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Anopheles gambiae
cluster # 7891 cluster # 7891       Sequences # 8       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7891#0 length = 1397 sequences # 5  
consensus_7891#1 length = 1006 sequences # 3  

consensusID : consensus_7891#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1397
fasta sequence
                              [GAGTTGCGTCGTGCCGCTA-TTTTTGCCTGATGCTCTGACGTAGCACCGGTGCAAGTGATTTTTCCGGACGACCAAATCGAAGCAGTCGTGTAGGGGCGGCGCA-CTTCATCGTTACCATCCCGTGCTCCCTCCGGAACTCGACATTGTGCCCATGGCGGGCGATGTCGTGCAGATTCAGATGACAGCGTACGCTGAACGAGCAGACCACGTTGTTGATCACGATGTCAATCTCCGGCTGCTCCTCCTGCGGTTCATTGTCCGGGCTCGTTTCTTTGGTTTCCAGCGACAGCTCAGTATCAGCGCCCGTCGGATCCGATTCGGTGGGAGTGTTCGTCGTGATCGTGGTGCTGTTGTTGGTTGTGGTACCGCTGCTACTGCT-GCTGCTGGTGGTGGTGGTGCTACTGCTGCTGGAGGTGATGATGGTGGTGGTATTACTGGCCAGGATGATGCTGCTGCTGTTGCCTGTGGTGGTGGTTGTCAAGCTGGTACTGTCACCGATCTTAGCGCCTGCCTTCTTTTCGCCGATTGCTCCGTCGCCTACTGGGGATGCGTTCGATAAAACCGACAGCTGCTGTTGGTGGTTGGTGGTCGTTGTTGTCGCGAACAT-CAAGGAACTGTGATTAATCATTCCGCCTGCGATGGACTGGTGATACTGGTGGTCGCTCGGAAGCGATATCACGGTGCTAGTGCTGCCCTTCGCAAGCCTAACAACACCGGAAGTGCTCGACTGCTGCTGCTGC-TGC-TGTTGCGGATGTTGCCGTAGATGGAGCCCGTTCGCAACGCTCACCACCTCATTATGTCCGGTGGCCGAATTCACACCGAGTACCGTGGCTTTG-CACCAACACTAATTCCGTTGCAAAGAACCGTGCCAGAACCGGCGGTGTTGCTGTTGGTGCTACTGCTGCTACTAGTGCCACTGATACCATTGGGCGCACTGGAGGTGCTAATGGCGTTGCTGATGAAGGAGCTGGTACCCACCATTCGCGATATGGACTGGTTTGTGTGTGTTTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGGATGTGA-TTGTTTGGTGTGGTGTTCTATCTGCACACGACTCACAGTTAAGGCACACGCTGCATTCCGAGGCACGGCTAACTAACTCCTCATAAGCTCATTCTGCGCGCACGGCTGCGTTCGGTGTGGTCAATGAATTGCACTCTATTTTTATCAAGTTCACATCGAGTCTGGCGACGGGGTCGGCGAAAACTGCTCCCATGCGGCAAATATCGC-A-CGCTTCCTGTCCGCC-CACTGGCTGTGTGCGATAGTGCGCTCGCTGCTGCAGGTCTTGCGCCAAACC-ACGCTAGGAAATCGCACTTTAAATACCGTTTTTCGCGAATCTTTTCGGAGCGAGGCGTCGAACGTTGTTGTCGATTTGTTGTTTA]

[+] EMBL CNS08DB1             [GAGTTGCGTCGTGCCGCTA TTTTTGCCTGATGCTCTGACGTAGCACCGGTGCAAGTGATTTTTCCGGACGACCAAATCGAAGCAGTCGTGTAGGGGCGGCGCA CTTCATCGTTACCATCCCGTGCTCCCTCCGGAACTCGACATTGTGCCCATGGCGGGCGATGTCGTGCAGATTCAGATGACAGCGTACGCTGAACGAGCAGACCACGTTGTTGATCACGATGTCAATCTCCGGCTGCTCCTCCTGCGGTTCATTGTCCGGGCTCGTTTCTTTGGTTTCCAGCGACA CTCAGTATCAGCGCCCGTCGGATCCGATTCGGTGGGAGTGTTCGTCGTGATCGTGGTGCTGTTGTTGGTTGTGGTACCGCTGCTACTGCT GCTGCTGGTGGTGGTGGTGCTACTGCTGCTGGAGGTGATGATGGTGGTGGTATTACTGGCCAGGATGATGCTGCTGCTGTTGCCTGTGGTGGTGGTTGTCAAGCTGGTACTGTCACCGATCTTAGCGCCTGCCTTCTTTTCGCCGATTGCTCCGTCGCCTACTGGGGATGCGTTCGATAAAACCGACAGCTGCTGTTGGTGGTTGGTGGTCGTTGTTGTCGCGAACATACAAGGAACTGTGATTAATCATTCCGCCTGCGATGGACTGGTGATACTGGTGGTCGCTCGGAAGCGATACCACGGTGCTAGTGCTGCCCTTCGCAAGCCTAACAACACCGGAAGTGCTCGACTGCTGCTGCTGC TGC TGTTGCGGATGTTGCCGTAGATGGAGCCCGTTCGCAACGCTCACCACCTCATTATGTCCGGTGGCCGAATTCACACCGAGTACCGTGGCTTTG CACCAACACTAATTCCGTTGCAAAGAACCGTGCCAAAACCGGCGGTGTTGCTGTTGGTGCTACTGCTGCTACTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CNS08WZ3             [ AGTAGCGTCGTGCCGCTATTTTTTGCCTGATGCTCTGACGTAGCACCGGTGCAAGTGATTTTTCCGGACGACCAAATCGAAGCAGTCGTGTAGGGGCGGCGCA CTTCATCGTTACCATCCCGTGCTCCCTCCGGAACTCGACATTGTGCCCATGGCGGGCGATGTCGTGCAGATTCAGATGACAGCGTACGCTGAACGAGCAGACCACGTTGTTGATCACGATGTCAATCTCCGGCTGCTCCTCCTGCGGTTCATTGTCCGGGCTCGTTTCTTTGGTTTCCAGCGACAGCTCAGTATCAGCGCCCGTCGGATCCGATTCGGTGGGAGTGTTCGTCGTGATCGTGGTGCTGTTGTTGGTTGTGGTACCGCTGCTACTGCTAGCTGCTGGTGGTGGTGGTGCTACTGCTGCTGGAGGTGATGATGGTGGTGGTATTACTGGCCAGGATGATGCTGCTGCTGTTGCCTGTGGTGGTGGTTGTCAAGCTGGTACTGTCACCGATCTTAGCGCCTGCCTTCTTTTCGCCGATTGCTCCGTCGCCTACTGGGGATGCGTTCGATAAAACCGACAGCTGCTGTTGGTGGTTGGTGGTCGTTGTTGTCGCGAACAT CAAGGAACTGTGATTAATCATTCCGCCTGCGATGGACTGGTGATACTGGTGGTCGCTCGGAAGCGATATCACGGTGCTAGTGCTGCCCTTCGCAAGCCTAACAACACCGGAAGTGCTCGACTGCTGCTGCTGC TGC TGTTGCGGATGTTGCCGTAGATGGAGCCCGTTCGCAACGCTCACCACCTCATTATGTCCGGTGGCCGAATTCACACCGAGTACCGTGGCTTTG CACCAACACTAATTCCGTTGCAAAGAACCGTGCCAGAACCGGCGGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL BM604643             [                                                                 CGGACGACCAAATCGAAGCAGTCGTGTAGGGGCGGCGCAGCTTCATCGTTACCATCCCGTGCTCCCTCCGGAACTCGACATTGTGCCCATGGCGGGCGATGTCGTGCAGATTCAGATGACAGCGTACGCTGAACGAGCAGACCACGTTGTTGATCACGATGTCAATCTCCGGCTGCTCCTCCTGCGGTTCATTGTCCGGGCTCGTTTCTTTGGTTTCCAGCGACAGCTCAGTATCAGCGCCCGTCGGATCCGATTCGGTGGGAGTGTTCGTCGTGATCGTGGTGCTGTTGTTGGTTGTGGTACCGCTGCTACTGCT GCTGCTGGTGGTGGTGGTGCTACTGCTGCTGGAGGTGATGATGGTGGTGGTATTACTGGCCAGGATGATGCTGCTGCTGTTGCCTGTGGTGGTGGTTGTCAAGCTGGTACTGTCACCGATCTTAGCGCCTGCCTTCTTTTCGCCGATTGCTCCGTCGCCTACTGGGGATGCGTTCGATAAAACCGACAGCTGCTGTTGGTGGTTGGTGGTCGTTGTTGTCGCGAACAT CAAGGAACTGTGATTAATCATTCCGCCTGCGATGGACTGGTGATACTGGTGGTCGCTCGGAAGCGATATCACGGTGCTAGTGCTGCCCTTCGCAAGCCTAACAACACCGGAAGTGCTCGACTGCTGCTGCTGC TGC TGTTGCGGATGTTGCCGTAGATGGAGCCCGTcgg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CNS08DB0             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTGCTGCTGTTGCCTGTGGTGGTGGTTGTCAAGCTGGTACTGTCACCGATCTTAGCGCCTGCCTTCTTTTCGCCGATTGCTCCGTCGCCTACTGGGGATGCGTTCGATAAAACCGACAGCTGCTGTTGGTGGTTGGTGGTCGTTGTTGTCGCGAACAT CAAGGAACTGTGATTAATCATTCCGCCTGCGATGGACTGGTGATACTGGTGGTCGCTCGGAAGCGATATCACGGTGCTAGTGCTGCCCTTCGCAAGCCTAACAACACCGGAAGTGCTCGACTGCTGCTGCTGCGTGCGTGTTGCGGATGTTGCCGTAGATGGAGCCCGTTCGCAACGCTCACCACCTCATTATGTCCGGTGGCCGAATTCACACCGAGTACCGTGGCTTTGCCACCAACACTAATTCCGTTGCAAAGAACCGTGCCAGAACCGGCGGTGTTGCTGTTGGTGCTACTGCTGCTACTAGTGCCACTGATACCATTGGGCGCACTGGAGGTGCTAATGGCGTTGCTGATGAAGGAGCTGGTACCCACCATTCGCGATATGGACTGGTTTGTGTGTGTTTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGGATGTGA TTGTTTGGTGTGGTGTTCTATCTGCACACGACTCACAGTTAAGGCACACGCTGCATTCCGAGGCACGGCTAACTAACTCCTCATAAGCTCATTCTGCGCGCACGGCTGCGTTCGGTGTGGTCAATGAATTGCACTCTATTTTTATCAAGTTCACATCGAGTCTGGCGACGGGGTCGGCGAAAACTGCTCCCATGCGGCAAATATCGC A CGCTTCCTGTCCGCC CACTGGCTGTGTGCGATAGTGCGCTCGCTGCTGCAGGTCTTGCGCCAAACC ACGCTAGGAAATCGCACTTTAAATACCGTTTTTCGCGAATCTTTTCGGAGCGAGGCGTCGAACGTTGTTGTCGATTTGTTGTTTA]
[-] EMBL CNS08WZ2             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCTGGTACTGTCACCGATCTTAGCGCCTGCCTTCTTTTCGCCGATTGCTCCGTCGCCTACTGGGGATGCGTTCGATAAAACCGACAGCTGCTGTTGGTGGTTGGTGGTCGTTGTTGTCGCGAACAT CAAGGAACTGTGATTAATCATTCCGCCTGCGATGGACTGGTGATACTGGTGGTCGCTCGGAAGCGATATCACGGTGCTAGTGCTGCCCTTCGCAAGCCTAACAACACCGGAAGTGCTCGACTGCTGCTGCTGC TGC TGTTGCGGATGTTGCCGTAGATGGAGCCCGTTCGCAACGCTCACCACCTCATTATGTCCGGTGGCCGAATTCACACCGAGTACCGT GCTTTGCCACCAACACTAATTCCGTTGCAAAGAACCGTGCCAGAACCGGCGGTGTTGCTGTTGGTGCTACTGCTGCTACTAGTGCCACTGATACCATTGGGCGCACTGGAGGTGCTAATGGCGTTGCTGATGAAGGAGCTGGTACCCACCATTCGCGATATGGACTGGTTTGTGTGTGTTTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGGATGTGATTTGTTTGGTGTGGTGTTCTATCTGCACACGACTCACAGTTAAGGCACACGCTGCATTCCGAGGCACGGCTAACTAACTCCTCATAAGCTCATTCTGCGCGCACGGCTGCGTTCGGTGTGGTCAATGAATTGCACTCTATTTTTATCAAGTTCACATCGAGTCTGGCGACGGGGTCGGCGAAAACTGCTCCCATGCGGCAAATATCGCGAGCGCTTCCTGTCCGCCGCACTGGCTGTGTGCGATAGTGCGCTCGCTGCTGCAGGTCTTGCGCCTAACCTACGCTAGGAAATCGCAC                                                                    ]


>consensus_7891#0 GAGTTGCGTCGTGCCGCTATTTTTGCCTGATGCTCTGACGTAGCACCGGTGCAAGTGATT TTTCCGGACGACCAAATCGAAGCAGTCGTGTAGGGGCGGCGCACTTCATCGTTACCATCC CGTGCTCCCTCCGGAACTCGACATTGTGCCCATGGCGGGCGATGTCGTGCAGATTCAGAT GACAGCGTACGCTGAACGAGCAGACCACGTTGTTGATCACGATGTCAATCTCCGGCTGCT CCTCCTGCGGTTCATTGTCCGGGCTCGTTTCTTTGGTTTCCAGCGACAGCTCAGTATCAG CGCCCGTCGGATCCGATTCGGTGGGAGTGTTCGTCGTGATCGTGGTGCTGTTGTTGGTTG TGGTACCGCTGCTACTGCTGCTGCTGGTGGTGGTGGTGCTACTGCTGCTGGAGGTGATGA TGGTGGTGGTATTACTGGCCAGGATGATGCTGCTGCTGTTGCCTGTGGTGGTGGTTGTCA AGCTGGTACTGTCACCGATCTTAGCGCCTGCCTTCTTTTCGCCGATTGCTCCGTCGCCTA CTGGGGATGCGTTCGATAAAACCGACAGCTGCTGTTGGTGGTTGGTGGTCGTTGTTGTCG CGAACATCAAGGAACTGTGATTAATCATTCCGCCTGCGATGGACTGGTGATACTGGTGGT CGCTCGGAAGCGATATCACGGTGCTAGTGCTGCCCTTCGCAAGCCTAACAACACCGGAAG TGCTCGACTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGCGGATGTTGCCGTAGATGGAGCCCGTTCGCAA CGCTCACCACCTCATTATGTCCGGTGGCCGAATTCACACCGAGTACCGTGGCTTTGCACC AACACTAATTCCGTTGCAAAGAACCGTGCCAGAACCGGCGGTGTTGCTGTTGGTGCTACT GCTGCTACTAGTGCCACTGATACCATTGGGCGCACTGGAGGTGCTAATGGCGTTGCTGAT GAAGGAGCTGGTACCCACCATTCGCGATATGGACTGGTTTGTGTGTGTTTGTGTGTATGT GTGTGTGTGTGGATGTGATTGTTTGGTGTGGTGTTCTATCTGCACACGACTCACAGTTAA GGCACACGCTGCATTCCGAGGCACGGCTAACTAACTCCTCATAAGCTCATTCTGCGCGCA CGGCTGCGTTCGGTGTGGTCAATGAATTGCACTCTATTTTTATCAAGTTCACATCGAGTC TGGCGACGGGGTCGGCGAAAACTGCTCCCATGCGGCAAATATCGCACGCTTCCTGTCCGC CCACTGGCTGTGTGCGATAGTGCGCTCGCTGCTGCAGGTCTTGCGCCAAACCACGCTAGG AAATCGCACTTTAAATACCGTTTTTCGCGAATCTTTTCGGAGCGAGGCGTCGAACGTTGT TGTCGATTTGTTGTTTA



consensusID : consensus_7891#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1006
fasta sequence
                              [TGATCTGTCGTCTTGATGATCTGATGTTGTGTGTCTGTGTTTTCTTTAAGTTTGGCGAGAATGGTGGNTNTTGGGTGGATACATTGATGTTTGTTTCCNCGAAAAATTTTCAAAAAGGGGGAACGCTTGGTGGNATTAAAATGNCAATGTTCCCGCCCTTGCNGGANGTTGGAACCTTGGGTTGAATCAACCTTTGGGTTGGTTCCGNCTTTCGGGAAAAGCTGGAAATATTCCACCGGTTGTCTAAGGTGCTGCNGCCCCTTTCGCAAGCCCTTAAACAACACCCGGGAAGTGCCTTCGGACCTTGCCTTGCCTGCTTGCTGCTGTTGCGGATTGTTCCCGTAGATGGAGCCCGTTCGCCAACGCTCACCACCTCATTATGTCCGGTGGCCGAATTCACACCGAGTACCGTGGCTTTGCCACCTAACACTAATTCCGTTGCAAAGAACCGTGCCAGAACCGGCGGTGTTGCTGTTGGTGCTACTGCTGCTACTAGTGCCACTGATACCATTGGGCGCACTGGAGGTGCTAATGGCGTTGCTGATGAAGGAGCTGGTACCCACCATTCGCGATATGGACTGGTTTGTGTGTGTT--TGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGGATGTGATTGTTTGGTGTGGTGTTCTATCTGCACACGACTCACAGTTAAGGCACACGCTGCATTCCGAGGCACGGCTAACTAACTCCTCATAAGCTCATTCTGCGCGCACGGCTGCGTTCGGTGTGGTCAATGAATTGCACTCTATTTTTATCAAGTTCACATCGAGTCTGGCGACGGGGTCGGCGAAAACTGCTCCCATGCGGCAAATATCGCACGCTTCCTGTCCGCCCACTGGCTGTGTGCGATAGTGCGCTCGCTGCTGCAGGTCTTGCGCCACCGCTACGCTAGGAAATCGCACTTTAAATACCGTTTTTCGCGAATCTTTTCGGAGCGAGGCGTCGAACGTTGTTGTCGATTTGTTGTTTATGATCGCCTCGTGCCGATTCTGG]

[-] EMBL BX467350             [TGATCTGTCGTCTTGATGATCTGATGTTGTGTGTCTGTGTTTTCTTTAAGTTTGGCGAGAATGGTGGNTNTTGGGTGGATACATTGATGTTTGTTTCCNCGAAAAATTTTCAAAAAGGGGGAACGCTTGGTGGNATTAAAATGNCAATGTTCCCGCCCTTGCNGGANGTTGGAACCTTGGGTTGAATCAACCTTTGGGTTGGTTCCGNCTTTCGGGAAAAGCTGGAAATATTCCACCGGTTGTCTAAGGTGCTGCNGCCCCTTTCGCAAGCCCTTAAACAACACCCGGGAAGTGCCTTCGGACCTTGCCTTGCCTGCTTGCTGCTGTTGCGGATTGTTCCCGTAGATGGAGCCCGTTCGCCAACGCTCACCACCTCATTATGTCCGGTGGCCGAATTCACACCGAGTACCGTGGCTTTGCCACCTAACACTAATTCCGTTGCAAAGAACCGTGCCAGAACCGGCGGTGTTGCTGTTGGTGCTACTGCTGCTACTAGTGCCACTGATACCATTGGGCGCACTGGAGGTGC AATGGCGTTGCTGATGAAGGAGCTGGTACCCACCATTCGCGATATGGACTGGTTTGTGTGTGTT  TGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGGATGTGATTGTTTGGTGTGGTGTTCTATCTGCACACGACTCACAGTTAAGGCACACGCTGCATTCCGAGGCACGGCTAACTAACTCCTCATAAGCTCATTCTGCGCGCACGGCTGCGTTCGGTGTGGTCAATGAATTGCACTCTATTTTTATCAAGTTCACATCGAGTCTGGCGACGGGGTCGGCGAAAACTGCTCCCATGCGGCAAATATCGCACGCTTCCTGTCCGCCCACTGGCTGTGTGCGATAGTGCGCTCGCTGCTGCAGGTCTTGCGCCACCGCTACGCTAGGAAATCGCACTTTAAATACCGTTTTTCGCGAATCTTTTCGGAGCGAGGCGTCGAACGTTGTTGTCGATTTGTTGTTTATGATCGCCTCGTGCCGATTCTGG]
[-] EMBL BM655815             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTTGCCGTAGATGGAGCCCGTTCG CAACGCTCACCACCTCATTATGTCCGGTGGCCGAATTCACACCGAGTACCGTGGCTTTGCCACC AACACTAATTCCGTTGCGAAGAACCGTGCCAGAACCGGCGGTGTTGCTGTTGGTGCTACTGCTGCTACTAGTGCCACTGATACCATTGGGCGCACTGGAGGTGCTAATGGCGTTGCTGATGAAGGAGCTGGTACCCACCATTCGCGATACGGACTGGTTTGTGTGTGTTTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGGATGTGATTGTTTGGTGTGGTGTTCTATCTGCACACGACTCACAGTTAAGGCACACGCTGCATTCCGAGGCACGGCTAACTAACTCCTCATAAGCTCATTCTGCGCGCACGGCTGCGTTCGGTGTGGTCAATGAATTGCACTCTATTTTTATCAAGTTCACATCGAGTCTGGCGACGGGGTCGGCGAAAACTGCTCCCATGCGGCAAATATCGCACGCTTCCTGTCCGCCCACTGGCCGTGTGCGATAGTGCGCTCGCTGCTGCAGGTCTTGCGCCACCGCTACGCTAGGAAATCGCACTTTAAATACCGTTTTTCGCGAATCTTTTCGGAGCGAGGCGTCGAACGTTGTTGcgg                                   ]
[-] EMBL BM584868             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGGAGGTGCTAATGGCGTTGTTGATGAAGGAGCTGGTACCCACCATTCGCGATATGGACTGGTTTGTGTGTGTT  TGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGGATGTGATTGTTTGGTGTGGTGTTCTATCTGCACACGACTCACAGTTAAGGCACACGCTGCATTCCGAGGCACGGCTAACTAACTCCTCATAAGCTCATTCTGCGCGCACGGCTGCGTTCGGTGTGGTCAATGAATTGCACTCTATTTTTATCAAGTTCACATCGAGTCTGGCGACGGGGTCGGCGAAAACTGCTCCCATGCGGCAAATATCGCACGCTTCCTGTCCGCCCACTGGCTGTGTGCGATAGTGCGCTCGCTGCTGCAGGTCTTGCGCCACCGCTACGCTAGGAAATCGCACTTTAAATACCGTTTTTCGCGAATCTTTTCGGAGAGAGGCGTCGAACGTTGTTGTCGATTTGTTGcgg                        ]


>consensus_7891#1 TGATCTGTCGTCTTGATGATCTGATGTTGTGTGTCTGTGTTTTCTTTAAGTTTGGCGAGA ATGGTGGNTNTTGGGTGGATACATTGATGTTTGTTTCCNCGAAAAATTTTCAAAAAGGGG GAACGCTTGGTGGNATTAAAATGNCAATGTTCCCGCCCTTGCNGGANGTTGGAACCTTGG GTTGAATCAACCTTTGGGTTGGTTCCGNCTTTCGGGAAAAGCTGGAAATATTCCACCGGT TGTCTAAGGTGCTGCNGCCCCTTTCGCAAGCCCTTAAACAACACCCGGGAAGTGCCTTCG GACCTTGCCTTGCCTGCTTGCTGCTGTTGCGGATTGTTCCCGTAGATGGAGCCCGTTCGC CAACGCTCACCACCTCATTATGTCCGGTGGCCGAATTCACACCGAGTACCGTGGCTTTGC CACCTAACACTAATTCCGTTGCAAAGAACCGTGCCAGAACCGGCGGTGTTGCTGTTGGTG CTACTGCTGCTACTAGTGCCACTGATACCATTGGGCGCACTGGAGGTGCTAATGGCGTTG CTGATGAAGGAGCTGGTACCCACCATTCGCGATATGGACTGGTTTGTGTGTGTTTGTGTG TATGTGTGTGTGTGTGGATGTGATTGTTTGGTGTGGTGTTCTATCTGCACACGACTCACA GTTAAGGCACACGCTGCATTCCGAGGCACGGCTAACTAACTCCTCATAAGCTCATTCTGC GCGCACGGCTGCGTTCGGTGTGGTCAATGAATTGCACTCTATTTTTATCAAGTTCACATC GAGTCTGGCGACGGGGTCGGCGAAAACTGCTCCCATGCGGCAAATATCGCACGCTTCCTG TCCGCCCACTGGCTGTGTGCGATAGTGCGCTCGCTGCTGCAGGTCTTGCGCCACCGCTAC GCTAGGAAATCGCACTTTAAATACCGTTTTTCGCGAATCTTTTCGGAGCGAGGCGTCGAA CGTTGTTGTCGATTTGTTGTTTATGATCGCCTCGTGCCGATTCTGG



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_7891#0      GAGTTGCGTCGTGCCGCTATTTTTGCCTGATGCTCTGACGTAGCACCGGTGCAAGTGATT 60
consensus_7891#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7891#0      TTTCCGGACGACCAAATCGAAGCAGTCGTGTAGGGGCGGCGCACTTCATCGTTACCATCC 120
consensus_7891#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7891#0      CGTGCTCCCTCCGGAACTCGACATTGTGCCCATGGCGGGCGATGTCGTGCAGATTCAGAT 180
consensus_7891#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7891#0      GACAGCGTACGCTGAACGAGCAGACCACGTTGTTGATCACGATGTCAATCTCCGGCTGCT 240
consensus_7891#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7891#0      CCTCCTGCGGTTCATTGTCCGGGCTCGTTTCTTTGGTTTCCAGCGACAGCTCAGTATCAG 300
consensus_7891#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7891#0      CGCCCGTCGGATCCGATTCGGTGGGAGTGTTCGTCGTGATCGTGGTGCTGTTGTTGGTTG 360
consensus_7891#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7891#0      TGGTACCGCTGCTACTGCTGCTGCTGGTGGTGGTGGTGCTACTGCTGCTGGAGGTGATGA 420
consensus_7891#1      ---------------------------------------------------------TGA 3
                                                                               ***

consensus_7891#0      TGGTGGTGGTATTACTGGCCAGGATGATGC-TGCTGCTGTTGCCTGTGGTGGTGGTTGTC 479
consensus_7891#1      T--CTGTCGTCTTGATGATCTG-ATGTTGTGTGTCTGTGTTTTCTTTAAGTTTGGCGAGA 60
                      *    ** ** **  **  * * *** **  **    ****  ** *     ***     

consensus_7891#0      AAGCTGGTACTGTCACCGATCTTAGCGCCTGCCTTCTTTTCGCCGATTGCTCCGTCGCCT 539
consensus_7891#1      ATGGTGGNTNTTGGGTGGAT----ACATTGATGTTTGTTTCCNCGAAAAAT---TTTCAA 113
                      * * ***   *      ***     *       **  ****  ***    *   *  *  

consensus_7891#0      ACTGGGGATGCGTTCGATAAAACCGACA-GCTGCTGTTGGTGG--TTGGTGGTCGTTGTT 596
consensus_7891#1      AAAGGGGGAACGCTTGGTGGNATTAAAATGNCAATGTTCCCGCCCTTGCNGGANGTTGGA 173
                      *  ****   ** * * *   *   * * *    ****   *   ***  **  ****  

consensus_7891#0      GTCGCGAACATCAAGGAACTGTGATTAATCATTCCGCCTGCGATGGACTGGTGATACTGG 656
consensus_7891#1      ACCTTGGGTTGAATCAACCTTTGGGT--TGGTTCCGNCTTT------CGGGAAAAGCTGG 225
                        *  *      *   * ** **  *  *  ***** **        * **  *  ****

consensus_7891#0      TGGTCGCTCGGAAGCGATATCACGGTGCTAGTGCTGCCCTTCGCAAGCCT---AACAACA 713
consensus_7891#1      AAATATTCCACCGGTTGTCTAA-GGTGCTGCNGCC-CCTTTCGCAAGCCCTTAAACAACA 283
                         *    *    *   * * * ******   **  ** **********    *******

consensus_7891#0      CC--GGAAGTGC--TCGACTGCTGC--TGC-----TGCTGCTGTTGCGGAT-GTTGCCGT 761
consensus_7891#1      CCCGGGAAGTGCCTTCGGACCTTGCCTTGCCTGCTTGCTGCTGTTGCGGATTGTTCCCGT 343
                      **  ********  ***     ***  ***     **************** *** ****

consensus_7891#0      AGATGGAGCCCGTTCGC-AACGCTCACCACCTCATTATGTCCGGTGGCCGAATTCACACC 820
consensus_7891#1      AGATGGAGCCCGTTCGCCAACGCTCACCACCTCATTATGTCCGGTGGCCGAATTCACACC 403
                      ***************** ******************************************

consensus_7891#0      GAGTACCGTGGCTTTGCA--CCAACACTAATTCCGTTGCAAAGAACCGTGCCAGAACCGG 878
consensus_7891#1      GAGTACCGTGGCTTTGCCACCTAACACTAATTCCGTTGCAAAGAACCGTGCCAGAACCGG 463
                      *****************   * **************************************

consensus_7891#0      CGGTGTTGCTGTTGGTGCTACTGCTGCTACTAGTGCCACTGATACCATTGGGCGCACTGG 938
consensus_7891#1      CGGTGTTGCTGTTGGTGCTACTGCTGCTACTAGTGCCACTGATACCATTGGGCGCACTGG 523
                      ************************************************************

consensus_7891#0      AGGTGCTAATGGCGTTGCTGATGAAGGAGCTGGTACCCACCATTCGCGATATGGACTGGT 998
consensus_7891#1      AGGTGCTAATGGCGTTGCTGATGAAGGAGCTGGTACCCACCATTCGCGATATGGACTGGT 583
                      ************************************************************

consensus_7891#0      TTGTGTGTGTTTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGGATGTGATTGTTTGGTGTGGTGTTCTA 1058
consensus_7891#1      TTGTGTGTGTTTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGGATGTGATTGTTTGGTGTGGTGTTCTA 643
                      ************************************************************

consensus_7891#0      TCTGCACACGACTCACAGTTAAGGCACACGCTGCATTCCGAGGCACGGCTAACTAACTCC 1118
consensus_7891#1      TCTGCACACGACTCACAGTTAAGGCACACGCTGCATTCCGAGGCACGGCTAACTAACTCC 703
                      ************************************************************

consensus_7891#0      TCATAAGCTCATTCTGCGCGCACGGCTGCGTTCGGTGTGGTCAATGAATTGCACTCTATT 1178
consensus_7891#1      TCATAAGCTCATTCTGCGCGCACGGCTGCGTTCGGTGTGGTCAATGAATTGCACTCTATT 763
                      ************************************************************

consensus_7891#0      TTTATCAAGTTCACATCGAGTCTGGCGACGGGGTCGGCGAAAACTGCTCCCATGCGGCAA 1238
consensus_7891#1      TTTATCAAGTTCACATCGAGTCTGGCGACGGGGTCGGCGAAAACTGCTCCCATGCGGCAA 823
                      ************************************************************

consensus_7891#0      ATATCGCACGCTTCCTGTCCGCCCACTGGCTGTGTGCGATAGTGCGCTCGCTGCTGCAGG 1298
consensus_7891#1      ATATCGCACGCTTCCTGTCCGCCCACTGGCTGTGTGCGATAGTGCGCTCGCTGCTGCAGG 883
                      ************************************************************

consensus_7891#0      TCTTGCGCCAA-ACCACGCTAGGAAATCGCACTTTAAATACCGTTTTTCGCGAATCTTTT 1357
consensus_7891#1      TCTTGCGCCACCGCTACGCTAGGAAATCGCACTTTAAATACCGTTTTTCGCGAATCTTTT 943
                      **********   * *********************************************

consensus_7891#0      CGGAGCGAGGCGTCGAACGTTGTTGTCGATTTGTTGTTTA-------------------- 1397
consensus_7891#1      CGGAGCGAGGCGTCGAACGTTGTTGTCGATTTGTTGTTTATGATCGCCTCGTGCCGATTC 1003
                      ****************************************                    

consensus_7891#0      ---
consensus_7891#1      TGG 1006
                         




Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)