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Anopheles gambiae
cluster # 6752 cluster # 6752       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6752#0 length = 1743 sequences # 6  

consensusID : consensus_6752#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1743
fasta sequence
                              [CCGCCCACGCGTCCGCATGGTTGCAAACCGCCGGTCGAAAAGGAACGGCAACCAAGTGCGTTGTTGCCGGCATGCACAAGCGCTAGAATAAAAGAGGAACCGCTAGACGATGTGGAGCACCTCGATGAAGAGGAAAGGGAGATGCGACACAGCTCTAAAGTCCCTGGTGGAGAAGGGGCCGTGACCGGTGCAACTAAAACCATCTGTCCCGAGAGCACTAGTCAACCGTTGGCAGTGGTGTCTGCAAATGGCAAAAGTCATGCCAACGGTGCCAACGGCGTTAGTACCTCTACGAACGCTTCTTATCCACCGCACGACCGGCAGCGACAAGAACACAACCCACAGAGCAATCTAACAAGCTTATGATGACACAGACAGCGATCCATCGTCGAGGGATACGGAAACAAATGAGGTGGAGTTATTGAGAGTTAACGAGTGACTGAAATAAGTGAATTTGAGTATATTTACTTCAGCGCATATTTGTGTGTTGAAGTGACAAAAAAACCTAAACAAAAAGGTGTAAAAAGGTATAAAACGGCCCACCTGATGATTCTTATCCTCCGTTTTGATGAGGTCGAAGAGAATGAACAAATTAA-GGAAGAGGTAGTAAGGTCCGAAAATGAATTGTTTCGGTTAAATTATTAGACACTAGCTTTTTTGTTAGTTAGTAAGTTTTGGAAACAGATTTTCTCAACTGGACTAGAGTTCATAACAC-AAAAAAAAAGAATTCCTTTGAGAAAAAAGCAGAATTAGTGGACGAATGCTTGAAATAAGTGTATTTTACTTCTGCTTGTATAGCCTTTTCGCAGAAGATGTTTGTAGTAGAAGTGTTAGAAATGAGAAAGTAGCAGTAGGACAAAGGTAATTAACGTTAGGAATCGTAGACCATCATCGCATCCTTACGATATTTTTATACACGTTTTTGTTCTTACATTGAAGCAAAAGCATGCCAATAGTGTTTGGGGAATAGAAGGACAAATGCCAGTGATTGACATTGTGCTGGCAATGTATTTAAAACAAGGGTGCGCATGTTGAACTGGCAACTATGACGATTAGCACTACTATTACTACTACTACTACTACTACTACTGCTACTGCTGCTGCTGATGATATGGCCGTTCGCCGTTGCCATTGTTGCAAGAATGCAACCAGGTCTTGCCCGCTGCATTCGGAAGAAAGATGCAATGCGCGTACGCATTATGTAGTACCTTTTTTAAGCTCCTAAATGCAATGCGTTAGTTGAACGTTCTGCATTACATTGACGTGTTTATGGCTTGCAAGATTCCTCTCTTGTTAGGGGTGTTGTCAACAGCATGCTCTCCATATGCTTATTTTTAATTGTAACATACACAAACGGTTCAAACCAGCAGCATATGTCACGTTTGTGCAATTTGCGATCGAAGTAGACAACACATGGATAGATTTAATAAGTATTTCCTTTTCAAGTTTCATTTGCTATGCTACGGTACTGCGTTTCGATCCAGCTTCATGGGGAAATGGGGTGGTGTAGATCTCTATAATAAGGCTTAATAAGGCTTAATTAAGGTCCTGCAGGAATAATTAGCAAGCATGAAAAGAAACTAATCTTACGTAGATAATTCTGCGCATCCACCGAACCACACTCACGCACCTTTAAGCACTTTTGGACCAGACCGCAGGGTTAGAATTATTTGTGAGTGGCTGCTCTGTGAAAAGCTTGCAGCAATTTGAAATCATCAAATAAAAATTAATTATATAGCCCTG]

[+] EMBL BM581376             [CCGCCCACGCGTCCGCATGGTTGCAAACCGCCGGTCGAAAAGGAACGGCAACCAAGTGCGTTGTTGCCGGCATGCACAAGCGCTAGAATAAAAGAGGAACCGCTAGACGATGTGGAGCACCTCGATGAAGAGGAAAGGGAGATGCGACACAGCTCTAAAGTCCCTGGTGGAGAAGGGGCCGTGACCGGTGCAACTAAAACCATCTGTCCCGAGAGCACTAGTCAACCGTTGGCAGTGGTGTCTGCAAATGGCAAAAGTCATGCCAACGGTGCCAACGGCGTTAGTACCTCTACGAACGCTTCTTATCCACCGCACGACCGGCAGCGACAAGAACACAACCCACAGAGCAATCTAACAAGCTTATGATGACACAGACAGCGATCCATCGTCGAGGGATACGGAAACAAATGAGGTGGAGTTATTGAGAGTTAACGAGTGACTGAAATAAGTGAATTTGAGTATATTTACTTCAGCGCATATTTGTGTGTTGAAGTGACAAAAAAACCTAAACAAAAAGGTGTAAAAAGGTATAAAACGGCCCACCTGATGATTCTTATCCTCCGTTTTGATGAGGTCGAAGAGAATGAACAAATTAAGGGAAGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
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[+] EMBL BM623948             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ccgAGAGTTCATAACACAAAAAAAAAAGAATTCCTTTGAGAAAAAAGCAGAATTAGTGGACGAATGCTTGAAATAAGTGTATTTTACTTCTGCTTGTATAGCCTTTTCGCAGAAGATGTTTGTAGTAGAAGTGTTAGAAATGAGAAAGTAGCAGTAGGACAAAGGTAATTAACGTTAGGAATCGTAGACCATCATCGCATCCTTACGATATTTTTATACACGTTTTTGTTCTTACATTGAAGCAAAAGCATGCCAATAGTGTTTGGGGAATAGAAGGACAAATGCCAGTGATTGACATTGTGCTGGCAATGTATTTAAAACAAGGGTGCGCATGTTGAACTGGCAACTATGACGATTAGCACTACTATTACTACTACTACTACTACTACTACTGCTA   CTGCTGCTGATGAT T   CGTTCGCCGTTGCCATTGTTGCAAGAATGCAACCAGGTCTTGCCCGCTGCATTCGGAAGAAAGATGCAATGCGTGTACGCATTATGTAGTACCTTTTTTAAGCTTCTAAATGCAATTCGTTAGTTGAACGTTCTGCATTACATTGACGTGTTTATGGCTTGCAAAATTCCTCTCTTGTTAGGGGTGTTGTCAACAGCATGCTCTCCATATGCTTATTTTTAATTGTAACATACACAAACGGTTCAAACCAGCAGCATATGTCAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BX626232             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TCATAACAC  AAAAAAAAGAATTCCTTTGAGAAAAAAGCAGAATTAGTGGACGAATGCTTGAAATAAGTGTATTTTACTTCTGCTTGTATAGCCTTTTCGNANAAGATGTTTGTAGTAGAAGTGTTAGAAATGAGAAAGTAGCAGTAGGACAAAGGTAATTAANGTTAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BM588181             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ccgGGCAACTATGACGATTAGCACTACTATTACTACTACTACTACTACTACTACTGCTACTGCTGCTGCTGATGATATGGCCGTTCGCCGTTGCCATTGTTGCAAGAATGCAACCAGGTCTTGCCCGCTGCATTCGGAAGAAAGATGCAATGCGCGTACGCATTATGTAGTACCTTTTTTAAGCTCCTAAATGCAATGCGTTAGTTGAACGTTCTGCATTACATTGACGTGTTTATGGCTTGCAAGATTCCTCTCTTGTTAGGGGTGTTGTCAACAGCATGCTCTCCATATGCTTATTTTTAATTGTAACATACACAAACGGTTCAAACCAGCAGCATATGTCACGTTTGTGCAATTTGCGATCGAAGTAGACAACACATGGATAGATTTAATAAGTATTTCCTTTTCAAGTTTCATTTGCTATGCTACGGTACTGCGTTTCGATCCAGCTTCATGGGGAAATGGGGTGGTGTAGATCTCTATAATAAGGCTTAATAAGGCTTAATTAAGGTCCTGCAGGAATAATTAGCAAGCATGAAAAGAAACTAATCTTACGTAGATAATTCTGCGCATCCACCGAACCACACTCACGCACCTTTAAGCACTTTTGGACCAGACCGCAGGGTTAGAATTATTTGTGAGTGGCTGCTCTGTGAAAAGCTTGCAGCAATTTGAAATCATCAAATAAAAATTAATTATATAGCCCTG]
[+] EMBL BX616859             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GGCAACTATGACGATTAGCACTACTATTACTACTACTACTACTACTACTACTACTGCTACTGCTGCTGATGATATGGCCGTTCGCCGTTGCCATTGTTGCAAGAATGCAACCAGGTCTTGCCCGCTGCATTCGGAAGAAAGATGCAATGCGCGTACGCATTATGTAGTACCTTTTTTAAGCTCCTAAATGCAATGCGTTAGTTGAACGTTCTGCATTACATTGACGTGTTTATGGCTTGCAAGATTCCTCTCTTGTTAGGGGCGTTGTCAACAGCATGCTCTCCATATGCTTATTTTTAATTGT ACATACACAAACGGTTCAAACCAGCAGCATATGTCACGTTTGTGCAATTTGCGATCGAAGTAGACAACACATGGATAGATTTAATAAGTATTTCCTTTTCAAGTTTCGTTTGCTATGCTACGGTACTGCGTTTCGATCCAGCTTCATGGGGAAATGGGGTGGTGTAGATCTCTATAATAAGGCTTAATAAGGCTTAATTAAGGTCCTGCAGGAATAATTAGCAAGCATGAAAAGAAACTAATCTTACGTAGATAATTCTGCGCATCCACCAAACCACACTCACGCACCTTTAAGCACTTTTGGACCAGACCGCAGGGTTAGAATTATTTGTGAGTG                                                                ]


>consensus_6752#0 CCGCCCACGCGTCCGCATGGTTGCAAACCGCCGGTCGAAAAGGAACGGCAACCAAGTGCG TTGTTGCCGGCATGCACAAGCGCTAGAATAAAAGAGGAACCGCTAGACGATGTGGAGCAC CTCGATGAAGAGGAAAGGGAGATGCGACACAGCTCTAAAGTCCCTGGTGGAGAAGGGGCC GTGACCGGTGCAACTAAAACCATCTGTCCCGAGAGCACTAGTCAACCGTTGGCAGTGGTG TCTGCAAATGGCAAAAGTCATGCCAACGGTGCCAACGGCGTTAGTACCTCTACGAACGCT TCTTATCCACCGCACGACCGGCAGCGACAAGAACACAACCCACAGAGCAATCTAACAAGC TTATGATGACACAGACAGCGATCCATCGTCGAGGGATACGGAAACAAATGAGGTGGAGTT ATTGAGAGTTAACGAGTGACTGAAATAAGTGAATTTGAGTATATTTACTTCAGCGCATAT TTGTGTGTTGAAGTGACAAAAAAACCTAAACAAAAAGGTGTAAAAAGGTATAAAACGGCC CACCTGATGATTCTTATCCTCCGTTTTGATGAGGTCGAAGAGAATGAACAAATTAAGGAA GAGGTAGTAAGGTCCGAAAATGAATTGTTTCGGTTAAATTATTAGACACTAGCTTTTTTG TTAGTTAGTAAGTTTTGGAAACAGATTTTCTCAACTGGACTAGAGTTCATAACACAAAAA AAAAGAATTCCTTTGAGAAAAAAGCAGAATTAGTGGACGAATGCTTGAAATAAGTGTATT TTACTTCTGCTTGTATAGCCTTTTCGCAGAAGATGTTTGTAGTAGAAGTGTTAGAAATGA GAAAGTAGCAGTAGGACAAAGGTAATTAACGTTAGGAATCGTAGACCATCATCGCATCCT TACGATATTTTTATACACGTTTTTGTTCTTACATTGAAGCAAAAGCATGCCAATAGTGTT TGGGGAATAGAAGGACAAATGCCAGTGATTGACATTGTGCTGGCAATGTATTTAAAACAA GGGTGCGCATGTTGAACTGGCAACTATGACGATTAGCACTACTATTACTACTACTACTAC TACTACTACTGCTACTGCTGCTGCTGATGATATGGCCGTTCGCCGTTGCCATTGTTGCAA GAATGCAACCAGGTCTTGCCCGCTGCATTCGGAAGAAAGATGCAATGCGCGTACGCATTA TGTAGTACCTTTTTTAAGCTCCTAAATGCAATGCGTTAGTTGAACGTTCTGCATTACATT GACGTGTTTATGGCTTGCAAGATTCCTCTCTTGTTAGGGGTGTTGTCAACAGCATGCTCT CCATATGCTTATTTTTAATTGTAACATACACAAACGGTTCAAACCAGCAGCATATGTCAC GTTTGTGCAATTTGCGATCGAAGTAGACAACACATGGATAGATTTAATAAGTATTTCCTT TTCAAGTTTCATTTGCTATGCTACGGTACTGCGTTTCGATCCAGCTTCATGGGGAAATGG GGTGGTGTAGATCTCTATAATAAGGCTTAATAAGGCTTAATTAAGGTCCTGCAGGAATAA TTAGCAAGCATGAAAAGAAACTAATCTTACGTAGATAATTCTGCGCATCCACCGAACCAC ACTCACGCACCTTTAAGCACTTTTGGACCAGACCGCAGGGTTAGAATTATTTGTGAGTGG CTGCTCTGTGAAAAGCTTGCAGCAATTTGAAATCATCAAATAAAAATTAATTATATAGCC CTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)