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Anopheles gambiae
cluster # 8089 cluster # 8089       Sequences # 9       consensus # 4


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8089#0 length = 727 sequences # 4  
consensus_8089#1 length = 688 sequences # 1  
consensus_8089#2 length = 685 sequences # 3  
consensus_8089#3 length = 657 sequences # 1  

consensusID : consensus_8089#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 727
fasta sequence
                              [AGAATCGCNGAGGTA-TTTCTGTGCCGTCTGTGCGTGAGCCCGTCGGTAATTTAGTGTTTTTCTCCCCCGGAGTTTGGTGTTTTTGGTGCTGCGGCTTTGCATAAATCCTCCTTGGAGTTTCCCGTTTTATCGCCTAAAGTGTGGCATAGT-CCTAGCGGCCTTCGAAAATGGTGGACTACGGCAAGCAGTTCATGCTGTACCTGATGGACGAGAAGTGCTACGATAATTACTTCGTAGAGTTCGACCTGCTCGATGGTGACTGTTTCCGGGCGCTGCTCAGCAAGGGCCTAGGGCTCGGCATCATCGCCGGCTCGGTGCTGGTAAAGGTGCCCCAGATTACGAAGATTCTCGCCAACAAGTCGGCCCGCGGCATCAGCCTGTTCAGCGTGCTGCTGGACCTGTTCGCCATCACGATCCACATGGCGTACAGCTTCGTGAACGGTTTTCCGTTCAGTGCCTGGGGCGATACGGCCTTCCTTGCCCTGCAGACGGCCATCATTGCGATGATGGTGCTGTTCTACGGTGGTTCTACCGTGCTTGCCGGTGCCTTTACCGTCGGCTATTCCGCGCTGGTGTACGTGCTGATGGGTGGGCTGACCCCGCTCAACTATCTGCTCATTGCGCAAGGGTTCAACGTGCCGATACTGCTGCTCGGGAAGCTGTCGCAGGCATTCACCAACTATCGCAACGGTAGCACCGGGCAGCTATCGGCGGTAACGTGCTTTAT]

[+] EMBL AL696927             [AGAATCGCNGAGGTA TTTCTGTGCCGTCTGTGCGTGAGCCCGTCGGTAATTTAGTGTTTTTCTCCCCCGGAGTTTGGTGTTTTTGGTGCTGCGGCTTTGCATAAATCCTCCTTGGAGTTTCCCGTTTTATCGCCTAAAGTGTGGCATAGT CCTAGCGG CTTCGAAAATGGTGGACTACGGCAAGCAGTTCATGCTGTACCTGATGGACGAGAAGTGCTACGATAATTACTTCGTAGAGTTCGACCTGCTCGATGGTGACTGTTTCCGGGCGCTGCTCAGCAAGGGCCTA GGCTCGGCATCATCGCCGGCTCGGTGCTGGTAAAGGTGCCCCAGATTACGAAGATTCTCGCCAACAAGTCGGCCCGCGGCATCAGCCTGTTCAGCGTGCTGCTGGACCTGTTCGCCATCACGATCCACATGGCGTACAGCTTCGTGAACGGTTTTCCGTTCAGTGCCTGGGGCGATACGGCCTTCCTTGCCCTGCAGACGGCCATCATTGCGATGATGGTGCTGTTCTACGGTGGTTCTACCGTGCTTGCCGGTGCCTTTACCGTCGGCTATTCCGCGCTGGTGTACGTGCTGATGGGTGGGCTGACCCCGCTCAACTATCTGCTCATTGCGCAAGGGTTCAACGTGCCGATACTGCTGCTCGGGAAGCTGTCGCAGGCATTCACCAACTATCGCAACGGTAGCACCGGGCAGCTATCGGCGGTAACG        ]
[+] EMBL AL693523             [       ccGAGGTATTTTCTGTGCCGTCTGTGCGTGAGCCCGTCGGT ATTTAGTGTTTTTCTCCCTCGGAGTTTGGTG CTTTGGTATTGCCGCTTTGCATAAACCCTCCTTGGAGTTTCCCGTCTTATCGCCCAAAGTGTGGCATAGT CCTAGCGGCCTTCGAAAATGGTGGACTACGGCAAGCAGTTCATGCTGTACCTGATGGACGAGAAGTGCTACGATAATTACTTCGTAGAGTTCGACCTGCTCGATGGCGACTGTTTCCGGGCGCTGCTCAGCAAGGGCCTAGGGCTCGGCATCATCGCCGGCTCGGTGCTGGTAAAGGTGCCCCAGATTACGAAGATTCTCGCCAACAAGTCGGCCCGCGGCATCAGCCTGTTCAGCGTGCTGCTGGATCTGTTCGCCATCACGATCCACATGGCGTACAGCTTCGTGAACGGGTTTCCGTTCAGTGCGTGGGGCGATACGGCCTTCCTCGCCCTGCAGACGGCCATCATTGCGATAATGGTGCTGTTCTACGGTGGTTCTACCGTGCTTGCCGGTGCCTTTACCGTCGGCTATTCC                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BM644221             [                                                                   CCGGAGTTTGGTGCTTTTGGTGTTGCTGTTTTGCATAAACCCTCCTTGGAGTTTCCCGTTTCATCGCCTAAAGTGTGGCATAGTCCCTAGCGGCCTTCGAAAATGGTAGACTACGGCAAGCAGTTCATGCTGTACCTGATGGACGAGAAGTGCTACGATAATTACTTCGTAGAGTTTGATCTGCTCGATGGTGACTGTTTCCGGGCGCTGCTCAGCAAGGGCCTAGGGCTCGGCATCATCGCCGGCTCGGTGCTGGTAAAGGTGCCCCAGATTACGAAGATTCTCGCCAACAAGTCGGCCCGCGGCATCAGCCTGTTCAGCGTGCTGCTGGACCTGTTCGCCATCACGATCCACATGGCGTACAGCTTCGTGAACGGGTTTCCGTTCAGTGCCTGGGGCGATACGGCCTTCCTCGCCCTGCAGACGGCCATCATTGCGATGATGGTGCTGTTCTACGGTGGTTCTACCGTGCTTGCCGGTGCCTTTACCGTCGGCTATTCCGCGCTGGTGTACGTGCTGATGGGTGGGCTGACCCCACTGAACTATCTGCTCATTGCGCAAGGGTTCAACGTGCCGATACTGCTGCTCGGGAAGCTGTCGCAGGCATTCACCAACTATCGCAACGGTAGCACCGGGCAGCTATCGGCGGTAACGTGCTTTAT]
[+] EMBL BM622033             [                                                                          ccGGTGTTTTTGGTGCTGCGGCTTTGCATAAATCCTCCTTGGAGTTTCCCGTTTTATCGCCTAAAGTGTGGCATAGT CCTAGCGGCCTTCGAAAATGGTGGACTACGGCAAGCAGTTCATGCTGTACCTGATGGACGAGAAGTGCTACGATAATTACTTCGTAGAGTTCGACCTGCTCGATGGTGACTGTTTCCGGGCGCTGCTCAGCAAGGGCCTAGGGCTCGGCATCATCGCCGGCTCGGTGCTGGTAAAGGTGCCCCAGATTACGAAGATTCTCGCCAACAAGTCGGCCCGCGGCATCAGCCTGTTCAGCGTGCTGCTGGACCTGTTCGCCATCACGATCCACATGGCGTACAGCTTCGTGAACGGTTTTCCGTTCAGTGCCTGGGGCGATACGGCCTTCCTTGCCCTGCAGACGGCCATCATTGCGATGATGGTGCTGTTCTACGGTGGTTCTACCGTGCTTGCCGGTGCCTTTACCGTCGGCTATTCCGCGCTGGTGTACGTGCTGATGGGTGGGCTGACCCCGCTCAACTATCTGCTCATTGCGCAAGGGTTCAACGTGCCGATACTGCTGCTCGGGAAGCTGTCGCAGGCATTCACCAACTATCGCAACGGTAGCACCGGGCAGCTATCGGCGGT            ]


>consensus_8089#0 AGAATCGCNGAGGTATTTCTGTGCCGTCTGTGCGTGAGCCCGTCGGTAATTTAGTGTTTT TCTCCCCCGGAGTTTGGTGTTTTTGGTGCTGCGGCTTTGCATAAATCCTCCTTGGAGTTT CCCGTTTTATCGCCTAAAGTGTGGCATAGTCCTAGCGGCCTTCGAAAATGGTGGACTACG GCAAGCAGTTCATGCTGTACCTGATGGACGAGAAGTGCTACGATAATTACTTCGTAGAGT TCGACCTGCTCGATGGTGACTGTTTCCGGGCGCTGCTCAGCAAGGGCCTAGGGCTCGGCA TCATCGCCGGCTCGGTGCTGGTAAAGGTGCCCCAGATTACGAAGATTCTCGCCAACAAGT CGGCCCGCGGCATCAGCCTGTTCAGCGTGCTGCTGGACCTGTTCGCCATCACGATCCACA TGGCGTACAGCTTCGTGAACGGTTTTCCGTTCAGTGCCTGGGGCGATACGGCCTTCCTTG CCCTGCAGACGGCCATCATTGCGATGATGGTGCTGTTCTACGGTGGTTCTACCGTGCTTG CCGGTGCCTTTACCGTCGGCTATTCCGCGCTGGTGTACGTGCTGATGGGTGGGCTGACCC CGCTCAACTATCTGCTCATTGCGCAAGGGTTCAACGTGCCGATACTGCTGCTCGGGAAGC TGTCGCAGGCATTCACCAACTATCGCAACGGTAGCACCGGGCAGCTATCGGCGGTAACGT GCTTTAT



consensusID : consensus_8089#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 688
fasta sequence
                              [CGAGGTTACATTCTGATGTTGGAGCGGCGCACATGCCTGTTTTTTATTTTATTTTTNTATCTAGTGCCGTACTGTGCGTGAGCCCCGTACGGTAATTATAGTAGTTTATATACTACCCTACGGAGTATTGGTGCTATTTGGTATATGCCGCTTATGCATAAACCCTACCTTGGAGTTNTCCCGTACTTATCGCCCAAAGTGTGGCATAGTCCTAGACGGCTTCGAAAATGGTGGACTACGGCAAGCAGTTCATGCTGTACCTGATGGACAGAGAAGTGCTACGATAATTACTTCGTAGAGTTCGANCTGCTCGATGGCGATGTTTCCGGGCGCTGCTCAGACCAAGGGCCTANNGGCTCGGCCATCATCGCCGGCCTCGGCTGCTGGTANAGGTGCCCCANATTNACGAANGNATTCTCGCCAACAAAGTCGGCCCGCGGCATCAGCCTGTTCACGCGTGCCTGCTGAGCATCTGTACCGCCATCACGATCCACACTGGCGNTACAGCTTCGCTGAACGGGTTTCCGTTCAGTGCGTGGGGCGATACGGCTTCCTCGCCCTGCCGCACGGCCATCATTGCGCACTCANCTGGCTGCTGTTCTACGCGNGGTNCTACCGTGCCTTGCCGGCTGCCTTCTACCGCTCGCGCTATTCCGCGCTGGTGTTCGTGCTGACTGGCTGCGNTCNG]

[+] EMBL AL694477             [CGAGGTTACATTCTGATGTTGGAGCGGCGCACATGCCTGTTTTTTATTTTATTTTTNTATCTAGTGCCGTACTGTGCGTGAGCCCCGTACGGTAATTATAGTAGTTTATATACTACCCTACGGAGTATTGGTGCTATTTGGTATATGCCGCTTATGCATAAACCCTACCTTGGAGTTNTCCCGTACTTATCGCCCAAAGTGTGGCATAGTCCTAGACGGCTTCGAAAATGGTGGACTACGGCAAGCAGTTCATGCTGTACCTGATGGACAGAGAAGTGCTACGATAATTACTTCGTAGAGTTCGANCTGCTCGATGGCGATGTTTCCGGGCGCTGCTCAGACCAAGGGCCTANNGGCTCGGCCATCATCGCCGGCCTCGGCTGCTGGTANAGGTGCCCCANATTNACGAANGNATTCTCGCCAACAAAGTCGGCCCGCGGCATCAGCCTGTTCACGCGTGCCTGCTGAGCATCTGTACCGCCATCACGATCCACACTGGCGNTACAGCTTCGCTGAACGGGTTTCCGTTCAGTGCGTGGGGCGATACGGCTTCCTCGCCCTGCCGCACGGCCATCATTGCGCACTCANCTGGCTGCTGTTCTACGCGNGGTNCTACCGTGCCTTGCCGGCTGCCTTCTACCGCTCGCGCTATTCCGCGCTGGTGTTCGTGCTGACTGGCTGCGNTCNG]


>consensus_8089#1 CGAGGTTACATTCTGATGTTGGAGCGGCGCACATGCCTGTTTTTTATTTTATTTTTNTAT CTAGTGCCGTACTGTGCGTGAGCCCCGTACGGTAATTATAGTAGTTTATATACTACCCTA CGGAGTATTGGTGCTATTTGGTATATGCCGCTTATGCATAAACCCTACCTTGGAGTTNTC CCGTACTTATCGCCCAAAGTGTGGCATAGTCCTAGACGGCTTCGAAAATGGTGGACTACG GCAAGCAGTTCATGCTGTACCTGATGGACAGAGAAGTGCTACGATAATTACTTCGTAGAG TTCGANCTGCTCGATGGCGATGTTTCCGGGCGCTGCTCAGACCAAGGGCCTANNGGCTCG GCCATCATCGCCGGCCTCGGCTGCTGGTANAGGTGCCCCANATTNACGAANGNATTCTCG CCAACAAAGTCGGCCCGCGGCATCAGCCTGTTCACGCGTGCCTGCTGAGCATCTGTACCG CCATCACGATCCACACTGGCGNTACAGCTTCGCTGAACGGGTTTCCGTTCAGTGCGTGGG GCGATACGGCTTCCTCGCCCTGCCGCACGGCCATCATTGCGCACTCANCTGGCTGCTGTT CTACGCGNGGTNCTACCGTGCCTTGCCGGCTGCCTTCTACCGCTCGCGCTATTCCGCGCT GGTGTTCGTGCTGACTGGCTGCGNTCNG



consensusID : consensus_8089#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 685
fasta sequence
                              [CCGGTTGTCCTTTTTTTCTGTGCCGTCTGTGCGTGAGCCCCGTCGGTAATTTAGTGTTTTTCTCCCCCGGAGTTTGGTGTTTTTGGTGCTGCGGCTTTGCATAAATCCTCCTTGGAGTTTCCCGTTTTATCGCCTAAAGTGTGGCATAGTCCTAGCGGCCTTCGAAAATGGTGGACTACGGCAAGCAGTTCATGCTGTACCTGATGGACGAGAAGTGCTACGATAATTACTTCGTAGAGTTCGACCTGCTCGATGGTGACTGTTTCCGGGCGCTGCTCAGCAAGGGCCTAGGGCTCGGCATCATCGCCGGCTCGGTGCTGGTAAAGGTGCCCCAGATTACGAAGATTCTCGCCAACAAGTCGGCCCGCGGCATCAGCCTGTTCAGCGTGCTGCTGGACCTGTTCGCCATCACGATCCACATGGCGTACAGCTTCGTGAACGGTTTTCCGTTCAGTGCCTGGGGCGATACGGCCTTCCTTGCCCTGCAGACGGCCATCATTGCGATGATGGTGCTGTTCTACGGTGGTTCTACCGTGCTTGCCGGTGCCTTTACCGTCGGCTATTCCGCGCTGGTGTACGTGCTGATGGGTGGGCTGACCCCGCTCAACTATCTGCTCATTGCGCAAGGGTTCAACGTGCCGATACTGCTGCTTCGGGAAGCTGTCGCAGGCATTCACCAACTATC]

[+] EMBL BM588940             [CCGGTTGTCCTTTTTTTCTGTGCCGTCTGTGCGTGAGCCCCGTCGGTAATTTAGTGTTTTTCTCCCCCGGAGTTTGGTGTTTTTGGTGCTGCGGCTTTGCATAAATCCTCCTTGGAGTTTCCCGTTTTATCGCCTAAAGTGTGGCATAGTCCTAGCGGCCTTCGAAAATGGTGGACTACGGCAAGCAGTTCATGCTGTACCTGATGGACGAGAAGTGCTACGATAATTACTTCGTAGAGTTCGACCTGCTCGATGGTGACTGTTTCCGGGCGCTGCTCAGCAAGGGCCTAGGGCTCGGCATCATCGCCGGCTCGGTGCTGGTAAAGGTGCCCCAGATTACGAAGATTCTCGCCAACAAGTCGGCCCGCGGCATCAGCCTGTTCAGCGTGCTGCTGGACCTGTTCGCCATCACGATCCACATGGCGTACAGCTTCGTGAACGGTTTTCCGTTCAGTGCCTGGGGCGATACGGCCTTCCTTGCCCTGCAGACGGCCATCATTGCGATGATGGTGCTGTTCTACGGTGGTTCTACCGTGCTTGCCGGTGCCTTTACCGTCGGCTATTCCGCGCTGGTGTACGTGCTGATGGGTGGGCTGACCCCGCTCAACTATCTGCTCATTGCGCAAGGGTTCAACGTGCCGATACTGCTGCTTCGGGAAGCTGTCGCAGGCATTCACCAACTATC]
[+] EMBL BM630497             [                         ccgGTGCGTGAGCCCCGTCGGTAATTTAGTGTTTTTCTCCCCCGGAGTTTGGTGTTTTTGGTGCTGCGGCTTTGCATAAATCCTCCTTGGAGTTTCCCGTTTTATCGCCTAAAGTGTGGCATAGTCCTAGCGGCCTTCGAAAATGGTGGACTACGGCAAGCAGTTCATGCTGTACCTGATGGACGAGAAGTGCTACGATAATTACTTCGTAGAGTTCGACCTGCTCGATGGTGACTGTTTCCGGGCGCTGCTCAGCAAGGGCCTAGGGCTCGGCATCATCGCCGGCTCGGTGCTGGTAAAGGTGCCCCAGATTACGAAGATTCTCGCCAACAAGTCGGCCCGCGGCATCAGCCTGTTCAGCGTGCTGCTGGACCTGTTCGCCATCACGATCCACATGGCGTACAGCTTCGTGAACGGTTTTCCGTTCAGTGCCTGGGGCGATACGGCCTTCCTTGCCCTGCAGACGGCCATCATTGCGATGATGGTGCTGTTCTACGGTGGTTCTACCGTGCTTGCCGGTGCCTTTACCGTCGGCTATTCCGCGCTGGTGTACGTGCTGATGGGTGGGCTGACCCCGCTCAACTATCTGCTCATTGCGCAAGGGTTCAACGTGCCGATACTGCTG                                   ]
[+] EMBL BM604257             [                                       CCG CGGTAATTTAGTGTTTTTCTCCCCCGGAGTTTGGTGTTTTTGGTGCTGCGGCTTTGCATAAATCCTCCTTGGAGTTTCCCGTTTTATCGCCTAAAGTGTGGCATAGTCCTAGCGGCCTTCGAAAATGGTGGACTACGGCAAGCAGTTCATGCTGTACCTGATGGACGAGAAGTGCTACGATAATTACTTCGTAGAGTTCGACCTGCTCGATGGTGACTGTTTCCGGGCGCTGCTCAGCAAGGGCCTAGGGCTCGGCATCATCGCCGGCTCGGTGCTGGTAAAGGTGCCCCAGATTACGAAGATTCTCGCCAACAAGTCGGCCCGCGGCATCAGCCTGTTCAGCGTGCTGCTGGACCTGTTCGCCATCACGATCCACATGGCGTACAGCTTCGTGAACGGTTTTCCGTTCAGTGCCTGGGGCGATACGGCCTTCCTTGCCCTGCAGACGGCCATCATTGCGATGATGGTGCTGTTCTACGGTGGTTCTACCGTGCTTGCCGGTGCCTTTACCGTCGGCTATTCCGCGCTGGTGTACGTGCTGATGGGTGGGCTGACCCCGCTCAACTATCTGCTCATTGCGCAAGGGTTCAACGTGCCGATACTGCTGCT                                 ]


>consensus_8089#2 CCGGTTGTCCTTTTTTTCTGTGCCGTCTGTGCGTGAGCCCCGTCGGTAATTTAGTGTTTT TCTCCCCCGGAGTTTGGTGTTTTTGGTGCTGCGGCTTTGCATAAATCCTCCTTGGAGTTT CCCGTTTTATCGCCTAAAGTGTGGCATAGTCCTAGCGGCCTTCGAAAATGGTGGACTACG GCAAGCAGTTCATGCTGTACCTGATGGACGAGAAGTGCTACGATAATTACTTCGTAGAGT TCGACCTGCTCGATGGTGACTGTTTCCGGGCGCTGCTCAGCAAGGGCCTAGGGCTCGGCA TCATCGCCGGCTCGGTGCTGGTAAAGGTGCCCCAGATTACGAAGATTCTCGCCAACAAGT CGGCCCGCGGCATCAGCCTGTTCAGCGTGCTGCTGGACCTGTTCGCCATCACGATCCACA TGGCGTACAGCTTCGTGAACGGTTTTCCGTTCAGTGCCTGGGGCGATACGGCCTTCCTTG CCCTGCAGACGGCCATCATTGCGATGATGGTGCTGTTCTACGGTGGTTCTACCGTGCTTG CCGGTGCCTTTACCGTCGGCTATTCCGCGCTGGTGTACGTGCTGATGGGTGGGCTGACCC CGCTCAACTATCTGCTCATTGCGCAAGGGTTCAACGTGCCGATACTGCTGCTTCGGGAAG CTGTCGCAGGCATTCACCAACTATC



consensusID : consensus_8089#3
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 657
fasta sequence
                              [CCGCCCACGCGTCCGCCCACGCGTCCGTGCATAAACCCTCCTTGGAGTTTCCCGTTTTATCGCCTAAAGTGTGGCATAGTCCTAGCGGCCTTCGAAAATGGTGGACTACGGCAAGCAGTTCATGCTGTACCTGATGGACGAGAAGTGCTACGATAATTACTTCGTAGAGTTCGACCTGCTCGATGGTGACTGTTTCCGGGCGCTGCTCAGCAAGGGCCTAGGGCTCGGCATCATCGCCGGCTCGGTGCTGGTAAAGGTGCCCCAGATTACGAAGATTCTCGCCAACAAATCGGCCCGCGGCATCAGCCTGTTCAGCGTGCTGCTGGATCTGTTCGCCATCACGATCCACATGGCGTACAGCTTCGTGAACGGGTTTCCGTTCAGTGCGTGGGGCGATACGGCCTTCCTCGCCCTGCAGACGGCCATCATTGCGATGATGGTGCTGTTCTACGGTGGTTCTACCGTGCTTGCCGGTGCCTTTACCGTCGGCTATTCCGCGCCTGGTGTACGTGCTGATGGGTGGGCTGACCCCGCTCAACTATCTGCTCATTGCGCAGGGGTTTAACGTGCCGATACTGCTGCTCGGGAAGCTGTCGCAGGCATTCACCAACTATCGCAACGGTAGCACCGGGCAGCTATCGGCGGTAACGTGCTTTA]

[+] EMBL BM602509             [CCGCCCACGCGTCCGCCCACGCGTCCGTGCATAAACCCTCCTTGGAGTTTCCCGTTTTATCGCCTAAAGTGTGGCATAGTCCTAGCGGCCTTCGAAAATGGTGGACTACGGCAAGCAGTTCATGCTGTACCTGATGGACGAGAAGTGCTACGATAATTACTTCGTAGAGTTCGACCTGCTCGATGGTGACTGTTTCCGGGCGCTGCTCAGCAAGGGCCTAGGGCTCGGCATCATCGCCGGCTCGGTGCTGGTAAAGGTGCCCCAGATTACGAAGATTCTCGCCAACAAATCGGCCCGCGGCATCAGCCTGTTCAGCGTGCTGCTGGATCTGTTCGCCATCACGATCCACATGGCGTACAGCTTCGTGAACGGGTTTCCGTTCAGTGCGTGGGGCGATACGGCCTTCCTCGCCCTGCAGACGGCCATCATTGCGATGATGGTGCTGTTCTACGGTGGTTCTACCGTGCTTGCCGGTGCCTTTACCGTCGGCTATTCCGCGCCTGGTGTACGTGCTGATGGGTGGGCTGACCCCGCTCAACTATCTGCTCATTGCGCAGGGGTTTAACGTGCCGATACTGCTGCTCGGGAAGCTGTCGCAGGCATTCACCAACTATCGCAACGGTAGCACCGGGCAGCTATCGGCGGTAACGTGCTTTA]


>consensus_8089#3 CCGCCCACGCGTCCGCCCACGCGTCCGTGCATAAACCCTCCTTGGAGTTTCCCGTTTTAT CGCCTAAAGTGTGGCATAGTCCTAGCGGCCTTCGAAAATGGTGGACTACGGCAAGCAGTT CATGCTGTACCTGATGGACGAGAAGTGCTACGATAATTACTTCGTAGAGTTCGACCTGCT CGATGGTGACTGTTTCCGGGCGCTGCTCAGCAAGGGCCTAGGGCTCGGCATCATCGCCGG CTCGGTGCTGGTAAAGGTGCCCCAGATTACGAAGATTCTCGCCAACAAATCGGCCCGCGG CATCAGCCTGTTCAGCGTGCTGCTGGATCTGTTCGCCATCACGATCCACATGGCGTACAG CTTCGTGAACGGGTTTCCGTTCAGTGCGTGGGGCGATACGGCCTTCCTCGCCCTGCAGAC GGCCATCATTGCGATGATGGTGCTGTTCTACGGTGGTTCTACCGTGCTTGCCGGTGCCTT TACCGTCGGCTATTCCGCGCCTGGTGTACGTGCTGATGGGTGGGCTGACCCCGCTCAACT ATCTGCTCATTGCGCAGGGGTTTAACGTGCCGATACTGCTGCTCGGGAAGCTGTCGCAGG CATTCACCAACTATCGCAACGGTAGCACCGGGCAGCTATCGGCGGTAACGTGCTTTA



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_8089#0      -----------------------------------------------------AGAATCG 7
consensus_8089#3      ------------------------------------------------------------
consensus_8089#2      ------------------------------------------------------CCGGTT 6
consensus_8089#1      CGAGGTTACATTCTGATGTTGGAGCGGCGCACATGCCTGTTTTTTATTTTATTTTTNTAT 60
                                                                                  

consensus_8089#0      CNGAGGTATTTCTGTGCCGTCTGTGCGTGAGCCC-GTCGGTAATTTAGTGTTTTTCTCCC 66
consensus_8089#3      ------------------------------------------------------------
consensus_8089#2      GTCCTTTTTTTCTGTGCCGTCTGTGCGTGAGCCCCGTCGGTAATTTAGTGTTTTTCTCCC 66
consensus_8089#1      CTAGTGCCGTACTGTGCGTGAGCCCCGTACGGTAATTATAGTAGTTTATATACTACCCTA 120
                                                                                  

consensus_8089#0      CCGGAGTTTGGTGTT--TTTGGTGCTGC-GGCTTTGCATAAATCCT-CCTTGGAGTTT-C 121
consensus_8089#3      CCG----CCCACGCG--TCCGCCCACGC-GTCCGTGCATAAACCCT-CCTTGGAGTTT-C 51
consensus_8089#2      CCGGAGTTTGGTGTT--TTTGGTGCTGC-GGCTTTGCATAAATCCT-CCTTGGAGTTT-C 121
consensus_8089#1      CGGAGTATTGGTGCTATTTGGTATATGCCGCTTATGCATAAACCCTACCTTGGAGTTNTC 180
                      * *         *    *  *     ** *    ******** *** **********  *

consensus_8089#0      CCGT-TTTATCGCCTAAAGTGTGGCATAGTCCTAGCGGCCTTCGAAAATGGTGGACTACG 180
consensus_8089#3      CCGT-TTTATCGCCTAAAGTGTGGCATAGTCCTAGCGGCCTTCGAAAATGGTGGACTACG 110
consensus_8089#2      CCGT-TTTATCGCCTAAAGTGTGGCATAGTCCTAGCGGCCTTCGAAAATGGTGGACTACG 180
consensus_8089#1      CCGTACTTATCGCCCAAAGTGTGGCATAGTCCTAGACGGCTTCGAAAATGGTGGACTACG 240
                      ****  ******** ********************  * *********************

consensus_8089#0      GCAAGCAGTTCATGCTGTACCTGATGGAC-GAGAAGTGCTACGATAATTACTTCGTAGAG 239
consensus_8089#3      GCAAGCAGTTCATGCTGTACCTGATGGAC-GAGAAGTGCTACGATAATTACTTCGTAGAG 169
consensus_8089#2      GCAAGCAGTTCATGCTGTACCTGATGGAC-GAGAAGTGCTACGATAATTACTTCGTAGAG 239
consensus_8089#1      GCAAGCAGTTCATGCTGTACCTGATGGACAGAGAAGTGCTACGATAATTACTTCGTAGAG 300
                      ***************************** ******************************

consensus_8089#0      TTCGACCTGCTCGATGGTGACTGTTTCCGGGCGCTGCTCAG--CAAGGGCCTAGGG-CTC 296
consensus_8089#3      TTCGACCTGCTCGATGGTGACTGTTTCCGGGCGCTGCTCAG--CAAGGGCCTAGGG-CTC 226
consensus_8089#2      TTCGACCTGCTCGATGGTGACTGTTTCCGGGCGCTGCTCAG--CAAGGGCCTAGGG-CTC 296
consensus_8089#1      TTCGANCTGCTCGATGGCGA-TGTTTCCGGGCGCTGCTCAGACCAAGGGCCTANNGGCTC 359
                      ***** *********** ** ********************  **********  * ***

consensus_8089#0      GGC-ATCATCGCCGGC-TCGG-TGCTGGTAAAGGTGCCCCAGATTA-CGAAG--ATTCTC 350
consensus_8089#3      GGC-ATCATCGCCGGC-TCGG-TGCTGGTAAAGGTGCCCCAGATTA-CGAAG--ATTCTC 280
consensus_8089#2      GGC-ATCATCGCCGGC-TCGG-TGCTGGTAAAGGTGCCCCAGATTA-CGAAG--ATTCTC 350
consensus_8089#1      GGCCATCATCGCCGGCCTCGGCTGCTGGTANAGGTGCCCCANATTNACGAANGNATTCTC 419
                      *** ************ **** ******** ********** ***  ****   ******

consensus_8089#0      GCCAACAAG-TCGGCCCGCGGCATCAGCCTGTTCA-GCGTGC-TGCTGG--ACCTGT-TC 404
consensus_8089#3      GCCAACAAA-TCGGCCCGCGGCATCAGCCTGTTCA-GCGTGC-TGCTGG--ATCTGT-TC 334
consensus_8089#2      GCCAACAAG-TCGGCCCGCGGCATCAGCCTGTTCA-GCGTGC-TGCTGG--ACCTGT-TC 404
consensus_8089#1      GCCAACAAAGTCGGCCCGCGGCATCAGCCTGTTCACGCGTGCCTGCTGAGCATCTGTACC 479
                      ********  ************************* ****** *****   * ****  *

consensus_8089#0      GCCATCACGATCCACA-TGGCGT-ACAGCTTCG-TGAACGGTTTTCCGTTCAGTGCCTGG 461
consensus_8089#3      GCCATCACGATCCACA-TGGCGT-ACAGCTTCG-TGAACGGGTTTCCGTTCAGTGCGTGG 391
consensus_8089#2      GCCATCACGATCCACA-TGGCGT-ACAGCTTCG-TGAACGGTTTTCCGTTCAGTGCCTGG 461
consensus_8089#1      GCCATCACGATCCACACTGGCGNTACAGCTTCGCTGAACGGGTTTCCGTTCAGTGCGTGG 539
                      **************** *****  ********* ******* ************** ***

consensus_8089#0      GGCGATACGGCCTTCCTTGCCCTGCAG-ACGGCCATCATTGCG-----ATGATGGTGCTG 515
consensus_8089#3      GGCGATACGGCCTTCCTCGCCCTGCAG-ACGGCCATCATTGCG-----ATGATGGTGCTG 445
consensus_8089#2      GGCGATACGGCCTTCCTTGCCCTGCAG-ACGGCCATCATTGCG-----ATGATGGTGCTG 515
consensus_8089#1      GGCGATACGGC-TTCCTCGCCCTGCCGCACGGCCATCATTGCGCACTCANCTGGCTGCTG 598
                      *********** ***** ******* * ***************     *    * *****

consensus_8089#0      TTCTACG-GTGGTTCTACCGTGC-TTGCCGG-TGCCTT-TACCG-TCG-GCTATTCCGCG 569
consensus_8089#3      TTCTACG-GTGGTTCTACCGTGC-TTGCCGG-TGCCTT-TACCG-TCG-GCTATTCCGCG 499
consensus_8089#2      TTCTACG-GTGGTTCTACCGTGC-TTGCCGG-TGCCTT-TACCG-TCG-GCTATTCCGCG 569
consensus_8089#1      TTCTACGCGNGGTNCTACCGTGCCTTGCCGGCTGCCTTCTACCGCTCGCGCTATTCCGCG 658
                      ******* * *** ********* ******* ****** ***** *** ***********

consensus_8089#0      C-TGGTGTACGTGCTGATGGGTGGGCTGACCCCGCTCAACTATCTGCTCATTGCGCAAGG 628
consensus_8089#3      CCTGGTGTACGTGCTGATGGGTGGGCTGACCCCGCTCAACTATCTGCTCATTGCGCAGGG 559
consensus_8089#2      C-TGGTGTACGTGCTGATGGGTGGGCTGACCCCGCTCAACTATCTGCTCATTGCGCAAGG 628
consensus_8089#1      C-TGGTGTTCGTGCTGA--------CTGGCTGCGNTCNG--------------------- 688
                      * ****** ********        *** *  ** **                       

consensus_8089#0      GTTCAACGTGCCGATACTGCTGCT-CGGGAAGCTGTCGCAGGCATTCACCAACTATCGCA 687
consensus_8089#3      GTTTAACGTGCCGATACTGCTGCT-CGGGAAGCTGTCGCAGGCATTCACCAACTATCGCA 618
consensus_8089#2      GTTCAACGTGCCGATACTGCTGCTTCGGGAAGCTGTCGCAGGCATTCACCAACTATC--- 685
consensus_8089#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8089#0      ACGGTAGCACCGGGCAGCTATCGGCGGTAACGTGCTTTAT 727
consensus_8089#3      ACGGTAGCACCGGGCAGCTATCGGCGGTAACGTGCTTTA- 657
consensus_8089#2      ----------------------------------------
consensus_8089#1      ----------------------------------------
                                                              




Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)