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Anopheles gambiae
cluster # 7866 cluster # 7866       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7866#0 length = 1544 sequences # 8  

consensusID : consensus_7866#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1544
fasta sequence
                              [GTTGAAGTAACTAATTGATTTCTATGTTGCCGTTTATGTTGTCAGGTGGAGCATAAACGGGTTTTCAAGCATTTAGTTTTTGAAGTGCTACACCATGTTTCTTCGTACTTATTTGTGCCATGGCGCAATAGCTAACGAGACAGAGAGAGCGAGAGAGAGCGCGAGTTTCCGTTTCGTTGTTTTTGAATTGTGTAATTTTGTGTTGCAAATTGTGAAACCACAACAACAACAACAAGAACAACAATAATAAGCAAAATAATTATAACCGAATGATGAAGTATTGAACTGGTTTCAGTGCTCAGTGCAGTAAAAAGGGCGTTTTAATTAAAGAAGAAGNAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAACGGAGGAAGGAAGCAACACGAAATACCCGCGTTGGAGGTTGGTTGAAACGGAAGAAGAAAAAAATCAACACTATAACAAGCTATAGGACATAGCTCTAACTAGGACAGTTTATTATTATTAGGTAACAAGATCGATGATCTCTCTTTCTCTCATTCGCGATACGAAGGGCAATTGAGGGCAAAAAAAACAACACAAGTAAACACATACACAAGTAAACACATATTCACAGGGACACAGGTTGGCCGGCAAGGTTGTGGGAGAGGCTTCTTTGGAACACACAAGCAGACAGGCAGGCAGTCAAAGCATGCGGCGAAACAAAAAATGCAAACGTAGAGTAAT--ACACACACATCTTAGTCGCTGGCGAAACATTAAGAAAACCCAC--ACACACACAACTACAC-AAC-TACACACATACAGACACAGATCGTTTAATCGCGTAACTTGTACATATTCCTTGTTCTCATATGATTTCTAT---AACAAGTATAGAGAAAGCAGTACCGACATACACATACATTCCATTAGCTTCTAGTTTATATCGAGTAAGGTTTAGAAGAAACACTTAAATAATAACAATTATCGGACTAGAAC---AAAAAAAACAAAATGGAAGCTATTGAATATATAACGAATTACAAGAAAAAAAAAATACAAAAACCAAAAAAAGCAGATAATGTTTTAAATTTTTAGAAGCTTTAATTTGTGCGTGTGTGTGCGCGTGCGTGCGCTGCCTGTGATGTGGGATTGGTGCGCATAATAATGATTCATTGTTGTTGATTGCGTTCATG-TTTTTGCTTCTTGCCACCACAGGGCACGTTTCATTTTTTTTATTCAAGGAAATTAGCTTGAAGTTGATATTATTTTATTTTTATATTGCTTAAATACAAAACGAGATTCCGTTGTTCGATGCAAACGAACAAACTTACAAACAAACAAACAGTGCAAATCAGTTGTAAACCGGTGCGCGTTAAATGCACCCATGCTTTTAAGTTTAGGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAAGGTGGAAGAAGAGCAAATTAATTTATTTTTTGCGGCGCATTTATTTATTGATAAAAACTGAGTGTGTGTGTCTTAGGTTTACTTATTTTTTTATTTTTCGTACTGTGTAACTCCCTATAGATTGTATGATTTCTAAAGAAAAATAAATAAATCTAAAAGTAA]

[+] EMBL BX620731             [GTTGAAGTAACTAATTGATTTCTATGTTGCCGTTTATGTTGTCAGGTGGAGCATAAACGGGTTTTCAAGCATTTAGTTTTTGAAGTGCTACACCATGTTTCTTCGTACTTATTTGTGCCATGGCGCAATAGCTAACGAGACAGAGAGAGCGAGAGAGAGCGCGAGTTTCCGTTTCGTTGTTTTTGAATTGTGTAATTTTGTGTTGCAAATTGTGAAACCACAACAACAACAACAAGAACAACAATAATAAGCAAAATAATTATAACCGAATGATGAAGTATTGAACTGGTTTCAGTGCTCAGTGCAGTAAAAAGGGCGTTTTAATTAAAGAAGAAGNAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAACGGAGGAAGGAAGCAACACGAAATACCCGCGTTGGAGGTTGGTTGAAACGGAAGAAGAAAAAAATCAACACTATAACAAGCTATAGGACATAGCTCTAACTAGGACAGTTTATTATTATTAGGTAACAAGATCGATGATCTCTCTTTCTCTCATTCGCGATACGAAGGGCAATTGAGGGCAAAAAAAACAACACAAGTAAACACATACACAAGTAAACACATATTCACAGGGACACAGGTTGGCCGGCAAGGTTGTGGGAGAGGCTTCTTTGGAAC CACAAGCAGACAGGCAGGCAGTC AAGCATGCGGCG AACCAAAAATGCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BX609333             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTCACAGGGACACAGGTTGGCCGGCAAGGTTGTGGGAGAGGCTTCTTTGGAACACACAAGCAGACAGGCAGGCAGTCAAAGCATGCGGCGAAACAAAAAATGCAAACGTAGAGTAAT  ACACACACATCTTAGTCGCTGGCGAAACATTAAGAAAACCCAC  ACACACACAACTACAC AAC TACACACATACAGACACAGATCGTTTAATCGCGTAACTTGTACATATTCCTTGTTCTCATATGATTTCTAT   AACAAGTATATAGAAAGCAGTACCGACATACACATACATTCCATTAGCTTCTAGTTTATATCGAGTAAGGTTTAGAAGAAACACTTAAATAATAACAATTATCGGACTAGAACA  AAAAAAAACAAAATGGAAGCTATTGAATATATAACGAATTACAAGAAAAAAAAAATACAAAAACCAAAAAAAGCAGATAATGTTTTAAATTTTTAGAAGCTTTAATTTGTGCGTGTGTGTGCGCGTGCGTGCGCTGCCTGTGATGTGGGATTGGTGCGCATAATAATGATTCATTGTTGTTGATTGCGTTCATG TTTTTGCTTCTTGCCACCACAGGGCACGTTTCATTTTTTTTATTCAAGGAAATTAGCTTGAAGTTGATATTATTTTATTTTTATATTGCTTAAATACAAAACGAGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BX617620             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGAGGCTTCTTTGGAACACACAAGCAGACAGGCAGGCAGTCAAAGCATGCGGCGAAACAAAAAATGCAAACGTAGAGTAAT  ACACACACATCTTAGTCGCTGGCGAAACATTAAGAAAACCCAC  ACACACACAACTACAC AAC TACACACATACAGACACAGATCGTTTAATCGCGTAACTTGTACATATTCCTTGTTCTCATATGATTTCTAT   AACAAGTATAGAGAAAGCAGTACCGACATACACATACATTCCATTAGCTTCTAGTTTATATCGAGTAAGGTTTAGAAGAAACACTTAAATAATAACAATTATCGGACTAGAAC   AAAAAAAACAAAATGGAAGCTATTGAATATATAACGAATTACAAGAAAAAAAAAATACAAAAACCAAAAAAAGCAGATAATGTTTTAAATTTTTAGAAGCTTTAATTTGTGCGTGTGTGTGCGCGTGCGTGCGCTGCCTGTGATGTGGGATTGGTGCGCATAATAATGATTCATTGTTGTTGATTGCGTTCATG TTTTTGCTTCTTGCCA CACAGGGCACGTTTCATTTTTTTTATTCAAGGAAATTAGCTTGAAAGTGATATTATTTTA TTTTATATTGGCTAAATAC AAACGAGATTCCGTTGTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BX617615             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GAACACACAAGCAGACAGGCAGGCAGTCAAAGCATGCGGCGAAACAAAAAATGCAAACGTAGAGTAAT  ACACACACATCTTAGTCGCTGGCGAAACATTAAGAAAACCCAC  ACACACACAACTACAC AAC TACACACATACAGACACAGATCGTTTAATCGCGTAACTTGTACATATTCCTTGTTCTCATATGATTTCTAT   AACAAGTATAGAGAAAGCAGTACCGACATACACATACATTCCATTAGCTTCTAGTTTATATCGAGTAAGGTTTAGAAGAAACACTTAAATAATAACAATTATCGGACTAGAACA  AAAAAAAACAAAATGGAAGCTATTGAATATATAACGAATTACAAGAAAAAAAAAATACAAAAACCAAAAAAAGCAGATAATGTTTTAAATTTTTAGAAGCTTTAATTTGTGCGTGTGTGTGCGCGTGCGTGCGCTGCCTGTGATGTGGGATTGGTGCGCATAATAATGATTCATTGTTGTTGATTGCGTTCATG TTTTTGCTTCTTGCCACCACAGGGCACGTTTCATTTTTTTTATTCAAGGAAATTAGCTTGAAGTTGATATTATTTTATTTTTATATTGCTTAAATACAAAACGAGATTCCGTTGTTCGATGCAAACGAACAAACTTACAAACAAACAAACA                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BM634241             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ccgGTAGAGTAATACACACACACATCTTAGTCGCTGGCGAAACATTAAGAAAACCCACAAACACACACAACTACACAAACACACACACATACAGACACAGATCGTTTAATCGCGTAACTTGTACATATTCCTTGTTCTCATATGATTTCTATAACAACAAGTTTAGAGAAAGCAGTACCGACATACACATACATTCCATTAGCTTCTAGTTTATATCGAGTAAGGTTTAGAAGAAACACTTAAATAATAACAATTATCGGACTAGAACAAAAAAAAAAACAAAATGGAAGCTATTGAATATATAACGAATTACAAG  AAAAAAAATACAAAAACCAAAAAAAGCAGATAATGTTTTAAATTTTTAGAAGCTTTAATTTGTGCGTGTGTGTGCGCGTGCGTGCGCTGCCTGTGATGTGGGATTGGTGCGCATAATAATGATTCATTGTTGTTGATTGCGTTCATGTTTTTTGCTTCTTGCCACCACAGGGCACGTTTCA   TTTTTGTTCAAGGAAATTAGCTTGAAGTTGATATTATTTTATTTTTATATTGCTTAAATACAAAACGAGATTCTGTTGTTCGATGCAAACGAACAAACTTACAAACAAACAAACAGTGCAAATCAGTTGTAAACCGGTGCGCGTT                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BX612153             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ACACAGATCGTTTAATCTTGTAACTTGTACATATTCCTTGTTCTCATATGATTTCTAT   AACAAGTATAGAGAAAGCAGTACCGACATACACATACATTCCATTAGCTTCTAGTTTATATCGAGTAAGGTTTAGAAGAAACACTTAAATAATAACAATTATCGGACTAGAAC   AAAAAAAACAAAATGGAAGCTATTGAATATATAACGAATTACAAGAAAAAAAAAATACAAAAACCAAAAAAAGCAGATAATGTTTTAAATTTTTAGAAGCTTTAATTTGTGCGTGTGTGTGCGCGTGCGTGCGCTGCCTGTGATGTGGGATTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BX608761             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TAGAAGAAACACTTAAATAATAACAATTATCGGACTAGAAC   AAAAAAAACAAAATGGAAGCTATTGAATATATAACGAATTACAAGAAAAAAAAAATACAAAAACCAAAAAAAGCAGATAATGTTTTAAATTTTTAGAAGCTTTAATTTGTGCGTGTGTGTGCGCGTGCGTGCGCTGCCTGTGATGTGGGATTGGTGCGCATAATAATGATTCATTGTTGTTGATTGCGTTCATG TTTTTGCTTCTTGCCACCACAGGGCACGTTTCATTTTTTTTATTCAAGGAAATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL BX611090             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ACGAGATTCCGTTGTTCGATGCAAACGAACAAACTTACAAACAAACAAACAGTGCAAATCAGTTGTAAACCGGTGCGCGTTAAATGCACCCATGCTTTTAAGTTTAGGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAAGGTGGAAGAAGAGCAAATTAATTTATTTTTTGCGGCGCATTTATTTATTGATAAAAACTGAGTGTGTGTGTCTTAGGTTTACTTATTTTTTTATTTTTCGTACTGTGTAACTCCCTATAGATTGTATGATTTCTAAAGAAAAATAAATAAATCTAAAAGTAA]


>consensus_7866#0 GTTGAAGTAACTAATTGATTTCTATGTTGCCGTTTATGTTGTCAGGTGGAGCATAAACGG GTTTTCAAGCATTTAGTTTTTGAAGTGCTACACCATGTTTCTTCGTACTTATTTGTGCCA TGGCGCAATAGCTAACGAGACAGAGAGAGCGAGAGAGAGCGCGAGTTTCCGTTTCGTTGT TTTTGAATTGTGTAATTTTGTGTTGCAAATTGTGAAACCACAACAACAACAACAAGAACA ACAATAATAAGCAAAATAATTATAACCGAATGATGAAGTATTGAACTGGTTTCAGTGCTC AGTGCAGTAAAAAGGGCGTTTTAATTAAAGAAGAAGNAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA GAAGAAGAAGAAAACGGAGGAAGGAAGCAACACGAAATACCCGCGTTGGAGGTTGGTTGA AACGGAAGAAGAAAAAAATCAACACTATAACAAGCTATAGGACATAGCTCTAACTAGGAC AGTTTATTATTATTAGGTAACAAGATCGATGATCTCTCTTTCTCTCATTCGCGATACGAA GGGCAATTGAGGGCAAAAAAAACAACACAAGTAAACACATACACAAGTAAACACATATTC ACAGGGACACAGGTTGGCCGGCAAGGTTGTGGGAGAGGCTTCTTTGGAACACACAAGCAG ACAGGCAGGCAGTCAAAGCATGCGGCGAAACAAAAAATGCAAACGTAGAGTAATACACAC ACATCTTAGTCGCTGGCGAAACATTAAGAAAACCCACACACACACAACTACACAACTACA CACATACAGACACAGATCGTTTAATCGCGTAACTTGTACATATTCCTTGTTCTCATATGA TTTCTATAACAAGTATAGAGAAAGCAGTACCGACATACACATACATTCCATTAGCTTCTA GTTTATATCGAGTAAGGTTTAGAAGAAACACTTAAATAATAACAATTATCGGACTAGAAC AAAAAAAACAAAATGGAAGCTATTGAATATATAACGAATTACAAGAAAAAAAAAATACAA AAACCAAAAAAAGCAGATAATGTTTTAAATTTTTAGAAGCTTTAATTTGTGCGTGTGTGT GCGCGTGCGTGCGCTGCCTGTGATGTGGGATTGGTGCGCATAATAATGATTCATTGTTGT TGATTGCGTTCATGTTTTTGCTTCTTGCCACCACAGGGCACGTTTCATTTTTTTTATTCA AGGAAATTAGCTTGAAGTTGATATTATTTTATTTTTATATTGCTTAAATACAAAACGAGA TTCCGTTGTTCGATGCAAACGAACAAACTTACAAACAAACAAACAGTGCAAATCAGTTGT AAACCGGTGCGCGTTAAATGCACCCATGCTTTTAAGTTTAGGGAAGGAAGGAAGGAAGGA AAGGTGGAAGAAGAGCAAATTAATTTATTTTTTGCGGCGCATTTATTTATTGATAAAAAC TGAGTGTGTGTGTCTTAGGTTTACTTATTTTTTTATTTTTCGTACTGTGTAACTCCCTAT AGATTGTATGATTTCTAAAGAAAAATAAATAAATCTAAAAGTAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)