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Anopheles gambiae
cluster # 7001 cluster # 7001       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7001#0 length = 1562 sequences # 6  

consensusID : consensus_7001#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1562
fasta sequence
                              [GTGATATATTTTTGTTTAATTTCCTACAATCTGTTAGCACATTAGCCACTTTTACACGCTATCGCTCACGTCCGGTTTGTCGGCTTACAGAACTATATTACGAACGCACGTCTATTGTTTTAATGAATAGAAA-AGAGAACACGATATATCATACCGTAACAATTTTGCAAAAATCAGAGCTGTGATGCCGTGCCGTTCCTTTTCTCACTTAACCACTATGTAGCCTTATCGATCTAGCAGAGCGAAGGAAGTAACGTGTTATTTCAAGATCGAAGAGAAATCGTTCTTGGTCCTTCTTGGTTGGATCGTTTCTGTTTTTTGTATGTGTGTGTGGCAGTGTGTTATTAAACAAGATAAGTTTTTGTTGCATTTTTAGTGCTCTTGTTCGTTTTCCTTTGCTGCTCTCGCTCTGGTTGAACAAATACAAATTATAGTGAAAACGATAGATAATATCAACGTAGCTGCTATTTACAAATGTACAATGACGAGTCAGGGCGCGTCTGGACGCCCTTCGCACCAGGGGAAACAACATTGCTATCGGGTTTAGTTTCTTTTTTAATGGTGAAATTTTCACTCAATCTGAAGCTCTCATATCTGTGGTATCCTAAAATGTAGAAGATGATCTTTTTTTTAACCTTATTTTAAGCACACGTGGTTCTCCATCAATAATGTGGATCC-ATTGCATTTGCTGCGTCTCGGAGTTGCGTCCCTGCCCTGGTCATATTTTAGTGCGAAGTATTTTGACTCGGCAGCGGGTGTGTAGTAGAATGATCCGCTATCCATTAACATAGGCTTGTTTCACGATGACTGCGTACTGGTATCTACTCGTAAAGCTGGCAAATATCAGCAAGTCTGTAACCTAAGCGAGTTCATCTCGTATCCACCTTTACTTTGCATTTGGTTCTGCAACACAGACAGATGGTTCGTGGTTAGCTCAACGTCGTTCGAGCCAATGTGACCGGTGTGTACAAAGTTGGTCGGGTTGCCGATCATCGATCGATCTATTCGCAGGCGCTGGTGGGTCCTCCGGCGGCGCGGGCTTTGCGGCTGGTGGAAGCAGCAGGAGAACCACTGCAGCCAGATGTCACCCGTGCTGGCCATCTTCTTGCCGGTGGTAATCGTCTGGCCGTGCTTTTGCTCACACGGTGGCAGCTGTGTCCGTTACCGGGATCGAGTACGAATCCGACGGGGGCGTTGTCTGCGCTTTCCGCTAGCGAGTTGATCCACAACACCAAGCGCCAAGTGGGGGACACAGGGGGAAGTCTACAGTCGTGTTGTGATCACTAGCTAGGCCAGAGCATGGAATTCCTCGACGCTTCGTCTACGAGAACCGGACCGGACGCACCCTGGTGGATAAAAGGTGAAATGCTTTTATTAAATTTTCACTTTTTTACTCGTTCGTGTTTTTTTTCAGTTGCAGGATGTTTAAGATGTTCTAAATTCTATTTCACTGCTCGTATAGGCATCACTTTTCGTGAGATGTAGCAAAGAATATACGGCCTTCTAAATAAAATTAACAGTAGCAGCAGCGCCAACGCACACGTCGGTCCGTCCTCACTCGC]

[+] EMBL CNS08M6W             [GTGATATATTTTTGTTTAATTTCCTACAATCTGTTAGCACATTAGCCACTTTTACACGCTATCGCTCACGTCCGGTTTGTCGGCTTACAGAACTATATTACGAACGCACGTCTATTGTTTTAATGAATAGAAA AGAGAACACGATATATCATACCGTAACAATTTTGCAAAAATCAGAGCTGTGATGCCGTTTCGTTCCTTTTCTCACTTAACCACTATGTAGCCTTATCGATCTAGCAGAGCGAAGGAAGTAACGTGTTATTTCAAGATCGAAGAGAAATCGTTCTTGGTCCTTCTTGGTTGGATCGTTTCTGTTTTTTGTATGTGTGTGTGGCAGTGTGTTATTAAACAAGATAAGTTTTTGTTGCATTTTTAGTGCTCTTGTTCGTTTTCCTTTGCTGCTCTCGCTCTGGTTGAACAAATACAAATTATAGTGAAAACGATAGATAATATCAACGTAGCTGCTATTTACAAATGTACAATGACGAGTCAGGGCGCGTCTGGACGCCCTTCGCACCAGGGGAAACAACATTGCTATCGGGTTTAGTTTCTTTTTTAATGGTGAAATTTTCACTCAATCTGAAGCTCTCATATCTGTGGTATCCTAAAATGTAGAAGATGATCTTTTTTTTAACCTTATTTTAAGCACACGTGGTTCTCCATCAATAATGTGGATCC ATTGCATTTGCTGCGTCTCGGAGTTGCGTCCCTGCCCTGGTCATATTTTAGTGCGAAGTATTTTGACTCGGCAGCGGGTGTGTAGTAGAATGATCCGCTATCCATTAACATAGGCTTGTATCACGATGACTGCGTACTGGTATCTACTCGTAAAGCTGGCAAATATCAGCAAGTCTGTAACCTAAGCGAGTTCATCTCGTATCCACCTTTACTTTGCATTTGGTTCTGCAACACAGACAGATGGTTCGTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CNS08F6L             [       ttgTTTGTTTAATTTCCTACAATCTGTTAGCACATTAGCCACTTTTACACGCTATCGCTCACGTCCGGTTTGTCGGCTTACAGAACTATATTACGAACGCACGTCTATTGTTTTAATGAATAGAAA AGAGAACACGATATATCATACCGTAACAATTTTGCAAAAATCAGAGCTGTGATGCCGTGCCGTTCCTTTTCTCACTTAACCACTATGTAGCCTTACCGATCTAGCAGAGCGAAGGAAGTAACGTGTTATTTCAAGATCGAAGAGAAATCGTTCTTGGTCCTTCTTGGTTGGATCGTTTCTGTTTTTTGTATGTGTGTGTGGCAGTGTGTTATTAAACAAGATAAGTTTTTGTTGCATTTTTAGTGCTCTTGTTCGTTTTCCTTTGCTGCTCTCGCTCTGGTTGAACAAATACAAATTATAGTGAAAACGATAGATAATATCAACGTAGCTGCTATTTACAAATGTACAATGACGAGTCAGGGCGCGTCTGGACGCCCTTCGCACCAGGGGAAACAACATTGCTATCGGGTTTAGTTTCTTTTTTAATGGTGAAATTTTCACTCAATCTGAAGCTCTCATATCTGTGGTATCCTAAAATGTAGAAGATGATCTTTTTTTTAACCTTATTTTAAGCACACGTGGTTCTCCATCAATAATGTGGATCC ATTGCATTTGCTGCGTCTCGGAGTTGCGTCCCTGCCCTGGTCATATTTTAGTGCGAAGTATTTTGACTCGGCAGCGGGTGTGTAGTAGAATGATCCGCTATCCATTAACATAGGCTTGTTTCACGATGACTGCGTACTGGTATCTACTCGTAAAGCTGGCAAATATCAGCAAGTCTGTAACCTAAGCGAGTTCATCTCGTATCCACCTTTACTTTGCATTTGGTTCTGCAACACAGACAGATGGTTCGTGGTTAGCTCAACGTCGTTCGAGCCAATGTGACCGGTGTGTACAAAGTTGGTCGGGTTGCCGATCATCGATCGATCTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CNS08RPR             [                       CTACAATTTGTTAGCACATTAGCCACTTTTACACGCTATCGCTCACGTCCGGTTTGTCGGCTTACAGAACTATATTACGAACGCACGTCTATTGTTTTAATGAATAGAAATAGAGAACACGATATATCATACCGTAACAATTTTGCAAAAATCAGAGCTGTGATGCCGTGCCGTTCCTTTTCTCACTTAACCACTATGTAGCCTTATCGATCTAGCAGAGCGAAGGAAGTAACGTGTTATTTCAAGATCGAAGAGAAATCGTTCTTGGTCCTTCTTGGTTGGATCGTTTCTGTTTTTTGTATGTGTGTGTGGCAGTGTGTTATTAAACAAGATAAGTTTTTGTTGCATTTTTAGTGCTCTTGTTCGTTTTCCTCTGCTGCTCTCGCTCTGGTTGAACAAATACAAATTATAGTGAAAACGATAGATAATATCAACGTAGCTGCTATTTACAAATGTACAATGACGAGTCAGGGCGCGTCTGGACGCCCTTCGCACCAGGGGAAACAACATTGCTATCGGGTTTAGTTTCTTTTTTAATGGTGAAATTTTCACTCAATCTGAAGCTCTCATATCTAAAGTATCCTAAAATGTAGAAGATGATCTTTTTTTTAACCTTATTTTAAGCACACGTGGTTCTCCATCAATAATGTGGATCCTATTGCATTTGCTGCGTCTCGGAGTTGCGTCCCTGCCCTGGTCATATTTTAGTGCGAAGTATTTTGACTCGGCAGCGGGTGTGTAGTAGAATGATCCGCTATCCATTAACATAGGCTTGTTTCACGATGACTGCGTACTGGTATCTACTCGTAAAGCTGGCAAATATCAGCAAGTCTGTAACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CNS08F6K             [                                                                                                                            GAATAGATA AGAGAACACGATATATCATACCGTAACAATTTTGCAAAAATCAGAGCTGTGATGCCGTGCCGTTCCTTTTCTCACTTAACCACTATGTAGCCTTACCGATCTAGCAGAGCGAAGGAAGTAACGTGTTATTTCAAGATCGAAGAGAAATCGTTCTTGGTCCTTCTTGGTTGGATCGTTTCTGTTTTTTGTATGTGTGTGTGGCAGTGTGTTATTAAACAAGATAAGTTTTTGTTGCATTTTTAGTGCTCTTGTTCGTTTTCCTTTGCTGCTCTCGCTCTGGTTGAACAAATACAAATTATAGTGAAAACGATAGATAATATCAACGTAGCTGCTATTTACAAATGTACAATGACGAGTCAGGGCGCGTCTGGACGCCCTTCGCACCAGGGGAAACAACATTGCTATCGGGTTTAGTTTCTTTTTTAATGGTGAAATTTTCACTCAATCTGAAGCTCTCATATCTGTGGTATCCTAAAATGTAGAAGATGATCTTTTTTTTAACCTTATTTTAAGCACACGTGGTTCTCCATCAATAATGTGGATCC ATTGCATTTGCTGCGTCTCGGAGTTGCGTCCCTGCCCTGGTCATATTTTAGTGCGAAGTATTTTGACTCGGCAGCGGGTGTGTAGTAGAATGATCCGCTATCCATTAACAGAGGCTTGTTTCACGATGACTGCGTACTGGTATCTACTCGTAAAGCTGGCAAATATCAGCAAGTCTGTAACCTAAGCGAGTTCATCTCGTATCCACCTTTACTTTGCATTTGGTTCTGCAACACAGACAGATGGTTCGTGGTTAGCTCAACGTCGTTCGAGCCAATGTGACCGGTGTGTACAAAGTTGGTCGGGTTGCCGATCATCGATCGATCTATTCGCAGGCGCTGGTGGGTCCTCCGGCGGCGCGGGCTTTGCGGCTGGTGGAAGCAGCAGGAGAACCACTGCAGCCAGATGTCACCCGTGCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CNS08M6V             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACTGCGTACTGGTATCTACTCGTAAAGCTGGCAAATATCAGCAAGTCTGTAACCTAAGCGAGTTCATCTCGTATCCACCTTTACTTTGCATTTGGTTCTGCAACACAGACAGATGGTTCGTGGTTAGCTCAACGTCGTTCGAGCCAATGTGACCGGTGTGTACAAAGTTGGTCGGGTTGCCGATCATCGATCGATCTATTTGCAGGCGCTGGTGGGTGGTCCGGCGGCGCGGGCTTTGCGGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CNS08RPQ             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTCGTTCGAGCCAATGTGACCGGTGTGTACAAAGTTGGTCGGGTTTTTTTTCATCGATCGATCTATTCGCAGGCGCTGGT GGTCCTCCGGCGGCGCGGGCTTTGCGGCTGGTGGAAGCAGCAGGAGAACCACTGCAGCCAGATGTCACCCGTGCTGGCCATCTTCTTGCCGGTGGTAATCGTCTGGCCGTGCTTTTGCTCACACGGTGGCAGCTGTGTCCGTTACCGGGATCGAGTACGAATCCGACGGGGGCGTTGTCTGCGCTTTCCGCTAGCGAGTTGATCCACAACACCAAGCGCCAAGTGGGGGACACAGGGGGAAGTCTACAGTCGTGTTGTGATCACTAGCTAGGCCAGAGCATGGAATTCCTCGACGCTTCGTCTACGAGAACCGGACCGGACGCACCCTGGTGGATAAAAGGTGAAATGCTTTTATTAAATTTTCACTTTTTTACTCGTTCGTGTTTTTTTTCAGTTGCAGGATGTTTAAGATGTTCTAAATTCTATTTCACTGCTCGTATAGGCATCACTTTTCGTGAGATGTAGCAAAGAATATACGGCCTTCTAAATAAAATTAACAGTAGCAGCAGCGCCAACGCACACGTCGGTCCGTCCTCACTCGC]


>consensus_7001#0 GTGATATATTTTTGTTTAATTTCCTACAATCTGTTAGCACATTAGCCACTTTTACACGCT ATCGCTCACGTCCGGTTTGTCGGCTTACAGAACTATATTACGAACGCACGTCTATTGTTT TAATGAATAGAAAAGAGAACACGATATATCATACCGTAACAATTTTGCAAAAATCAGAGC TGTGATGCCGTGCCGTTCCTTTTCTCACTTAACCACTATGTAGCCTTATCGATCTAGCAG AGCGAAGGAAGTAACGTGTTATTTCAAGATCGAAGAGAAATCGTTCTTGGTCCTTCTTGG TTGGATCGTTTCTGTTTTTTGTATGTGTGTGTGGCAGTGTGTTATTAAACAAGATAAGTT TTTGTTGCATTTTTAGTGCTCTTGTTCGTTTTCCTTTGCTGCTCTCGCTCTGGTTGAACA AATACAAATTATAGTGAAAACGATAGATAATATCAACGTAGCTGCTATTTACAAATGTAC AATGACGAGTCAGGGCGCGTCTGGACGCCCTTCGCACCAGGGGAAACAACATTGCTATCG GGTTTAGTTTCTTTTTTAATGGTGAAATTTTCACTCAATCTGAAGCTCTCATATCTGTGG TATCCTAAAATGTAGAAGATGATCTTTTTTTTAACCTTATTTTAAGCACACGTGGTTCTC CATCAATAATGTGGATCCATTGCATTTGCTGCGTCTCGGAGTTGCGTCCCTGCCCTGGTC ATATTTTAGTGCGAAGTATTTTGACTCGGCAGCGGGTGTGTAGTAGAATGATCCGCTATC CATTAACATAGGCTTGTTTCACGATGACTGCGTACTGGTATCTACTCGTAAAGCTGGCAA ATATCAGCAAGTCTGTAACCTAAGCGAGTTCATCTCGTATCCACCTTTACTTTGCATTTG GTTCTGCAACACAGACAGATGGTTCGTGGTTAGCTCAACGTCGTTCGAGCCAATGTGACC GGTGTGTACAAAGTTGGTCGGGTTGCCGATCATCGATCGATCTATTCGCAGGCGCTGGTG GGTCCTCCGGCGGCGCGGGCTTTGCGGCTGGTGGAAGCAGCAGGAGAACCACTGCAGCCA GATGTCACCCGTGCTGGCCATCTTCTTGCCGGTGGTAATCGTCTGGCCGTGCTTTTGCTC ACACGGTGGCAGCTGTGTCCGTTACCGGGATCGAGTACGAATCCGACGGGGGCGTTGTCT GCGCTTTCCGCTAGCGAGTTGATCCACAACACCAAGCGCCAAGTGGGGGACACAGGGGGA AGTCTACAGTCGTGTTGTGATCACTAGCTAGGCCAGAGCATGGAATTCCTCGACGCTTCG TCTACGAGAACCGGACCGGACGCACCCTGGTGGATAAAAGGTGAAATGCTTTTATTAAAT TTTCACTTTTTTACTCGTTCGTGTTTTTTTTCAGTTGCAGGATGTTTAAGATGTTCTAAA TTCTATTTCACTGCTCGTATAGGCATCACTTTTCGTGAGATGTAGCAAAGAATATACGGC CTTCTAAATAAAATTAACAGTAGCAGCAGCGCCAACGCACACGTCGGTCCGTCCTCACTC GC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)