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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6971#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1283 fasta sequence
[TCTTCCTCACATCATCCCTTGCTCGTCGCGGAGGACACAGATGAGCTTCGTTTGGTGAAATTTGACCTTTCTTTTGTAGCGGGCAGCTGTTTATCAGCAGCTTTTGGTGCTGTTTTGCTATTTTCCATCTGTTTGAAGGTGTTTTTCATGTGGTCCGATACGGTTTGTTTCCGGGCATAAGGCGTAGACGTGCGAATTGTGCTCTCCGTCGTTGATGCAGACGATTCGCTACCGGATGATTCCGAGGAGTCGAGGATGGTTCGTCCACGCTTTACCTTTTTCGTTGGCTTAAATTGAACTCGGTGCTGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCCACTTTTGCTCCGATTCTTCACATCATCGATGACGCGCGTTTTGGGCACCGATTTCAACGCACTTTTCAAGATGCTGCCCACATTCGTCTTTTTAAGCGCGTCGATGTTGACACC-CTTACTACTGCTGCCTCCTTTCGCAAGCTGCATTATCCTGTCCCTTGCCGATGCTTTCGACAGTTGCGTGGGCATTTTGAATGGCGTAATGTTCGGAATGCTTTCGACCAG-ACTGTTCAAATCCAACCT-AGACACTGTGCCCGGCGGCCCACTGGCACCTTCCGGCTCGATCGTCAGGTACGAGGAAATGATCGTCTTCTCTACCTGGTGCACAATGACCCGCTTGCTGCGATTGCTGTCCGAGTACACGCAGCTAGAATGGTTTTCCATTTCATACTGTTGCTTTGCCGTCTCGTTCAGTATCGAGACGTTCTCCTTGTGGGTCACGTCCATCTGGGCGCTTCCATCGTACTCCGTGAAGCGTGTTTCCCGCTCCTGCGTTATCTGC-TTGCCCGTGCCGGGCTGACACCCCTGCTGCAGCCACCGCTGTACGTGATCAACGCTGAGGGAAAAATTGCTATTAAAAATCTGCTCCATCCCGTTGCACTTCCACTCGGCGGTCCGTTGCTTCAGGGCAACCTGCAGCTGGTCCTTTAACGCAGCGTAACTGCTGCCCGACTGTTCATTCTCCTTGTCCGACGCATCATCATCATCGCTGCTTTCGCTCGCTTCTTCGACAGTTTGCTGCTGGTCGTCAGTTTCTTTATCCGTTTCCCCGTACAAGTCAACCGCATCGTCGAGCGTCAGACCGTTCTCATCGTTCTCGAATTGTTTGTTGTATTTATCTAACAAGTTTTTCCACGTAATATAACGATTGGCGATGGTTTTATCGTCCGGGAACACACCCTCCGCCTTTGGACTTTTCGATTTCCTGTTACTGGCCGGTTTAGGATTGTTAAG]
[+] EMBL CNS08JXJ [TCTTCCTCACATCATCCCTTGCTCGTCGCGGAGGACACAGATGAGCTTCGTTTGGTGAAATTTGACCTTTCTTTTGTAGCGGGCAGCTGTTTATCAGCAGCTTTTGGTGCTGTTTTGCTATTTTCCATCTGTTTGAAGGTGTTTTTCATGTGGTCCGATACGGTTTGTTTCCGGGCATAAGGCGTAGACGTGCGAATTGTGCTCTCCGTCGTTGATGCAGACGATTCGCTACCGGATGATTCCGAGGAGTCGAGGATGGTTCGTCCACGCTTTACCTTTTTCGTTGGCTTAAATTGAACTCGGTGCTGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCCACTTTTGCTCCGATTCTTCACATCATCGATGACGCGCGTTTTGGGCACCGATTTCAACGCACTTTTCAAGATGCTGCCCACATTCGTCTTTTTAAGCGCGTCGATGTTGACACC CTTACTACTGCTGCCTCCTTTCGCAAGCTGCATTATCCTGTCCCTTGCCGATGCTTTCGACAGTGGCGTGGGCATTTTGAATGGCGTAATGTTCGGAATGCTTTCGACCAG ACTGTTCAAATCCAACCT AGACACTGTGCCCGGCGGCCCACTGGCACCTTCCGGCTCGATCGTCAGGTACGAGGAAATGATCGTCTTCTCTACCTGGTGCACAATGACCCGCTTGCTGCGATTGCTGTCCGAGTACACGCAGCTAGAATGGTTTTCCATTTCATACTGTTGCTTTGCCGTCTCGTTCAGTATCGAGACGTTCTCCTTGTGGGTCACGTCCATCTGGGCGCTTCCATCGTACTCCGTGAAGCGTGTTTCCCGCTCCTGCGTTATCTGC TTGCCCGTGCCGGGCTGACACCCCTGCTGCAGCCACCGCTGTACGTGATCAACGCTGAGGGAA ]
[+] EMBL CNS08WTZ [ TTCCTCACATCATCCCTTGCTCGTCGCGGAGGACACAGATGAGCTTCGTTTGGTGAAATTTGACCTTTCTTTTGTAGCGGGCAGCTGTTTATCAGCAGCTTTTGGTGCTGTTTTGCTATTTTCCATCTGTTTGAAGGTGTTTTTCATGTGGTCCGATACGGTTTGTTTCCGGGCATAAGGCGTAGACGTGCGAATTGTGCTCTCCGTCGTTGATGCAGACGATTCGCTACCGGATGATTCCGAGGAGTCGAGGATAGTTCGTCCACGCTTTACCTTTTTCGTTGGCTTAAATTGAACTCGGTGCTGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCCACTTTTGCTCCGATTCTTCACATCATCGATGACGCGCGTTTTGGGCTCCGATTTCAACGCACTTTTCAAGATGCTGCCCACATTCGTCTTTTTAAGCGCGTCGATGTTGACACCGCTTACTACTGCTGCCTCCTTTCGCAAGCTGCATTATCCTGTCCCTTGCCGATGCTTTCGACAGTTGCGTGGGCATTTTGAATGGCGTAATGTTCGGAATGCTTTCGACCAGAACTGTTCAAATCCAACCTAAGACACTGTGCCCGGCGGCCCACTGGCACCTTCCGGCTCGATCGTCAGGT ]
[+] EMBL CNS08T3V [ CTCCGATTCTTAAAAAAATCGATGACGCGCGTTTTGGGCACCCTTTTCAACGCACTTTTCAAGATGCTGCCCAAATTCGTCTTTTTAAGCGCGTCGATGTTGACACC CTTACTACTGCTGCCTCCTTTCGCAAGCTGCATTATCCTGTCCCTTGCCGATGCTTTCGACAGTGGCGTGGGCATTTTGAATGGCGTAATGTTCGGAATGCTTTCGACCAG ACTGTTCAAATCCAACCT AGACACTGTGCCCGGCGGCCCACTGGCACCTTCCGGCTCGATCGTCAGGTACGAGGAAATGATCGTCTTCTCTACCTGGTGCACAATGACCCGCTTGCTGCGATTGCTGTCCGAGTACACGCAGCTAGAATGGTTTTCCATTTCATACTGTTGCTTTGCCGTCTCGTTCAGTATCGAGACGTTCTCCTTGTGGGTCACGTCCATCTGGGCGCTTCCATCGTACTCCGTGAAGCGTGTTTCCCGCTCCTGCGTTATCTGC TTGCCCGTGCCGGGCTGACACCCCTGCTGCAGCCACCGCTGTACGTGATCAACGCTGAGGGAAAAATTGCTATTAAAAATCTGCTCCATCCCGTTGCA ]
[-] EMBL CNS08T3U [ GCACTTTTCAAGATGCTGCCCACATTCGTCTTTTTAAGCGCGTCGATG TGACACC CTTACTACTGCTGCCTCCTTTCGCAAGCTGCATTATCCTGTCCCTTGCCGATGCTTTCGACAGTTGCGTGGGCATTTTGAATGGCGTAATGTTCGGAATGCTTTCGACCAG ACTGTTCAAATCCAACCT AGACACTGTGCCCGGCGGCCCACTGGCACCTTCCGGCTCGATCGTCAGGTACGAGGAAATGATCGTCTTCTCTACCTGGTGCACAATGACCCGCTTGCTGCGATTGCTGTCCGAGTACACGCAGCTAGAATGGTTTTCCATTTCATACTGTTGCTTTGCCGTCTCGTTCAGTATCGAGACGTTCTCCTTGTGGGTCACGTCCATCTGGGCGCTTCCATCGTACTCCGTGAAGCGTGTTTCCCGCTCCTGCGTTATCTGC TT TCCGTGCCGGGCTGACACCCCTGCTGCAGCCACCGCTGTACGTGATCAACGCTGAGGGAAAAATTGCTATTAAAAATCTGCTCCATCCCGTTGCACTTCCACTCGGCGGTCCGTTGCTTCAGGGCAACCTGCAGCTGGTCCTTTAACGCTTTGTAACTGCTGCCCGACTGTTCATTCTCCTTGTCCGACGCATCATCATCATCGCTG TTTTTTTCGCTTCTTCGACAGTTTGCTGCTGGTCGTCAGTTTCTTTATCCGTTTCCCCGTACAAGTCAACCGCATCGTCGAGCGTCAGACCGTTCTCATCGTTCTCGAATTGTTTGTTGTATTTATCTAACAAGTTTTTCCACGTAATATAACGATTGGCGATGGTTTTATCGTCCGGGAACACACCCTCCGCCTTTGGACTTTTCGATTTCCTGTTACTGGCCGGTTTAGGATTGTTAAG]
[-] EMBL CNS08WTY [ CGCGTCGATG TGACACC CTTACTACTGCTGCCTCCTTTCGCAAGCTGCATTATCCTGTCCCTTGCCGATGCTTTCGACAGTTGCGTGGGCATTTTGAATGGCGTAATGTTCGGAATGCTTTCGACCAG ACTGTTCAAATCCAACCT AGACACTGTGCCCGGCGGCCCACTGGCACCTTCCGGCTCGATCGTCAGGTACGAGGAAATGATCGTCTTCTCTACCTGGTGCACAATGACCCGCTTGCTGCGATTGCTGTCCGAGTACACGCAGCTAGAATGGTTTTCCATTTCATACTGTTGCTTTGCCGTCTCGTTCAGTATCGAGACGTTCTCCTTGTGGGTCACGTCCATCTGGGCGCTTCCATCGTACTCCGTGAAGCGTGTTTCCCGCTCCTGCGTTATCTGC TT TCCGTGCCGGGCTGACACCCCTGCTGCAGCCACCGCTGTACGTGATCAACGCTGAGGGAAAAATTGCTATTAAAAATCTGCTCCATCTCGTTGCACTTCCACTCGGCGGTCCGTTGCTTCAGGGCAACCTGCAGCTGGTCCTTTAACGCAGCGTAACTGCTGCCCGACTGTTCATTCACCTTGTCCGACGCATCATCATCATCGCTGCTTTCGCTCGCTTCTTCGACAGTTTGCTGCTGGTCGTCAGTTTCTTTATCCGTTTCCCCGTACAAGTCAACCGCATCGTCGAGCGTCAGACCGTTCTCATCGTTCTCGAATTGTTTGTTGTATTTATCTAACAAGTTTTTCCACGTAATATAACGATTGGCGATGGTTTTATCGTCCGGGAACACACCCTCCGCCTTTGGACTTTTCGATTTCCTGTTACTGGCCGGTTTAGGATTGTTAA ]
[-] EMBL CNS08JXI [ TGCCTCCTTTCGCAAGCTGCATTATCCTGTCCCTTGCCGATGCTTTCGACAGTTGCGTGGGCATTTTGAATGGCGTAATGTTCGGAATGCTTTCGACCAG ACTGTTCAAATCCAACCT AGACACTGTGCCCGGCGGCCCACTGGCACCTTCCGGCTCGATCGTCAGGTACGAGGAAATGATCGTCTTCTCTACCTGGTGCACAATGACCCGCTTGCTGCGATTGCTGTCCGAGTACACGCAGCTAGAATGGTTTTCCATTTCATACTGTTGCTTTGCCGTCTCGTTCAGTATCGAGACGTTCTCCTTGTGGGTCACGTCCATCTGGGCGCTTCCATCGTACTCCGTGAAGCGTGTTTCCCGCTCCTGCGTTATCTGCGTTG CCGTGCCGGGCTGACACCCCTGCTGCAGCCACCGCTGTACGTGATCAACGCTGAGGGAAAAATTGCTATTAAAAATCTGCTCCATCCCGTTGCACTTCCACTCGGCGGTCCGTTGCTTCAGGGCAACCTGCAGCTGGTCCTTTAACGCAGCGTAACTGCTGCCCGACTGTTCATTCTCCTTGTCCGACGCATCATCATCATCGCTGCTTTCGCTCGCTTCTTCGACAGTTTGCTGCTGGTCGTCAGTTTCTTTATCCGTTTCCCCGTACAAGTCAACCGCATCGTCGAGCGTCAGACCGTTCTCATCGTTCTCGAATTGTTTGTTGTATTTATCTAACAAGTTTTTCCACGTAATATAACGATTGGCGATGGTTTTATCGTCCGGGAACACACCCTCCGCCTTTGGACTTTTCGATTTCCTGTTACTGGCCGGTTTAGGATTGTTAA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||