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Anopheles gambiae
cluster # 6649 cluster # 6649       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6649#0 length = 2626 sequences # 5  

consensusID : consensus_6649#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 2626
fasta sequence
                              [CGAGCTGAGCGGCAGCGAGCGCTTAGCTGTCCGATATTAAATTCGATCAATAATTTATTGAGAATTATGCAGTGTTCTTGCAAACCAGAGTTCGGGCACGTTTAGTTTAAATTGCAATTGCAAAGTTACTTGCTGCCATGACCGCATTCAAGATATCTGTAACTCTATTGGTGACTACGTATCTGCTTAGTTTGGCATTTGGGCAGTCGTCCCGTGTTGTTACTCAATCCAAGTGTTTCTTTCAAAAAAATTGCATTGAATGTCTCGACGCTGATAAAGACTGTGCATGGTGCACAGATGAGTTGTATGACATGCGAAAATCCCGATGCATGACTAAACATGAGCTGTTAGAATCCAAATGCAACGCGTTAAAAATCGAGACAAACGATGATTATTCATTCCTTCAAATCGAGAAAAATGAGCCGCATCGGGATTTCGATTCGCAGCAGTTGGAAGCTGTACAAATAATGCCACAAAAAATGAATTTACGTCTAGGAAAGTTGGGCTCCAGAACCATCTCGTTCAAGTACAAACCGGCGAAAAATTATCCTTTGGATATGTACTACCTGATGGATCTTACCTGGTCGATGCGTGACGACAAAGCAACGCTCGAGAGCATGGGTAGTCAGTTAGCACTAGCATTAGCTAACTTAACCGCCAACTATCAGTTGGGTTTTGGTAGTTTTGCTGACAAGCCCGCCTTTCCGTTCATACAATCCGAACCACATCGACTTCAGAATCCGTGCTATTCAGAAAACGACCAATGCGAACCGACCTACGGCTTTAAACACCGGTTGAAAATTACACGCGACATCGATAGCTTTATTGCGCAGGTCAAAGAAAGCAATGTCACTGGAAATGTGGACAATCTAGAAGCGGGACTAGATGCCCTAATGCAGGTGCTGGTATGCGAGAAACAGATCGGATGGGGTTCAAATACCCGTAAAATTGTGATCGTAGCCACAGACGGCTGGCTGCATATGGCTGGCGATGGGCTGCTGGCGGGTATCGTGGAAGAAAACGATAAACAGTGTCATCTGGACAGTGACGGAAACTTTGTAGATGCTTTAAAGTACGATTATCCGTCTTTGGAACAAATTTGGCGCGTACTGTTGCGAAGCAAAACGGCTGTGATATTTGCCGTCACCGAGGCGCAGCAAGCATACTACCGGCGCTTAAGCGATCTGATGCCTGAGTTTACCAGTGTTGGCCGACTGCAGGATGATTCCTCCAACATTATCCAGTTGGTAGATGAGGGATATAGAGAGTTTGTTAAGCGGGTGGAGTTTATAGACAATTCACCAGACTACATGCAATTACGCTACACCACTGATTGTGCAGGACTGTATCGTGAACCGCAACCGATCAACAGATGTGACAATATTGAAATTGGAAAAGAGTATAAATTTAACGTTGAAATACATCTGCTGGAATATCCTAAAGATCCGTCAATAACGAATGTTACAGTTCGAATAGAAGAGAAACTGATCAGTAATGAAGCCGTGGAACTGGACATAGATTTGCGCACTAGTTGTAACTGTGAAAAAAATAAGAAACCGATGGAGCTGAGCGAGCTGTGCAACTTCAACGGAGATTACGTGTGCGGGCAATGCCAATGCTATGTCGGATGGATTGGCAAAACGTGCGAATGCAATTTACAAAACTCTCAAAATCGACGCGAATTGTTCGAGCAGTGTGTGGCGCCCAGTGTAGGTGACGAGCTACGTACTGGTCCTATTTGTTCCGATCGAGGCGAATGCATATGCGGACAATGCTATTGTAATCCCGGATTTGAGGGAGAGCATTGCGAATGTAATGAATGTGCCACCATTGATGGAAGCATTTGTGGAGGTCCAGATCACGGTATTTGCACGTGTGGCACATGCAGCTGCTTCGACTCGTGGTCAGGTGACAATTGTGAATGTACTACAGACACAACTGGTTGTAAGGCACCATCCAATGATGCTGTTTGCTCTGGACACGGGCAATGCAACTGCGGACGATGTTCTTGTGACGAATCCTTCTTCGGACCATTCTGCGAAACGAAGGATGGGGAACAACCGGCATTATGCTCGTCGTACGAGGATTGTATTCGATGTGCAGTACATGAGATAAACAATATACCATGCCAAGATTTAGATAACAAGTGTCGTGAAAAAATTGGGCTGTATAAAGTGCAGCTCGTTGATGCCACTGATGATTCGCTAAACTGCACTTTTCGATTCAGTGACGAGAAGAATGTATGTGACTACAGGTTTTCGTACGAACTTGCGAACAATAGAGAAACATTGCTAAAGGTACAGAATTTACAATGCAAAGAGATCAACTTGATTGCTGCTGGGTTCACTATCGCTGCATCCATCATTATCGGTGGACTGCTGATGCTATTTTGCTACCGATGTAAAATTATGTACGACGATAGAAAAATGTTTGCAAAGTTCGAAAAGGAAAGGGAACAAGAAACGAAGTATCAAATGGAGAGTCCATTGTATAAATCACCCATATCTAATTTTAAAGTTCCTGCTGAGATGGAGACAAGTGTTTTGTAAATGATGTACGAACTGTATCCTCGAAGAAAAACAAAAATAAAACTAACAATAGTGTGATTTTAGTTTAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AF492464             [CGAGCTGAGCGGCAGCGAGCGCTTAGCTGTCCGATATTAAATTCGATCAATAATTTATTGAGAATTATGCAGTGTTCTTGCAAACCAGAGTTCGGGCACGTTTAGTTTAAATTGCAATTGCAAAGTTACTTGCTGCCATGACCGCATTCAAGATATCTGTAACTCTATTGGTGACTACGTATCTGCTTAGTTTGGCATTTGGGCAGTCGTCCCGTGTTGTTACTCAATCCAAGTGTTTCTTTCAAAAAAATTGCATTGAATGTCTCGACGCTGATAAAGACTGTGCATGGTGCACAGATGAGTTGTATGACATGCGAAAATCCCGATGCATGACTAAACATGAGCTGTTAGAATCCAAATGCAACGCGTTAAAAATCGAGACAAACGATGATTATTCATTCCTTCAAATCGAGAAAAATGAGCCGCATCGGGATTTCGATTCGCAGCAGTTGGAAGCTGTACAAATAATGCCACAAAAAATGAATTTACGTCTAGGAAAGTTGGGCTCCAGAACCATCTCGTTCAAGTACAAACCGGCGAAAAATTATCCTTTGGATATGTACTACCTGATGGATCTTACCTGGTCGATGCGTGACGACAAAGCAACGCTCGAGAGCATGGGTAGTCAGTTAGCACTAGCATTAGCTAACTTAACCGCCAACTATCAGTTGGGTTTTGGTAGTTTTGCTGACAAGCCCGCCTTTCCGTTCATACAATCCGAACCACATCGACTTCAGAATCCGTGCTATTCAGAAAACGACCAATGCGAACCGACCTACGGCTTTAAACACCGGTTGAAAATTACACGCGACATCGATAGCTTTATTGCGCAGGTCAAAGAAAGCAATGTCACTGGAAATGTGGACAATCTAGAAGCGGGACTAGATGCCCTAATGCAGGTGCTGGTATGCGAGAAACAGATCGGATGGGGTTCAAATACCCGTAAAATTGTGATCGTAGCCACAGACGGCTGGCTGCATATGGCTGGCGATGGGCTGCTGGCGGGTATCGTGGAAGAAAACGATAAACAGTGTCATCTGGACAGTGACGGAAACTTTGTAGATGCTTTAAAGTACGATTATCCGTCTTTGGAACAAATTTGGCGCGTACTGTTGCGAAGCAAAACGGCTGTGATATTTGCCGTCACCGAGGCGCAGCAAGCATACTACCGGCGCTTAAGCGATCTGATGCCTGAGTTTACCAGTGTTGGCCGACTGCAGGATGATTCCTCCAACATTATCCAGTTGGTAGATGAGGGATATAGAGAGTTTGTTAAGCGGGTGGAGTTTATAGACAATTCACCAGACTACATGCAATTACGCTACACCACTGATTGTGCAGGACTGTATCGTGAACCGCAACCGATCAACAGATGTGACAATATTGAAATTGGAAAAGAGTATAAATTTAACGTTGAAATACATCTGCTGGAATATCCTAAAGATCCGTCAATAACGAATGTTACAGTTCGAATAGAAGAGAAACTGATCAGTAATGAAGCCGTGGAACTGGACATAGATTTGCGCACTAGTTGTAACTGTGAAAAAAATAAGAAACCGATGGAGCTGAGCGAGCTGTGCAACTTCAACGGAGATTACGTGTGCGGGCAATGCCAATGCTATGTCGGATGGATTGGCAAAACGTGCGAATGCAATTTACAAAACTCTCAAAATCGACGCGAATTGTTCGAGCAGTGTGTGGCGCCCAGTGTAGGTGACGAGCTACGTACTGGTCCTATTTGTTCCGATCGAGGCGAATGCATATGCGGACAATGCTATTGTAATCCCGGATTTGAGGGAGAGCATTGCGAATGTAATGAATGTGCCACCATTGATGGAAGCATTTGTGGGGGTCCAGATCACGGTATTTGCACGTGTGGCACATGCAGCTGCTTCGACTCGTGGTCAGGTGACAATTGTGAATGTACTACAGACACAACTGGTTGTAAGGCACCATCCAATGATGCTGTTTGCTCTGGACACGGGCAATGCAACTGCGGACGATGTTCTTGTGACGAATCCTTCTTCGGACCATTCTGCGAAACGAAGGATGGGGAACAACCGGCATTATGCTCGTCGTACGAGGATTGTATTCGATGTGCAGTACATGAGATAAACAATATACCATGCCAAGATTTAGATAACAAGTGTCGTGAAAAAATTGGGCTGTATAAAGTGCAGCTCGTTGATGCCACTGATGATTCGCTAAACTGCACTTTTCGATTCAGTGACGAGAAGAATGTATGTGACTACAGGTTTTCGTACGAACTTGCGAACAATAGAGAAACATTGCTAAAGGTACAGAATTTACAATGCAAAGAGATCAACTTGATTGCTGCTGGGTTCACTATCGCTGCATCCATCATTATCGGTGGACTGCTGATGCTATTTTGCTACCGATGTAAAATTATGTACGACGATAGAAAAATGTTTGCAAAGTTCGAAAAGGAAAGGGAACAAGAAACGAAGTATCAAATGGAGAGTCCATTGTATAAATCACCCATATCTAATTTTAAAGTTCCTGCTGAGATGGAGACAAGTGTTTTGTAAATGATGTACGAACTGTATCCTCGAAGAAAAACAAAAATAAAACTAACAATAGTGTGATTTTAGTTTAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL BM612868             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AGTCAGTTAGCACTAGCATTAGCTAACTTAACCGCCAACTATCAGTTGGGTTTTGGTAGTTTTGCTGACAAGCCCGCCTTTCCGTTCATACAATCCGAACCACATCGACTTCAGAATCCGTGCTATTCAGAAAACGACCAATGCGAACCGACCTACGGCTTTAAGCACCGGTTGAAAATTACACGCGACATCGATAGCTTTATTGCGCAGGTCAAAGAAAGCAATGTCACTGGAAATGTGGACAATCTAGAAGCGGGACTAGATGCCCTAATGCAGGTGCTGGTATGCGAGAAACAGATCGGATGGGGTTCAAATACCCGTAAAATTGTGATCGTAGCCACAGACGGATGGCTGCATATGGCTGGCGATGGGCTGCTGGCGGGTATCGTGGAAGAAAACGATAAACAGTGTCATCTGGACAGTGACGGAAACTTTGTAGATGCTTTAAAGTACGATTATCCCTCTTTGGAACAAATTTGGCGCGTACTGTTGCGAAGCAAAACGGCTGTGATATTTGCCGTCACCGAGGCGCAGCAAGCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BM647360             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ccgGCGGGCAATGCCAATGCTATGTCGGATGGATTGGCAAAACGTGCGAATGCAATTTACAAAACTCTCAAAATCGACGCGAATTGTTCGAGCAGTGTGTGGCGCCCAGTGTAGGTGACGAGCTACGTACTGGTCCTATTTGTTCCGATCGAGGCGAATGCATATGCGGACAATGCTATTGTAATCCCGGATTTGAGGGAGAGCATTGCGAATGCAATGAATGTGCCACCATTGATGGAAGCATTTGTGGAGGTCCAGATCACGGTATTTGCACGTGTGGCACATGCAGCTGCTACTACTCGTGGTCAGGTGACAATTGTGAATGTACTACAGACACAACTGGTTGTAAGGCACCATCCAATGATGCTGTTTGCTCTGGACACGGGCAATGCAACTGCGGACGATGTTCTTGTGACGAATCCTTCTTCGGACCATTCTGCGAAACGAAGGATGGGGAACAACCGGCATTATGCTCGTCGTACGAGGATTGTATTCGATGTGCAGTACATGAGATAAACCATATACCATGCCAAGATTTATATAACAAGTGTCGTGAAAAAATTGGGATGTATAAAGTGCAGCTCGTTGATGCCACTGATGATTCCCTAAACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL AGA281027            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tttTTTGTGGAGGTCCAGATCACGGTATTTGCACGTGTGGCACATGCAGCTGCTTCGACTCGTGGTCAGGTGACAATTGTGAATGTACTACAGACACAACTGGTTGTAAGGCACCATCCAATGATGCTGTTTGCTCTGGACACGGGCAATGCAACTGCGGACGATGTTCTTGTGACGAATCCTTCTTCGGACCATTCTGCGAAACGAAGGATGGGGAACAACCGGCATTATGCTCGTCGTACGAGGATTGTATTCGATGTGCAGTACATGAGATAAACAATATACCATGCCAAGATTTAGATAACAAGTGTCGTGAAAAAATTGGGCTGTATAAAGTGCAGCTCGTTGATGCCACTGATAATTCGCTAAACTGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL AGA282655            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CGAAGGATGGGGAACAACCGGCATTATGCTCGTCGTACGAGGATTGTATTCGATGTGCAGTACATGAGATAAACAATATACCATGCCAAGATTTAGATAACAAGTGTCGTGAAAAAATTGGGCTGTATAAAGTGCAGCTCGTTGATGCCACTGATAATTCGCTAAACTGCACTTTTCGATTCAGTGACGAGAAGAATGTATGTGACTACAGGTTTTCGTACGAACTTGCGAACAATAGAGAAACATTGCTAAAGGTACAGAATTTACAATGCAAAGAGATCAACTTGATTGCTGCTGGGTTCACTATCGCTGCATCCATCATTATCGGTGGACTGCTGATGCTATTTTGCTACCGATGTAAAATTATGTACGACGATAGAAAAATGTTTGCAAAGTTCGAAAAGGAAAGGGAACAAGAAACGAAGTATCAAATGGAGAGTCCATT                                                                                                                                          ]


>consensus_6649#0 CGAGCTGAGCGGCAGCGAGCGCTTAGCTGTCCGATATTAAATTCGATCAATAATTTATTG AGAATTATGCAGTGTTCTTGCAAACCAGAGTTCGGGCACGTTTAGTTTAAATTGCAATTG CAAAGTTACTTGCTGCCATGACCGCATTCAAGATATCTGTAACTCTATTGGTGACTACGT ATCTGCTTAGTTTGGCATTTGGGCAGTCGTCCCGTGTTGTTACTCAATCCAAGTGTTTCT TTCAAAAAAATTGCATTGAATGTCTCGACGCTGATAAAGACTGTGCATGGTGCACAGATG AGTTGTATGACATGCGAAAATCCCGATGCATGACTAAACATGAGCTGTTAGAATCCAAAT GCAACGCGTTAAAAATCGAGACAAACGATGATTATTCATTCCTTCAAATCGAGAAAAATG AGCCGCATCGGGATTTCGATTCGCAGCAGTTGGAAGCTGTACAAATAATGCCACAAAAAA TGAATTTACGTCTAGGAAAGTTGGGCTCCAGAACCATCTCGTTCAAGTACAAACCGGCGA AAAATTATCCTTTGGATATGTACTACCTGATGGATCTTACCTGGTCGATGCGTGACGACA AAGCAACGCTCGAGAGCATGGGTAGTCAGTTAGCACTAGCATTAGCTAACTTAACCGCCA ACTATCAGTTGGGTTTTGGTAGTTTTGCTGACAAGCCCGCCTTTCCGTTCATACAATCCG AACCACATCGACTTCAGAATCCGTGCTATTCAGAAAACGACCAATGCGAACCGACCTACG GCTTTAAACACCGGTTGAAAATTACACGCGACATCGATAGCTTTATTGCGCAGGTCAAAG AAAGCAATGTCACTGGAAATGTGGACAATCTAGAAGCGGGACTAGATGCCCTAATGCAGG TGCTGGTATGCGAGAAACAGATCGGATGGGGTTCAAATACCCGTAAAATTGTGATCGTAG CCACAGACGGCTGGCTGCATATGGCTGGCGATGGGCTGCTGGCGGGTATCGTGGAAGAAA ACGATAAACAGTGTCATCTGGACAGTGACGGAAACTTTGTAGATGCTTTAAAGTACGATT ATCCGTCTTTGGAACAAATTTGGCGCGTACTGTTGCGAAGCAAAACGGCTGTGATATTTG CCGTCACCGAGGCGCAGCAAGCATACTACCGGCGCTTAAGCGATCTGATGCCTGAGTTTA CCAGTGTTGGCCGACTGCAGGATGATTCCTCCAACATTATCCAGTTGGTAGATGAGGGAT ATAGAGAGTTTGTTAAGCGGGTGGAGTTTATAGACAATTCACCAGACTACATGCAATTAC GCTACACCACTGATTGTGCAGGACTGTATCGTGAACCGCAACCGATCAACAGATGTGACA ATATTGAAATTGGAAAAGAGTATAAATTTAACGTTGAAATACATCTGCTGGAATATCCTA AAGATCCGTCAATAACGAATGTTACAGTTCGAATAGAAGAGAAACTGATCAGTAATGAAG CCGTGGAACTGGACATAGATTTGCGCACTAGTTGTAACTGTGAAAAAAATAAGAAACCGA TGGAGCTGAGCGAGCTGTGCAACTTCAACGGAGATTACGTGTGCGGGCAATGCCAATGCT ATGTCGGATGGATTGGCAAAACGTGCGAATGCAATTTACAAAACTCTCAAAATCGACGCG AATTGTTCGAGCAGTGTGTGGCGCCCAGTGTAGGTGACGAGCTACGTACTGGTCCTATTT GTTCCGATCGAGGCGAATGCATATGCGGACAATGCTATTGTAATCCCGGATTTGAGGGAG AGCATTGCGAATGTAATGAATGTGCCACCATTGATGGAAGCATTTGTGGAGGTCCAGATC ACGGTATTTGCACGTGTGGCACATGCAGCTGCTTCGACTCGTGGTCAGGTGACAATTGTG AATGTACTACAGACACAACTGGTTGTAAGGCACCATCCAATGATGCTGTTTGCTCTGGAC ACGGGCAATGCAACTGCGGACGATGTTCTTGTGACGAATCCTTCTTCGGACCATTCTGCG AAACGAAGGATGGGGAACAACCGGCATTATGCTCGTCGTACGAGGATTGTATTCGATGTG CAGTACATGAGATAAACAATATACCATGCCAAGATTTAGATAACAAGTGTCGTGAAAAAA TTGGGCTGTATAAAGTGCAGCTCGTTGATGCCACTGATGATTCGCTAAACTGCACTTTTC GATTCAGTGACGAGAAGAATGTATGTGACTACAGGTTTTCGTACGAACTTGCGAACAATA GAGAAACATTGCTAAAGGTACAGAATTTACAATGCAAAGAGATCAACTTGATTGCTGCTG GGTTCACTATCGCTGCATCCATCATTATCGGTGGACTGCTGATGCTATTTTGCTACCGAT GTAAAATTATGTACGACGATAGAAAAATGTTTGCAAAGTTCGAAAAGGAAAGGGAACAAG AAACGAAGTATCAAATGGAGAGTCCATTGTATAAATCACCCATATCTAATTTTAAAGTTC CTGCTGAGATGGAGACAAGTGTTTTGTAAATGATGTACGAACTGTATCCTCGAAGAAAAA CAAAAATAAAACTAACAATAGTGTGATTTTAGTTTAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)