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Anopheles gambiae
cluster # 7195 cluster # 7195       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7195#0 length = 1129 sequences # 6  

consensusID : consensus_7195#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1129
fasta sequence
                              [TTGGACAAGGTTACGGGATTCCTATTTTTCTTGTCTAAGTTACTCCTTGCTTCTGGAATGGCAGCCGTAACGTACACGTATTTTGATAGTGATCTACCAAAGATGCAACTAAATTACCCTTTTGTGCCAGCTGTACTCGTTTTCATTGGAACGTTCATTATTGCGTCCATATTCTTCAGCGTTTACTCTGTTGCTGTTGACACCTTATTTTTGTGTTTTTTGGAAGACATAGAACGAAACGATGGCAGTGCCGAACGACCGTTTTATATGTCCAGAGGATTGCAAAAAATATTGGGGAAGAAGCAAAAGTAAATTGAAGATATCACCAAAGATTTATTGTCTACCGTCAACACTGTCGCGGGGTAGCAGCACCAATCAACTGCAGTTCTTCCTATGGACTATTTGGATAATGCGTGACCAAGCAAATATTTCCACGCACATAGAATTCTAAACCTTTAAGCCAATACAGCCCATTTGTAAATATTTGGATGAAACAGCTGCTTAATAGTGTATGTCATTTTGTTCACATATGAACTAATTTAAGTCTATATTTTGATACTAATTTATACATAATGCGTACCATGGGTATGATGAAATGAAATTCAACGAGAATTTAGAAGAACAGATGAGAGTAGGCATTTAAATCAAGAATATATTGTGATTGATAATATTGGTGGATCTTATAAGAATTCAAAACTCATAAATGCAAATTACACCTTGATAATTTTCTAATGTATTGAATATTTCTACAACCATCACTAGATGAATTGTAATTATTATATACATACAGTAATTTACAGTAAGTAAAAAACTATACGACCAAAGTATGTACTGTTCGGTAAATATTGGAAATTCATATCTGGAATTGATAGTGAAACATTAGATTGTACTATAATGATGATCAAAGGAACAGATTTCTTGTTTTGACAATGGTATAGTAATGAAAATATCAATTTTTCAAATTTAACTTACACCCGTGTTTTATTCATAATGTTGTGGAAAACATTGAAGAAAGCATAAAAACTCGGTGTTCTTATAGTTTTGAAAAGAATTGTATACACTAATATTC-ATGTGAAGC-ATACGTTCTAGCCTTTCCTTCTGATAAAAAAAAAAACACCTCGGGGCGATC]

[+] EMBL BX625495             [TTGGACAAGGTTACGGGATTCCTATTTTTCTTGTCTAAGTTACTCCTTGCTTCTGGAATGGCAGCCGTAACGTACACGTATTTTGATAGTGATCTACCAAAGATGCAACTAAATTACCCTTTTGTGCCAGCTGTACTCGTTTTCATTGGAACGTTCATTATTGCGTCCATATTCTTCAGCGTTTACTCTGTTGCTGTTGACACCTTATTTTTGTGTTTTTTGGAAGACATAGAACGAAACGATGGCAGTGCCGAACGACCGTTTTATATGTCCAGAGGATTGCAAAAAATATTTGGGAAGAAGCAAAAGTAAATTGAAGATATCACCAAAGATTTATTGTCTACCGTCAACACTGTCGCGGGGTAGCAGCACCAATCAACTGCAGTTCTTCCTATGGACTATTTGGATAATGCGTGACCAAGCAAATATTTCCACGCACATAGAATTCTAAACC  TAAGCCAATACAGCCCATTTGTAAATATTTGGATGAAACAGCTGCTTAATAGTGTATGTCATTTTGTTCACATATGAACTAATTTAAGTCTATATTTTGATACTAATTTATACATAATGCGTACCATGGGTATGATGAAATGAAATTCAACGAGAATTTAGAAGAACAGATGAGAGTAGGCATTTAAATCAAGAATATATTGTGATTGATAATATTGGTGGATCTTATAAGAATTCAAAACTCATAAATGCNAATTACACCTTGATAATTTTCTAATGNATTGAATATTTCTACCACCATCACTAGATGAATTGTAATTATTATATACATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BX623568             [                                                                                                          AACTAAATTACCCTTTTGTGCCAGCTGTACTCGTTTTCATTGGAACGTTCATTATTGCGTCCATATTCTTCAGCGTTTACTCTGTTGCTGTTGACACCTTATTTTTGTGTTTTTTGGAAGACATAGAACGAAACGATGGCAGTGCCGAACGACCGTTTTATATGTCCAGAGGATTGCAAAAAATATTGGGGAAGAAGCAAAAGTAAATTGAAGATATCACCAAAGATTTATTGTCTACCGTCAACACTGTCGCGGGGTAGCAGCACCAATCAACTGCAGTTCTTCCTATGGACTATTTGGATAATGCGTGACCAAGCAAATATTTCCACGCACATAGAATTCTAAACCTTTAAGCCAATACAGCCCATTTGTAAATATTTGGATGAAACAGCTGCTTAATAGTGTATGTCATTTTGTTCACATATTAACTAATTTAAGTCTATATTTTGATACTAATTTATACATAATGCGTACCATGGGTATGATGAAATGAAATTCAACGAGAATTTAGAAGAACAGATGAGAGTAGGCATTTAAATCAAGAATATATTGTGATTGATAATATTGGTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BX626317             [                                                                                                                                                                                                                                                    GCAGTGCCGAACGACCGTTTTATATGTCCAGAGGATTGCAAAAAATATTGGGGAAGAAGCAAAAGTAAATTGAAGATATCACCAAAGATTTATTGTCTACCGTCAACACTGTCGCGGGGTAGCAGCACCAATCAACTGCAGTTCTTCCTATGGACTATTTGGATAATGCGTGACCAAGCTAATATTTCCACTCACATAGAATTCTAAACCTTTAAGCCAATACAGCCCATTTGTAAATATTTGGATGAAACAGCTGCTTAATAGTGTATGTCATTTTGTTCACATATGAACTAATTTAAGTCTATATTTTGATACTAATTTATACATAATGCGTACCATGGGTATGATGAAATGAAATTCAACGAGAATTTAGAAGAAGAGATGAGAGTAGGCATTTAAATCAAGAATATATTGTGATTGATAATATTGGTGGATCTTATAAGAATTCAAAACTCATAAATGCAAATTACACCTTGATAATTTTCTAATGTATTGAATATTTCTACAACCATCACTAGATGAATTGTAATTACTATATACATACAGTAATTTACAGTAAGTAAAAAACTATACGACCAAAGTATGTACTGTTCGGTAAATATTGGAAATTCATATCTGGAATTGATAGTGAAACATTAGATTGTACTAT                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BX613251             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTGGATGAAACAGCTGTTTAATAGTGTATGTCATTTTGTTCAGATATGAACTAATTTAAGTCTATATTTTGATACTAATTTATACATAATGCGTATAATGGGTATGAAGAAATGAAATTCAAGGAGAATTTAGAAGAACAGATGAGAGTAGGCATTTAAATTAAGAATATATTGTGATTGATAATATTGGTGGATCTTATAAGAATTCAAAACTTATAAATGCAAATTACAAGTTGATAATTTTCTAATGTATTGAATATTTCTACAACCATCACTAGATGAATTGTAATTA TATATACATACAGTAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL AL931104             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCTATATTTTGATACTAATTTATACATAATGCGTACCATGGGTATGATGAAATGAAATTCAACGAGAATTTAGAAGAACAGATGAGAGTAGGCATTTAAATCAAGAATATATTGTGATTGATAATATTGGTGGATCTTATAAGAATTCAAAACTCATAAATGCAAATTACACCTTGATAATTTTCTAATGTATTGAATATTTCTACAACCATCACTAGATGAATTGTAATTATTATATAAATACAGTAATTTACAGTAAGTAAAAAACTATACGACCAAAGTATGTACTGTTCGGTAAATATTGGAAATTCATATCTGGAATTGATAGTGAAACATTAGATTGTACTATAATGATGATCAAAGGAACAGATTTCTTGTTTTGACAATGGTATAGTAATGAAAATATCAATTTTTCAAATTTAACTTACACCCGTGTTTTATTCATAATGTTGTGGAAAACATTGAAGAAAGCATAAAAACTCGGTGTTCTTATAGTTTTGAAAAGAATTGTATACACTAATATTC ATGTGAAGC ATACGTTCTAGCCTTTCCTTCTGATAAAAAAAAAAACACCTCGGGGCGATC]
[+] EMBL BM626426             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ccgATGAAATTCAACGAGAATTTAGAAGAACAGATGAGAGTAGGCATTTAAATCAAGAATATATTGTGATTGATAATATTGGTGGATCTTATAAGAATTCAAAACTCATAAATGCAAATTACACCTTGATAATTTTCTAATGTATTGAATATTTCTACAACCATCACTAGATGAATTGTAATTACTATATACATACAGTAATTTACAGTAAGTAAAAAACTATACGACCAAAGTATGTACTGTTCGGTAAATATTGGAAATTCATATCTGGAATTGATAGTGAAACATTAGATTGTACTATAATGATGATCAAAGGAACAGATTTCTTGTTTTGACAATGGTATAGTAATGAAAATATCAATTTTTCAAATTTAACTTACACCCGTGTTTTATTCATAATGTTGTGGAAAACATTGAAGAAAGCATAAAAACTCGGTGTTCTTATAGTTTTGAAAAGAATTGTATACACTAATATTCAATGTGAAGCAATACGTTC                                           ]


>consensus_7195#0 TTGGACAAGGTTACGGGATTCCTATTTTTCTTGTCTAAGTTACTCCTTGCTTCTGGAATG GCAGCCGTAACGTACACGTATTTTGATAGTGATCTACCAAAGATGCAACTAAATTACCCT TTTGTGCCAGCTGTACTCGTTTTCATTGGAACGTTCATTATTGCGTCCATATTCTTCAGC GTTTACTCTGTTGCTGTTGACACCTTATTTTTGTGTTTTTTGGAAGACATAGAACGAAAC GATGGCAGTGCCGAACGACCGTTTTATATGTCCAGAGGATTGCAAAAAATATTGGGGAAG AAGCAAAAGTAAATTGAAGATATCACCAAAGATTTATTGTCTACCGTCAACACTGTCGCG GGGTAGCAGCACCAATCAACTGCAGTTCTTCCTATGGACTATTTGGATAATGCGTGACCA AGCAAATATTTCCACGCACATAGAATTCTAAACCTTTAAGCCAATACAGCCCATTTGTAA ATATTTGGATGAAACAGCTGCTTAATAGTGTATGTCATTTTGTTCACATATGAACTAATT TAAGTCTATATTTTGATACTAATTTATACATAATGCGTACCATGGGTATGATGAAATGAA ATTCAACGAGAATTTAGAAGAACAGATGAGAGTAGGCATTTAAATCAAGAATATATTGTG ATTGATAATATTGGTGGATCTTATAAGAATTCAAAACTCATAAATGCAAATTACACCTTG ATAATTTTCTAATGTATTGAATATTTCTACAACCATCACTAGATGAATTGTAATTATTAT ATACATACAGTAATTTACAGTAAGTAAAAAACTATACGACCAAAGTATGTACTGTTCGGT AAATATTGGAAATTCATATCTGGAATTGATAGTGAAACATTAGATTGTACTATAATGATG ATCAAAGGAACAGATTTCTTGTTTTGACAATGGTATAGTAATGAAAATATCAATTTTTCA AATTTAACTTACACCCGTGTTTTATTCATAATGTTGTGGAAAACATTGAAGAAAGCATAA AAACTCGGTGTTCTTATAGTTTTGAAAAGAATTGTATACACTAATATTCATGTGAAGCAT ACGTTCTAGCCTTTCCTTCTGATAAAAAAAAAAACACCTCGGGGCGATC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)