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Anopheles gambiae
cluster # 6710 cluster # 6710       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6710#0 length = 1358 sequences # 6  

consensusID : consensus_6710#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1358
fasta sequence
                              [TTATAGTATTAGGGGTTTTAAAATGTAGTCCATGCCTAACTCTTTCCTTCCTTCACTTTCTCTCTCTCTTCCCCCTCCTTCTTTCTATCTCTCTCTATTGCGCGCTCTCTCTGTCTCTCTATTACTTTCTCTTTGCCTCTCCATGTCCATGCCTCATGTGTGTTTCCCTGTATTTTGTTTCCTTTTTTATTTCTATTTCCATTCTCAGTGAGTAATGAGAATATGCGATTTAACATGAGATGTTTAAAATTACAAAAGAATTTGACGAAAATGTTGTATTGTAAGCATATCTTAATTTTTGTGAGTTTCTTCGCATAT-CTTCCTTGATAAATGTTAGCTGTTGCTAATTTCATTGTCCTCTGTTGTTTCGGTATTTGTCTTTGTGGTCGTCTGGTATCGGTTTTGTTTGAATGTGCGGCTTTAATACGCTTCATACGAGGGTCTATATTGTGGGTGCGTGTAGAGGATTCTACAACAGTGAAGTAGAACCATTTTGAGTTAGTTTGGCTATAACTGTATGACGCAAGTATGAGTTTGCTATGAAAACTGTATATTCATGTATGCCTCACAATAGGAATCAAGCGAAAAGTGAAACTGTCCCATGCTTGATTATTGTTGCATTGTTTAGTTTTACCTTTCAACTAAAGTACTTTTATCATTTGTT-CCGCGAGTTTAATAGTTTTTACAAATAAGCATTGATTGATACATCGATTTCATCTCACCTTCACCTTTTCATCCAACGTAAAACGATACTTTCGGTTTGATTAAACATGCTGCATCTGTAAAAAGCAATAAATGGTGTATCATAAATGAGATAACAACACAAGAAATCGCCAGTTGAATGGTACTGTTTATCAATCCGCCGCACTGTATGAGCTATAGATTTGGACATATATTTGTGAAGTACGTTGTGTGTAGCTTAAACCACATCTAACTATATAGCACTCACCTGAATTGGTGCCAGTTCCGAAGCACGCACTTAACAGCAGACGTTTGGTTTTAAATTACAACGTTTTCAAGGGATGGCCAACAAATCCGTCGTGACAGTGGTGCTCGGAGAGCTTAAACCCGAGTGTTGTCGTAGAAACATATTCGCTGATAGAACTATTGAACGATAAGCAACTAAAACCTAGTGCAAGAAGCAATTGTTGACGTAAGTTTTTAGTGTGCATATTTCTAGTTTCCGATAGCAATCAATGTATGTATGGGTTGTATGTATATAGCAGTTATGTATAGTAAATATACATAAGGGCTTTTATGCATATATAAATACACAGCTACGTGAGATTGTGCCACGCTAGGCAAAACGAAACATGTTAATAGTG-TTTTTATTTGTTAAGTGTATTCATTAGGCGATA]

[+] EMBL BX620757             [TTATAGTATTAGGGGTTTTAAAATGTAGTCCATGCCTAACTCTTTCCTTCCTTCACTTTCTCTCTCTCTTCCCCCTCCTTCTTTCTATCTCTCTCTATTGCGCGCTCTCTCTGTCTCTCTATTACTTTCTCTTTGCCTCTCCATGTCCATGCCTCATGTGTGTTTCCCTGTATTTTGTTTCCTTTTTTATTTCTATTTCCATTCTCAGTGAGTAATGAGAATATGCGATTTAACATGAGATGTTTAAAATTACAAAAGAATTTGACGAAAATGTTGTATTGTAAGCATATCTTAATTTTTGTGAGTTTCTTCGCATATCCTTCCTTGATAAATGTTAGCTGTTGCTAATTTCATTGTCCTCTGTTGTTTCGGTATTTGTCTTTGTGGTCGTCTGGTATCGGTTTTGTTTGAATGTGCGGCTTTAATACGCTTCATACGAGGGTCTATATTGTGGGTGCGTGTAGAGGATTCTACAACAGTGAAGTAGAACCATTTTGAGTTAGTTTGGCTATAACTGTATGACGCAAGTATGAGTTTGCTATGAAAACTGTATATTCATGTATGCCTCACAATAGGAATCAAGCGAAAAGTGAAACTGTCCCATGCTTGATTATTGTTGCATTGTTTAGTTTTACCTTTCAACTAAAGTACTTTTATCATTTGTTCCCGCGAGTTTAATAGTTTTTACNAATAAGCATTGATTGATACATCGATTTCATCTCACCTTCACC TTTCATCCAACGTAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BM626156             [                                                                                                                                                                                    CCGTTTTTATTTCTATTTCCATTCTCAGTGAGTAATGAGAATATGCGATTTAACATGAGATGTTTAAAATTACAAAAGAATTTGACGAAAATGTTGTATTGTAAGCATATCTTAATTTTTTTGAGTTTCTTCGCATAT CTTCCTTGATAAATGTTAGCTGTTGCTAATTTCATTGTCCTCTGTTGTTTCGGTATTTGTCTTTGTGGTCGTCTGGTATCGGTTTTGTTTGAATGTGCGGCTTTAATACGCTTCATACGAGGGTCTATATTGTGGGTGCGTGTAGAGGATTCTACAACAGTGAAGTAGAACCATTTTGAGTTAGTTTGGCTATAACTGTATGACGCAAGTATGAGTTTGCTATGAAAACTGTATATTCATGTATGCCTCACAATAGGAATCAAGCGAAAAGTGAAACTGTCCCATGCTTGATTATTGTTGCATTGTTTAGTTTTACCTTTCAACTAAAGTACTTTTATCATTTGTT CCGCGAGTTTAATAGTTTTTACAAATAAGCATTGATTGATACATCGATTTCATCTCACCTTCACCTTTTCATCCAACGTAAAACGAAACTTTCGGTTTGATTAAACATGCTGCATCTGTAAAAAGCAATAAATGGTGTATCATAAATGAGATAACAACACAAGAAATCGCCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BX612213             [                                                                                                                                                                                                                                                           ACAAAAGAATTTGACGAAAATGTTTTATTGTAAGCATATCTTAATTTTTGTGAGTTTCTTCGCATAT CTTCCTTGATAAATGTTAGCTGTTGCTAATTTCATTGTCCTCTGTTGTTTCGGTATTTGTCTTTGTGGTCGTCTGGTATCGGTTTTGTTTGAATGTGCGGCTTTAATACGCTTCATACGAGGGTCTATATTGTGGGTGCGTGTAGAGGATTCTACAACAGTGAAGTAGAACCATTTTGAGTTAGTTTGGCTATAACTGTATGACGCAAGTATAAGTTTGCTATGAAAACTGCATATTCATGTATGCCTCACAATAGGAATCAAGCGAAAAGTGAAACTGTCCCATGCTTGATTATTGTTGCATTGTTTAGTTTTACCTTTCAACTAAAGTACTTTTATCATTTGTT CCGCGAGTTTAATAGTTTTTACAAATAAGCATTGATTGATACATCGATTTCATCTCACCTTCACCTTTTCATCCAACGTAAAACGATACTTTCGGTTTGATTAAACATGCTGCATCTGTAAAAAGCAATAAATGGTGTATCATAAATGAGATAACAACACAAGAAATCGCCAGTTGAATGGTACTGTTTATCAATCCGCCGCACTGTATGAGCTATAGATTTGGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BX614515             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTCGCATATCCTTCCTTGATAAATGTTAGCTGTTGCTAATTTCATTGTCCTCTGTTGTTTCGGTATTTGTCTTTGTGGTCGTCTGGTATCGGTTTTGTTTGAATGTGCGGCTTTAATACGCTTCATACGAGGGTCTATATTGTGGGTGCGTGTAGAGGATTCTACAACAGTGAAGTAGAACCATTTTGAGTTAGTTTGGCTATAACTGTATGACGCAAGTATGAGTTTGCTATGAAAACTGTATATTCATGTATGCCTCACAATAGGAATCAAGCGAAAAGTGAAACTGTCCCATGCTTGATTATTGTTGCATTGTTTAGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BX612683             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GCTTGATTATTGTTGCATTGTTTAGTTTTACCTTTCAACTAAAGTACTTTTATCATTTGTT CCGCGAGTTTAATAGTTTTTACAAATAAGCATTGATTGATACATCGATTTCATCTCACCTTCACCTTTTCATCCAACGTAAAACGATACTTTCGGTTTGATTAAACATGCTGCATCTGTAAAAAGCAATAAATGGTGTATCATAAATGAGATAACAACACAAGAAATCGCCAGTTGAATGGTATTGTTTATCAATCCGCCGCACTGTATGAGCTATAGATTTGGACATATATTTGTGAAGTACGTTGTGTGTAGCTTAAACCACATCTAACTATATAGCACTCACCTGAATTGGTGCCAGTTCCGAAGCACGCACTTAACAGCAGACGTTTGGTTTTAAATTACAACGTTTTCAAGGGATGGCCAACAAATCCGTCGTGACAGTGGTGCTCGGAGAGCTTAAACCCGAGTGTTGTCGTAGAAACATATTCGCTGATAGAACTATTGAACGATAAGCAACTAAAACCTAGTGCAAGAAGCAATTGTTGACGTAAGTTTTTAGTGTGCATATTTCTAGTTTCCGATAGCAATCAATGTATGTATGGGTTGTATGTATATAGCAGTTATGTATAGTAAATATACATAAGGGCTTTTATGCATATATAAATACACAGCTACGTGAGATTGTGCCACGCTAGGCAAAACGAAACATGTTAATAGTG TTTTTATTTGTTAAGTGTATTCATTAGGCGATA]
[+] EMBL BX615440             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AAAGCAATAAATGGTGTATCATAAATGAGATAACAACACAAGAAATCGCCAGTTGAATGGTACTGTTTATCAATCCGCCGCACTGTATGAGCTATAGATTTGGACATATATTTGTGAAGTACGTTGTGTGTAGCTTAAACCACATCTAACTATATAGCACTCACCTGAATTGGTGCCATTTTCGAAGCACGCACTTAACAGCAGACGTTTGGTTTTAAATTACAACGTTTTCAAGGGATGGCCAACAAATCCGTCGTGACAGTGGTGCTCGGAGAGCATAAACCCGAGTGTTGTCGTAGAAATATATTCGCTGATAGAACTATTGAACGATAAGCAACTAAAACCTAGTGCAAGAAGCAATTGTTGACGTAAGTTTTTAGTGTGCATATTTCTAGTTTCCGATAGCAATCAATGTATGTATGGGTTGTATGTATATAGCAGTTATGTATAGTAAATATACATAAGGGCTTTTATGCATATATAAATACACAGCTACGTGAGATTGTGCCACGCTAGGCAAAACGAAACATGTTAATAGTGTTTTTTATTT                        ]


>consensus_6710#0 TTATAGTATTAGGGGTTTTAAAATGTAGTCCATGCCTAACTCTTTCCTTCCTTCACTTTC TCTCTCTCTTCCCCCTCCTTCTTTCTATCTCTCTCTATTGCGCGCTCTCTCTGTCTCTCT ATTACTTTCTCTTTGCCTCTCCATGTCCATGCCTCATGTGTGTTTCCCTGTATTTTGTTT CCTTTTTTATTTCTATTTCCATTCTCAGTGAGTAATGAGAATATGCGATTTAACATGAGA TGTTTAAAATTACAAAAGAATTTGACGAAAATGTTGTATTGTAAGCATATCTTAATTTTT GTGAGTTTCTTCGCATATCTTCCTTGATAAATGTTAGCTGTTGCTAATTTCATTGTCCTC TGTTGTTTCGGTATTTGTCTTTGTGGTCGTCTGGTATCGGTTTTGTTTGAATGTGCGGCT TTAATACGCTTCATACGAGGGTCTATATTGTGGGTGCGTGTAGAGGATTCTACAACAGTG AAGTAGAACCATTTTGAGTTAGTTTGGCTATAACTGTATGACGCAAGTATGAGTTTGCTA TGAAAACTGTATATTCATGTATGCCTCACAATAGGAATCAAGCGAAAAGTGAAACTGTCC CATGCTTGATTATTGTTGCATTGTTTAGTTTTACCTTTCAACTAAAGTACTTTTATCATT TGTTCCGCGAGTTTAATAGTTTTTACAAATAAGCATTGATTGATACATCGATTTCATCTC ACCTTCACCTTTTCATCCAACGTAAAACGATACTTTCGGTTTGATTAAACATGCTGCATC TGTAAAAAGCAATAAATGGTGTATCATAAATGAGATAACAACACAAGAAATCGCCAGTTG AATGGTACTGTTTATCAATCCGCCGCACTGTATGAGCTATAGATTTGGACATATATTTGT GAAGTACGTTGTGTGTAGCTTAAACCACATCTAACTATATAGCACTCACCTGAATTGGTG CCAGTTCCGAAGCACGCACTTAACAGCAGACGTTTGGTTTTAAATTACAACGTTTTCAAG GGATGGCCAACAAATCCGTCGTGACAGTGGTGCTCGGAGAGCTTAAACCCGAGTGTTGTC GTAGAAACATATTCGCTGATAGAACTATTGAACGATAAGCAACTAAAACCTAGTGCAAGA AGCAATTGTTGACGTAAGTTTTTAGTGTGCATATTTCTAGTTTCCGATAGCAATCAATGT ATGTATGGGTTGTATGTATATAGCAGTTATGTATAGTAAATATACATAAGGGCTTTTATG CATATATAAATACACAGCTACGTGAGATTGTGCCACGCTAGGCAAAACGAAACATGTTAA TAGTGTTTTTATTTGTTAAGTGTATTCATTAGGCGATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)