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Anopheles gambiae
cluster # 7296 cluster # 7296       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7296#0 length = 1322 sequences # 7  

consensusID : consensus_7296#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1322
fasta sequence
                              [CGTGCCCCGGATATACAGCTAATCCACGGCTGCCCTTGCTCGATATGGTCTGCAATGCCGTGCATTGCGAGGACGAGTGTGTTACGTAGCTACGTACCGTTTTATCAACCATTTCATGTATATGTGATATAATATCAGTCCGCGGCATCTCACAGTATCTTTCCGGTGCAAACAGTCATAACATCGGATACGGTACGGTCCCCGTGCTAATGCACGGTGTTGGTAAGATGCTGATTCGGCAGCACCAATTGAGAGTGACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCAAGTGCAAAATTAGACAAACAGACCTTACATCACCAACGTGAATCACCCTGCAATTGATAGCTAGTATTAAAGGTATGGTTTGTATATAACTGCCTGAAGTTAACAGTACGCCGGACACAGTATGTCCTTTCTTGAAGAAGCACCGTTTCTTATCTCAACCCGCATGGCTGCAACATTCCATCGTGTAAAGTGATACTTTATTTAATTGGATTTTATTACCGTGTTTTATTTGTTTTTGCCACGAGGGGGCAACAATACGGGGGCAGTATTAGTCTTTCGCTTTTGTTTTTATTCAAAATTCGTCGAGAGAGAACGTGTTGTGCGGAATATTTTACAGAACGTCCCATCCCCTTTCTGCCATATGGTAAGATAGTCGATAGCGCAGGATGTGCTCCTTCTCTGTAACAGTTTCCGCAACGACGGCCATTCCAACTGCAACACAATCCTACAGCAAAAAGGCACAAAGGTGTTAAAAAGAATTGCAATACTGCCAAAGTCATACGTTCTCGTACGTAAATCAAAATCGTTTGTTTTAAAATCACATTTTTTTATATAATTATTGTCGGTTTACTGCGCATCATATCCCTTTACGCTGGAGATATCATCCGGGAGGTGTGCGCGTATGCGAACATGATTTGAAGATTTCCTACCTTCCTGTTTCATTATGTTTTGTTGATATTTTAGTTGTATTATTAGGTTTTCCGGCGCTAGTCGTGGTGCGCTTTAACGTGCGATACGAATTATGGTTCGGTTATAAACTTTATTATTTTGGCGAAATTTGTTTTTCTCTCGTACTTGCAAATTCTCTCTACATTATGGTTCATGTGCTTTTTTCATGGTGAGCTATTAGTGTTCCAATCTTTCCGTTCTCTCTTTTCCCCTTTTCTAACAAATGTATCCTGCCTCTCCCTGTTATCACATTTTGTAATAGCCTAGCGATTGCTAATGTCCCCCGCTGTCCATATTTGTTTTACACGAACATTAGGATTTTCGTTTTTATTTAAGAATTACGCTAAATAGGCAATAAAGTGTATGACTAAG]

[+] EMBL AGA280854            [CGTGCCCCGGATATACAGCTAATCCACGGCTGCCCTTGCTCGATATGGTCTGCAATGCCGTGCATTGCGAGGACGAGTGTGTTACGTAGCTACGTACCGTTTTATCAACCATTTCATGTATATGTGATATAATATCAGTCCGCGGCATCTCACAGTATCTTTCCGGTGCAAACAGTCATAACATCGGATACGGTACGGTCCCCGTGCTAATGCACGGTGTTGGTAAGATGCTGATTCGGCAGCACCAATTGAGAGTGACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCAAGTGCAAAATTAGACAAACAGACCTTACATCACCAACGTGAATCACCCTGCAATTGATAGCTAGTATTAAAGGTATGGTTTGTATATAACTGCCTGAAGTTAACAGTACGCCGGACACAGTATGTCCTTTCTTGAAGAAGCACCGTTTCTTATCTCAACCCGCATGGCTGCAACATTCCATCGTGTAAAGTGATACTTTATTTAATTGGATTTTATTACCGTGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AGA283776            [CGTGCCCCGGATATACAGCTAATCCACGGCTGCCCTTGCTCGATATGGTCTGCAATGCCGTGCATTGCGAGGACGAGTGTGTTACGTAGCCACGTACCGTTTTATCAACCATTTCATGTATATGTGATATAATATCAGTCCGCAGCATCTCACAGTATCTTTCCGGTGCAAACAGTCATAACATCGGATACGGTACGATCCCCACACTAATGCATGGTGTTGGTAAGATGCTGATTTGGCAGCACCAATTGAGAGTGAC  TGTGTGTGTGTGTGTGTTCAAGTGCAAAATTAGACAAACAGACATTACATCACCAACGTGAATCACCCTGCAATTGATAGCTAGTATTAAAGGTATGGTTTGTATATAACTGCCTGAAGTTAACAGTACGCCGGACACAGTATGTCCTTTCTTGAAGAAGCACCGTTTCTTATCTCAACCCGCATGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL AGA280016            [CGTGCCCCGGATATACAGCTAATCCACGGCTGCCCTTGCTCGATATGGTCTGCAATGCCGTGCATTGCGAGGACGAGTGTGTTACGTAGCTACGTACCGTTTTATCAACCATTTCATGTATATGTGATATAATATCAGTCCGCGGCATCTCACAGTATCTTTCCGGTGCAAACAGTCATAACATCGGATACGGTACGGTCCCCGTGCTAATGCACGGTGTTGGTAAGATGCTGATTCGGCAGCACCAATTGAGAGTGACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCAAGTGCAAAATTAGACAAACAGACCTTACATCACCAACGTGAATCACCCTGCAATTGATAGCTAGTATTAAAGGTATGGTTTGTATATAACTGCCTGAAGTTAACAGTACGCCGGACACAGTATGTCCTTTCTTGAAGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BX608944             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTTGAAGAAGCACCGTTTCTTATCTCAACCCGCATGGCTGCAACATTCCATCGTGTAAAGTGATACTTTATTTAATTGGATTTTATTACCGTGTTTTATTTGTTTTTGCCACGAGGGGGCAACAATACGGGGGCAGTATTAGTCTTTCGCTTTTGTTTTTATTCAAAATTCGTCGAGAGAGAACGTGTTGTGCGGAATATTTTACAGAACGTCCCATCCCCTTTCTGCCATATGGTAAGATAGTCGATAGCGCAGGATGTGCTCCTTCTCTGTAACAGTTTCCGCAACGACGGCCATTCCAACTGCAACACAATCCTACAGCAAAAAGGCACAAAGGTGTTAAAAAGAATTGCAATACTGCCAAAGTCATACGTTCTCGTACGTAAATCAAAATCGTTTGTTTTAAAATCACATTTTTTTATATAATTATTGTCGGTTTACTGCGCATCATATCCCTTTACGCTGGAGATATCATCCGGGAGGTGTGCGCGTATGCGAACATGATTTGAAGATTTCCTACCTTCCTGTTTCATTATGTTTTGTTGATATTTTAGTTGTATTATTAGGTTTTCCGGCGCTAGTCGTGGTGCGCTTTAACGTGCGATACGAATTATGGTTCGGTTATAAACTTTATTATTTTGGCGAAATTTGTTTTTCT                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL AGA281712            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cGCAATACTGCCAAAGTCATACGTTCTCGTACGTAAATCAAAATCGTTTGTTTTAAAATCACATTTTTTTATATAGTTATTGTCGGTTTACTGCGCATCATATCCCTTTACGCTGGAGATATCATCCTGGAGGTGTGCGCGTACGCGAACATGATTTGAAGATTTCCTACCCTCCTGTTTCATTATGTTTTGTTGATATTTTAGTTGTATTATTAGGTTTTCCGGCGCTAGTCGTGGTGCGCTTTAACGTGCGATACGAATTATGGTTCGGTTATAAACTTTATTATTTTGGCGAAATTTGTTTTTCTCTCGTACTTGCAAATTCTCTCTACATTATGGTTCATGTGCTTTTTTCATGGTGAGCTATTAGTGTTCCAATCTTTCCGTTCTCTCTTTTCCCCTTTTCTAACAAATGTATCCTGCCTCTCCCTGTTATCACATTTTGTAATAGCCTAGCGA                                                                                                      ]
[-] EMBL AGA285067            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAATCGTTTGTTTTAAAATCACATTTTTTTATATAATTATTGTCGGTTTACTGCGCATCATATCCCTTTACGCTGGAGATATCATCCGGGAGGTGTGCGCGTATGCGAACATGATTTGAAGATTTCCTACCTTCCTGTTTCATTATGTTTTGTTGATATTTTAGTTGTATTATTAGGTTTTCCGGCGCTAGTCGTGGTGCGCTTTAACGTGCGATACGAATTATGGTTCGGTTATAAACTTTATTATTTTGGCGAAATTTGTTTTTCTCTCGTACTTGCAAATTCTCTCTACATTATGGTTCATGTGCTGTTTTCATGGTGAGCTATTAGTGTTCCAATCTTTCCGATCTCTCTTTTCCCCTTTTCTAACAAATGTCTCCTGCCACTCCCTGTTATCACGTTTTGTAATAGCCTAGCAATTGCTAATGTCCCCCGCTGTCCATATTTGTTTTACACGAACAT                                                           ]
[-] EMBL AGA282476            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCATATCCCTTTACGCTGGAGATATCATCCTGGAGGTGTGCGCGTACGCGAACATGATTTGAAGATTTCCTACCCTCCTGTTTCATTATGTTTTGTTGATATTTTAGTTGTATTATTAGGTTTTCCGGCGCTAGTCGTGGTGCGCTTTAACGTGCGATACGAATTATGGTTCGGTTATAAACTTTATTATTTTGGCGAAATTTGTTTTTCTCTCGTACTTGCAAATTCTCTCTACATTATGGTTCATGTGCTTTTTTCATGGTGAGCTATTAGTGTTCCAATCTTTCCGTTCTCTCTTTTCCCCTTTTCTAACAAATGTATCCTGCCTCTCCCTGTTATCACATTTTGTAATAGCCTAGCGAATGCTAA CTACTCCGCTGTCCCTATTTGTTTTACACGAACATTAGGATTTTCGTTTTTATTTAAGAATTACGCTAAATAGGCAATAAAGTGTATGACTAAG]


>consensus_7296#0 CGTGCCCCGGATATACAGCTAATCCACGGCTGCCCTTGCTCGATATGGTCTGCAATGCCG TGCATTGCGAGGACGAGTGTGTTACGTAGCTACGTACCGTTTTATCAACCATTTCATGTA TATGTGATATAATATCAGTCCGCGGCATCTCACAGTATCTTTCCGGTGCAAACAGTCATA ACATCGGATACGGTACGGTCCCCGTGCTAATGCACGGTGTTGGTAAGATGCTGATTCGGC AGCACCAATTGAGAGTGACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCAAGTGCAAAATTAGACAAAC AGACCTTACATCACCAACGTGAATCACCCTGCAATTGATAGCTAGTATTAAAGGTATGGT TTGTATATAACTGCCTGAAGTTAACAGTACGCCGGACACAGTATGTCCTTTCTTGAAGAA GCACCGTTTCTTATCTCAACCCGCATGGCTGCAACATTCCATCGTGTAAAGTGATACTTT ATTTAATTGGATTTTATTACCGTGTTTTATTTGTTTTTGCCACGAGGGGGCAACAATACG GGGGCAGTATTAGTCTTTCGCTTTTGTTTTTATTCAAAATTCGTCGAGAGAGAACGTGTT GTGCGGAATATTTTACAGAACGTCCCATCCCCTTTCTGCCATATGGTAAGATAGTCGATA GCGCAGGATGTGCTCCTTCTCTGTAACAGTTTCCGCAACGACGGCCATTCCAACTGCAAC ACAATCCTACAGCAAAAAGGCACAAAGGTGTTAAAAAGAATTGCAATACTGCCAAAGTCA TACGTTCTCGTACGTAAATCAAAATCGTTTGTTTTAAAATCACATTTTTTTATATAATTA TTGTCGGTTTACTGCGCATCATATCCCTTTACGCTGGAGATATCATCCGGGAGGTGTGCG CGTATGCGAACATGATTTGAAGATTTCCTACCTTCCTGTTTCATTATGTTTTGTTGATAT TTTAGTTGTATTATTAGGTTTTCCGGCGCTAGTCGTGGTGCGCTTTAACGTGCGATACGA ATTATGGTTCGGTTATAAACTTTATTATTTTGGCGAAATTTGTTTTTCTCTCGTACTTGC AAATTCTCTCTACATTATGGTTCATGTGCTTTTTTCATGGTGAGCTATTAGTGTTCCAAT CTTTCCGTTCTCTCTTTTCCCCTTTTCTAACAAATGTATCCTGCCTCTCCCTGTTATCAC ATTTTGTAATAGCCTAGCGATTGCTAATGTCCCCCGCTGTCCATATTTGTTTTACACGAA CATTAGGATTTTCGTTTTTATTTAAGAATTACGCTAAATAGGCAATAAAGTGTATGACTA AG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)