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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7177#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1312 fasta sequence
[TCAATGCCCACCGTTTGAAGCATCTTTTTCTGCTTGGCTTGAGTTTCTTCCTGTTGCTGCTCTGCCGCTGCCAGCTCTTCCTTGAAGTCTTCCAGTATGCGATTGATGCTTTCCATTGCATCATCATCGCCCCGCTTCTCCGACACTTCGTTGGTTGTTTCGGCGTTATTTTCATCCTCACGGAACGAATCAAGCAGCGCTTTATTCTTGGCATCCACCTTGGCCACCAGCTTTTTTCCTCCCACCTCTAAGTCGTGTACCAAGCGCACGGCACGTAACCCCCCGGCAGGATCATATTCGCAGAATCCAAAGGTTGATACACGTTTCCAGTTTACCACTGTGCCGCAAGCGGCTAGTATTTGTTTTATCATGGGATCTGGTACCTTTTCGCTGATATTGCCTACGAATACGGTTACTATCGGACCATCGTACACGGGTTCTGGTTGGGGTGGTGGTTTGTTATTGTACATCTGTGGACGAGACCCGATTGTCGCTCCGGATCGGAAACTCCCTCCTCGGTTAGACGGGGGTGGCTGGTTCATAGCAGGCATCATCGGTTGCTGTACAATTGGTGGAGCTATGTACGGTATCCCAGGGGACACGATGGTGGTTCCCGGAGGACGAGGATGGAAAGACATGATGCTGATTTGTCAAAGTGCCGTTGCTTATCCAAAGAGCAGCATCAATTGAACCACACAACGTTTTGACAATAATTTGCTGAAATAATTCACACTTGTGTGTTTTGATTAAGGGGAGTGAACGCAACCTCTACAAAACTAAAGCTTGAATCGATGTTGTTCAGCTTGTAATCTAAGTGAAGACACGACTCTGATCTGAGTTAGCTGCCAGTCGTTTGCACACCAGAAGGTTTGCTCCGGAAGCTTCAGGGAAGCGGATGATACAGCTTGTCAACAATCGATTTATACTGTTGCCTTTACACCCACCAGCAGCCCAAAACAGTTGCTATGGCGGTACCTACACAATTTGATTCCGCTTGCCAACTAACCCTCCCGGTTCCTTGCTTCGATAACGAGAGGCACACACTTTGCACACAGCTACACGTACGTAACCCCAGCCCTGCGGACTCGCGGAGGCGCGCTAAGATGAAAACGAAGAACCTTTCTGCTTCTTATTTTGCTCTTCAAATTCCACAAATGATGCTAACTTTTACAGTTCACTTACAGTGAATCCCAAATTGGGAGGACTGGGACGACCTTCATTGCACGAGTCTAGCTAAACGCGAGCCGGTTTTAGCAGGAATTGAAGAATTATTTCTTTAAGATTTGCTGGCCCGTGCGTGCAAAAAAAGCGG]
[+] EMBL CNS08I7G [TCAATGCCCACCGTTTGAAGCATCTTTTTCTGCTTGGCTTGAGTTTCTTCCTGTTGCTGCTCTGCCGCTGCCAGCTCTTCCTTGAAGTCTTCCAGTATGCGATTGATGCTTTCCATTGCATCATCATCGCCCCGCTTCTCCGACACTTCGTTGGTTGTTTCGGCGTTATTTTCATCCTCACGGAACGAATCAAGCAGCGCTTTATTCTTGGCATCCACCTTGGCCACCAGCTTTTTTCCTCCCACCTCTAAGTCGTGTACCAAGCGCACGGCACGTAACCCCCCGGCAGGATCATATTCGCAGAATCCAAAGGTTGATACACGTTTCCAATTTAC ]
[+] EMBL CNS08ECO [ TTTCTGCTTGGCTTGAGTTTCTTCCTGTTGCTGCTCTGCCGCTGCCAGCTCTTCCTTGAAGTCTTCCAGTATGCGATTGATGCTTTCCATTGCATCATCATCGCCCCGCTTCTCCGACACTTCGTTGGTTGTTTCGGCGTTATTTTCATCCTCACGGAACGAATCAAGCAGCGCTTTATTCTTGGCATCCACCTTGGCCACCAGCTTTTTTCCTCCCACCTCTAAGTCGTGTACCAAGCGCACGGCACGTGAACCCCCGGCAGGATCATATTCGCAGAATCCAAAGGTTGATACACGTTTCCAGTTTACCACTGTGCCGCAAGCGGCTAGTATTTGTTTTATCATGGGATCTGGTACCTTTTCGCTGATATTGCCTACGAATACGGTTACTATCGGACCATCGTACACGGGTTCTGGTTGGGGTGGTGGTTTGTTATTGTACATCTGTGGACGAGACCCGATTGTCGCTCCGGATCGGAAACTCCCTCCTCGGTTAGACGGGGGTGGCTGGTTCATAGCAGGCATCATCGGTTGCTGTACAATTGGTGGATCTATGTACGGTATCCCAGGGGACACGATGGTGGTTCCCGGAGGACGAGGATGGAAAGACATGATGCCGATTTGTCAAAGTGCCGTTGCTTATCCAAAGAGCAGCATCAATTGAACCACACAACGTTTTGACAATAATTTGCTGAAATAATTCACACTTGTGTGTTTTGATTAAGGGGAGTGAACGCAACCTCTACAAAACTAAAGCTTGAATCGATGTTGTTCAGCTTGTAATCTAAGTGAAGACACGACTCTGATCTGAGTTAGCTGCCAGTCGTTTGCACACCAGAAGGTTTGCTCCGGAAGCTTCAGGGAAGCGGATGATACAGCTTGTCAACAATC ]
[-] EMBL CNS08ECN [ ATTCGCAGAATCCAAAGGTTGATACACGTTTCCAGTTTACCACTGT CCGCAAGCGGCTAGTATTTGTTTTATCATGGGATCTGGTACCTTTTCGCTGATATTGCCTACGAATACGGTTACTATCGGACCATCGTACACGGGTTCTGGTTGGGGTGGTGGTTTGTTATTGTACATCTGTGGACGAGACCCGATTGTCGCTCCGGATCGGAAACTCCCTCCTCGGTTAGACGGGGGTGGCTGGTTCATAGCAGGCATCATCGGTTGCTGTACAATTGGTGGAGCTATGTACGGTATCCCAGGGGACACGATGGTGGTTCCCGGAGGACGAGGATGGAAAGACATGATGCCGATTTGTCAAAGTGCCGTTGCTTATCCAAAGAGCAGCATCAATTGAACCACACAACGTTTTGACAATAATTTGCTGAAATAATTCACACTTGTGTGTTTTGATTAAGGGGAGTGAACGCAACCTCTACAAAACTAAAGCTTGAATCGATGTTGTTCAGCTTGTAATCTAAGTGAAGACACGACTCTGATCTGAGTTAGCTGCCAGTCGTTTGCACACCAGAAGGTTTGCTCCGGAAGCTTCAGGGAAGCGGATGATACAGCTTGTCAACAATCGATTTATACTGTTGCCTTTACACCCACCAGCAGCCCAAAACAGTTGCTATGGCGGTACCTACACAATTTGATTCCGCTTGCCAACTAACCCTCCCGGTTCCTTGCTTCGATAACGAGAGGCACACACTTTGCACACAGCTACACGTACGTAACCCCAGCCCTGCGGACTCGCGGAGGCGCGCTAAGATGAAAACGAAGAACCTTTCTGCTT ]
[-] EMBL CNS08I7F [ GCGGCTAGTATTTGTTTTATCATGGGATCTGGTACCTTTTCGCTGATATTGCCTACGAATACGGTTACTATCGGACCATCGTACACGGGTTCTGGTTGGGGTGGTGGTTTGTTATTGTACATCTGTGGACGAGACCCGATTGTCGCTCCGGATCGGAAACTCCCTCCTCGGTTAGACGGGGGTGGCTGGTTCATAGCAGGCATCATCGGTTGCTGTACAATTGGTGGAGCTATGTACGGTATCCCAGGGGACACGATGGTGGTTCCCGGAGGACGAGGATGGAAAGACATGATGCTGATTTGTCAAAGTGCCGTTGCTTATCCAAAGAGCAGCATCAATTGAACCACACAACGTTTTGACAATAATTTGCTGAAATAATTCACACTTGTGTGTTTTGATTAAGGGGAGTGAACGCAACCTCTACAAAACTAAAGCTTGAATCGATGTTGTTCAGCTTGTAATCTAAGTGAAGACACGACTCTGATCTGAGTTAGCTGCCAGTCGTTTGCACACCAGAAGGTTTGCTCCGGAAGCTTCAGGTTTTTTGATGATACAGTTTGTCAACAATCGATTTATACTGTTGCCTTTACACCCACCAGCAGCCCAAAACAGTTGCTATGGCGGTACCTACACAATTTGATTCCGCTTGCCAACTAACCCTCCCGGTTCCTTGCTTCGATAACGAGAGGCACACACTTTGCACACAGCTACACGTACGTAACCCCAG CCTGCGGACTCGCGGAGGCGCGCTAAGATGAAAACGAAGAACCTTTCTGCTT ]
[-] EMBL BM580160 [ GGATCGGAAACTCCCTCCTCGGTTAGACGGGGGTGGCTGGTTCATAGCAGGCATCATCGGTTGCTGTACAATTGGTGGAGCGATGTACGGTATCCCAGGGGAAACGATGGTGGTTCCCGGAGGACGAGGATGGAAAGACATGATGCTGATTTGTCAAAGTGCCGTTGCTTATCCAAAGAGCAGCATCAATTGAACCACACAACGTTTTGACAATAATTTGCTGAAATAATTCACACTTGTGTGTTTTGATTAAGGGGAGTGAACGCAACCTCTACAAAACTAAAGCTTGAATCGAAGTTGTTCAGCTAGTATCCTAAGTGAAAACACGACTGTGATCTGAGTTAGCTGCCAGTCGTTTGCACACCAGAAGGTTTGCTCCGGAAGCTTCAGGGAAGCGGATGATACAGCTTGTCAACAATCGATTTATACTGTTGCCTTCACACCCACCAGCAGCCCAAAACAGTTGCTATGGCGGTACCTACACAATTTGATTCCGCTTGCCAACTAACCCTCCCGGTTCCTTGCTTCGATAACGAGCGG ]
[-] EMBL BM575271 [ ACGAGGATGGAAAGACATGATGCTGATTTGTCAAAGTGCCGTTGCTTATCCAAAGAGCAGCATCAATTGAACCACACAACGTTTTGACAATAATTTGCTGAAATAATTCACACTTGTGTTTTTTGATTAAGGGGAGTGAACGCAACCTCTACAAAACTAAAGCTTGACTCGATGTTGTTCAGCTTGTAATCTAAGTGAAGACACGACTCTGATCTGAGTTAGCTGCCAGTCGTTTGCACACCAGAAGGTTTGCTCCGGAAGCTTCAGGGAAGCGGATGATACAGCTTGTCAACAATCGATTTATACTGTTGCCTTTACACCCACCAGCAGCCCAAAACAGTTGCTATGGCGGTACCTACACAATTTGATTCCGCTTGCCAACTAACCCTCCCGGTTCCTTGCTTCGATAACGAGAGGCACACACTTTGCACACAGCTACACGCACGTAACCCCAGCCCTGCGGACTCGCGGAGGCGCGCTAAGATGAAAACGAAGAACCTTTCTGCTTCTTATTTTGCTCTTCAAATTCCACAAATGATGCTAACTTTTACAGTTCACTTACAGTGAATCCCAAATTGGGAGGACTGGGACGACCTTCATTGCACGAGTCTAGCTAAACGCGAGCCGGTTTTAGCAGGAATTGAAGAATTATTTCTTTAAGATTTGCTGGCCCGTGCGTGCAAAAAAAGCGG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||