These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6574#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 889 fasta sequence [CCGCAACGATGGTAGTACGGCTGAAGCGGCGGCGGCGGCAGCTAGCGACGAACCCGGCAGCACCAGTGGCCGGATCCGTGTCGCGATGGAAGCTGTACAGTAGGAGGAGTGAACAATCATGCAGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGGGGCGTGTTACGATATTTTTAATATGCTACCTTAGTAGAACCACACTAACCCATTTTCCTCCCATTTTCCCAAGCCCCCGCTGATCTGGAACATTGGCACGCATCGTATCCTCGCGCTCTAACCGTTAAATTAGATTGCAAATCCCGCCAATACGGCCAACATTCGAATAAGCTTTCGTTTTAACTTGCTGCAAAGCGTTAGAAAAGGTTAGAAAGCCCCTTCATTATCACTTGTGATTAATTTGTTTTTTCAAACTGACCAAATTTACCCGGTGCAATAGTAACAGCAAACACGTACCTTCACCCTTACAATGCAAATGCAAAATTTCATTAAAAGACACCCGTTTCACTCGCTGCTTTGTGCTGCGCTGCGGCCTTGGTGGGACACTTTTGTTGGTTG--AAAAAACACGCATCTATTCCCCACGTATTTATCCGATTTTGTGATAGTAAA-CCCCCCAAGCTCCTCCACCCTACGATGATAACCACCACACAGTGTGCTGCTAGCAATCGTTTAACTAGTTTGTTTTTTTCTTTCAATTTTTAATTGATTATTTTATAGTACATTGTAGTTATAGTTTACTCCTTTACTGCTGTATAGTTGCGCCACAGTTCCCTTGTTTTTTGTTTTTTTTTCATTGCGTGTGTTTGGTGGGGTCTCAAAAAAGGGGGAAATGTTATTAGGGCTCAGTCTTTCCTTCTCCGTCACACACTCTTTTGCTTCACTGTGGCTGGTAATAAA] [+] EMBL BM633319 [CCGCAACGATGGTAGTACGGCTGAAGCGGCGGCGGCGGCAGCTAGCGACGAACCCGGCAGCACCAGTGGCCGGATCCGTGTCGCGATGGAAGCTGTACAGTAGGAGGAGTGAACAATCATGCAGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGGGGCGTGTTACGATATTTTTAATATGCTACCTTAGTAGAACCACACTAACCCATTTTCCTACCATTTTCCCAAGCCCCCGCTAATCTGGAACATTGGCACGCATCGTATCCCCGCGCTCTATTCGTTAATTTAAATTGCAATTCCCGCTAATACGGCCAACATTTGAATAAGCTTTCGTTTTAACTTGCTGCAAAGCGTCAGAAAAAGTCAAAAAGGCCCCTCATTATCATTTGTGATTAATTTGTCTTTTCAAACTGACCAAATTTACCCGGTGCAATAGTAACAGCAAACACGTACCTTCACCCTTACAATGCAAATGCAAAATTTCATTAAAAGACACCCGTTTCACTCGCTGCTTTGTGCTGCGCTGCGGCCTTGGTGGGACACTTTTGTTGGTAGAAAAAAAACACGCATCTATTCCCCCCGTATTTATCCGATTTTGTGATAGTAAACCCCCCCAAGCTCCTCCACCCTACGATGATAACTACCACACAGTGTGCTGCTAGCAATCGTTTAACTAGTTTGGTT TTTCAATTTCTA ] [+] EMBL BX618097 [ TGTATGTGTGTGTGTATGGGGCGTGTTACGATATTTTTAATATGCTACCTTAGTAGAACCACACTAACCCATTTTCCTCCCATTTTCCCAAGCCCCCGCTGATCTGGAACATTGGCACGCATCGTATCCTCGCGCTCTAACCGTTAAATTAGATTGCAAATCCCGCCAATACGGCCAACATTCGAATAAGCTTTCGTTTTAACTTGCTGCAAAGCGTTAGAAAAGGTTAGAAAGCCCCTTCATTATCACTTGTGATTAATTTGTTTTTTCAAACTGACCAAATTTACCCGGTGCAATAGTAACAGCAAACACGTACCTTCACCCTTACAATGCAAATGCAAAATTTCATTAAAAGACACCCGTTTCACTCGCTGCTTTGTGCTGCGCTGCGGCCTTGGTGGGACACTTTTGTTGGTTG AAAAAACACGCATCTATTCCCCACGTATTTATCCGATTTTGTGATAGTAAA CCCCCCAAGCTCCTCCACCCTACGATGATAACCACCACACAGTGTGCTGCTAGCAATCGTTTAACTAGTTTGTTTTTTT ] [+] EMBL BX608493 [ TATGTGTGTGTGTATGGGGCGTGTTACGATATTTTTAATATGCTACCTTAGTAGAACCACACTAACCCATTTTCCTCCCATTTTCCCAAGCCCCCGCTGATCTGGAACATTGGCACGCATCGTATCCTCGCGCTCTAACCGTTAAATTAGATTGCAAATCCCGCCAATACGGCCAACATTCGAATAAGCTTTCGTTTTAACTTGCTGCAAAGCGTTAGAAAAGGTTAGAAAGCCCCTTCATTATCACTTGTGATTAATTTGTTTTTTCAAACTGACCAAATTTACCCGGTGCAATAGTAACAGCAAACACGTACCTTCACCCTTACAATGCAAATGCAAAATTTCATTAAAAGACACCCGTTTCACTCGCTGCTTTGTGCTGCGCTGCGGCCTTGGTGGGACACTTTTGTTGGTTG AAAAAACACGCATCTATTCCCCACGTATTTATCCGATTTTGTGATAGTAAA CCCCCCAAGCTCCTCCACCCTACGATGATAACCACCACACAGTGTGCTGCTAGCAATCGTTTAACTAGTTTGTTTTTTTCTTTCAATTTTTAATTGATTATTTTATAGTACATTGTAGTTATAGTTTACTCCTTTACTGCTGTATAGTTGCGCCACAGTTCCCTTGTTTT ] [+] EMBL BX611866 [ TGATCTGGAACATTGGCACGCATCGTATCCTCGCGCTCTAACCGTTAAATTAGATTGCAAATCCCGCCAATACGGCCAACATTCGAATAAGCTTTCGTTTTAACTTGCTGCAAAGCGTTAGAAAAGGTTAGAAAGCCCCTTCATTATCACTTGTGATTAATTTGTTTTTTCAAACTGACCAAATTTACCCGGTGCAATAGTAACAGCAAACACGTACCTTCACCCTTACAATGCAAATGCAAAATTTCATTAAAAGACACCCGTTTCACTCGCTGCTTTGTGCTGCGCTGCGGCCTTGTTGGGACACTTTTGTTGGTTG AAAAAACACGCATCTATTCCCCACGTATTTATCCGATTTTGTGATAGTAAA CCCCCCAAGCTCCTCCACCCTACGATGATAACCACCACACAGTGTGCTGCTAGCAATCGTTTAACTAGTTTGTTTTTTTCTTTCAATTTTTAATTGATTATTTTATAGTACATTGTAGTTATAGTTTACTCCTTTACTGCTGTATAGTTGCGCCACAGTTCCCTTGTTTTTTGTTTTTTTTTCATTGCGTGTGTTTGGTGGGGTCTCAAAAAAGGGGGAAATGTTATTAGGGCTCAGTCTTTCCTTCTCCGTCACACACTCTTTTGCTTCACT ] [+] EMBL BX611452 [ ACGGCCAACATTCGAATAAGCTTTCGTTTTAACTTGCTGCAAAGCGTTAGAAAAGGTTAGAAAGCCCCTTCATTATCACTTGTGATTAATTTGTTTTTTCAAACTGACCAAATTTACCCGGTGCAATAGTAACAGCAAACACGTACCTTCACCCTTACAATGCAAATGCAAAATTTCATTAAAAGACACCCGTTTCACTCGCTGCTTTGTGCTGCGCTGCGGCCTTGGTGGGACACTTTTGTTGGTTG AAAAAACACGCATCTATTCCCCACGTATTTATCCGATTTTGTGATAGTAAA CCCCCCAAGCTCCTCCACCCTACGATGATAACCACCACACAGTGTGCTGCTAGCAATCGTTTAACTAGTTTGTTTTTTTCTTTCAATTTTTAATTGATTATTTTATAGTACATTGTAGTTATAGTTTACTCCTTTACTGCTGTATAGTTGCGCCACAGTTCCCTTGTTTTTTGTTTTTTTTTCATTGCGTGTGTTTGGTGGGGTCTCAAAAAAGGGGGAAATGTTATTAGGGCTCAGTCTTTCCTTCTCCGTCACACACTCTTTTGCTTCACTGTGGCTGGTAATAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||