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Anopheles gambiae
cluster # 8242 cluster # 8242       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8242#0 length = 1852 sequences # 9  

consensusID : consensus_8242#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1852
fasta sequence
                              [CCGCGGACGGTGAAAACACCTACGCCACCGAACGTGTCCGGCGTCATGTCACCGATTCCGTTCGGCAGCAGCAGTAGCAACAGCAGCAAGTCGGCCAACCCATCATCCGGTGGCACCACTGGATAGTATCGGTTTTTCTTCTGCTAGAAAAGCAAGTACCACCATATCCTTTCCCCCGAACGAGAGCGTGAGCTGAAGGTAGAAGTTACCACTGTTACAGTGCTGCTGGGTGCAAAACCGGGACAACACCCCGTCCACATCATTTGTCGGCCATCGGGCAGCGAACGTCAAACCCCCCGAGCGAGCGGGCGGTTGCTGTTGCACTAGGGCGCGCACTATACGCAATACCGGGCGTCGGCTTGTTTGTCGTTAGCGAGTAGTAGGGTGAGTGGAAAGACTTTCCAACCAAGACTATAGACTAGTGCAAAACAAATTGTACTGCGTACTGGTACTAAGAGAGAAGGCGAGAGAATGGTGATATATACCACCCCACACGCGCGCTATACGGAAGGAGGAAAAGCGAACGTTGATAGCGTACGAGAGAGAGGCTAGGAGGAGATTTCAGAAATGTTGTTTTTAGTGGATGATGATGATTGGGGTTCTGCTGTGGCGGGGCAGACCGTGCGGAGCGAAGGAGTTGGATATCGGATAAGCCTGTGTAAAATGGGTATGGTGCCTTCCTTCTTTAGTGCAAACCGGTCCGTCGGTGAGAGCGTGTGCCTCGGCTTTGCTTATCCTGCCAGTTCTGTACGTTTAATTTCTTTCCGCGCTCCTCCTTCCTTATTATTATCCCTTTCGTGTTTTGTTTGTTTGTAGCAACAACTGCTAGTATTTTCACAAGGACTGACACCCCGAACGCCATTCCTGACGCTAGCTTGTTTTGTTTTTTTTTTTTCTTCTTTTCTCTCGAAGATATCTACTTGTTATCCGTTTCTCAGCTGCGTGAGAATGCTTTAAGTAATGTAAATTTCATGTTATACCC-TCGTAGAAGGCGCTCGCTTACCCACCAAACAACGCATCACATAGGGAAGCGAGTGTCCAGTGAGTCTGCGAGTTTATATGTGCTAGTGGTAAGCTGAGTGTGGTGTATGCCGGTGTTTTTTTTACGTATGCTTTCCAGCAACAACAGCAAACAAAAGGAAGAGGTAGTTGCGATGTTAAATGGAAATACTCTTAAGATTACATCTGCAGTAACAGAGAGTGTAACACAAACATTCACTATTAGCAGCCCCAGAGTGTGGCTCCAGGGAAAATTTGATTCACTACAGATAAGTGGCACTGCATCAGAATGCTAAGCTTGAATGTTTATACTGTTGTTTTATGCTTTATGTTAGCATATTTTTAAAACATGTAAACTCTAATCTACGTTTGATGTGTATCGGGTGTGGATGCTATATATGCTCCCATCACTTAGACCTTAGTTAAAATGCCACACACTCCTCGTTTTCGGTACAAAACACTCACACACACACACATACTGCTGTATTATTATTATCCCGTTTGTGCACTAAGGGCAAAGAAGTAGGTTAAATGAGATGTAGCGCGTAGCATGGCAAAAGGAGGGCAAGAATCTGAACTAAACAACGGACTGGTTCCTAGTATATTGAACTCTAACAAGAAAGTGAT-CCGAATGTGTCTGTCCACACACCGACCGATCCTTAGGCACCCGTTCCTCTTCGTAAATAATAATAAATAAAAAAAGGCTCGGTAACAATTGTAGGCTAGGAAACGACACACATCCCCCCTCCCTTCCCCTCCTAAATGCAAAGAAAGCAAACAGTGAAATACACTTG-AATCAATTTTGAATACNAAATCACTCNTTCC-AAACATAGGGATACAGC-AACAGGACGCA]

[+] EMBL BM580770             [CCGCGGACGGTGAAAACACCTACGCCACCGAACGTGTCCGGCGTCATGTCACCGATTCCGTTCGGCAGCAGCAGTAGCAACAGCAGCAAGTCGGCCAACCCATCATCCGGTGGCACCACTGGATAGTATCGGTTTTTCTTCTGCTAGAAAAGCAAGTACCACCATATCCTTTCCCCCGAACGAGAGCGTGAGCTGAAGGTAGAAGTTACCACTGTTACAGTGCTGCTGGGTGCAAAACCGGGACAACACCCCGTCCACATCATTTGTCGGCCATCGGGCAGCGAACGTCAAACCCCCCGAGCGAGCGGGCGGTTGCTGTTGCACTAGGGCGCGCACTATACGCAATACCGGGCGTCGGCTTGTTTGTCGTTAGCGAGTAGTAGGGTGAGTGGAAAGACTTTCCAACCAAGACTATAGACTAGTGCAAAACAAATTGTACTGCGTACTGGTACTAAGAGAGAAGGCGAGAGAATGGTGATATATACCACCCCACACGCGCGCTATACGGAAGGAGGAAAAGCGAACGTTGATAGCGTACGAGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BM655814             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ccgGGAAAGACTTTCCAACCAAGACTATAGACTAGTGCAAAACAAATTGTACTGCGTACTGGTACTAAGAGAGAAGGCGAGAGAATGGTGATATATACCACCCCACACGCGCGCTATACGGAAGGAGGAAAAGCGAACGTTGATAGCGTACGAGAGAGAGGCTAGGAGGAGATTTCAGAAATGTTGTTTTTAGTGGATGATGATGATTGGGGTTCTGCTGTGGCGGGGCAGACCGTGCGGAGCGAAGGAGTTGGATATCGGATAAGCCTGTGTAAAATGGGTATGGTGCCTTCCTTCTTTAGTGCAAACCGGTCCGTCGGTGAGAGCGTGTGCCTCGGCTTTGCTTATCCTGCCAGTTCTGTACGTTTAATTTCTTTCCGCGCTCCTCCTTCCTTATTATTATCCCTTTCGTGTTTTGTTTGTTTGTAGCAACAACTGCTAGTATTTTCACAAGGACTGACACCCCGAACGCCATTCCTGACGCTAGCTTGTTTTGTTTTTTTTTTTTCTTCTTTTCTCTCGAAGATATCTACTTGTTATCCGTTTCTCAGCTGCGTGAGAATGCTTTAAGTAATGTAAATTTCATGTTATACCCATCGTAGAAGGCGCTCGCTTACCCACCAAACAACGCATCACATAGGGAAGCGAGTGTCCAGTGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BX627948             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AACTGCTAGTATTTTCACAAGGACTGACACCCCGAACGCCATTCCTGACGCTAGCTTGTTTTGTTTTTTTTTTTTCTTCTTTTCTCTCGAAGATATCTACTTGTTATCCGTTTCTCAGCTGCGTGAGAATGCTTTAAGTAATGTAAATTTCATGTTATACCC TCGTAGAAGGCGCTCGCTTACCCACCAAACAACGCATCACATAGGGAAGCGAGTGTCCAGTGAGTCTGCGAGTTTATATGTGCTAGTGGTAAGCTGAGTGTGGTGTATGCCGGTGTTTTTTTTACGTATGCTTTCCAGCAACAACAGCAAACAAAAGGAAGAGGTAGTTGCGATGTTAAATGGAAATACTCTTAAGATTACATCTGCAGTAACAGAGAGTGTAACACAAACATTCACTATTAGCAGCCCCAGAGTGTGGCTCCAGGGAAAATTTGATTCACTACAGATAAGTGGCACTGCATCAGAATGCTAAGCTTGAATGTTTATACTGTTGTTTTATGCTTTATGTTAGCATATTTTTAAAACATGTAAACTCTAATCTACGTTTGATGTGTATCGGGTGTGGATGCTATATATGCTCCCATCACTTAGACCTTAGTTAAAATGCCACACACTCCTCGTTTTCGGTACAAAACACTCACACACACACACATACTGCTGTATTATTATTATCCCGTTTGTGCACTAAGGGCAAAGAAGTAGGTTAAATGAGATGTAGCGCGTAGCATGGCAAAAGGAGGGCAAGAATCTGAACTAAACAACGGACTGGTTCCTAGTATATTGAACTCTAAC AGAAAGTGATCCCGAATGTGTCTGTCC CNCACCGACCGATCCTTANGC                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BX622348             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AACTGCTAGTATTTTCACAAGGACTGACACCCCGAACGCCATTCCTGACGCTAGCTTGTTTTGTTTTTTTTTTTTCTTCTTTTCTCTCGAAGATATCTACTTGTTATCCGTTTCTCAGCTGCGTGAGAATGCTTTAAGTAATGTAAATTTCATGTTATACCC TCGTAGAAGGCGCTCGCTTACCCACCAAACAACGCATCACATAGGGAAGCGAGTGTCCAGTGAGTCTGCGAGTTTATATGTGCTAGTGGTAAGCTGAGTGTGGTGTATGCCGGTGTTTTTTTTACGTATGCTTTCCAGCAACAACAGCAAACAAAAGGAAGAGGTAGTTGCGATGTTAAATGGAAATACTCTTAAGATTACATCTGCAGTAACAGAGAGTGTAACACAAACATTCACTATTAGCAGCCCCAGAGTGTGGCTCCAGGGAAAATTTGATTCACTACAGATAAGTGGCACTGCATCAGAATGCTAAGCTTGAATGTTTATACTGTTGTTTTATGCTTTATGTTAGCATATTTTTAAAACATGTAAACTCTAATCTACGTTTGATGTGTATCGGGTGTGGATGCTATATATGCTCCCATCACTTAGACCTTAGTTAAAATGCCACACACTCCTCGTTTTCGGTACAAAACACTCACACACACACACATACTGCTGTATTATTATTATCCCGTTTGTGCACTAANGGCAAAGAAGTAGGTTAAATGAGATGTAGCGCGTAGCATGGCAAAAGGAGGGCAAGAATCTGAACTAAACAACNGACTGGTTtcc                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BM582872             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ccgCAAGGACTGACACCCCGAACGCCATTCCTGACGCTAGCTTGTTTTGTTTTTTTTTTTTCTTCTTTTCTCTCGAAGATATCTACTTGTTATCCGTTTCTCAGCTGCGTGAGAATGCTTTAAGTAATGTAAATTTCATGTTATACCC TCGTAGAAGGCGCTCGCTTACCCACCAAACAACGCATCACATAGGGAAGCGAGTGTCCAGTGAGTCTGCGAGTTTATATGTGCTAGTGGTAAGCTGAGTGTGGTGTATGCCGGTGTTTTTTTTACGTATGCTTTCCAGCAACAACAGCAAACAAAAGGAAGAGGTAGTTGCGATGTTAAATGGAAATACTCTTAAGATTACATCTGCAGTAACAGAGAGTGTAACACAAACATTCACTATTAGCAGCCCCAGAGTGTGGCTCCAGGGAAAATTTGATTCACTACAGATAAGTGGCACTGCATCAGAATGCTAAGCTTGAATGTTTATACTGTTGTTTTATGCTTTATGTTAGCATATTTTTAAAACATGTAAACTCTAATCTACGTTTGATGTGTATCGGGTGTGGATGCTATATATGCTCCCATCACTTAGACCTTAGTTAAAATGCCACACACTCCTCGTTTTCGGTACAAAACACTCACACACACACACATACTGCTGTATTATTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BM599913             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCGGAACGCCATTCCTGACGCTAGCTTGTTTTGTTTTTTTTTTTTCTTCTTTTCTCTCGAAGATATCTACTTGTTATCCGTTTCTCAGCTGCGTGAGAATGCTTTAAGTAATGTAAATTTCATGTTATACCC TCGTAGAAGGCGCTCGCTTACCCACCAAACAACGCATCACATAGGGAAGCGAGTGTCCAGTGAGTCTGCGAGTTTATATGTGCTAGTGGTAAGCTGAGTGTGGTGTATGCCGGTGTTTTTTTTACGTATGCTTTCCAGCAACAACAGCAAACAAAAGGAAGAGGTAGTTGCGATGTTAAATGGAAATACTCTTAAGATTACATCTGCAGTAACAGAGAGTGTAACACAAACATTCACTATTAGCAGCCCCAGAGTGTGGCTCCAGGGAAAATTTGATTCACTACAGATAAGTGGCACTGCATCAGAATGCTAAGCTTGAATGTTTATACTGTTGTTTTATGCTTTATGTTAGCATATTTTTAAAACATGTAAACTCTAATCTACGTTTGATGTGTATCGGGTGTGGATGCTATATATGCTCCCATCACTTAGACCTTAGTTAAAATGCCACACACTCCTCGTTTTCGGTACAAAACACTCACACACACACACATACTGCTGTATTATTATTATCCCGTTTGTGCACTAAGGGCAAAGAAGTAGGTTAAATGAAATGTAGCGCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BX622679             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TATATGTGCTAGTGGTAAGCTGAGTGTGGTGTATGCCGGTGTTTTTTTTACGTATGCTTTCCAGCAACAACAGCAAACAAAAGGAAGAGGTAGTTGCGATGTTAAATGGAAATACTCTTAAGATTACATCTGCAGTAACAGAGAGTGTAACACAAACATTCACTATTAGCAGCCCCAGAGTGTGGCTCCAGGGAAAATTTGATTCACTACAGATAAGTGGCACTGCATCAGAATGCTAAGCTTGAATGTTTATACTGTTGTTTTATGCTTTATGTTAGCATATTTTTAAAACATGTAAACTCTAATCTACGTTTGATGTGTATCGGGTGTGGATGCTATATATGCTCCCATCACTTAGACCTTAGTTAAAATGCCACACACTCCTCGTTTTCGGTACAAAACACTCACACACACACACATACTGCTGTATTATTATTATCCCGTTTGTGCACTAAGGGCAAAGAAGTAGGTTAAATGAGATGTAGCGCGTAGCATGGCAAAAGGAGGGCAAGAATCTGAACTAAACAACGGACTGTTTCCTAGTATATTGAACTCTAACAAGAAAGTGAT CCGAATGTGTCTGTCCACACACCGACCGATCCTTAGGCACCCGTTCCTCTTCGTAAATAATAATAAATAAAAAAAGGCTCGGTAACNATTGTAGGCTAGGAAACGACACACATCCCCCCTNCCTTCCCCTCCTAAATGCAAAGAAAGCAAACAGTGAAATACACTTG AATCAATTTTGAATACNAAATCACTCNTTCC AAACATAGGGATACAGC AACAG      ]
[+] EMBL BM629737             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ccgCAAACATTCACTATTAGCAGCCCCAGAGTGTGGCTCCAGGGAAAATTTGATTCACTACAGATAAGTGGCACTGCATCAGAATGCTAAGCTTGAATGTTTATACTGTTGTTTTATGCTTTATGTTAGCATATTTTTAAAACATGTAAACTCTAATCTACGTTTGATGTGTATCGGGTGTGGATGCTATATATGCTCCCATCACTTAGACCTTAGTTAAAATGCCACACACTCCTCGTTTTCGGTACAAAACACTCACACACACACACATACTGCTGTATTATTATTATCCCGTTTGTGCACTAAGGGCAAAGAAGTAGGTTAAATGAGATGTAGCGCGTAGCATGGCAAAAGGAGGGCAAGAATCTGAACTAAACAACGGACTGTTTCCTAGTATATTGAACTCTAACAAGAAAGTGAT CCGAATGTGTCTGTCCACACACCGACCGATCCTTAGGCACCCGTTCCTCTTCGTAAATAATAATAAATAAAAAAAGGCTCGGTAACAATTGTAGGCTAGGAAACGACACACATCCCCCCTCCCTTCCCCTCCTAAATGCAAAGAAAGCAAACAGTGAAATAC                                                                   ]
[+] EMBL BX612332             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATTGAACTCTAACAAGAAAGTGAT CCGAAGGTGTCTGTCCACACACCGACCGATCCTTAGGCACCCGTTCCTCTTCGTAAATAATAATAAATAAAAAAAGGCTCGGTAACAATTGTAGGCTAGGAAACGACACACATCCCCCCTCCCTTCCCCTCCTAAATGCAAAGAAAGCAAACAGTGAAATACACTTGAAATCAATTTTGAAAACAAAATCACTCTTTCCAAAACATAGGGATACAGCAAACAGGACGCA]


>consensus_8242#0 CCGCGGACGGTGAAAACACCTACGCCACCGAACGTGTCCGGCGTCATGTCACCGATTCCG TTCGGCAGCAGCAGTAGCAACAGCAGCAAGTCGGCCAACCCATCATCCGGTGGCACCACT GGATAGTATCGGTTTTTCTTCTGCTAGAAAAGCAAGTACCACCATATCCTTTCCCCCGAA CGAGAGCGTGAGCTGAAGGTAGAAGTTACCACTGTTACAGTGCTGCTGGGTGCAAAACCG GGACAACACCCCGTCCACATCATTTGTCGGCCATCGGGCAGCGAACGTCAAACCCCCCGA GCGAGCGGGCGGTTGCTGTTGCACTAGGGCGCGCACTATACGCAATACCGGGCGTCGGCT TGTTTGTCGTTAGCGAGTAGTAGGGTGAGTGGAAAGACTTTCCAACCAAGACTATAGACT AGTGCAAAACAAATTGTACTGCGTACTGGTACTAAGAGAGAAGGCGAGAGAATGGTGATA TATACCACCCCACACGCGCGCTATACGGAAGGAGGAAAAGCGAACGTTGATAGCGTACGA GAGAGAGGCTAGGAGGAGATTTCAGAAATGTTGTTTTTAGTGGATGATGATGATTGGGGT TCTGCTGTGGCGGGGCAGACCGTGCGGAGCGAAGGAGTTGGATATCGGATAAGCCTGTGT AAAATGGGTATGGTGCCTTCCTTCTTTAGTGCAAACCGGTCCGTCGGTGAGAGCGTGTGC CTCGGCTTTGCTTATCCTGCCAGTTCTGTACGTTTAATTTCTTTCCGCGCTCCTCCTTCC TTATTATTATCCCTTTCGTGTTTTGTTTGTTTGTAGCAACAACTGCTAGTATTTTCACAA GGACTGACACCCCGAACGCCATTCCTGACGCTAGCTTGTTTTGTTTTTTTTTTTTCTTCT TTTCTCTCGAAGATATCTACTTGTTATCCGTTTCTCAGCTGCGTGAGAATGCTTTAAGTA ATGTAAATTTCATGTTATACCCTCGTAGAAGGCGCTCGCTTACCCACCAAACAACGCATC ACATAGGGAAGCGAGTGTCCAGTGAGTCTGCGAGTTTATATGTGCTAGTGGTAAGCTGAG TGTGGTGTATGCCGGTGTTTTTTTTACGTATGCTTTCCAGCAACAACAGCAAACAAAAGG AAGAGGTAGTTGCGATGTTAAATGGAAATACTCTTAAGATTACATCTGCAGTAACAGAGA GTGTAACACAAACATTCACTATTAGCAGCCCCAGAGTGTGGCTCCAGGGAAAATTTGATT CACTACAGATAAGTGGCACTGCATCAGAATGCTAAGCTTGAATGTTTATACTGTTGTTTT ATGCTTTATGTTAGCATATTTTTAAAACATGTAAACTCTAATCTACGTTTGATGTGTATC GGGTGTGGATGCTATATATGCTCCCATCACTTAGACCTTAGTTAAAATGCCACACACTCC TCGTTTTCGGTACAAAACACTCACACACACACACATACTGCTGTATTATTATTATCCCGT TTGTGCACTAAGGGCAAAGAAGTAGGTTAAATGAGATGTAGCGCGTAGCATGGCAAAAGG AGGGCAAGAATCTGAACTAAACAACGGACTGGTTCCTAGTATATTGAACTCTAACAAGAA AGTGATCCGAATGTGTCTGTCCACACACCGACCGATCCTTAGGCACCCGTTCCTCTTCGT AAATAATAATAAATAAAAAAAGGCTCGGTAACAATTGTAGGCTAGGAAACGACACACATC CCCCCTCCCTTCCCCTCCTAAATGCAAAGAAAGCAAACAGTGAAATACACTTGAATCAAT TTTGAATACNAAATCACTCNTTCCAAACATAGGGATACAGCAACAGGACGCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)