These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7795#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1054 fasta sequence [GCATCTCCCCGTTCTCGTACTCG-ATGTACTCGTAGCGCCGGGTGCCGCCCGGTGCCGCCGGGCAGATCCACATGTCCGAGTCGATGTACTCGCAGTCGTAGATGCGGCCGGCACAC-TTGGGCTGCTGGGAGCAGTACAGCTCCTTGTAGCACTGGTGCTGCTCGTGCCCGTACTTGTAGTGCGAGCACGTTTCCCGGCACGTGTTGTCCGTCGTCATGTCGACCTCGTTCTCGACGTAGCCCTGGACCAGGCGGGTGAACTGCACGTACGTG-ACGTTCTCGCGATGCGCCCCACGGTCCGGATCGCACCGCCAGTACTCGCCGCTCGTCTGGTTCATCACGTTCCTTACCAGCTGCTGGGTGCGGGCGAGCCGGGTCTGCAGCTCGTTCCGACGGGCCTGCGATTCCACCGTAAAGTTACCTTGGCCCTGGGTTTTGAGCAGCATGTAGGAGAACTGCATCATGATGTAGCCCTTCAGTTCGGTCGTTGCGATCGACTCGTACAGCACGTAGATGAGCTGCTGGGGTGACAGCCCGAAGCTGCAGAGGACGCTTCTTGCCGTCTCGTTTAGCTGGGAGAAGATGTCCTGGCGGCCGGGCGGCAACAGCACCTGGGTGCTSCCGGTGACCAGCAGCTCGAGGTTGTGCAGCAGCTCGATCACGCTGTCCGACTTGCTCACGTCGACCGTGGCCTGCGCGAACTGGGTAAGCGTCAGCTGCTCGACCGGCGTGTCCGTCCGCAGCAGCTGGTACATGCTGGCCTCCCGCCGCTCGACCAGCCGCACGATCATGTACAGCTTCTCGAGCCGCTCGACCAACCGGTTCCGGTGGCCGAAGCTCTCGATCACGTCGTGCACGCGCTGCCCGAGGATATCGACCATGGCCGTTTGGCTTTCGCGCATCTCCGCCGACAGCGTCTGGATGGTGTGCATGATGCGCAGGTCCTGGTTGAAGTTGATCGGGGACGGTTTGCTGTCGCCGAGCTGCATCTCCGCCACATCGACCGCGATGCGCAGCAGCACCTTGGTCGTTTCGCTCAGCGCCAGCCAGCCCGG] [-] EMBL AL932787 [GCATCTCCCCGTTCTCGTACTCGAATGTACTCGTAGCGCCGGGTGCCGCCCGGTGCCGCCGGGCAGATCCACATGTCCGAGTCGATGTACTCGCAGTCGTAGATGCGGCCGGCACACTTTGGGCTGCTGGGAGCAG ] [+] EMBL AGA281465 [ CGTTCTCGTACTCG ATGTACTCGTAGCGCCGGGTGCCGCCCGGTGCCGCCGGGCAGATCCACATGTCCGAGTCGATGTACTCGCAGTCGTAGATGCGGCCGGCACAC TT GACTGCTGGGAGCAGTACAGCTCCTTGTAGCACTGGTGCTGCTCGTGCCCGTACTTGTAGTGCGAGCACGTTTCCCGGCACGTGTTGTCCGTCGTCATGTCGACCTCGTTCTCGACGTAGCCCTGGACCAGGCGGGTGAACTGCACGTACGTG ACGTTCTCGCGATGCGCCCCACGGTCCGGATCGCACCGCCAGTACTCGCCGCTCGTCTGGTTCATCACGTTCCTTACCAGCTGCTGGGTGCGGGCGAGCCGGGTCTGCAGCTCGTTCCGACGGGCCTGCGATTCCACCGTAAAGTTACCTTGGCCCTGGGTTTTGAGCAGCATGTAGGAGAACTGCATCATGATGTAGCCCTTCAGTTCGGTCGTTGCGATCGACTCGTACAGCACGTAGATGAGCTGCTGGGGTGACAGCCCGAAGCTGCAGAGGACGCTTCTTGCCGTCTCGTTTAGCTGGGAGAAGATGTCCTGGCGGCCGGGCGGCAACAGCACCTGGGTGCTSCCGGTGACCAGCAGCTCGAGGTTGTGCAGCAGCTCGATCACGCTGTCCGACTTGCTCACGTCGACCGTGGCCTGCGCGAACTGGGTAAGCGTCAGCTGCTCGACCGGCGTGTCCGTCCGCAGCAGCTGGTACATGCTGGCCTCCCGCCGCTCGACCAGCCGCACGATCATGTACAGCTTCTCGAGCCGCTCGACCAACCGGTTCCGGTGGCCGAAGCTCTCGATCACGTCGTGCA ] [+] EMBL AGA283782 [ CGTTCTCGTACTCG ATGTACTCGTAGCGCCGGGTGCCGCCCGGTGCCGCCGGGCAGATCCACATGTCCGAGTCGATGTACTCGCAGTCGTAGATGCGGCCGGCACAC TTGGGCTGCTGGGAGCAGTACAGCTCCTTGTAGCACTGGTGCTGCTCGTGCCCGTACTTGTAGTGCGAGCACGTTTCCCGGCACGTGTTGTCCGTCGTCATGTCGACCTCGTTCTCGACGTAGCCCTGGACCAGGCGGGTGAACTGCACGTACGTG ACGTTCTCGCGATGCGCCCCACGGTCCGGATCGCACCGCCAGTACTCGCCGCTCGTCTGGTTCATCACGTTCCTTACCAGCTGCTGGGTGCGGGCGAGCCGGGTCTGCAGCTCGTTCCGACGGGCCTGCGATTCCACCGTAAAGTTACCTTGGCCCTGGGTTTTGAGCAGCATGTAGGAGAAC ] [+] EMBL AGA283677 [ CGTTCTCGTACTCG ATGTACTCGTAGCGCCGGGTGCCGCCCGGTGCCGCCGGGCAGATCCACATGTCCGAGTCGATGTACTCGCAGTCGTAGATGCGGCCGGCACAC TTGGGCTGCTGGGAGCAGTACAGCTCCTTGTAGCACTGGTGCTGCTCGTGCCCGTACTTGTAGTGCGAGCACGTTTCCCGGCACGTGTTGTCCGTCGTCATGTCGACCTCGTTCTCGACGTAGCCCTGGACCAGGCGGGTGAACTGCACGTACGTG ACGTTCTCGCGATGCGCCCCACGGTCCGGATCGCACCGCCAGTACTCGCCGCTCGTCTGGTTCATCACGTTCCTTACCAGCTGCTGGGTGCGGGCGAGCCGGGTCTGCAGCTCGTTCCGACGGGCCTGCGATTCCACCGTAAAGTTACCTTGGCCCTGGGTTTTG ] [-] EMBL BM599958 [ GTTCTCGTACTCG ATGTACTCGTAGCGCCGGGCGCCGCCCGGTGCCGCCGGGCAGATCCACATGTCCGAGTCGATGTACTCGCAGTCGTAGATGCGGCCGGCACAC TTGGGCTGCTGGGAGCAGTACAGCTCCTTGTAGCACTGGTGCTGCTCGTGCCCGTACTTGTAGTGCGAGCACGTTTCCCGGCACGTGTTGTCCGTCGTCATGTCGACCTCGTTCTCGACGTAGCCCTGGACCAGGCGGGTGAACTGCACGTACGTG ACGTTCTCGCGATGCGCCCCACGGTCCGGATCGCACCGCCAGTACTCGCCGCTCGTCTGGTTCATCcgg ] [+] EMBL AGA281481 [ tyTCGTACTCG ATGTACTCGTAGCGCCGGGTGCCGCCCGGTGCCGCCGGGCAGATCCACATGTCCGAGTCGATGTACTCGCAGTCGTAGATGCGGCCGGCACAC TTGGGCTGCTGGGAGCA TACAGCTCCTTGTAGCACTGGTGCTGCTCGTGCCCGTACTTGTAGTGCGAGCACGTTTCCCGGCACGTGTTGTCCGTCGTCATGTCGACCTCGTTCTCGACGTAGCCCTGGACCAGGCGGGTGAACTGCACGTACGTGAACGTTCTCGCGATGCGCCCCACGGTCCGGATCGCACCGCCAGTACTCGCCGCTCGTCTGGTTCATCACGTTCCTTACCAGCTGC ] [-] EMBL BM578860 [ TCCGAGTCGATGTACTCGCAGTCGTAGATGCGGCCGGCACAC TTGGGCTGCTGGGAGCAGTACAGCTCCTTGTAGCACTGGTGCTGCTCGTGCCCGTACTTGTAGTGCGAGCACGTTTCCCGGCACGTGTTGTCCGTCGTCATGTCGACCTCGTTCTCGACGTAGCCCTGGACCAGGCGGGTGAACTGCACGTACGTG ACGTTCTCGCGATGCGCCCCACGGTCCGGATCGCACCGCCAGTACTCGCCGCTCGTCTGGTTCATCACGTTCCTTACCAGCTGCTGGGTGCGGGCGAGCCGGGTCTGCAGCTCGTTCCGACGGGCCTGCGATTCCACCGTAAAGTTACCTTGGCCCTGGGTTTTGAGCAGCATGTAGGAGAATTGCATCATGATGTAGCCCTTCAGTTCGGTCGTTGCGATCGACTCGTACAGCACGTAGATGAGCTGCTGGGGTGACAGCCCGAAGCTGCAGAGGACGCTTCTTGCCGTCTCGTTTAGCTGGGAGAAGATGTCCTGGCGGCCGGGCGGCAACAGCACCTGGGTGCTGCCGGTGACCAGCAGCTCGAGGTTGTGCAGCAGCTCGATCACGCTGTCCGACTTGCTCACGTCGACCGTGGCCTGCGCGAACTGGGTAAGCGTCAGCTGCTCGACCGGCGTGTCCGTCCcgg ] [-] EMBL AGA282112 [ AGCAGCTCGATCACGCTGTCCGACTTGCTCACGTCGACCGTGGCCTGCGCGAACTGGGTAAGCGTCAGCTGCTCGACCGGCGTGTCCGTCCGCAGCAGCTGGTACATGCTGGCCTCCCGCCGCTCGACCAGCCGCACGATCATGTACAGCTTCTCTAGCCGCTCGACCAACCGGTTCCGGTGGCCGAAGCTCTCGATCACGTCGTGCACGCGCTGCCCGAGGATATCGACCATGGCCGTTTGGCTTTCGCGCATCTCCGCCGACAGCGTCTGGATGGTGTGCATGATGCGCAGGTCCTGGTTGAAGTTGATCGGGGACGGTTTGCTGTCGCCGAGCTGCATCTCCGCCACATCGACCGCGATGCGCAGCAGCACCTTGGTCGTTTCGCTCAGCGCCAGCCAGCCCGG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||