTTTAATTGATTATTTTATAGTACATTGTAGTTATAGTTTACTCCTTTACTGCTGTATAGTTGCGCCACAGTTCCCTTGTTTTTTGTTTTTTTTTCATTGCGTGTGTTTGGTGGGGTCTCAAAAAAGGGGGAAATGTTATTAGGGCTCAGTCTTTCCTTCTCCGTCACACACTCTTTTGCTTCACTGTGGCTGGTAATAAA]

[+] EMBL BM633319             [CCGCAACGATGGTAGTACGGCTGAAGCGGCGGCGGCGGCAGCTAGCGACGAACCCGGCAGCACCAGTGGCCGGATCCGTGTCGCGATGGAAGCTGTACAGTAGGAGGAGTGAACAATCATGCAGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGGGGCGTGTTACGATATTTTTAATATGCTACCTTAGTAGAACCACACTAACCCATTTTCCTACCATTTTCCCAAGCCCCCGCTAATCTGGAACATTGGCACGCATCGTATCCCCGCGCTCTATTCGTTAATTTAAATTGCAATTCCCGCTAATACGGCCAACATTTGAATAAGCTTTCGTTTTAACTTGCTGCAAAGCGTCAGAAAAAGTCAAAAAGGCCCCTCATTATCATTTGTGATTAATTTGTCTTTTCAAACTGACCAAATTTACCCGGTGCAATAGTAACAGCAAACACGTACCTTCACCCTTACAATGCAAATGCAAAATTTCATTAAAAGACACCCGTTTCACTCGCTGCTTTGTGCTGCGCTGCGGCCTTGGTGGGACACTTTTGTTGGTAGAAAAAAAACACGCATCTATTCCCCCCGTATTTATCCGATTTTGTGATAGTAAACCCCCCCAAGCTCCTCCACCCTACGATGATAACTACCACACAGTGTGCTGCTAGCAATCGTTTAACTAGTTTGGTT     TTTCAATTTCTA                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BX618097             [                                                                                                                                    TGTATGTGTGTGTGTATGGGGCGTGTTACGATATTTTTAATATGCTACCTTAGTAGAACCACACTAACCCATTTTCCTCCCATTTTCCCAAGCCCCCGCTGATCTGGAACATTGGCACGCATCGTATCCTCGCGCTCTAACCGTTAAATTAGATTGCAAATCCCGCCAATACGGCCAACATTCGAATAAGCTTTCGTTTTAACTTGCTGCAAAGCGTTAGAAAAGGTTAGAAAGCCCCTTCATTATCACTTGTGATTAATTTGTTTTTTCAAACTGACCAAATTTACCCGGTGCAATAGTAACAGCAAACACGTACCTTCACCCTTACAATGCAAATGCAAAATTTCATTAAAAGACACCCGTTTCACTCGCTGCTTTGTGCTGCGCTGCGGCCTTGGTGGGACACTTTTGTTGGTTG  AAAAAACACGCATCTATTCCCCACGTATTTATCCGATTTTGTGATAGTAAA CCCCCCAAGCTCCTCCACCCTACGATGATAACCACCACACAGTGTGCTGCTAGCAATCGTTTAACTAGTTTGTTTTTTT                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BX608493             [                                                                                                                                      TATGTGTGTGTGTATGGGGCGTGTTACGATATTTTTAATATGCTACCTTAGTAGAACCACACTAACCCATTTTCCTCCCATTTTCCCAAGCCCCCGCTGATCTGGAACATTGGCACGCATCGTATCCTCGCGCTCTAACCGTTAAATTAGATTGCAAATCCCGCCAATACGGCCAACATTCGAATAAGCTTTCGTTTTAACTTGCTGCAAAGCGTTAGAAAAGGTTAGAAAGCCCCTTCATTATCACTTGTGATTAATTTGTTTTTTCAAACTGACCAAATTTACCCGGTGCAATAGTAACAGCAAACACGTACCTTCACCCTTACAATGCAAATGCAAAATTTCATTAAAAGACACCCGTTTCACTCGCTGCTTTGTGCTGCGCTGCGGCCTTGGTGGGACACTTTTGTTGGTTG  AAAAAACACGCATCTATTCCCCACGTATTTATCCGATTTTGTGATAGTAAA CCCCCCAAGCTCCTCCACCCTACGATGATAACCACCACACAGTGTGCTGCTAGCAATCGTTTAACTAGTTTGTTTTTTTCTTTCAATTTTTAATTGATTATTTTATAGTACATTGTAGTTATAGTTTACTCCTTTACTGCTGTATAGTTGCGCCACAGTTCCCTTGTTTT                                                                                                                      ]
[+] EMBL BX611866             [                                                                                                                                                                                                                                       TGATCTGGAACATTGGCACGCATCGTATCCTCGCGCTCTAACCGTTAAATTAGATTGCAAATCCCGCCAATACGGCCAACATTCGAATAAGCTTTCGTTTTAACTTGCTGCAAAGCGTTAGAAAAGGTTAGAAAGCCCCTTCATTATCACTTGTGATTAATTTGTTTTTTCAAACTGACCAAATTTACCCGGTGCAATAGTAACAGCAAACACGTACCTTCACCCTTACAATGCAAATGCAAAATTTCATTAAAAGACACCCGTTTCACTCGCTGCTTTGTGCTGCGCTGCGGCCTTGTTGGGACACTTTTGTTGGTTG  AAAAAACACGCATCTATTCCCCACGTATTTATCCGATTTTGTGATAGTAAA CCCCCCAAGCTCCTCCACCCTACGATGATAACCACCACACAGTGTGCTGCTAGCAATCGTTTAACTAGTTTGTTTTTTTCTTTCAATTTTTAATTGATTATTTTATAGTACATTGTAGTTATAGTTTACTCCTTTACTGCTGTATAGTTGCGCCACAGTTCCCTTGTTTTTTGTTTTTTTTTCATTGCGTGTGTTTGGTGGGGTCTCAAAAAAGGGGGAAATGTTATTAGGGCTCAGTCTTTCCTTCTCCGTCACACACTCTTTTGCTTCACT               ]
[+] EMBL BX611452             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACGGCCAACATTCGAATAAGCTTTCGTTTTAACTTGCTGCAAAGCGTTAGAAAAGGTTAGAAAGCCCCTTCATTATCACTTGTGATTAATTTGTTTTTTCAAACTGACCAAATTTACCCGGTGCAATAGTAACAGCAAACACGTACCTTCACCCTTACAATGCAAATGCAAAATTTCATTAAAAGACACCCGTTTCACTCGCTGCTTTGTGCTGCGCTGCGGCCTTGGTGGGACACTTTTGTTGGTTG  AAAAAACACGCATCTATTCCCCACGTATTTATCCGATTTTGTGATAGTAAA CCCCCCAAGCTCCTCCACCCTACGATGATAACCACCACACAGTGTGCTGCTAGCAATCGTTTAACTAGTTTGTTTTTTTCTTTCAATTTTTAATTGATTATTTTATAGTACATTGTAGTTATAGTTTACTCCTTTACTGCTGTATAGTTGCGCCACAGTTCCCTTGTTTTTTGTTTTTTTTTCATTGCGTGTGTTTGGTGGGGTCTCAAAAAAGGGGGAAATGTTATTAGGGCTCAGTCTTTCCTTCTCCGTCACACACTCTTTTGCTTCACTGTGGCTGGTAATAAA]


>consensus_6574#0 CCGCAACGATGGTAGTACGGCTGAAGCGGCGGCGGCGGCAGCTAGCGACGAACCCGGCAG CACCAGTGGCCGGATCCGTGTCGCGATGGAAGCTGTACAGTAGGAGGAGTGAACAATCAT GCAGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGGGGCGTGTTACGATATTTTTAATATGCTAC CTTAGTAGAACCACACTAACCCATTTTCCTCCCATTTTCCCAAGCCCCCGCTGATCTGGA ACATTGGCACGCATCGTATCCTCGCGCTCTAACCGTTAAATTAGATTGCAAATCCCGCCA ATACGGCCAACATTCGAATAAGCTTTCGTTTTAACTTGCTGCAAAGCGTTAGAAAAGGTT AGAAAGCCCCTTCATTATCACTTGTGATTAATTTGTTTTTTCAAACTGACCAAATTTACC CGGTGCAATAGTAACAGCAAACACGTACCTTCACCCTTACAATGCAAATGCAAAATTTCA TTAAAAGACACCCGTTTCACTCGCTGCTTTGTGCTGCGCTGCGGCCTTGGTGGGACACTT TTGTTGGTTGAAAAAACACGCATCTATTCCCCACGTATTTATCCGATTTTGTGATAGTAA ACCCCCCAAGCTCCTCCACCCTACGATGATAACCACCACACAGTGTGCTGCTAGCAATCG TTTAACTAGTTTGTTTTTTTCTTTCAATTTTTAATTGATTATTTTATAGTACATTGTAGT TATAGTTTACTCCTTTACTGCTGTATAGTTGCGCCACAGTTCCCTTGTTTTTTGTTTTTT TTTCATTGCGTGTGTTTGGTGGGGTCTCAAAAAAGGGGGAAATGTTATTAGGGCTCAGTC TTTCCTTCTCCGTCACACACTCTTTTGCTTCACTGTGGCTGGTAATAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)