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Anopheles gambiae
cluster # 7942 cluster # 7942       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7942#0 length = 1677 sequences # 8  

consensusID : consensus_7942#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1677
fasta sequence
                              [AACCAGTTCCGTGGCTCCCTCTGGTGGTCGTGCATGGAGCCTTTTTTGTTTCGGTTGCTTGCGCATCCGCATCCTTCCGCATCCGTACACGCTCTGTATGTGTACACGCGAGCGGTGGAAGGATTTTTGGTGCTTTCCACACAACGATCCACACACCCTTGATTGAAGGTTTAATATCCGTATGTGCTGTGCATGAGAGATAGGTAATTGTTTCTGTTTTAAGGAAAACATACACGTGGCATTTAGCCGAAGAGCG-TTGGTGGCAAGCAGGGCCGATGAAAATTTCAAACTTTTCACACATCTTCATCGTAACCACGTGCTATTAGTGTGTGTGCTTTACGCAGGAATACACAAAGCTAACGAGCAAAGCGACACCTGGTGGTAG-TGGATGGAACTTATCTTTAACGGATAGAGGATCG-AACAAGGGTCCTTACCCTTTT-TACCACCTCACACACACTAACACAGCTGGTATCGGTGTAAATAGTTCTATAGTTACAAGCGGTGCTAACAG-TTACATGTGTGCTAAAAATAGCTCGGTGGTCTCATTTTCCCCCTTGGCTGGGAGAGGAGTACGCACTTTTTACATCGGCAGTGGGGTGGGTTCCCCCCTCCCCCTTGCCATTGCTATCATCCCCAACTGCTGTTAAGCAAGTTTCTCAGCAAATCTTTAATATGCCTATTTATATGAAGT-AAAAAAAATCCCCGGCCGTTATTAATGTTATTAACAAACTATTTATGCTTAACTACTTGTACATACACATTCCCCGCCCTTTTCCCCTGGTCCCTTATTCCGTGGATTACTCCATGGATTG---TTTTTTTTTTATTTTCATATTTTTGTTTCCTTTTTTGTTGCTCCCAACTTGCCGGTATTGAGTTTTGAGCTCAAAGTTTTACAAAGTTAGAAAGCGGTATCCGGGCTGTTGTATGCTTAGT--AAAAAAACAGTTTAGTG-TTTTTTTTTGGTAATATTACCGCAGCAAATGTAAAGCTAGCCGTACGGTAGTTTGCGTTACAGGGAATAACTGGCTTCGCCAGTCGAGAAATGATTGGCGGTAATGGATGGACTGAGTGGATGCGCTACACAATTGTGCAGTGCATCGTGAAAAGTGGCTTGTGATGGTGGCGTACTACGGCCGTACGAGAACCGTACAAGGGCTCGTCAAAGGATAGACGAGGGTGAATGTGTGCGCGGGCTCGTGCACTTATTGAACCGTTCTGCTACTCTCTGAACAGTGCTTAAACGCTACTGCTAATCCTACTGTACTACT--ACAACAACCACTACTACTACTACTACTACTCTAAATGCTGTGTTTGCTGAATCGTACCCGACAACCGATGTGATGGATAGTTTTGTTTTTTTTTTATATACATTAATAATATTATTAGTTTTATACACTTTTGTACATATACATATATACATTAACATTAGAATGCAGTAAGTGAATACNAACCCGTAGCTTTCCAATGTTGTAGTAAGATAATTTAGGCTGCCGGAAAGGAGGAGAAGGGGTGCAATTGGAATGCAAAAAAAAAAGATAAATTNGTATGTAAAATATTAAGTGCAAAGGGACCGTAGGGAGGAGCGCGTAAAAAAAACAAGTNNCGAAAGCTNAGGGAAAATATTATATATGGGGAAAAGTTGTAAAATAATAAAAACAAAAACAAAACGAAAAAAAAAA]

[-] EMBL BM591620             [AACCAGTTCCGTGGCTCCCTCTGGTGGTCGTGCATGGAGCCTTTTTTGTTTCGGTTGCTTGCGCATCCGCATCCTTCCGCATCCGTACACGCTCTGTATGTGTACACGCGAGCGGTGGAAGGATTTTTGGTGCTTTCCACACAACGATCCACACACCCTTGATTGAAGGTTTAATATCCGTATGTGCTGTGCATGAGAGATAGGTAATTGTTTCTGTTTTAAGGAAAACATACACGTGGCATTTAGCCGAAGAGCG TTGGTGGCAAGCAGGGCCGATGAAAATTTCAAACTTTTCACACATCTTCATCGTAACCACGTGCTATTAGTGTGTGTGCTTTACGCAGGAATACACAAAGCTAACGAGCAAAGCGACACCTGGTGGTAG TGGATGGAACTTATCTTTAACGGATAGAGGATCG AACAAGGGTCCTTACCCTTTT TACCACCTCACACACACAAACACAGCTGGTATCGGTGTAAATAGTTCTATAGTTACAAGCGGTGCTAACAG TTACATGTGTGCTAAAAATTGCTCGGTGGTCTCATTTTCCCCCTTGGCTGGGAGAGGAGTACGCACTTTTTACATCGGCAGTGGGGTGGGTTCCCCCCTCCCCCTTGCCATTGCTATCATCCCCAACTGCTGTTAAGCAAGTTTCTCAGCAAATCTTTAATATGCCTATTTATATGAAGTAAAAAAAAATCCCCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BX618230             [                                                                                                                                                                                     ATGTGCTGTGCATGAGAGAAAGGTAATTGTTTCTGTTTTAAGGAAAACATACACGTGGCATTTAGCCGAAGAGCGTTTGTTGGCAAGCAGGGCCGAAGAAATTTTCAAACTTTTCACACAACTTCATCGTAACCACGTGCTATTAGTGTGTGCGCTTTACGCAGGAATACACAAAGCCAACGAGCAAAGCGACACCTGGTGGTAG TGGAAGGAACTTATCTTTAACGGATAGAGGAACG AACAAGGGTCCTTACCCTTTT TACCACCTCACACACACTAACACAGCTGGTATCGGTGTAAATAGTTCTATAGTTACAAGCGGTGCTAACAG TTACATGTGTGCTAAAAATAGCTCGGTGGTCTCATTTCCCCCCTTGGCTGGGAGAGGAGTATGCACTTTTTACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BX619699             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAAGCGACACCTGGTGGTAGCTGGATGGAACTTATCTTNAACGGATATAGGATCGCAACAAGGGTCCTTACCCTTTTCTACCACCTCACACACACTAACACAGCTGGTATCGGTGTAAATAGTTCTATAGTTACAAGCGGTGCTAACAGTTTACATGTGTGCTAAAAATAGCTCGGTGGTCTCATTTCCCCCCTTGGCTGGGAGAGGAGTATGCACTTTTTACATCcg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BX621178             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTCCCCCTTGGCTGGGAGAGGAGTACGCACTTTTTACATCGGCAGTGGGGTGGGTTCCCCCCTCCCCCTTGCCATTGCTATCATCCCCAACTGCTGTTAAGCAAGTTTCTCAGCAAATCTTTAATATGCCTATTTATATGAAGT AAAAAAAATCCCGCCCCGTTATTAATGTTATTAACAAACTATTTATGCTTAACTACTTGTACATACACATTCCCCGCCCTTTCCCCCTGGTCCCTTATTCCGTGGATTACTCCATGGATTG    TTTTTTTTTATTTTCATATTTTTGTTTCCTTTTTTGTTGCTCCCAACTTGCCGGTATTGAGTTTTGAGCTCAAAGTTTTACAAAGTTAGAAAGCGGTATCCGGGCTGTTGAATGCTTAGT   AAAAAACAGTTTAGTGTTTTTTTTTTGGTAATATTACCGCAGCAAATGTAAAGCTAGCCGTACGGTAGTTTGCGTTACAGGGAATAACTGGCTTCGCCAGTGGAGAAATGATTGGCGGTAATGGATGGACTGAGTGGATGCGCTACACAATTGTGCAGTGCATCGTGAAAAGTGGCTTGTGATGGTGGCGTACTACGGNCGTACGAGAACCGTACAAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BX628770             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TATTAATGTTATTAACAAACTATTTATGCTTAACTACTTGTACATACACATTCCCCGCCCTTTTCCCCTGGTCCCTTATTCCGTGGATTACTCCATGGATTGTTTTTTTTTTTTTATTTTCATATTTTTGTTTCCTTTTTTGTTGCTCCCAACTTGCCGGTATTGAGTTTTGAGCTCAAAGTTTTACAAAGTTAGAAAGCGGTATCCGGGCTGTTGTATGCTTAGTAAAAAAAAACAGTTTAGTG TTTTTTTTTGGTAATATTACCGCAGCAAATGTAAAGCTAGCCGTACGGTAGTTTGCGTTACAGGGAATAATTGGCTTCGCCAGTCGAGAAATGATTGGCGGTAATGGATGGACTGAGTGGATGCGCTACACAATTGTGCAGTGCATCGTGAAAAGTGGCTTGTGATGGTGGCGTACTACGGCCGTACGAGAACCGTACAAGGGCTCGTCAAAGGATAGACGAGGGTGAATGTGTGCGCGGGCTCGTGCACTTATTGAACCGTTCTGCTACTCTCTGAACAGTGCTTAAACGCTACTGCTAATCCTACTGTACTACT  ACAACAACCACTACTACTACTACTACTACTCTAAATGCTGTGTTTGCTGAATCGTACCCGACAACCGATGTGATGGATAGTTTTGTTTTTTTTTTATATACATTAATAATATTATTAGTTTTATACACTTTTGTACATATACATATATACATTAACATTAGAATGCAGTAAGTGAATACNAACCCGT                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BX628843             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATGTTATTAACAAACTATTTATGCTTAACTACTTGTACATACACATTCCCCGCCCTTTTCCCCTGGTCCCTTATTCCGTGGATTACTCCATGGATTGTTTTTTTTTTTTTATTTTCATATTTTTGTTTCCTTTTTTGTTGCTCCCAACTTGCCGGTATTGAGTTTTGAGCTCAAAGTTTTACAAAGTTAGAAAGCGGTATCCGGGCTGTTGTATGCTTAGTAAAAAAAAACAGTTTAGTG TTTTTTTTTGGTAATATTACCGCAGCAAATGTAAAGCTAGCCGTACGGTAGTTTGCGTTACAGGGAATAATTGGCTTCGCCAGTCGAGAAATGATTGGCGGTAATGGATGGACTGAGTGGATGCGCTACACAATTGTGCAGTGCATCGTGAAAAGTGGCTTGTGATGGTGGCGTACTACGGCCGTACGAGAACCGTACAAGGGCTCGTCAAAGGATAGACGAGGGTGAATGTGTGCGCGGGCTCGTGCACTTATTGAACCGTTCTGCTACTCTCTGAACAGTGCTTAAACGCTACTGCTAATCCTACTGTACTACT  ACAACAACCACTACTACTACTACTACTACTCTAAATGCTGTGTTTGCTGAATCGTACCCGACAACCGATGTGATGGATAGTTTTGTTTTTTTTTTATATACATTAATAATATTATTAGTTTTATACACTTTTGTACATATACATATATACATTAACATTAGAA                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BM645470             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ccgCCCTTATTCTGTGGATTACTCCATGGATTG   TTTTTTTTTTATTTTCATATTTTTGTTTTCTTTTTTGTTGCTCCCAACTTGCCGGTATTGAGTTTTGAGCTCAAAGTTTTACAAAGTTAGAAAGCGGTATCCGGGCTGTTGTATGCTTAGT  AAAAAAACAGTTAAGTG TTTTTTTTTTGTAATATTAACGCTGCAAAGATAAAGCTAGCTGTACGGTAGTTTGCGTTACAGGGAATAACTGGCTTCGCCAGTCGAGAAATGATTGGCGGTAATGGATGGACTGAGCGGATGCGCTACACAATTGCGCAGTGCATCGTGAAAAGTGGCTTGTGATGGTGGCGTACTACGGCCGTACGAGAACCGTACAAGGGCTCGTCAAAGGATAGACGAGGGTGAATGTGTGCGCGGGCTCGTGCACTTATTGAACCGTTCTGCTACTCTCTGAACAGTGCTAAAACGCTACTGCTAATCCTACTGTACTACTACACAACAACCACTACTACTACTACTACTACTCTAAATGCTGTGTTTGCTGAATCGTACCCGACAACCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CF541921             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTGCTACTCTCTGAACAGTGCTAAAACGCTACTGCTAATCCTACTGTACTACTACACAACAACCACTACTACTACTACTACTACTCTAAATGCTGTGTTTGCTGAATCGTACCCGAC ACCGATGTGATGGATAGTTTTG TTTTTTTTTATATACATTAATAATATTATTAGTTTTATACACTTTTGTACATATACATATATACATTAACATTAGAATGCAGTAAGTGAATACAAACCCGTAGCTTTCCAATGTTGTAGTAAGATAATTTAGGCTGCCGGAAAGGAGGAGAAGGGGTGCAATTGGAATGCAAAAAAAAAAGATAAATTNGTATGTAAAATATTAAGTGCAAAGGGACCGTAGGGAGGAGCGCGTAAAAAAAACAAGTNNCGAAAGCTNAGGGAAAATATTATATATGGGGAAAAGTTGTAAAATAATAAAAACAAAAACAAAACGAAAAAAAAAA]


>consensus_7942#0 AACCAGTTCCGTGGCTCCCTCTGGTGGTCGTGCATGGAGCCTTTTTTGTTTCGGTTGCTT GCGCATCCGCATCCTTCCGCATCCGTACACGCTCTGTATGTGTACACGCGAGCGGTGGAA GGATTTTTGGTGCTTTCCACACAACGATCCACACACCCTTGATTGAAGGTTTAATATCCG TATGTGCTGTGCATGAGAGATAGGTAATTGTTTCTGTTTTAAGGAAAACATACACGTGGC ATTTAGCCGAAGAGCGTTGGTGGCAAGCAGGGCCGATGAAAATTTCAAACTTTTCACACA TCTTCATCGTAACCACGTGCTATTAGTGTGTGTGCTTTACGCAGGAATACACAAAGCTAA CGAGCAAAGCGACACCTGGTGGTAGTGGATGGAACTTATCTTTAACGGATAGAGGATCGA ACAAGGGTCCTTACCCTTTTTACCACCTCACACACACTAACACAGCTGGTATCGGTGTAA ATAGTTCTATAGTTACAAGCGGTGCTAACAGTTACATGTGTGCTAAAAATAGCTCGGTGG TCTCATTTTCCCCCTTGGCTGGGAGAGGAGTACGCACTTTTTACATCGGCAGTGGGGTGG GTTCCCCCCTCCCCCTTGCCATTGCTATCATCCCCAACTGCTGTTAAGCAAGTTTCTCAG CAAATCTTTAATATGCCTATTTATATGAAGTAAAAAAAATCCCCGGCCGTTATTAATGTT ATTAACAAACTATTTATGCTTAACTACTTGTACATACACATTCCCCGCCCTTTTCCCCTG GTCCCTTATTCCGTGGATTACTCCATGGATTGTTTTTTTTTTATTTTCATATTTTTGTTT CCTTTTTTGTTGCTCCCAACTTGCCGGTATTGAGTTTTGAGCTCAAAGTTTTACAAAGTT AGAAAGCGGTATCCGGGCTGTTGTATGCTTAGTAAAAAAACAGTTTAGTGTTTTTTTTTG GTAATATTACCGCAGCAAATGTAAAGCTAGCCGTACGGTAGTTTGCGTTACAGGGAATAA CTGGCTTCGCCAGTCGAGAAATGATTGGCGGTAATGGATGGACTGAGTGGATGCGCTACA CAATTGTGCAGTGCATCGTGAAAAGTGGCTTGTGATGGTGGCGTACTACGGCCGTACGAG AACCGTACAAGGGCTCGTCAAAGGATAGACGAGGGTGAATGTGTGCGCGGGCTCGTGCAC TTATTGAACCGTTCTGCTACTCTCTGAACAGTGCTTAAACGCTACTGCTAATCCTACTGT ACTACTACAACAACCACTACTACTACTACTACTACTCTAAATGCTGTGTTTGCTGAATCG TACCCGACAACCGATGTGATGGATAGTTTTGTTTTTTTTTTATATACATTAATAATATTA TTAGTTTTATACACTTTTGTACATATACATATATACATTAACATTAGAATGCAGTAAGTG AATACNAACCCGTAGCTTTCCAATGTTGTAGTAAGATAATTTAGGCTGCCGGAAAGGAGG AGAAGGGGTGCAATTGGAATGCAAAAAAAAAAGATAAATTNGTATGTAAAATATTAAGTG CAAAGGGACCGTAGGGAGGAGCGCGTAAAAAAAACAAGTNNCGAAAGCTNAGGGAAAATA TTATATATGGGGAAAAGTTGTAAAATAATAAAAACAAAAACAAAACGAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)