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Anopheles gambiae
cluster # 7931 cluster # 7931       Sequences # 8       consensus # 3


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7931#0 length = 973 sequences # 6  
consensus_7931#1 length = 598 sequences # 1  
consensus_7931#2 length = 522 sequences # 1  

consensusID : consensus_7931#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 973
fasta sequence
                              [GTCCGTTTTATGATCTAGAACTTGCTGCGGTATTCGTGCAATGATAAATCTACGATAGCGCTGATTGTTAAAATTGCCATATAGAAACTGCAACATAAGCTGACGGCAGAATGGCCCAAAAAGCGCCA-CAAGGCAAACGAATGAAACAAAGTGTTCAGCAGTACTGCAGTAAACTTTTTTCCTACTTTGTGCAACAGCGGTAGGATTCTAGAGTGTAAAGTTGCTATACCAAAATACTAATATAAGTTGGGAACGGTTGAATTGCGCTAATTTTCTGTTTTATCACAGCAGTGAAGCATACATTTGTAGACGGTTTGAGTTTTGGTTTTCGGTTCTCTGCTGCTATTTTTTCAATGATAAAACG-CCGTTTAAAACTGTGCTAAAAGCCTAATGCGTAAAA-CCGTGCTGCCTTTCTCTATCTTACTATCGCATGTCAGCTGTCGGCTCGATAAAAGTGTTTGGAACCTATCATAGAGGAATGATTAACAGTCTGCTGCTGTATTGGAGTTTCATTTTAAAAAAAACCCCAGAAACTCTTCTGGTACCATTTTTATATTCTTAACTAACTCACTTGTTGCATTTGTTACGGAATAAGTGGCAATAAAAGCAATTGTTCAAAGTTTAATCGATTAATCAAATGCTTTTAAGCAGATAAAATTTCTTTTCTACGTCGTGTAATAAAATCGGAGTTTGGGGATCGAAAAATGTCTTAACAAACGGTGTGTTCATTTGTAGTTGATATGATTAAAATTCCCTACACAGCTTGTTGTATCGTGTTAAATATGGAGTTCGAAAATGAATTTTCGTTGGCGTCGATGTTGCATGAAACGCCTGGTGTTAAACTGTTGAGCTAACTTCAATCCTTCTTCTAAAAGTAATCATAACGACGAACAATTCTATCATTTGCG-TTTATCTACGGATCTATGACCGTTCCCTTGCGTCAACTCGCTACTACACATTGCAGAACAATGGA]

[+] EMBL CNS09CYP             [GTCCGTTTTATGATCTAGAACTTGCTGCGGTATTCGTGCAATGATAAATCTACGATAGCGCTGATTGTTAAAATTGCCATATAGAAACTGCAACATAAGCTGACGGCAGAATGGCCCAAAAAGCGCCA CAAGGCAAACGAATGAAACAAAGTGTTCAGCAGTACTGCAGTAAACTTTTTTCCTACTTTGTGCAACAGCGGTAGGATTCTAGAGTGTAAAGTTGCTATACCAAAATACTAATATAAGTTGGGAACGGTTGAATTGCGCTAATTTTCTGTTTTATCACAGCAGTTAAGCATACATTTGTAGACGGTTTGAGTTTTGGTTTTCGGTTCTCTGCTGCTATTTTTTCAATGATAAAACG CCGTTTAAAACTGTGCTAAAAGCCTAATGCGTAAAA CCGTGCTGCCTTTCTCTATCTTACTATCGCATGTCAGCTGTCGGCTCGATAAAAGTGTTTGGAACCTATCATAGAGGAATGATTAACAGTCTGCTGCTGTATTGGAGTTTCATTTTAAAAAAAACCCCAGAAACTCTTCTGGTACCATTTTTATATTCTTAACTAACTCACTTGTTGCATTTGTTACGGAATAAGTGGCAATAAAAGCAATTGTTCAAAGTTTAATCGATTAATCAAATGCTTTTAAGCAGATAAAATTTCTTTTCTACGTCGTGTAATAAAATCGGAGTTTGGGGATCGAAAAATGTCTTAACAAACGGTGTGTTCATTTGTAGTTGATATGATTAAAATTCCCTACACAGCTTGTTGTATCGTGTTAAATATGGAGTTCGAAAATGAATTTTCGTTGGCGTCGATGTTGCATGAAACGCCTGGTGTTAAACTGTTGAGCTAACTTCAATCCTTCTTCTAAAAGTAATCATAACGACGAACAATTC                                                                             ]
[+] EMBL CNS09C1S             [   CGTTTTATGATCTAGAACTTGCTGCGGTATTCGTGCAATGATAAATCTACGATAGCGCTGATTGTTAAAATTGCCATATAGAAACTGCAACATAAGCTGACGGCAGAATGGCCCAAAAAGCGCCA CAAGGCAAACGAATGAAACAAAGTGTTCAGCAGTACTGCAGTAAACTTTTTTCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CNS09KCL             [      TTTATGATCTAGAACTTGCTGCGGTATTCGTGCAATGATAAATCTACGATAGCGCTGATTGTTAAAATTGCCATATAGAAACTGCAACATAAGCTGACGGCAGAATGGCCCAAAAAGCGCCA CAAGGCAAACGAATGAAACAAAGTGTTCAGCAGTACTGCAGTAAACTTTTTTCCTACTTTGTGCAACAGCGGTAGGATTCTAGAGTGTAAAGTTGCTATACCAAAATACTAATATAAGTTGGGAACGGTTGAATTGCGCTAATTTTCTGTTTTATCACAGCAGTAAAGCATACATTTGTAGACGGTTTGAGTTTTGGTTTTCGGTTCTCTGCTGCTATTTTTTCAATGATAAAACGCCCGTTTAAAACTGTGCTAAAAGCCTAATGCGTAAAACCCGTGCTGCCTTTCTCTATCTTACTATCGCATGTCAGCTGTCGGCTCGATAAAAGTGTTTGGAACCTATCATAGAGGAATGATTAACAGTCTGCTGCTGTATTGGAGTTTCATTTTAAAAAAAACCCCAGAAACTCTTCTGGTACCATTTTTATATTCTTAACTAACTCACTTGTTGCATTTGTTACGGAATAAGTGGCAATAAAAGCAATTGTTCAAAGTTTAATCGATTAATCAAATGCTTTTAAGCAGATAAAATTTCTTTTCTACGTCGTGTAATAAAATCGGAGTTTGGGGATCGAAAAATGTCTTAACAAACGGTGTGTTCATTTGTAGTTGATATGATTAAAATTCCCTACACAGCTTGTTGTATCGTGTTAAATATGGAGTTCGAAAATGAATTTTCGTTGGCGTCGATGTTGCATGAAACGCCTG                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CNS09CYO             [                                                                                                   CTGACGGCAGAATGGCCCAAAAAGCGCCAGCAAGGCAAACGAATGAAACAAAGTGTTCAGCAGTACTGCAGTAAACTTTTTTCCTACTTTGTGCAACAGCGGTAGGATTCTAGAGTGTAAAGTTGCTATACCAAAATACTAATATAAGTTGGGAACGGTTGAATTGCGCTAATTTTCTGTTTTATCACAGCAGTGAAGCATACATTTGTAGACGGTTTGAGTTTTGGTTTTCGGTTCTCTGCTGCTATTTTTTCAATGATAAAACG CCGTTTAAAACTGTGCTAAAAGCCTAATGCGTAAAA CCGTGCTGCCTTTCTCTATCTTACTATCGCATGTCAGCTGTCGGCTCGATAAAAGTGTTTGGAACCTATCATAGAGGAATGATTAACAGTCTGCTGCTGTATTGGAGTTTCATTTTAAAAAAAACCCCAGAAACTCTTCTGGTACCATTTTTATATTCTTAACTAACTCACTTGTTGCATTTGTTACGGAATAAGTGGCAATAAAAGCAATTGTTCAAAGTTTAATCGATTAATCAAATGCTTTTAAGCAGATAAAATTTCTTTTCTACGTCGTGTAATAAAATCGGAGTTTGGGGATCGAAAAATGTCTTAACAAACGGTGTGTTCATTTGTAGTTGATATGATTAAAATTCCCTACACAGCTTGTTGTATCGTGTTAAATATGGAGTTCGAAAATGAATTTTCGTTGGCGTCGATGTTGCATGAAACGCCTGGTGTTAAACTGTTGAGCTAACTTCAATCCTTCTTCTAAAAGTAATCATAACGACGAACAATTCTATCATTTGCG TTTATCTACGGATCTATGACCGTTCCCTTGCGTCAACTCGCTACTACACATTGCAGAACAATGGA]
[-] EMBL CNS09KCK             [                                                                                                                                            AATGAAACAAAGTGTTCAGCAGTACTGCAGTAAACTTTTTTCCTACTTTGTGCAACAGCGGTAGGATTCTAGAGTGTAAAGTTGCTATACCAAAATACTAATATAAGTTGGGAACGGTTGAATTGCGCTAATTTTCTGTTTTATCACAGCAGTGAAGCATACATTTGTAGACGGTTTGAGTTTTGGTTTTCGGTTCTCTGCTGCTATTTTTTCAATGATAAAACG CCGTTTAAAACTGTGCTAAAAGCCTAATGCGTAAAA CCGTGCTGCCTTTCTCTATCTTACTATCGCATGTCAGCTGTCGGCTCGATAAAAGTGTTTGGAACCTATCATAGAGGAATGATTAACAGTCTGCTGCTGTATTGGAGTTTCATTTTAAAAAAAACCCCAGAAACTCTTCTGGTACCATTTTTATATTCTTAACTAACTCACTTGTTGCATTTGTTACGGAATAAGTGGCAATAAAAGCAATTGTTCAAAGTTTAATCGATTAATCAAATGCTTTTAAGCAGATAAAATTTCTTTTCTACGTCGTGTAATAAAATCGGAGTTTGGGGATCGAAAAATGTCTTAACAAACGGTGTGTTCATTTGTAGTTGATATGATTAAAATTCCCTACACAGCTTGTTGTATCGTGTTAAATATGGAGTTCGAAAATGAATTTTCGTTGGCGTCGATGTTGCATGAAACGCCTGGTGTTAAACTGTTGAGCTAACTTCAATCCTTCTTCTAAAAGTAATCATAACGACGAACAATTCTATCATTTGCG TTTATCTACGGATCTATGACCGTTCCCTTGCGTCAACTCGCTACTACACATTGCAGAACAAT   ]
[-] EMBL CNS09C1R             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTCAGCTGTCGGCTCGATAAAAGTGTTTGGAACCTATCATAGAGGAATGATTAACAGTCTGCTGCTGTATTGGAGTTTCATTTTAAAAAAAACCCCAGAAACTCTTCTGGTACCATTTTTATATTCTTAACTAACTCACTTGTTGCATTTGTTACGGAATAAGTGGCAATAAAAGCAATTGTTCAAAGTTTAATCGATTAATCAAATGCTTTTAAGCAGATAAAATTTCTTTTCTACGTCGTGTAATAAAATCGGAGTTTGGGGATCGAAAAATGTCTTAACAAACGGTGTGTTCATTTGTAGTTGATATGATTAAAATTCCCTACACAGCTTGTTGTATCGTGTTAAATATGGAGTTCGAAAATGAATTTTCGTTGGCGTCGATGTTGCATGAAACGCCTGGTGTTAAACTGTTGAGCTAACTTCAATCCTTCTTCTAAAAGTAATCATAACGACGAACAATTCTATCATTTGCGTTTTATCTACGGATCTATG                                               ]


>consensus_7931#0 GTCCGTTTTATGATCTAGAACTTGCTGCGGTATTCGTGCAATGATAAATCTACGATAGCG CTGATTGTTAAAATTGCCATATAGAAACTGCAACATAAGCTGACGGCAGAATGGCCCAAA AAGCGCCACAAGGCAAACGAATGAAACAAAGTGTTCAGCAGTACTGCAGTAAACTTTTTT CCTACTTTGTGCAACAGCGGTAGGATTCTAGAGTGTAAAGTTGCTATACCAAAATACTAA TATAAGTTGGGAACGGTTGAATTGCGCTAATTTTCTGTTTTATCACAGCAGTGAAGCATA CATTTGTAGACGGTTTGAGTTTTGGTTTTCGGTTCTCTGCTGCTATTTTTTCAATGATAA AACGCCGTTTAAAACTGTGCTAAAAGCCTAATGCGTAAAACCGTGCTGCCTTTCTCTATC TTACTATCGCATGTCAGCTGTCGGCTCGATAAAAGTGTTTGGAACCTATCATAGAGGAAT GATTAACAGTCTGCTGCTGTATTGGAGTTTCATTTTAAAAAAAACCCCAGAAACTCTTCT GGTACCATTTTTATATTCTTAACTAACTCACTTGTTGCATTTGTTACGGAATAAGTGGCA ATAAAAGCAATTGTTCAAAGTTTAATCGATTAATCAAATGCTTTTAAGCAGATAAAATTT CTTTTCTACGTCGTGTAATAAAATCGGAGTTTGGGGATCGAAAAATGTCTTAACAAACGG TGTGTTCATTTGTAGTTGATATGATTAAAATTCCCTACACAGCTTGTTGTATCGTGTTAA ATATGGAGTTCGAAAATGAATTTTCGTTGGCGTCGATGTTGCATGAAACGCCTGGTGTTA AACTGTTGAGCTAACTTCAATCCTTCTTCTAAAAGTAATCATAACGACGAACAATTCTAT CATTTGCGTTTATCTACGGATCTATGACCGTTCCCTTGCGTCAACTCGCTACTACACATT GCAGAACAATGGA



consensusID : consensus_7931#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 598
fasta sequence
                              [ATGTGTCTGTTGTTATCACCAGCAGTGAAGCATACAGTTGTGTAGACGGTTTGAGTTTTGGTTNTTCGGTTGCTGCTGCTGCTATTTGTTTCAGCTGATAAAATGCCGTTTAAAACTGTGCTAGAAAGCCTAATGCGTAAAACCGTGCTGCCTGTTGCTCTATCTTAATCGCATGTCAGCTGTCGGCTCGATAAAAGTGTTTGGAAGCCTATCATAGAGGAATGATTAACAGTCTGCTGACTGTATTGGAGTTTCATGTTAAAGAGNAAAAGCCCAGAAACTCATCTGGTACACCATTTTGATAGTTCTNTAGAGGTAAGCGTNTGCTTATTGAATTTGTTACGGAATAAGTGGCAATAGAAAGCAAGTTGTGTCAAAGTGTTAAGTCGAGTTANAGTCAGAAGTGCTTTTAAGCGGATAAAAGTTTCTTTTCTACGTCGTTTGTCAACCGGAGTTTGGGGATCGCAAAATGTCTTGACAAACGGCGTGTTCATTTGTAGTTGATATGATTAAAATTCCACTACACAGCTTGTTGTATCGTGTTAAATATGGAGTCCAAAAATGAATTTTCGTTGGCGTCACCTCGGGCNATTCTTGC]

[-] EMBL AL931230             [ATGTGTCTGTTGTTATCACCAGCAGTGAAGCATACAGTTGTGTAGACGGTTTGAGTTTTGGTTNTTCGGTTGCTGCTGCTGCTATTTGTTTCAGCTGATAAAATGCCGTTTAAAACTGTGCTAGAAAGCCTAATGCGTAAAACCGTGCTGCCTGTTGCTCTATCTTAATCGCATGTCAGCTGTCGGCTCGATAAAAGTGTTTGGAAGCCTATCATAGAGGAATGATTAACAGTCTGCTGACTGTATTGGAGTTTCATGTTAAAGAGNAAAAGCCCAGAAACTCATCTGGTACACCATTTTGATAGTTCTNTAGAGGTAAGCGTNTGCTTATTGAATTTGTTACGGAATAAGTGGCAATAGAAAGCAAGTTGTGTCAAAGTGTTAAGTCGAGTTANAGTCAGAAGTGCTTTTAAGCGGATAAAAGTTTCTTTTCTACGTCGTTTGTCAACCGGAGTTTGGGGATCGCAAAATGTCTTGACAAACGGCGTGTTCATTTGTAGTTGATATGATTAAAATTCCACTACACAGCTTGTTGTATCGTGTTAAATATGGAGTCCAAAAATGAATTTTCGTTGGCGTCACCTCGGGCNATTCTTGC]


>consensus_7931#1 ATGTGTCTGTTGTTATCACCAGCAGTGAAGCATACAGTTGTGTAGACGGTTTGAGTTTTG GTTNTTCGGTTGCTGCTGCTGCTATTTGTTTCAGCTGATAAAATGCCGTTTAAAACTGTG CTAGAAAGCCTAATGCGTAAAACCGTGCTGCCTGTTGCTCTATCTTAATCGCATGTCAGC TGTCGGCTCGATAAAAGTGTTTGGAAGCCTATCATAGAGGAATGATTAACAGTCTGCTGA CTGTATTGGAGTTTCATGTTAAAGAGNAAAAGCCCAGAAACTCATCTGGTACACCATTTT GATAGTTCTNTAGAGGTAAGCGTNTGCTTATTGAATTTGTTACGGAATAAGTGGCAATAG AAAGCAAGTTGTGTCAAAGTGTTAAGTCGAGTTANAGTCAGAAGTGCTTTTAAGCGGATA AAAGTTTCTTTTCTACGTCGTTTGTCAACCGGAGTTTGGGGATCGCAAAATGTCTTGACA AACGGCGTGTTCATTTGTAGTTGATATGATTAAAATTCCACTACACAGCTTGTTGTATCG TGTTAAATATGGAGTCCAAAAATGAATTTTCGTTGGCGTCACCTCGGGCNATTCTTGC



consensusID : consensus_7931#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 522
fasta sequence
                              [CCAAATACTGAATATAAGTTGGGAACGGTTGAATTGCGCTAATTTTCTGTTTTATCACAGCAGTGAAGCATACATTTGTAGACGGTTTGAGTTTTGGTTTTCGGTTCTCTGCTGCTATTTTTTTACTGATAAAATGCCGTTTAAAACTGTGCTAAAAGCCTAATGCATAAAACCGTGCTGCCTTTCTCTATCTTACTATCGCATGTCAGCTGTCGGCTCGATAAAAGTGTTTGGAACCTATCATAGAGGAATGACTAACAGTCTGCTGCTGTATTGGAGTTTCATTTAAAAAAACCCAGAAACTCATCTGGTACCATTTTGATATTCTTAACTAACTTGCTTATTGCGGAATACGGAATAAGTGNCAATAAAAGCAATTGTTCAAAGTTTAATCGATTAATCAAATGCTTTTAAGCGGATAAAATTTCTTTTCTACGTCGTGTAATAAAACCGGAGTTTGGGGATCGAAAAATGTCTTGACAAACGGCGTGTTCATTTGTAGTTGATACCTCGGGGCGATTC]

[-] EMBL AL930076             [CCAAATACTGAATATAAGTTGGGAACGGTTGAATTGCGCTAATTTTCTGTTTTATCACAGCAGTGAAGCATACATTTGTAGACGGTTTGAGTTTTGGTTTTCGGTTCTCTGCTGCTATTTTTTTACTGATAAAATGCCGTTTAAAACTGTGCTAAAAGCCTAATGCATAAAACCGTGCTGCCTTTCTCTATCTTACTATCGCATGTCAGCTGTCGGCTCGATAAAAGTGTTTGGAACCTATCATAGAGGAATGACTAACAGTCTGCTGCTGTATTGGAGTTTCATTTAAAAAAACCCAGAAACTCATCTGGTACCATTTTGATATTCTTAACTAACTTGCTTATTGCGGAATACGGAATAAGTGNCAATAAAAGCAATTGTTCAAAGTTTAATCGATTAATCAAATGCTTTTAAGCGGATAAAATTTCTTTTCTACGTCGTGTAATAAAACCGGAGTTTGGGGATCGAAAAATGTCTTGACAAACGGCGTGTTCATTTGTAGTTGATACCTCGGGGCGATTC]


>consensus_7931#2 CCAAATACTGAATATAAGTTGGGAACGGTTGAATTGCGCTAATTTTCTGTTTTATCACAG CAGTGAAGCATACATTTGTAGACGGTTTGAGTTTTGGTTTTCGGTTCTCTGCTGCTATTT TTTTACTGATAAAATGCCGTTTAAAACTGTGCTAAAAGCCTAATGCATAAAACCGTGCTG CCTTTCTCTATCTTACTATCGCATGTCAGCTGTCGGCTCGATAAAAGTGTTTGGAACCTA TCATAGAGGAATGACTAACAGTCTGCTGCTGTATTGGAGTTTCATTTAAAAAAACCCAGA AACTCATCTGGTACCATTTTGATATTCTTAACTAACTTGCTTATTGCGGAATACGGAATA AGTGNCAATAAAAGCAATTGTTCAAAGTTTAATCGATTAATCAAATGCTTTTAAGCGGAT AAAATTTCTTTTCTACGTCGTGTAATAAAACCGGAGTTTGGGGATCGAAAAATGTCTTGA CAAACGGCGTGTTCATTTGTAGTTGATACCTCGGGGCGATTC



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_7931#0      GTCCGTTTTATGATCTAGAACTTGCTGCGGTATTCGTGCAATGATAAATCTACGATAGCG 60
consensus_7931#2      ------------------------------------------------------------
consensus_7931#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7931#0      CTGATTGTTAAAATTGCCATATAGAAACTGCAACATAAGCTGACGGCAGAATGGCCCAAA 120
consensus_7931#2      ------------------------------------------------------------
consensus_7931#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7931#0      AAGCGCCACAAGGCAAACGAATGAAACAAAGTGTTCAGCAGTACTGCAGTAAACTTTTTT 180
consensus_7931#2      ------------------------------------------------------------
consensus_7931#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7931#0      CCTACTTTGTGCAACAGCGGTAGGATTCTAGAGTGTAAAGTTGCTATACCAAAATACT-A 239
consensus_7931#2      -------------------------------------------------CCAAATACTGA 11
consensus_7931#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7931#0      ATATAAGTTGGGAACGGTTGAATTGCGCTAATTTTCTGTT-TTATCAC-AGCAGTGAAGC 297
consensus_7931#2      ATATAAGTTGGGAACGGTTGAATTGCGCTAATTTTCTGTT-TTATCAC-AGCAGTGAAGC 69
consensus_7931#1      -----------------------------ATGTGTCTGTTGTTATCACCAGCAGTGAAGC 31
                                                   *  * ****** ******* ***********

consensus_7931#0      ATACATTTGT--AGACGGTTTGAGTTTTGGTTTT-CGGTTCT--CTGCTGCTATTTTTTC 352
consensus_7931#2      ATACATTTGT--AGACGGTTTGAGTTTTGGTTTT-CGGTTCT--CTGCTGCTATTTTTTT 124
consensus_7931#1      ATACAGTTGTGTAGACGGTTTGAGTTTTGGTTNTTCGGTTGCTGCTGCTGCTATTTGTTT 91
                      ***** ****  ******************** * *****    ************ ** 

consensus_7931#0      --AATGATAAAACGCCGTTTAAAACTGTGCTA-AAAGCCTAATGCGTAAAACCGTGCTGC 409
consensus_7931#2      --ACTGATAAAATGCCGTTTAAAACTGTGCTA-AAAGCCTAATGCATAAAACCGTGCTGC 181
consensus_7931#1      CAGCTGATAAAATGCCGTTTAAAACTGTGCTAGAAAGCCTAATGCGTAAAACCGTGCTGC 151
                          ******** ******************* ************ **************

consensus_7931#0      CTTTCTCTATCTTACTATCGCATGTCAGCTGTCGGCTCGATAAAAGTGTTTGGAA-CCTA 468
consensus_7931#2      CTTTCTCTATCTTACTATCGCATGTCAGCTGTCGGCTCGATAAAAGTGTTTGGAA-CCTA 240
consensus_7931#1      CTGTTGCTCTATCTTAATCGCATGTCAGCTGTCGGCTCGATAAAAGTGTTTGGAAGCCTA 211
                      ** *  ** * *    *************************************** ****

consensus_7931#0      TCATAGAGGAATGATTAACAGTCTGCTG-CTGTATTGGAGTTTCATTTTAAA---AAAAA 524
consensus_7931#2      TCATAGAGGAATGACTAACAGTCTGCTG-CTGTATTGGAGTTTCATTTAAAA---AAA-- 294
consensus_7931#1      TCATAGAGGAATGATTAACAGTCTGCTGACTGTATTGGAGTTTCATGTTAAAGAGNAAAA 271
                      ************** ************* ***************** * ***    **  

consensus_7931#0      CCCCAGAAACTCTTCTGGTAC--CATTTTTATA-TTCTT---AACTAA---CTCACTTGT 575
consensus_7931#2      -CCCAGAAACTCATCTGGTAC--CATTTTGATA-TTCTT---AACTAA---CTTGCTTAT 344
consensus_7931#1      GCCCAGAAACTCATCTGGTACACCATTTTGATAGTTCTNTAGAGGTAAGCGTNTGCTTAT 331
                       *********** ********  ****** *** ****    *  ***       *** *

consensus_7931#0      TGCATTTGTTACGGAATAAGTGGCAATA-AAAGCAA-TTGT-TCAAAGTTT--AATCGAT 630
consensus_7931#2      TGCG--GAATACGGAATAAGTGNCAATA-AAAGCAA-TTGT-TCAAAGTTT--AATCGAT 397
consensus_7931#1      TGAATTTGTTACGGAATAAGTGGCAATAGAAAGCAAGTTGTGTCAAAGTGTTAAGTCGAG 391
                      **       ************* ***** ******* **** ******* *  * **** 

consensus_7931#0      TAATC-----AAATGCTTTTAAGCAGATAAAA-TTTCTTTTCTACGTCGTGTAATAAAAT 684
consensus_7931#2      TAATC-----AAATGCTTTTAAGCGGATAAAA-TTTCTTTTCTACGTCGTGTAATAAAAC 451
consensus_7931#1      TTANAGTCAGAAGTGCTTTTAAGCGGATAAAAGTTTCTTTTCTACGTCGTTTGTCAA--C 449
                      * *       ** *********** ******* ***************** *   **   

consensus_7931#0      CGGAGTTTGGGGATCGAAAAATGTCTTAACAAACGGTGTGTTCATTTGTAGTTGATATGA 744
consensus_7931#2      CGGAGTTTGGGGATCGAAAAATGTCTTGACAAACGGCGTGTTCATTTGTAGTTGATACCT 511
consensus_7931#1      CGGAGTTTGGGGATCGCAAAATGTCTTGACAAACGGCGTGTTCATTTGTAGTTGATATGA 509
                      **************** ********** ******** ********************   

consensus_7931#0      TTAAAATTCC-CTACACAGCTTGTTGTATCGTGTTAAATATGGAGTTCGAAAATGAATTT 803
consensus_7931#2      CGGGGCGATT-C------------------------------------------------ 522
consensus_7931#1      TTAAAATTCCACTACACAGCTTGTTGTATCGTGTTAAATATGGAGTCCAAAAATGAATTT 569
                                 *                                                

consensus_7931#0      TCGTTGGCGTCGATGTTGCATGAAACGCCTGGTGTTAAACTGTTGAGCTAACTTCAATCC 863
consensus_7931#2      ------------------------------------------------------------
consensus_7931#1      TCGTTGGCGTCACCTCGGGCNATTCTTGC------------------------------- 598
                                                                                  

consensus_7931#0      TTCTTCTAAAAGTAATCATAACGACGAACAATTCTATCATTTGCGTTTATCTACGGATCT 923
consensus_7931#2      ------------------------------------------------------------
consensus_7931#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7931#0      ATGACCGTTCCCTTGCGTCAACTCGCTACTACACATTGCAGAACAATGGA 973
consensus_7931#2      --------------------------------------------------
consensus_7931#1      --------------------------------------------------
                                                                        




Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)