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Anopheles gambiae
cluster # 7795 cluster # 7795       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7795#0 length = 1054 sequences # 8  

consensusID : consensus_7795#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1054
fasta sequence
                              [GCATCTCCCCGTTCTCGTACTCG-ATGTACTCGTAGCGCCGGGTGCCGCCCGGTGCCGCCGGGCAGATCCACATGTCCGAGTCGATGTACTCGCAGTCGTAGATGCGGCCGGCACAC-TTGGGCTGCTGGGAGCAGTACAGCTCCTTGTAGCACTGGTGCTGCTCGTGCCCGTACTTGTAGTGCGAGCACGTTTCCCGGCACGTGTTGTCCGTCGTCATGTCGACCTCGTTCTCGACGTAGCCCTGGACCAGGCGGGTGAACTGCACGTACGTG-ACGTTCTCGCGATGCGCCCCACGGTCCGGATCGCACCGCCAGTACTCGCCGCTCGTCTGGTTCATCACGTTCCTTACCAGCTGCTGGGTGCGGGCGAGCCGGGTCTGCAGCTCGTTCCGACGGGCCTGCGATTCCACCGTAAAGTTACCTTGGCCCTGGGTTTTGAGCAGCATGTAGGAGAACTGCATCATGATGTAGCCCTTCAGTTCGGTCGTTGCGATCGACTCGTACAGCACGTAGATGAGCTGCTGGGGTGACAGCCCGAAGCTGCAGAGGACGCTTCTTGCCGTCTCGTTTAGCTGGGAGAAGATGTCCTGGCGGCCGGGCGGCAACAGCACCTGGGTGCTSCCGGTGACCAGCAGCTCGAGGTTGTGCAGCAGCTCGATCACGCTGTCCGACTTGCTCACGTCGACCGTGGCCTGCGCGAACTGGGTAAGCGTCAGCTGCTCGACCGGCGTGTCCGTCCGCAGCAGCTGGTACATGCTGGCCTCCCGCCGCTCGACCAGCCGCACGATCATGTACAGCTTCTCGAGCCGCTCGACCAACCGGTTCCGGTGGCCGAAGCTCTCGATCACGTCGTGCACGCGCTGCCCGAGGATATCGACCATGGCCGTTTGGCTTTCGCGCATCTCCGCCGACAGCGTCTGGATGGTGTGCATGATGCGCAGGTCCTGGTTGAAGTTGATCGGGGACGGTTTGCTGTCGCCGAGCTGCATCTCCGCCACATCGACCGCGATGCGCAGCAGCACCTTGGTCGTTTCGCTCAGCGCCAGCCAGCCCGG]

[-] EMBL AL932787             [GCATCTCCCCGTTCTCGTACTCGAATGTACTCGTAGCGCCGGGTGCCGCCCGGTGCCGCCGGGCAGATCCACATGTCCGAGTCGATGTACTCGCAGTCGTAGATGCGGCCGGCACACTTTGGGCTGCTGGGAGCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL AGA281465            [         CGTTCTCGTACTCG ATGTACTCGTAGCGCCGGGTGCCGCCCGGTGCCGCCGGGCAGATCCACATGTCCGAGTCGATGTACTCGCAGTCGTAGATGCGGCCGGCACAC TT GACTGCTGGGAGCAGTACAGCTCCTTGTAGCACTGGTGCTGCTCGTGCCCGTACTTGTAGTGCGAGCACGTTTCCCGGCACGTGTTGTCCGTCGTCATGTCGACCTCGTTCTCGACGTAGCCCTGGACCAGGCGGGTGAACTGCACGTACGTG ACGTTCTCGCGATGCGCCCCACGGTCCGGATCGCACCGCCAGTACTCGCCGCTCGTCTGGTTCATCACGTTCCTTACCAGCTGCTGGGTGCGGGCGAGCCGGGTCTGCAGCTCGTTCCGACGGGCCTGCGATTCCACCGTAAAGTTACCTTGGCCCTGGGTTTTGAGCAGCATGTAGGAGAACTGCATCATGATGTAGCCCTTCAGTTCGGTCGTTGCGATCGACTCGTACAGCACGTAGATGAGCTGCTGGGGTGACAGCCCGAAGCTGCAGAGGACGCTTCTTGCCGTCTCGTTTAGCTGGGAGAAGATGTCCTGGCGGCCGGGCGGCAACAGCACCTGGGTGCTSCCGGTGACCAGCAGCTCGAGGTTGTGCAGCAGCTCGATCACGCTGTCCGACTTGCTCACGTCGACCGTGGCCTGCGCGAACTGGGTAAGCGTCAGCTGCTCGACCGGCGTGTCCGTCCGCAGCAGCTGGTACATGCTGGCCTCCCGCCGCTCGACCAGCCGCACGATCATGTACAGCTTCTCGAGCCGCTCGACCAACCGGTTCCGGTGGCCGAAGCTCTCGATCACGTCGTGCA                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL AGA283782            [         CGTTCTCGTACTCG ATGTACTCGTAGCGCCGGGTGCCGCCCGGTGCCGCCGGGCAGATCCACATGTCCGAGTCGATGTACTCGCAGTCGTAGATGCGGCCGGCACAC TTGGGCTGCTGGGAGCAGTACAGCTCCTTGTAGCACTGGTGCTGCTCGTGCCCGTACTTGTAGTGCGAGCACGTTTCCCGGCACGTGTTGTCCGTCGTCATGTCGACCTCGTTCTCGACGTAGCCCTGGACCAGGCGGGTGAACTGCACGTACGTG ACGTTCTCGCGATGCGCCCCACGGTCCGGATCGCACCGCCAGTACTCGCCGCTCGTCTGGTTCATCACGTTCCTTACCAGCTGCTGGGTGCGGGCGAGCCGGGTCTGCAGCTCGTTCCGACGGGCCTGCGATTCCACCGTAAAGTTACCTTGGCCCTGGGTTTTGAGCAGCATGTAGGAGAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL AGA283677            [         CGTTCTCGTACTCG ATGTACTCGTAGCGCCGGGTGCCGCCCGGTGCCGCCGGGCAGATCCACATGTCCGAGTCGATGTACTCGCAGTCGTAGATGCGGCCGGCACAC TTGGGCTGCTGGGAGCAGTACAGCTCCTTGTAGCACTGGTGCTGCTCGTGCCCGTACTTGTAGTGCGAGCACGTTTCCCGGCACGTGTTGTCCGTCGTCATGTCGACCTCGTTCTCGACGTAGCCCTGGACCAGGCGGGTGAACTGCACGTACGTG ACGTTCTCGCGATGCGCCCCACGGTCCGGATCGCACCGCCAGTACTCGCCGCTCGTCTGGTTCATCACGTTCCTTACCAGCTGCTGGGTGCGGGCGAGCCGGGTCTGCAGCTCGTTCCGACGGGCCTGCGATTCCACCGTAAAGTTACCTTGGCCCTGGGTTTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL BM599958             [          GTTCTCGTACTCG ATGTACTCGTAGCGCCGGGCGCCGCCCGGTGCCGCCGGGCAGATCCACATGTCCGAGTCGATGTACTCGCAGTCGTAGATGCGGCCGGCACAC TTGGGCTGCTGGGAGCAGTACAGCTCCTTGTAGCACTGGTGCTGCTCGTGCCCGTACTTGTAGTGCGAGCACGTTTCCCGGCACGTGTTGTCCGTCGTCATGTCGACCTCGTTCTCGACGTAGCCCTGGACCAGGCGGGTGAACTGCACGTACGTG ACGTTCTCGCGATGCGCCCCACGGTCCGGATCGCACCGCCAGTACTCGCCGCTCGTCTGGTTCATCcgg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL AGA281481            [            tyTCGTACTCG ATGTACTCGTAGCGCCGGGTGCCGCCCGGTGCCGCCGGGCAGATCCACATGTCCGAGTCGATGTACTCGCAGTCGTAGATGCGGCCGGCACAC TTGGGCTGCTGGGAGCA TACAGCTCCTTGTAGCACTGGTGCTGCTCGTGCCCGTACTTGTAGTGCGAGCACGTTTCCCGGCACGTGTTGTCCGTCGTCATGTCGACCTCGTTCTCGACGTAGCCCTGGACCAGGCGGGTGAACTGCACGTACGTGAACGTTCTCGCGATGCGCCCCACGGTCCGGATCGCACCGCCAGTACTCGCCGCTCGTCTGGTTCATCACGTTCCTTACCAGCTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL BM578860             [                                                                           TCCGAGTCGATGTACTCGCAGTCGTAGATGCGGCCGGCACAC TTGGGCTGCTGGGAGCAGTACAGCTCCTTGTAGCACTGGTGCTGCTCGTGCCCGTACTTGTAGTGCGAGCACGTTTCCCGGCACGTGTTGTCCGTCGTCATGTCGACCTCGTTCTCGACGTAGCCCTGGACCAGGCGGGTGAACTGCACGTACGTG ACGTTCTCGCGATGCGCCCCACGGTCCGGATCGCACCGCCAGTACTCGCCGCTCGTCTGGTTCATCACGTTCCTTACCAGCTGCTGGGTGCGGGCGAGCCGGGTCTGCAGCTCGTTCCGACGGGCCTGCGATTCCACCGTAAAGTTACCTTGGCCCTGGGTTTTGAGCAGCATGTAGGAGAATTGCATCATGATGTAGCCCTTCAGTTCGGTCGTTGCGATCGACTCGTACAGCACGTAGATGAGCTGCTGGGGTGACAGCCCGAAGCTGCAGAGGACGCTTCTTGCCGTCTCGTTTAGCTGGGAGAAGATGTCCTGGCGGCCGGGCGGCAACAGCACCTGGGTGCTGCCGGTGACCAGCAGCTCGAGGTTGTGCAGCAGCTCGATCACGCTGTCCGACTTGCTCACGTCGACCGTGGCCTGCGCGAACTGGGTAAGCGTCAGCTGCTCGACCGGCGTGTCCGTCCcgg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL AGA282112            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AGCAGCTCGATCACGCTGTCCGACTTGCTCACGTCGACCGTGGCCTGCGCGAACTGGGTAAGCGTCAGCTGCTCGACCGGCGTGTCCGTCCGCAGCAGCTGGTACATGCTGGCCTCCCGCCGCTCGACCAGCCGCACGATCATGTACAGCTTCTCTAGCCGCTCGACCAACCGGTTCCGGTGGCCGAAGCTCTCGATCACGTCGTGCACGCGCTGCCCGAGGATATCGACCATGGCCGTTTGGCTTTCGCGCATCTCCGCCGACAGCGTCTGGATGGTGTGCATGATGCGCAGGTCCTGGTTGAAGTTGATCGGGGACGGTTTGCTGTCGCCGAGCTGCATCTCCGCCACATCGACCGCGATGCGCAGCAGCACCTTGGTCGTTTCGCTCAGCGCCAGCCAGCCCGG]


>consensus_7795#0 GCATCTCCCCGTTCTCGTACTCGATGTACTCGTAGCGCCGGGTGCCGCCCGGTGCCGCCG GGCAGATCCACATGTCCGAGTCGATGTACTCGCAGTCGTAGATGCGGCCGGCACACTTGG GCTGCTGGGAGCAGTACAGCTCCTTGTAGCACTGGTGCTGCTCGTGCCCGTACTTGTAGT GCGAGCACGTTTCCCGGCACGTGTTGTCCGTCGTCATGTCGACCTCGTTCTCGACGTAGC CCTGGACCAGGCGGGTGAACTGCACGTACGTGACGTTCTCGCGATGCGCCCCACGGTCCG GATCGCACCGCCAGTACTCGCCGCTCGTCTGGTTCATCACGTTCCTTACCAGCTGCTGGG TGCGGGCGAGCCGGGTCTGCAGCTCGTTCCGACGGGCCTGCGATTCCACCGTAAAGTTAC CTTGGCCCTGGGTTTTGAGCAGCATGTAGGAGAACTGCATCATGATGTAGCCCTTCAGTT CGGTCGTTGCGATCGACTCGTACAGCACGTAGATGAGCTGCTGGGGTGACAGCCCGAAGC TGCAGAGGACGCTTCTTGCCGTCTCGTTTAGCTGGGAGAAGATGTCCTGGCGGCCGGGCG GCAACAGCACCTGGGTGCTSCCGGTGACCAGCAGCTCGAGGTTGTGCAGCAGCTCGATCA CGCTGTCCGACTTGCTCACGTCGACCGTGGCCTGCGCGAACTGGGTAAGCGTCAGCTGCT CGACCGGCGTGTCCGTCCGCAGCAGCTGGTACATGCTGGCCTCCCGCCGCTCGACCAGCC GCACGATCATGTACAGCTTCTCGAGCCGCTCGACCAACCGGTTCCGGTGGCCGAAGCTCT CGATCACGTCGTGCACGCGCTGCCCGAGGATATCGACCATGGCCGTTTGGCTTTCGCGCA TCTCCGCCGACAGCGTCTGGATGGTGTGCATGATGCGCAGGTCCTGGTTGAAGTTGATCG GGGACGGTTTGCTGTCGCCGAGCTGCATCTCCGCCACATCGACCGCGATGCGCAGCAGCA CCTTGGTCGTTTCGCTCAGCGCCAGCCAGCCCGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)